FuNGI

A0A1R3RCK8

Protein Details

Accession

A0A1R3RCK8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MPSDKVDKKRKRASDRHERPSKKPALE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-23	KKRKRASDRHERPSKK
461-495	GIKGGKAEAAARRVARLKIPVEFPKVSRGGGGGRR

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 10, mito 6, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MPSDKVDKKRKRASDRHERPSKKPALELQDLPPLSSSVVEDDSELAPVIITTPGLSAPRNLRLNPYLKTRSKTSSASSRNKGIVSSELLLQSSEHPKLDFVGREAEEDADSQLKHYVAIVDPEKKTWQFVEVRKMTLRGSVRKMRAIEEEEEEESEEEEMKTMRAQRTELTNTFGTKQSRKAAQSLAENAQLSNVPAGAASAAENAILSAMPADAATDIASKTAAVQAQVQAAKPLPQANLDAAHPSDVYPIDVLVPNGLATLRQLPNIKEWQDTVNSGGAVNTTSRYVSRRVEAVALSGNTTHIQILRFILLLLELARCLRPGRDKSSGPGSKRLPPREDLRRILSGGTTNENAASGDQLPDPVIDAVRRKFAPQGASLSKNDITFLHTTICALSLHIPPQPAKDGGNSSAGGNSPNELATDPSDLRDDLRLDNVAITQYFRELGCRVDKPRESEFAKWGIKGGKAEAAARRVARLKIPVEFPKVSRGGGGGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.91
2	0.91
3	0.92
4	0.92
5	0.88
6	0.84
7	0.84
8	0.83
9	0.75
10	0.71
11	0.69
12	0.66
13	0.66
14	0.63
15	0.57
16	0.57
17	0.53
18	0.46
19	0.39
20	0.31
21	0.24
22	0.21
23	0.17
24	0.12
25	0.13
26	0.13
27	0.13
28	0.14
29	0.14
30	0.14
31	0.13
32	0.1
33	0.08
34	0.08
35	0.08
36	0.06
37	0.06
38	0.05
39	0.06
40	0.08
41	0.1
42	0.11
43	0.15
44	0.2
45	0.28
46	0.32
47	0.33
48	0.37
49	0.43
50	0.48
51	0.47
52	0.51
53	0.53
54	0.54
55	0.58
56	0.57
57	0.56
58	0.56
59	0.55
60	0.52
61	0.53
62	0.57
63	0.63
64	0.62
65	0.62
66	0.6
67	0.56
68	0.51
69	0.42
70	0.36
71	0.3
72	0.27
73	0.23
74	0.21
75	0.21
76	0.2
77	0.18
78	0.19
79	0.21
80	0.21
81	0.19
82	0.19
83	0.19
84	0.21
85	0.25
86	0.22
87	0.18
88	0.23
89	0.23
90	0.24
91	0.25
92	0.23
93	0.19
94	0.18
95	0.17
96	0.13
97	0.12
98	0.12
99	0.13
100	0.12
101	0.12
102	0.12
103	0.13
104	0.11
105	0.17
106	0.2
107	0.24
108	0.25
109	0.27
110	0.3
111	0.28
112	0.3
113	0.25
114	0.27
115	0.28
116	0.33
117	0.41
118	0.4
119	0.43
120	0.43
121	0.44
122	0.38
123	0.37
124	0.38
125	0.34
126	0.39
127	0.44
128	0.45
129	0.49
130	0.5
131	0.46
132	0.45
133	0.42
134	0.37
135	0.32
136	0.32
137	0.27
138	0.26
139	0.24
140	0.19
141	0.15
142	0.13
143	0.1
144	0.07
145	0.07
146	0.07
147	0.07
148	0.09
149	0.14
150	0.17
151	0.17
152	0.19
153	0.2
154	0.27
155	0.33
156	0.31
157	0.3
158	0.29
159	0.29
160	0.3
161	0.32
162	0.3
163	0.26
164	0.3
165	0.32
166	0.36
167	0.37
168	0.38
169	0.36
170	0.36
171	0.38
172	0.37
173	0.33
174	0.3
175	0.29
176	0.25
177	0.23
178	0.19
179	0.15
180	0.1
181	0.08
182	0.05
183	0.04
184	0.05
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.03
193	0.04
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.02
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.05
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.08
214	0.09
215	0.12
216	0.13
217	0.13
218	0.12
219	0.12
220	0.13
221	0.13
222	0.14
223	0.11
224	0.12
225	0.13
226	0.12
227	0.13
228	0.12
229	0.12
230	0.09
231	0.09
232	0.08
233	0.08
234	0.08
235	0.07
236	0.07
237	0.06
238	0.05
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.1
250	0.1
251	0.13
252	0.15
253	0.16
254	0.2
255	0.25
256	0.26
257	0.21
258	0.21
259	0.21
260	0.2
261	0.2
262	0.17
263	0.14
264	0.13
265	0.12
266	0.11
267	0.09
268	0.08
269	0.07
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.07
274	0.09
275	0.13
276	0.14
277	0.15
278	0.16
279	0.17
280	0.18
281	0.17
282	0.16
283	0.15
284	0.13
285	0.12
286	0.11
287	0.11
288	0.09
289	0.1
290	0.09
291	0.08
292	0.08
293	0.09
294	0.1
295	0.09
296	0.09
297	0.09
298	0.08
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.06
306	0.06
307	0.07
308	0.1
309	0.18
310	0.23
311	0.29
312	0.35
313	0.36
314	0.39
315	0.49
316	0.52
317	0.47
318	0.5
319	0.47
320	0.48
321	0.56
322	0.59
323	0.52
324	0.5
325	0.55
326	0.58
327	0.62
328	0.59
329	0.55
330	0.51
331	0.48
332	0.45
333	0.38
334	0.31
335	0.25
336	0.23
337	0.19
338	0.16
339	0.15
340	0.15
341	0.14
342	0.1
343	0.1
344	0.08
345	0.09
346	0.08
347	0.09
348	0.09
349	0.08
350	0.1
351	0.09
352	0.09
353	0.1
354	0.15
355	0.16
356	0.21
357	0.22
358	0.22
359	0.25
360	0.28
361	0.3
362	0.28
363	0.34
364	0.34
365	0.38
366	0.38
367	0.38
368	0.36
369	0.33
370	0.3
371	0.23
372	0.21
373	0.18
374	0.19
375	0.17
376	0.14
377	0.15
378	0.14
379	0.15
380	0.11
381	0.1
382	0.13
383	0.13
384	0.16
385	0.17
386	0.2
387	0.19
388	0.22
389	0.25
390	0.23
391	0.22
392	0.24
393	0.26
394	0.25
395	0.28
396	0.26
397	0.22
398	0.22
399	0.22
400	0.19
401	0.15
402	0.14
403	0.11
404	0.11
405	0.11
406	0.1
407	0.11
408	0.11
409	0.16
410	0.15
411	0.16
412	0.17
413	0.17
414	0.18
415	0.2
416	0.2
417	0.17
418	0.2
419	0.2
420	0.19
421	0.19
422	0.19
423	0.17
424	0.15
425	0.15
426	0.12
427	0.12
428	0.14
429	0.13
430	0.15
431	0.14
432	0.18
433	0.24
434	0.29
435	0.33
436	0.41
437	0.46
438	0.49
439	0.53
440	0.57
441	0.55
442	0.53
443	0.53
444	0.53
445	0.51
446	0.46
447	0.45
448	0.41
449	0.4
450	0.37
451	0.35
452	0.3
453	0.29
454	0.34
455	0.35
456	0.34
457	0.36
458	0.34
459	0.37
460	0.37
461	0.38
462	0.38
463	0.4
464	0.4
465	0.41
466	0.48
467	0.5
468	0.53
469	0.54
470	0.5
471	0.51
472	0.5
473	0.44
474	0.38
475	0.33

A0A1R3RCK8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer