Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1R3RDE4

Protein Details
Accession A0A1R3RDE4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-172GTHTKGGKKDKASKKARRNKEKNGTANGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-165KGGKKDKASKKARRNKEK
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 10, nucl 7.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR045196  IF2/IF5  
IPR002735  Transl_init_fac_IF2/IF5_dom  
IPR016189  Transl_init_fac_IF2/IF5_N  
IPR016190  Transl_init_fac_IF2/IF5_Zn-bd  
IPR003307  W2_domain  
Gene Ontology GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01873  eIF-5_eIF-2B  
PF02020  W2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51363  W2  
CDD cd11561  W2_eIF5  
Amino Acid Sequences MATVNIRRDVSDPFYRYKMERLQSKIEGKGNGIKTVVVNLNSVAQSLSRPPAYVIKYFGFELGAQANAKPTDDRWIINGAHDAPKLQDYLDGFIAKFVLCKKCKNPETDVVVKDEKISLDCKACGQRSEVDSRLKLSTFILRNGTHTKGGKKDKASKKARRNKEKNGTANGDKDGSPGDSNNSENGDDDNGDVALEAGSDDELTRRIKADAKGIDAEEDIDDDNWAVDVSEEAVKARAKELPDDLKRSLVLEEGDDEGADGPSAYDELGSWVLNTATEKGGVTAVSDVDIYMKAKEYGIENKHKTVAVLAQTIFDEKITKQIPARAGLLKKMITSERHEKAFLGGTERFVGKDRPELIAQVPAILLKYYEHDLVSEDTLKAWGSKASKKYVDIQTSKKVRKAAEPFLEWLENAESEEESEEDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.44
3 0.44
4 0.47
5 0.49
6 0.48
7 0.52
8 0.54
9 0.58
10 0.63
11 0.67
12 0.66
13 0.63
14 0.57
15 0.52
16 0.55
17 0.49
18 0.44
19 0.38
20 0.32
21 0.27
22 0.31
23 0.32
24 0.24
25 0.22
26 0.2
27 0.23
28 0.22
29 0.22
30 0.16
31 0.12
32 0.13
33 0.16
34 0.2
35 0.17
36 0.17
37 0.19
38 0.26
39 0.3
40 0.3
41 0.31
42 0.28
43 0.3
44 0.3
45 0.28
46 0.22
47 0.18
48 0.18
49 0.14
50 0.15
51 0.13
52 0.13
53 0.16
54 0.15
55 0.16
56 0.15
57 0.14
58 0.21
59 0.22
60 0.23
61 0.21
62 0.26
63 0.26
64 0.26
65 0.29
66 0.24
67 0.26
68 0.26
69 0.24
70 0.2
71 0.21
72 0.2
73 0.16
74 0.16
75 0.13
76 0.16
77 0.18
78 0.17
79 0.16
80 0.16
81 0.16
82 0.13
83 0.14
84 0.16
85 0.23
86 0.25
87 0.32
88 0.38
89 0.48
90 0.54
91 0.58
92 0.59
93 0.59
94 0.63
95 0.64
96 0.59
97 0.54
98 0.5
99 0.44
100 0.39
101 0.31
102 0.24
103 0.18
104 0.18
105 0.15
106 0.16
107 0.17
108 0.2
109 0.25
110 0.26
111 0.26
112 0.27
113 0.3
114 0.31
115 0.36
116 0.36
117 0.35
118 0.34
119 0.35
120 0.35
121 0.29
122 0.26
123 0.22
124 0.25
125 0.22
126 0.24
127 0.27
128 0.25
129 0.29
130 0.32
131 0.33
132 0.3
133 0.31
134 0.33
135 0.36
136 0.44
137 0.46
138 0.49
139 0.58
140 0.62
141 0.7
142 0.76
143 0.77
144 0.8
145 0.85
146 0.88
147 0.89
148 0.89
149 0.89
150 0.89
151 0.88
152 0.84
153 0.81
154 0.76
155 0.68
156 0.61
157 0.52
158 0.42
159 0.33
160 0.26
161 0.2
162 0.15
163 0.13
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.03
183 0.03
184 0.02
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.08
193 0.09
194 0.14
195 0.15
196 0.22
197 0.21
198 0.23
199 0.24
200 0.23
201 0.22
202 0.17
203 0.16
204 0.1
205 0.08
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.13
227 0.17
228 0.24
229 0.27
230 0.32
231 0.31
232 0.3
233 0.29
234 0.28
235 0.24
236 0.16
237 0.13
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.04
248 0.03
249 0.03
250 0.04
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.05
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.1
283 0.12
284 0.2
285 0.26
286 0.35
287 0.37
288 0.38
289 0.41
290 0.39
291 0.36
292 0.3
293 0.28
294 0.22
295 0.22
296 0.2
297 0.19
298 0.19
299 0.2
300 0.18
301 0.14
302 0.12
303 0.09
304 0.16
305 0.17
306 0.19
307 0.2
308 0.25
309 0.28
310 0.29
311 0.33
312 0.31
313 0.32
314 0.33
315 0.35
316 0.31
317 0.28
318 0.28
319 0.29
320 0.27
321 0.32
322 0.38
323 0.39
324 0.41
325 0.41
326 0.38
327 0.36
328 0.38
329 0.32
330 0.28
331 0.24
332 0.23
333 0.25
334 0.25
335 0.24
336 0.2
337 0.23
338 0.19
339 0.25
340 0.26
341 0.27
342 0.27
343 0.28
344 0.27
345 0.29
346 0.27
347 0.21
348 0.18
349 0.15
350 0.15
351 0.13
352 0.12
353 0.07
354 0.1
355 0.12
356 0.14
357 0.13
358 0.13
359 0.15
360 0.17
361 0.19
362 0.19
363 0.16
364 0.15
365 0.16
366 0.16
367 0.15
368 0.13
369 0.16
370 0.19
371 0.26
372 0.32
373 0.4
374 0.44
375 0.46
376 0.54
377 0.58
378 0.63
379 0.62
380 0.63
381 0.65
382 0.71
383 0.74
384 0.7
385 0.66
386 0.59
387 0.62
388 0.64
389 0.64
390 0.62
391 0.6
392 0.58
393 0.58
394 0.56
395 0.45
396 0.4
397 0.32
398 0.23
399 0.21
400 0.19
401 0.14
402 0.13
403 0.15
404 0.12