Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1R3RD29

Protein Details
Accession A0A1R3RD29    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
353-373ASPPQQPRPPAVRKRPAPSLFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
362-381PAVRKRPAPSLFIQPKKKKV
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 6, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPPPSLLQLCTATAIRNVKLLNDIGNMPYTLARPFLLKVESPEKLRSLEMNSPHLMRDDEELWLEFIKRDIPRWEEYDLPERPDCWYDVYCDLREQVQRAVDEDAEKLKLALDGISSEREKHSAKLVTDRRIIGLPRERPTAKQRYASFDRRMGGIAPVFSSSKSGIGSSDPMGSPAWTFGRPQAPRQTQKKNSIFTATRRNTVLTVPTKHLNDRATQVRQAPRSLIEEHRRPAEPAVPRRQGPPALRAPGRSQSQVSIGFASQNNPTINPTLREREARLRAMTSGRSTNPQAHPPGASSRAVRNAPAPPPPRDPSESVSKGPRSHPKVQASDSRDSSATSPQLKSGVADMPASPPQQPRPPAVRKRPAPSLFIQPKKKKVN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.25
3 0.27
4 0.26
5 0.24
6 0.28
7 0.27
8 0.24
9 0.22
10 0.23
11 0.2
12 0.22
13 0.2
14 0.17
15 0.18
16 0.16
17 0.14
18 0.14
19 0.13
20 0.13
21 0.15
22 0.18
23 0.19
24 0.19
25 0.24
26 0.3
27 0.34
28 0.36
29 0.38
30 0.36
31 0.35
32 0.35
33 0.33
34 0.32
35 0.34
36 0.35
37 0.37
38 0.37
39 0.36
40 0.35
41 0.34
42 0.28
43 0.23
44 0.22
45 0.18
46 0.17
47 0.17
48 0.17
49 0.16
50 0.16
51 0.16
52 0.12
53 0.12
54 0.16
55 0.16
56 0.2
57 0.25
58 0.28
59 0.32
60 0.35
61 0.37
62 0.34
63 0.37
64 0.42
65 0.38
66 0.38
67 0.35
68 0.32
69 0.32
70 0.3
71 0.27
72 0.23
73 0.22
74 0.2
75 0.25
76 0.28
77 0.27
78 0.26
79 0.26
80 0.26
81 0.28
82 0.27
83 0.25
84 0.24
85 0.24
86 0.24
87 0.25
88 0.21
89 0.2
90 0.19
91 0.17
92 0.14
93 0.14
94 0.12
95 0.11
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.07
100 0.08
101 0.09
102 0.13
103 0.12
104 0.13
105 0.14
106 0.17
107 0.18
108 0.18
109 0.23
110 0.24
111 0.25
112 0.34
113 0.4
114 0.42
115 0.45
116 0.44
117 0.39
118 0.37
119 0.36
120 0.33
121 0.35
122 0.35
123 0.34
124 0.4
125 0.39
126 0.41
127 0.49
128 0.52
129 0.48
130 0.49
131 0.48
132 0.51
133 0.58
134 0.61
135 0.57
136 0.51
137 0.47
138 0.41
139 0.39
140 0.31
141 0.25
142 0.19
143 0.14
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.1
148 0.11
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.12
168 0.2
169 0.21
170 0.25
171 0.33
172 0.39
173 0.47
174 0.54
175 0.61
176 0.6
177 0.69
178 0.71
179 0.64
180 0.58
181 0.56
182 0.51
183 0.45
184 0.49
185 0.4
186 0.37
187 0.35
188 0.34
189 0.29
190 0.27
191 0.29
192 0.24
193 0.25
194 0.25
195 0.28
196 0.28
197 0.28
198 0.32
199 0.26
200 0.23
201 0.25
202 0.29
203 0.28
204 0.29
205 0.34
206 0.36
207 0.36
208 0.36
209 0.32
210 0.27
211 0.28
212 0.29
213 0.3
214 0.32
215 0.35
216 0.36
217 0.38
218 0.37
219 0.35
220 0.33
221 0.32
222 0.33
223 0.36
224 0.43
225 0.44
226 0.44
227 0.45
228 0.47
229 0.47
230 0.42
231 0.41
232 0.38
233 0.4
234 0.4
235 0.4
236 0.4
237 0.41
238 0.42
239 0.37
240 0.31
241 0.26
242 0.29
243 0.28
244 0.25
245 0.19
246 0.17
247 0.18
248 0.17
249 0.18
250 0.15
251 0.18
252 0.18
253 0.17
254 0.18
255 0.19
256 0.2
257 0.21
258 0.24
259 0.25
260 0.28
261 0.3
262 0.33
263 0.39
264 0.43
265 0.44
266 0.42
267 0.38
268 0.37
269 0.37
270 0.36
271 0.31
272 0.29
273 0.27
274 0.29
275 0.3
276 0.36
277 0.36
278 0.39
279 0.39
280 0.36
281 0.35
282 0.33
283 0.36
284 0.31
285 0.3
286 0.26
287 0.27
288 0.33
289 0.33
290 0.32
291 0.31
292 0.33
293 0.34
294 0.41
295 0.42
296 0.4
297 0.46
298 0.48
299 0.5
300 0.49
301 0.49
302 0.44
303 0.5
304 0.48
305 0.45
306 0.49
307 0.49
308 0.48
309 0.52
310 0.57
311 0.55
312 0.6
313 0.65
314 0.66
315 0.68
316 0.7
317 0.71
318 0.67
319 0.67
320 0.6
321 0.54
322 0.46
323 0.41
324 0.37
325 0.35
326 0.35
327 0.32
328 0.3
329 0.29
330 0.31
331 0.3
332 0.29
333 0.25
334 0.23
335 0.19
336 0.19
337 0.18
338 0.21
339 0.24
340 0.25
341 0.26
342 0.27
343 0.33
344 0.4
345 0.43
346 0.46
347 0.52
348 0.61
349 0.69
350 0.74
351 0.78
352 0.78
353 0.82
354 0.85
355 0.79
356 0.74
357 0.68
358 0.68
359 0.68
360 0.69
361 0.72
362 0.71