Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1R3RTF3

Protein Details
Accession A0A1R3RTF3    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-50VTGKQAKSGKRGKPPHRPGRLRSSGVBasic
81-119VISTPTSSKRKRKADEQTVAPSASTKKPRRSHPNDLTSSHydrophilic
146-165EPTPERRARRFRSHPPKSYLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-46QAKSGKRGKPPHRPGRLR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04434  SWIM  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50966  ZF_SWIM  
CDD cd16494  RING-CH-C4HC3_ZSWM2  
Amino Acid Sequences MRGCDGELDPSWTRRHSVVISAALVTGKQAKSGKRGKPPHRPGRLRSSGVNMGVSRTAPSRQEYASPSTPTRTRVPHPKTVISTPTSSKRKRKADEQTVAPSASTKKPRRSHPNDLTSSAVGVVDLTGDTPSPPKKRVQAQTPTDEPTPERRARRFRSHPPKSYLERAARALTQRMFVVGHTVTDADDAPKMCFDIVGTTGNIYKTTIGKVPTCSCPDAQKGNQCKHICYVLVKALRAPRHLQYQLAFLSSELREMYHDSAISRQPGTDENKDGNRKPVEGDCPICFMEFEPDKEEIVWCRAACGNNIHQTCFRKWAATQQAQGVRCVYCRSPWQADTSNLTLDKLVKEGTVSADGYLNVAEQVGLSGARGMKPTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.33
3 0.28
4 0.31
5 0.33
6 0.34
7 0.33
8 0.31
9 0.3
10 0.25
11 0.23
12 0.18
13 0.2
14 0.16
15 0.2
16 0.25
17 0.28
18 0.37
19 0.47
20 0.54
21 0.58
22 0.68
23 0.73
24 0.79
25 0.87
26 0.88
27 0.9
28 0.9
29 0.86
30 0.86
31 0.85
32 0.78
33 0.7
34 0.67
35 0.61
36 0.55
37 0.52
38 0.41
39 0.34
40 0.32
41 0.28
42 0.22
43 0.19
44 0.2
45 0.19
46 0.22
47 0.23
48 0.23
49 0.28
50 0.3
51 0.35
52 0.37
53 0.39
54 0.38
55 0.4
56 0.41
57 0.4
58 0.42
59 0.41
60 0.43
61 0.49
62 0.54
63 0.58
64 0.61
65 0.63
66 0.62
67 0.61
68 0.59
69 0.51
70 0.48
71 0.44
72 0.48
73 0.51
74 0.55
75 0.59
76 0.64
77 0.71
78 0.73
79 0.78
80 0.79
81 0.81
82 0.8
83 0.77
84 0.74
85 0.67
86 0.61
87 0.51
88 0.42
89 0.34
90 0.34
91 0.37
92 0.38
93 0.45
94 0.52
95 0.62
96 0.71
97 0.76
98 0.8
99 0.8
100 0.83
101 0.77
102 0.73
103 0.66
104 0.54
105 0.45
106 0.34
107 0.24
108 0.14
109 0.1
110 0.07
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.03
115 0.04
116 0.04
117 0.08
118 0.14
119 0.17
120 0.2
121 0.23
122 0.3
123 0.39
124 0.46
125 0.52
126 0.56
127 0.59
128 0.63
129 0.62
130 0.59
131 0.5
132 0.44
133 0.36
134 0.34
135 0.35
136 0.35
137 0.38
138 0.41
139 0.5
140 0.57
141 0.65
142 0.66
143 0.7
144 0.75
145 0.79
146 0.8
147 0.77
148 0.76
149 0.71
150 0.69
151 0.65
152 0.59
153 0.52
154 0.46
155 0.41
156 0.36
157 0.33
158 0.3
159 0.23
160 0.2
161 0.17
162 0.15
163 0.14
164 0.12
165 0.13
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.05
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.06
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.1
194 0.12
195 0.13
196 0.14
197 0.18
198 0.21
199 0.24
200 0.26
201 0.26
202 0.24
203 0.26
204 0.28
205 0.31
206 0.32
207 0.36
208 0.41
209 0.43
210 0.51
211 0.48
212 0.46
213 0.42
214 0.4
215 0.33
216 0.27
217 0.26
218 0.24
219 0.26
220 0.24
221 0.25
222 0.28
223 0.29
224 0.3
225 0.3
226 0.27
227 0.33
228 0.34
229 0.33
230 0.28
231 0.3
232 0.28
233 0.25
234 0.22
235 0.14
236 0.17
237 0.15
238 0.15
239 0.11
240 0.1
241 0.1
242 0.13
243 0.15
244 0.12
245 0.13
246 0.12
247 0.15
248 0.18
249 0.19
250 0.17
251 0.15
252 0.15
253 0.2
254 0.26
255 0.27
256 0.28
257 0.3
258 0.37
259 0.43
260 0.43
261 0.46
262 0.42
263 0.38
264 0.38
265 0.39
266 0.37
267 0.36
268 0.38
269 0.31
270 0.32
271 0.32
272 0.29
273 0.24
274 0.19
275 0.22
276 0.21
277 0.22
278 0.22
279 0.23
280 0.23
281 0.23
282 0.24
283 0.18
284 0.19
285 0.21
286 0.17
287 0.18
288 0.21
289 0.22
290 0.23
291 0.27
292 0.3
293 0.35
294 0.37
295 0.37
296 0.4
297 0.43
298 0.43
299 0.45
300 0.39
301 0.34
302 0.33
303 0.41
304 0.46
305 0.47
306 0.48
307 0.49
308 0.55
309 0.52
310 0.53
311 0.45
312 0.36
313 0.31
314 0.32
315 0.25
316 0.23
317 0.29
318 0.35
319 0.39
320 0.4
321 0.45
322 0.47
323 0.49
324 0.51
325 0.47
326 0.44
327 0.38
328 0.36
329 0.31
330 0.28
331 0.25
332 0.2
333 0.19
334 0.14
335 0.14
336 0.15
337 0.16
338 0.17
339 0.17
340 0.16
341 0.17
342 0.17
343 0.17
344 0.15
345 0.12
346 0.08
347 0.08
348 0.07
349 0.05
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.05
354 0.09
355 0.11
356 0.12