FuNGI

A0A1R3RCK9

Protein Details

Accession

A0A1R3RCK9

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
331-350	GTPIRRKKRKGALTNPSAYS	Hydrophilic
444-467	KTSAQAKRKGAKAKRGKNGNEAIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
335-340	RRKKRK
449-461	AKRKGAKAKRGKN

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 7, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPRKQWIDKKQATTYQLFHRAQNDPLIHDPSADDRVLAPVSGPAPTPSNASASTSQHRGLNLADLNQSFGAAAIRRNEGEAANYGIYYDDSKYDYMQHLRELGMGAGDAHFVEAKTKGKEKSKGLKLEDALRQVSLDDGRSEFGGAESVYSHDMRSTASSYVRQSTYQDQQNIPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEEYVDENDDEDVFGKLTTRAEEMDQGDWEDTLFDDVEEEDDGWESDATEKAPVQMNTTDAKARYQDAEQPDGELPVHDEPAPDMHPEDQGWMREFAKFKKDAKGKPIAPAAPASVVPSEQQSTLASTVFTVGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSALARTEGHRLLDDRFERVEALYSLDEEDEFDDSMSMVSGMTGMTNMTGMTGISTASSQAPSLVDANGEAVRPSHNFNNVMDDFLAGWDDKTSAQAKRKGAKAKRGKNGNEAIGIRMLDEVRQGLGPARLTGKVSGRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.66
3	0.64
4	0.66
5	0.59
6	0.55
7	0.54
8	0.51
9	0.49
10	0.51
11	0.44
12	0.38
13	0.41
14	0.42
15	0.36
16	0.33
17	0.31
18	0.27
19	0.3
20	0.25
21	0.2
22	0.16
23	0.19
24	0.19
25	0.18
26	0.14
27	0.13
28	0.13
29	0.14
30	0.14
31	0.13
32	0.15
33	0.16
34	0.19
35	0.17
36	0.2
37	0.2
38	0.23
39	0.26
40	0.28
41	0.32
42	0.32
43	0.33
44	0.33
45	0.32
46	0.29
47	0.26
48	0.28
49	0.24
50	0.23
51	0.25
52	0.23
53	0.25
54	0.23
55	0.22
56	0.15
57	0.13
58	0.13
59	0.11
60	0.14
61	0.15
62	0.17
63	0.18
64	0.19
65	0.2
66	0.18
67	0.19
68	0.18
69	0.18
70	0.16
71	0.15
72	0.14
73	0.13
74	0.13
75	0.12
76	0.11
77	0.1
78	0.11
79	0.12
80	0.13
81	0.16
82	0.2
83	0.24
84	0.24
85	0.24
86	0.25
87	0.24
88	0.24
89	0.22
90	0.17
91	0.12
92	0.1
93	0.09
94	0.07
95	0.07
96	0.06
97	0.05
98	0.06
99	0.06
100	0.07
101	0.1
102	0.14
103	0.18
104	0.23
105	0.29
106	0.37
107	0.44
108	0.51
109	0.59
110	0.64
111	0.68
112	0.67
113	0.67
114	0.61
115	0.62
116	0.57
117	0.51
118	0.43
119	0.34
120	0.3
121	0.24
122	0.24
123	0.17
124	0.14
125	0.11
126	0.11
127	0.11
128	0.11
129	0.11
130	0.09
131	0.08
132	0.08
133	0.07
134	0.06
135	0.06
136	0.07
137	0.09
138	0.09
139	0.09
140	0.08
141	0.08
142	0.09
143	0.11
144	0.12
145	0.12
146	0.14
147	0.17
148	0.19
149	0.23
150	0.23
151	0.22
152	0.23
153	0.27
154	0.32
155	0.35
156	0.37
157	0.34
158	0.35
159	0.39
160	0.36
161	0.31
162	0.24
163	0.18
164	0.15
165	0.14
166	0.13
167	0.07
168	0.07
169	0.07
170	0.07
171	0.08
172	0.09
173	0.09
174	0.09
175	0.13
176	0.13
177	0.13
178	0.13
179	0.12
180	0.12
181	0.12
182	0.11
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.07
187	0.06
188	0.05
189	0.05
190	0.04
191	0.04
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.06
201	0.07
202	0.08
203	0.08
204	0.08
205	0.09
206	0.13
207	0.13
208	0.13
209	0.13
210	0.12
211	0.12
212	0.11
213	0.1
214	0.06
215	0.05
216	0.05
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.05
223	0.05
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.06
234	0.06
235	0.07
236	0.11
237	0.11
238	0.13
239	0.13
240	0.15
241	0.15
242	0.17
243	0.17
244	0.13
245	0.14
246	0.13
247	0.13
248	0.13
249	0.13
250	0.17
251	0.18
252	0.21
253	0.2
254	0.21
255	0.2
256	0.19
257	0.18
258	0.13
259	0.12
260	0.09
261	0.1
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.1
266	0.11
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.1
271	0.1
272	0.12
273	0.12
274	0.13
275	0.14
276	0.15
277	0.15
278	0.17
279	0.19
280	0.2
281	0.25
282	0.28
283	0.29
284	0.36
285	0.43
286	0.44
287	0.49
288	0.56
289	0.51
290	0.52
291	0.55
292	0.46
293	0.4
294	0.37
295	0.3
296	0.22
297	0.2
298	0.16
299	0.11
300	0.1
301	0.09
302	0.1
303	0.1
304	0.09
305	0.1
306	0.09
307	0.11
308	0.11
309	0.11
310	0.09
311	0.08
312	0.09
313	0.08
314	0.07
315	0.06
316	0.06
317	0.09
318	0.12
319	0.18
320	0.25
321	0.36
322	0.43
323	0.47
324	0.56
325	0.63
326	0.71
327	0.75
328	0.78
329	0.78
330	0.79
331	0.81
332	0.72
333	0.64
334	0.54
335	0.43
336	0.34
337	0.25
338	0.17
339	0.13
340	0.12
341	0.1
342	0.11
343	0.12
344	0.11
345	0.12
346	0.17
347	0.16
348	0.17
349	0.18
350	0.19
351	0.2
352	0.27
353	0.26
354	0.24
355	0.23
356	0.23
357	0.22
358	0.21
359	0.21
360	0.14
361	0.15
362	0.13
363	0.12
364	0.12
365	0.12
366	0.11
367	0.09
368	0.1
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.06
376	0.05
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.06
396	0.07
397	0.08
398	0.08
399	0.09
400	0.09
401	0.1
402	0.12
403	0.11
404	0.09
405	0.09
406	0.11
407	0.11
408	0.11
409	0.1
410	0.09
411	0.11
412	0.13
413	0.17
414	0.2
415	0.25
416	0.27
417	0.27
418	0.36
419	0.33
420	0.34
421	0.3
422	0.25
423	0.2
424	0.18
425	0.19
426	0.1
427	0.1
428	0.08
429	0.09
430	0.08
431	0.12
432	0.17
433	0.22
434	0.3
435	0.37
436	0.45
437	0.52
438	0.59
439	0.66
440	0.7
441	0.74
442	0.77
443	0.8
444	0.82
445	0.84
446	0.82
447	0.81
448	0.8
449	0.74
450	0.7
451	0.61
452	0.53
453	0.46
454	0.4
455	0.31
456	0.26
457	0.22
458	0.15
459	0.16
460	0.14
461	0.12
462	0.13
463	0.13
464	0.14
465	0.18
466	0.19
467	0.19
468	0.22
469	0.22
470	0.24
471	0.29

A0A1R3RCK9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer