Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1R3RV79

Protein Details
Accession A0A1R3RV79    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-56AEAEKSKGRAVKRRRTQPKPQSQSDLHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-45KSKGRAVKRRRT
80-86RGKAKAK
176-177RR
279-290KKNAEKGKKSGK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MTTRKRNDFLDIAASDDSDANDHGYDSEAAEAEKSKGRAVKRRRTQPKPQSQSDLHGLNSESDDEGASDESEDERVFKGRGKAKAKAKTTVDSNDEAEDEKQLSDEDNYLDATEATKIINTNKPPKKNKTGVVYLSSLPPYLKPFALKALLEKRSFGPITRVFLSPEVRSASAPRRRSNKRKTYSDGWVEFASKKTAKVCAETLNANIIGGRKGGWYHDDVWNMKYLRGFKWADLTEQIQRERSEREARQRVEDSKARKEDKVFLEGYERGKVIEGIQKKNAEKGKKSGKDEQKIRMVFKQSEVKQGRDKIADPGAMGDETKRVLGKIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.23
3 0.21
4 0.18
5 0.11
6 0.12
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.09
11 0.11
12 0.11
13 0.1
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.11
18 0.12
19 0.13
20 0.17
21 0.17
22 0.2
23 0.24
24 0.31
25 0.4
26 0.49
27 0.58
28 0.64
29 0.74
30 0.81
31 0.85
32 0.9
33 0.91
34 0.92
35 0.9
36 0.86
37 0.83
38 0.75
39 0.71
40 0.66
41 0.58
42 0.47
43 0.4
44 0.35
45 0.27
46 0.26
47 0.21
48 0.15
49 0.12
50 0.11
51 0.09
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.11
63 0.11
64 0.15
65 0.22
66 0.28
67 0.37
68 0.42
69 0.49
70 0.56
71 0.65
72 0.65
73 0.65
74 0.62
75 0.57
76 0.56
77 0.54
78 0.48
79 0.41
80 0.39
81 0.31
82 0.28
83 0.25
84 0.2
85 0.16
86 0.13
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.11
106 0.16
107 0.21
108 0.31
109 0.37
110 0.47
111 0.55
112 0.62
113 0.67
114 0.69
115 0.7
116 0.66
117 0.66
118 0.6
119 0.55
120 0.49
121 0.41
122 0.36
123 0.3
124 0.23
125 0.16
126 0.14
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.15
133 0.17
134 0.16
135 0.19
136 0.25
137 0.29
138 0.29
139 0.29
140 0.27
141 0.29
142 0.29
143 0.25
144 0.24
145 0.21
146 0.24
147 0.25
148 0.25
149 0.21
150 0.23
151 0.25
152 0.18
153 0.18
154 0.16
155 0.15
156 0.14
157 0.16
158 0.23
159 0.28
160 0.33
161 0.36
162 0.43
163 0.52
164 0.62
165 0.7
166 0.72
167 0.73
168 0.76
169 0.77
170 0.74
171 0.73
172 0.7
173 0.61
174 0.52
175 0.44
176 0.39
177 0.33
178 0.28
179 0.25
180 0.18
181 0.18
182 0.17
183 0.22
184 0.21
185 0.23
186 0.24
187 0.24
188 0.26
189 0.25
190 0.24
191 0.21
192 0.2
193 0.17
194 0.15
195 0.12
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.1
203 0.12
204 0.14
205 0.19
206 0.23
207 0.24
208 0.24
209 0.29
210 0.28
211 0.26
212 0.26
213 0.24
214 0.22
215 0.27
216 0.28
217 0.22
218 0.3
219 0.29
220 0.28
221 0.28
222 0.29
223 0.28
224 0.31
225 0.32
226 0.28
227 0.28
228 0.29
229 0.29
230 0.32
231 0.36
232 0.37
233 0.46
234 0.52
235 0.53
236 0.58
237 0.6
238 0.57
239 0.56
240 0.56
241 0.51
242 0.52
243 0.58
244 0.55
245 0.53
246 0.53
247 0.54
248 0.52
249 0.52
250 0.43
251 0.35
252 0.37
253 0.37
254 0.37
255 0.31
256 0.27
257 0.21
258 0.21
259 0.21
260 0.19
261 0.22
262 0.26
263 0.28
264 0.35
265 0.41
266 0.41
267 0.48
268 0.52
269 0.53
270 0.52
271 0.56
272 0.61
273 0.63
274 0.69
275 0.72
276 0.76
277 0.78
278 0.8
279 0.79
280 0.77
281 0.73
282 0.71
283 0.67
284 0.64
285 0.56
286 0.56
287 0.57
288 0.5
289 0.57
290 0.56
291 0.55
292 0.56
293 0.6
294 0.59
295 0.53
296 0.52
297 0.48
298 0.49
299 0.45
300 0.37
301 0.33
302 0.29
303 0.25
304 0.24
305 0.18
306 0.15
307 0.15
308 0.16
309 0.15