Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1R3RZC0

Protein Details
Accession A0A1R3RZC0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-99KTTTRKTKARTTERRKKDPNABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-102KEKTTTRKTKARTTERRKKDPNAPKR
Subcellular Location(s) mito 20, mito_nucl 13.333, cyto_mito 11.333, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01390  HMG-box_NHP6-like  
Amino Acid Sequences MARLPVFPRSSPTTTALPLSLSHSLSTYSHYASSHTILSPIQKSTAYTALVEFADLKSSISVFFLRGSSDHLNKMPKEKTTTRKTKARTTERRKKDPNAPKRGLSAYMFFANENREKVREENPGISFGQVGKMLGERWKALSDEDRRPYEEKAAADKKRYEDEKASYNAAAEEDEESS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.31
4 0.25
5 0.22
6 0.23
7 0.22
8 0.2
9 0.18
10 0.17
11 0.18
12 0.17
13 0.2
14 0.18
15 0.15
16 0.16
17 0.16
18 0.17
19 0.18
20 0.2
21 0.18
22 0.16
23 0.15
24 0.15
25 0.19
26 0.2
27 0.18
28 0.18
29 0.17
30 0.17
31 0.19
32 0.22
33 0.18
34 0.16
35 0.15
36 0.15
37 0.15
38 0.14
39 0.12
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.14
55 0.16
56 0.18
57 0.19
58 0.21
59 0.25
60 0.26
61 0.32
62 0.29
63 0.28
64 0.32
65 0.37
66 0.43
67 0.49
68 0.58
69 0.58
70 0.63
71 0.64
72 0.66
73 0.69
74 0.71
75 0.72
76 0.73
77 0.77
78 0.79
79 0.84
80 0.82
81 0.78
82 0.77
83 0.77
84 0.77
85 0.77
86 0.71
87 0.63
88 0.61
89 0.56
90 0.48
91 0.39
92 0.31
93 0.23
94 0.21
95 0.2
96 0.16
97 0.16
98 0.17
99 0.18
100 0.18
101 0.17
102 0.17
103 0.19
104 0.21
105 0.26
106 0.3
107 0.3
108 0.33
109 0.33
110 0.34
111 0.32
112 0.3
113 0.25
114 0.17
115 0.17
116 0.12
117 0.11
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.13
122 0.15
123 0.14
124 0.15
125 0.17
126 0.17
127 0.19
128 0.26
129 0.29
130 0.36
131 0.42
132 0.43
133 0.45
134 0.46
135 0.46
136 0.44
137 0.42
138 0.36
139 0.39
140 0.45
141 0.47
142 0.51
143 0.53
144 0.51
145 0.55
146 0.56
147 0.52
148 0.5
149 0.5
150 0.51
151 0.5
152 0.49
153 0.4
154 0.38
155 0.32
156 0.26
157 0.21
158 0.15