Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1R3R9Y4

Protein Details
Accession A0A1R3R9Y4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
182-208RKQSSDSKSEKKKMKRFRLTHNQTRFLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-196KKKMK
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047152  Caudal_homeobox  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001356  Homeobox_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MSISGPCVWLSSLSPPSTSHLPALANHWSTASWNSEQASSRSRALPARLPGSWEREGEPAKTPAAEMQPPVLKAENAFTTVAPAGASSPAQRSTASTSFNNPENRHAHTEGDISRVKLEKFNHSEFHLPRPQGTASPRATKETTPEPKEREAIEQQEKEKDNGDAEMASSDDGAESSVGGDRKQSSDSKSEKKKMKRFRLTHNQTRFLMSEFTRQAHPDAAHRERLSKEIPGLTPRQVQVWFQNRRAKLKRLTSNDRERILKSRALPDDFDTTQVLRTPFDHKTPAEAPMLLTDGLPRLNDDDYVISPLSSASTTNGFSAAADRHFESYAQPGAIPGRGGPALSDLHRNNRSAFPFPRSSSFSESSYNSGLHFPGRFSRPGVEPLGHPGMTYARRPVDYALGRPANGMVVGYDHQRALEGSVSPTGPPDQSIQYNVDSHNQQIPNYHSSLAMPAPKGYGGMEINSHIQQHGRQIPALQSVPVSDAPDYRPYSYDHHPYSMNHAMPYSQPNASSMSLPASFPSDTNSVSQGSVGTSAEDRMNHPPQLLDPLRAKYGSQTFEYANYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.31
4 0.34
5 0.34
6 0.28
7 0.25
8 0.26
9 0.26
10 0.3
11 0.33
12 0.3
13 0.28
14 0.27
15 0.23
16 0.24
17 0.26
18 0.26
19 0.2
20 0.22
21 0.23
22 0.26
23 0.29
24 0.3
25 0.33
26 0.32
27 0.34
28 0.33
29 0.36
30 0.37
31 0.39
32 0.43
33 0.44
34 0.45
35 0.42
36 0.45
37 0.46
38 0.48
39 0.46
40 0.41
41 0.36
42 0.37
43 0.39
44 0.36
45 0.36
46 0.32
47 0.29
48 0.28
49 0.26
50 0.24
51 0.27
52 0.27
53 0.23
54 0.27
55 0.3
56 0.3
57 0.32
58 0.29
59 0.23
60 0.22
61 0.25
62 0.21
63 0.19
64 0.19
65 0.17
66 0.18
67 0.18
68 0.17
69 0.12
70 0.1
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.1
75 0.13
76 0.14
77 0.15
78 0.16
79 0.17
80 0.23
81 0.27
82 0.29
83 0.27
84 0.31
85 0.34
86 0.4
87 0.45
88 0.4
89 0.43
90 0.42
91 0.46
92 0.47
93 0.45
94 0.4
95 0.35
96 0.39
97 0.33
98 0.35
99 0.31
100 0.26
101 0.27
102 0.29
103 0.27
104 0.27
105 0.29
106 0.33
107 0.38
108 0.42
109 0.41
110 0.41
111 0.48
112 0.44
113 0.5
114 0.47
115 0.41
116 0.38
117 0.39
118 0.37
119 0.34
120 0.35
121 0.35
122 0.33
123 0.4
124 0.41
125 0.42
126 0.43
127 0.39
128 0.4
129 0.42
130 0.47
131 0.45
132 0.5
133 0.49
134 0.51
135 0.53
136 0.5
137 0.46
138 0.42
139 0.44
140 0.46
141 0.46
142 0.45
143 0.49
144 0.49
145 0.44
146 0.4
147 0.33
148 0.25
149 0.21
150 0.2
151 0.12
152 0.11
153 0.1
154 0.09
155 0.07
156 0.06
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.03
163 0.04
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.1
168 0.11
169 0.13
170 0.16
171 0.18
172 0.19
173 0.27
174 0.34
175 0.42
176 0.5
177 0.57
178 0.62
179 0.7
180 0.76
181 0.78
182 0.82
183 0.84
184 0.8
185 0.83
186 0.86
187 0.85
188 0.86
189 0.83
190 0.78
191 0.68
192 0.64
193 0.54
194 0.44
195 0.39
196 0.3
197 0.28
198 0.24
199 0.25
200 0.23
201 0.23
202 0.23
203 0.22
204 0.22
205 0.2
206 0.26
207 0.28
208 0.32
209 0.32
210 0.34
211 0.32
212 0.34
213 0.31
214 0.24
215 0.24
216 0.21
217 0.22
218 0.22
219 0.24
220 0.23
221 0.25
222 0.24
223 0.24
224 0.21
225 0.21
226 0.26
227 0.33
228 0.36
229 0.39
230 0.46
231 0.46
232 0.54
233 0.58
234 0.57
235 0.55
236 0.59
237 0.61
238 0.63
239 0.69
240 0.69
241 0.74
242 0.73
243 0.68
244 0.61
245 0.54
246 0.52
247 0.46
248 0.41
249 0.33
250 0.34
251 0.34
252 0.34
253 0.33
254 0.29
255 0.31
256 0.27
257 0.26
258 0.2
259 0.16
260 0.15
261 0.17
262 0.15
263 0.1
264 0.12
265 0.15
266 0.16
267 0.18
268 0.21
269 0.18
270 0.23
271 0.23
272 0.25
273 0.21
274 0.19
275 0.17
276 0.14
277 0.15
278 0.11
279 0.09
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.1
292 0.1
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.07
305 0.07
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.1
315 0.12
316 0.13
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.1
331 0.17
332 0.16
333 0.24
334 0.27
335 0.28
336 0.28
337 0.32
338 0.34
339 0.34
340 0.36
341 0.33
342 0.36
343 0.37
344 0.38
345 0.37
346 0.38
347 0.38
348 0.37
349 0.33
350 0.31
351 0.31
352 0.29
353 0.27
354 0.24
355 0.18
356 0.17
357 0.15
358 0.15
359 0.14
360 0.12
361 0.17
362 0.19
363 0.2
364 0.2
365 0.23
366 0.23
367 0.26
368 0.28
369 0.23
370 0.2
371 0.25
372 0.27
373 0.24
374 0.21
375 0.18
376 0.2
377 0.22
378 0.23
379 0.21
380 0.2
381 0.21
382 0.22
383 0.22
384 0.26
385 0.26
386 0.27
387 0.3
388 0.29
389 0.29
390 0.28
391 0.27
392 0.19
393 0.17
394 0.14
395 0.06
396 0.07
397 0.08
398 0.09
399 0.1
400 0.1
401 0.09
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.11
406 0.1
407 0.11
408 0.13
409 0.13
410 0.13
411 0.14
412 0.14
413 0.12
414 0.12
415 0.14
416 0.15
417 0.16
418 0.19
419 0.2
420 0.21
421 0.23
422 0.23
423 0.25
424 0.23
425 0.24
426 0.29
427 0.27
428 0.26
429 0.28
430 0.32
431 0.31
432 0.31
433 0.3
434 0.22
435 0.21
436 0.24
437 0.22
438 0.22
439 0.18
440 0.17
441 0.18
442 0.17
443 0.17
444 0.15
445 0.16
446 0.12
447 0.13
448 0.13
449 0.14
450 0.17
451 0.18
452 0.18
453 0.14
454 0.15
455 0.16
456 0.23
457 0.28
458 0.27
459 0.26
460 0.28
461 0.31
462 0.35
463 0.34
464 0.26
465 0.2
466 0.19
467 0.21
468 0.2
469 0.19
470 0.14
471 0.15
472 0.18
473 0.25
474 0.27
475 0.26
476 0.26
477 0.27
478 0.32
479 0.36
480 0.43
481 0.38
482 0.39
483 0.4
484 0.4
485 0.45
486 0.47
487 0.42
488 0.34
489 0.31
490 0.29
491 0.3
492 0.33
493 0.29
494 0.23
495 0.21
496 0.22
497 0.25
498 0.25
499 0.23
500 0.19
501 0.19
502 0.19
503 0.19
504 0.18
505 0.18
506 0.17
507 0.16
508 0.19
509 0.18
510 0.18
511 0.19
512 0.21
513 0.19
514 0.18
515 0.19
516 0.15
517 0.13
518 0.14
519 0.12
520 0.12
521 0.11
522 0.13
523 0.15
524 0.16
525 0.19
526 0.25
527 0.3
528 0.3
529 0.3
530 0.29
531 0.29
532 0.37
533 0.37
534 0.34
535 0.35
536 0.37
537 0.4
538 0.4
539 0.38
540 0.36
541 0.41
542 0.39
543 0.36
544 0.35
545 0.33