FuNGI

A0A1Q8RRX1

Protein Details

Accession

A0A1Q8RRX1

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-37	SPATNGHKSDKKSKKEKKEKKRLREDDVDAGE	Basic
76-131	NTTAERSSEKKKKSKKDKSRKSLGEAEEDASDAERKEKKEKKKKRKSQHKETEDGL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-30	KSDKKSKKEKKEKKRLRE
38-43	ERKHKR
84-101	EKKKKSKKDKSRKSLGEA
105-123	ASDAERKEKKEKKKKRKSQ
149-152	KSKK
426-442	RRRRAGKSGGVLSKERR

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MGSIDSPATNGHKSDKKSKKEKKEKKRLREDDVDAGEERKHKRSKSIGVAADDADDDSTNDTPAGSQDLSVVASANTTAERSSEKKKKSKKDKSRKSLGEAEEDASDAERKEKKEKKKKRKSQHKETEDGLEDTVVDAAEPASEKTEKKSKKSKAASPEPTAAAADEDAMDVDSPAKSKSTSRAHQPPDAPSKPQFPFFTQTVSLYLPIYPIGWDTPCTAAATQHLEPLVNRYVPDLKGVLLAFRNVALSEQPGRRHAATSDSEHCDLISVDEYAVGFGYVTVDVDLFVPRRGAWMEGSINLENEGHIGVVCWGKFNASIESARLPPEWRWIHAGSAEAAAYVSDPFDDNASTHTAEDEHGAVRQIHTTGFWVDGAGEKVKGRVRFRIKAFDVGVSGDHGYLSLEGTMLDAAGEKAAIERDAQQERRRRAGKSGGVLSKERRRMPDFSVTKFGVVEDEEDKALKQDVWNTTAPAEEAEREEAEQEAYTGIATEEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.55
3	0.61
4	0.71
5	0.8
6	0.83
7	0.88
8	0.93
9	0.93
10	0.95
11	0.96
12	0.95
13	0.96
14	0.94
15	0.92
16	0.9
17	0.85
18	0.83
19	0.76
20	0.68
21	0.57
22	0.49
23	0.43
24	0.4
25	0.38
26	0.38
27	0.41
28	0.41
29	0.49
30	0.56
31	0.63
32	0.66
33	0.71
34	0.68
35	0.65
36	0.64
37	0.55
38	0.47
39	0.37
40	0.27
41	0.18
42	0.13
43	0.1
44	0.1
45	0.1
46	0.09
47	0.09
48	0.09
49	0.08
50	0.09
51	0.13
52	0.11
53	0.1
54	0.11
55	0.11
56	0.12
57	0.12
58	0.11
59	0.07
60	0.07
61	0.07
62	0.07
63	0.06
64	0.06
65	0.07
66	0.07
67	0.12
68	0.16
69	0.26
70	0.34
71	0.43
72	0.52
73	0.62
74	0.72
75	0.8
76	0.87
77	0.88
78	0.91
79	0.93
80	0.94
81	0.95
82	0.91
83	0.86
84	0.84
85	0.76
86	0.71
87	0.61
88	0.53
89	0.42
90	0.35
91	0.28
92	0.2
93	0.18
94	0.11
95	0.16
96	0.18
97	0.21
98	0.32
99	0.4
100	0.5
101	0.6
102	0.72
103	0.77
104	0.84
105	0.91
106	0.93
107	0.96
108	0.95
109	0.96
110	0.96
111	0.92
112	0.86
113	0.78
114	0.73
115	0.65
116	0.55
117	0.44
118	0.32
119	0.24
120	0.19
121	0.16
122	0.09
123	0.05
124	0.04
125	0.04
126	0.04
127	0.05
128	0.05
129	0.07
130	0.1
131	0.11
132	0.16
133	0.25
134	0.3
135	0.37
136	0.47
137	0.53
138	0.61
139	0.69
140	0.71
141	0.72
142	0.78
143	0.78
144	0.72
145	0.68
146	0.58
147	0.51
148	0.43
149	0.33
150	0.23
151	0.15
152	0.1
153	0.06
154	0.05
155	0.05
156	0.05
157	0.04
158	0.04
159	0.05
160	0.05
161	0.05
162	0.06
163	0.07
164	0.07
165	0.09
166	0.18
167	0.26
168	0.29
169	0.38
170	0.46
171	0.5
172	0.55
173	0.56
174	0.55
175	0.56
176	0.54
177	0.49
178	0.42
179	0.45
180	0.41
181	0.43
182	0.38
183	0.31
184	0.34
185	0.31
186	0.32
187	0.25
188	0.25
189	0.22
190	0.2
191	0.18
192	0.13
193	0.13
194	0.1
195	0.09
196	0.08
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.07
202	0.08
203	0.09
204	0.1
205	0.1
206	0.1
207	0.09
208	0.11
209	0.15
210	0.14
211	0.14
212	0.14
213	0.13
214	0.13
215	0.16
216	0.16
217	0.12
218	0.12
219	0.12
220	0.15
221	0.15
222	0.16
223	0.13
224	0.11
225	0.13
226	0.12
227	0.12
228	0.09
229	0.09
230	0.08
231	0.08
232	0.08
233	0.06
234	0.06
235	0.05
236	0.06
237	0.11
238	0.14
239	0.15
240	0.16
241	0.19
242	0.19
243	0.2
244	0.18
245	0.19
246	0.19
247	0.22
248	0.25
249	0.26
250	0.26
251	0.25
252	0.24
253	0.2
254	0.17
255	0.13
256	0.09
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.05
262	0.05
263	0.04
264	0.03
265	0.03
266	0.04
267	0.03
268	0.03
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.05
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.07
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.09
281	0.08
282	0.11
283	0.12
284	0.13
285	0.17
286	0.16
287	0.15
288	0.15
289	0.14
290	0.1
291	0.1
292	0.08
293	0.05
294	0.04
295	0.04
296	0.05
297	0.07
298	0.07
299	0.08
300	0.07
301	0.08
302	0.09
303	0.11
304	0.11
305	0.11
306	0.12
307	0.13
308	0.15
309	0.16
310	0.16
311	0.15
312	0.16
313	0.14
314	0.23
315	0.23
316	0.23
317	0.27
318	0.26
319	0.27
320	0.26
321	0.26
322	0.17
323	0.16
324	0.14
325	0.09
326	0.09
327	0.07
328	0.06
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.08
338	0.1
339	0.11
340	0.1
341	0.1
342	0.1
343	0.1
344	0.11
345	0.11
346	0.09
347	0.09
348	0.11
349	0.11
350	0.11
351	0.12
352	0.11
353	0.1
354	0.1
355	0.11
356	0.1
357	0.11
358	0.1
359	0.09
360	0.08
361	0.1
362	0.12
363	0.11
364	0.12
365	0.11
366	0.16
367	0.2
368	0.27
369	0.28
370	0.35
371	0.43
372	0.49
373	0.54
374	0.6
375	0.58
376	0.58
377	0.56
378	0.49
379	0.41
380	0.34
381	0.3
382	0.21
383	0.19
384	0.12
385	0.1
386	0.08
387	0.08
388	0.07
389	0.07
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.05
403	0.06
404	0.07
405	0.07
406	0.11
407	0.18
408	0.27
409	0.33
410	0.39
411	0.47
412	0.53
413	0.62
414	0.62
415	0.58
416	0.58
417	0.62
418	0.62
419	0.61
420	0.64
421	0.6
422	0.59
423	0.61
424	0.61
425	0.6
426	0.61
427	0.58
428	0.57
429	0.56
430	0.56
431	0.58
432	0.61
433	0.57
434	0.55
435	0.57
436	0.51
437	0.46
438	0.42
439	0.36
440	0.27
441	0.23
442	0.2
443	0.14
444	0.15
445	0.15
446	0.15
447	0.15
448	0.15
449	0.16
450	0.14
451	0.15
452	0.21
453	0.25
454	0.29
455	0.31
456	0.31
457	0.3
458	0.29
459	0.27
460	0.21
461	0.19
462	0.16
463	0.17
464	0.19
465	0.19
466	0.19
467	0.19
468	0.18
469	0.17
470	0.15
471	0.12
472	0.09
473	0.08
474	0.08
475	0.07

A0A1Q8RRX1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer