FuNGI

G0VH06

Protein Details

Accession

G0VH06

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
639-664	FALDLPLNKRRKPKKHTRDGLTITDE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
647-654	KRRKPKKH

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_mito 6, mito 5.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046351 UTP4 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	ncs:NCAS_0F02940 -
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2

Amino Acid Sequences

MTSLQEQLLIHRSRFADLTPGNITALAFSHKSNINKLTPSDLRLAVGRSNGSIEIWNPRNDWVQELVIQGGVGRSIEGLVWCNVPGEPLRLFSIGGSTVVTEWDLLTGLPIKNYDCNSGVIWSVAINEQMDKLAVGCDNGTVCVIDISGGRGVLEHDLILTRQEARVLTLTWNGDSFVIGGCSDGRIRVWSVQKDDVNRGRLLHTMKVDKAKRESTLVWSVLYLAKTNQIVSGDSTGSVKFWDFQYATLTQTFKSHEADVLCLTTDASNTHVFSAGVDRKIFQFTSKLQGGNASSPKWVNSSNRLFHGNDVRAISSYQSKGADFLVSGGVEKTLVISSLSSFSDGNYKKFPVVVPFMKNILINKEQRLVVMWHESIIKIWIIGTDVESEKNYRLVCKLTLKDEQNINTCALSPDGQVLIVGRPSTTKLFHLQPMGTKLKVTKLDNEFLLKTGTKFVKFIDNSRIVMSSSSDDIYTLDLEGEDDEAPKEYELEDLPSTKSSIKIPYMNRINHLDVSLTHIAVSRGCGAIDLINLNTGKSKTLVRLMNFITSMAINVKRNTLVVVTAENKIYEFNIPEDDDTETEQGEEESLLTRWSKNNTENMPREIQQSKEKCLGIFFDDSNEDNVWFWGSTWLSKFNFALDLPLNKRRKPKKHTRDGLTITDESNFMNDDEEEEDVEMELSEDVTSLLESGHRIKAIAGDSKGKDAQKAFFFTDKYKPILFADFVANNELVIIERPTLMVASQQKAFNLPKLRF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.28
3	0.29
4	0.26
5	0.31
6	0.28
7	0.28
8	0.26
9	0.26
10	0.25
11	0.16
12	0.17
13	0.15
14	0.13
15	0.13
16	0.18
17	0.23
18	0.27
19	0.32
20	0.38
21	0.39
22	0.42
23	0.44
24	0.47
25	0.45
26	0.45
27	0.44
28	0.38
29	0.34
30	0.33
31	0.33
32	0.27
33	0.27
34	0.25
35	0.2
36	0.21
37	0.2
38	0.19
39	0.18
40	0.17
41	0.23
42	0.27
43	0.29
44	0.28
45	0.3
46	0.36
47	0.35
48	0.36
49	0.3
50	0.28
51	0.28
52	0.28
53	0.25
54	0.19
55	0.18
56	0.15
57	0.11
58	0.09
59	0.07
60	0.06
61	0.05
62	0.05
63	0.07
64	0.07
65	0.09
66	0.1
67	0.11
68	0.11
69	0.12
70	0.11
71	0.13
72	0.13
73	0.15
74	0.14
75	0.16
76	0.18
77	0.18
78	0.18
79	0.16
80	0.17
81	0.14
82	0.13
83	0.11
84	0.09
85	0.09
86	0.09
87	0.09
88	0.07
89	0.06
90	0.06
91	0.06
92	0.05
93	0.07
94	0.11
95	0.12
96	0.13
97	0.14
98	0.15
99	0.2
100	0.22
101	0.24
102	0.21
103	0.22
104	0.22
105	0.22
106	0.21
107	0.17
108	0.15
109	0.11
110	0.11
111	0.1
112	0.1
113	0.09
114	0.09
115	0.09
116	0.1
117	0.1
118	0.08
119	0.08
120	0.08
121	0.08
122	0.08
123	0.08
124	0.08
125	0.09
126	0.09
127	0.09
128	0.07
129	0.07
130	0.07
131	0.07
132	0.06
133	0.06
134	0.08
135	0.08
136	0.08
137	0.08
138	0.08
139	0.09
140	0.09
141	0.09
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.08
146	0.09
147	0.09
148	0.09
149	0.09
150	0.11
151	0.11
152	0.12
153	0.14
154	0.15
155	0.15
156	0.19
157	0.19
158	0.18
159	0.18
160	0.16
161	0.14
162	0.13
163	0.11
164	0.08
165	0.07
166	0.06
167	0.07
168	0.06
169	0.08
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.09
174	0.11
175	0.17
176	0.24
177	0.27
178	0.32
179	0.38
180	0.4
181	0.42
182	0.49
183	0.49
184	0.46
185	0.43
186	0.39
187	0.34
188	0.36
189	0.35
190	0.31
191	0.3
192	0.3
193	0.33
194	0.41
195	0.43
196	0.44
197	0.47
198	0.45
199	0.42
200	0.42
201	0.4
202	0.37
203	0.4
204	0.35
205	0.3
206	0.26
207	0.26
208	0.24
209	0.23
210	0.17
211	0.11
212	0.14
213	0.14
214	0.14
215	0.14
216	0.13
217	0.13
218	0.14
219	0.15
220	0.12
221	0.12
222	0.12
223	0.11
224	0.1
225	0.1
226	0.09
227	0.08
228	0.08
229	0.13
230	0.13
231	0.13
232	0.17
233	0.17
234	0.19
235	0.2
236	0.2
237	0.15
238	0.17
239	0.19
240	0.17
241	0.18
242	0.17
243	0.18
244	0.18
245	0.19
246	0.17
247	0.15
248	0.13
249	0.11
250	0.11
251	0.08
252	0.08
253	0.07
254	0.08
255	0.1
256	0.1
257	0.1
258	0.11
259	0.1
260	0.1
261	0.17
262	0.18
263	0.19
264	0.18
265	0.19
266	0.19
267	0.22
268	0.21
269	0.15
270	0.16
271	0.15
272	0.22
273	0.24
274	0.23
275	0.21
276	0.24
277	0.24
278	0.26
279	0.26
280	0.2
281	0.19
282	0.19
283	0.2
284	0.19
285	0.21
286	0.19
287	0.25
288	0.31
289	0.32
290	0.34
291	0.37
292	0.35
293	0.35
294	0.39
295	0.32
296	0.28
297	0.26
298	0.24
299	0.21
300	0.21
301	0.19
302	0.15
303	0.14
304	0.14
305	0.14
306	0.13
307	0.14
308	0.14
309	0.13
310	0.09
311	0.09
312	0.08
313	0.07
314	0.07
315	0.06
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.05
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.16
331	0.17
332	0.18
333	0.19
334	0.19
335	0.19
336	0.2
337	0.2
338	0.16
339	0.2
340	0.22
341	0.23
342	0.23
343	0.24
344	0.24
345	0.24
346	0.21
347	0.2
348	0.21
349	0.2
350	0.21
351	0.23
352	0.22
353	0.21
354	0.22
355	0.18
356	0.15
357	0.16
358	0.14
359	0.12
360	0.12
361	0.12
362	0.11
363	0.11
364	0.09
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.08
375	0.09
376	0.09
377	0.12
378	0.11
379	0.1
380	0.11
381	0.12
382	0.15
383	0.2
384	0.22
385	0.23
386	0.3
387	0.31
388	0.34
389	0.35
390	0.35
391	0.32
392	0.32
393	0.28
394	0.22
395	0.2
396	0.16
397	0.14
398	0.11
399	0.08
400	0.08
401	0.07
402	0.07
403	0.06
404	0.07
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.05
409	0.06
410	0.08
411	0.09
412	0.1
413	0.11
414	0.14
415	0.17
416	0.19
417	0.22
418	0.21
419	0.22
420	0.27
421	0.28
422	0.24
423	0.22
424	0.21
425	0.24
426	0.29
427	0.28
428	0.29
429	0.31
430	0.33
431	0.33
432	0.35
433	0.3
434	0.25
435	0.25
436	0.18
437	0.14
438	0.18
439	0.19
440	0.17
441	0.17
442	0.17
443	0.24
444	0.25
445	0.28
446	0.3
447	0.31
448	0.31
449	0.32
450	0.31
451	0.23
452	0.22
453	0.2
454	0.13
455	0.11
456	0.1
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.08
462	0.07
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.05
467	0.06
468	0.05
469	0.06
470	0.06
471	0.07
472	0.07
473	0.07
474	0.07
475	0.06
476	0.07
477	0.07
478	0.1
479	0.1
480	0.11
481	0.12
482	0.12
483	0.14
484	0.13
485	0.14
486	0.14
487	0.18
488	0.2
489	0.26
490	0.28
491	0.36
492	0.43
493	0.43
494	0.44
495	0.44
496	0.43
497	0.37
498	0.35
499	0.26
500	0.19
501	0.24
502	0.21
503	0.17
504	0.14
505	0.15
506	0.15
507	0.14
508	0.15
509	0.1
510	0.09
511	0.09
512	0.09
513	0.08
514	0.09
515	0.09
516	0.09
517	0.07
518	0.1
519	0.1
520	0.1
521	0.12
522	0.12
523	0.12
524	0.12
525	0.14
526	0.14
527	0.22
528	0.26
529	0.25
530	0.3
531	0.31
532	0.32
533	0.3
534	0.27
535	0.21
536	0.16
537	0.16
538	0.14
539	0.16
540	0.16
541	0.17
542	0.19
543	0.18
544	0.19
545	0.19
546	0.15
547	0.13
548	0.11
549	0.14
550	0.15
551	0.16
552	0.16
553	0.15
554	0.15
555	0.14
556	0.14
557	0.12
558	0.11
559	0.11
560	0.14
561	0.14
562	0.15
563	0.15
564	0.16
565	0.15
566	0.15
567	0.15
568	0.11
569	0.11
570	0.11
571	0.09
572	0.08
573	0.07
574	0.06
575	0.06
576	0.07
577	0.08
578	0.09
579	0.11
580	0.14
581	0.19
582	0.25
583	0.28
584	0.36
585	0.42
586	0.51
587	0.53
588	0.55
589	0.55
590	0.5
591	0.51
592	0.46
593	0.43
594	0.43
595	0.43
596	0.43
597	0.45
598	0.45
599	0.39
600	0.38
601	0.36
602	0.3
603	0.29
604	0.24
605	0.2
606	0.21
607	0.22
608	0.23
609	0.21
610	0.18
611	0.15
612	0.15
613	0.13
614	0.11
615	0.11
616	0.13
617	0.13
618	0.16
619	0.18
620	0.24
621	0.23
622	0.26
623	0.25
624	0.22
625	0.24
626	0.21
627	0.23
628	0.21
629	0.27
630	0.3
631	0.39
632	0.43
633	0.46
634	0.56
635	0.62
636	0.69
637	0.72
638	0.78
639	0.8
640	0.86
641	0.92
642	0.89
643	0.89
644	0.85
645	0.81
646	0.75
647	0.65
648	0.54
649	0.45
650	0.38
651	0.27
652	0.22
653	0.16
654	0.1
655	0.11
656	0.1
657	0.1
658	0.11
659	0.12
660	0.11
661	0.11
662	0.11
663	0.09
664	0.09
665	0.08
666	0.07
667	0.06
668	0.06
669	0.05
670	0.05
671	0.05
672	0.05
673	0.05
674	0.05
675	0.05
676	0.06
677	0.08
678	0.12
679	0.15
680	0.15
681	0.15
682	0.16
683	0.2
684	0.24
685	0.28
686	0.28
687	0.32
688	0.33
689	0.38
690	0.43
691	0.4
692	0.4
693	0.37
694	0.41
695	0.38
696	0.42
697	0.41
698	0.41
699	0.42
700	0.42
701	0.47
702	0.45
703	0.43
704	0.4
705	0.38
706	0.36
707	0.38
708	0.34
709	0.28
710	0.3
711	0.28
712	0.28
713	0.29
714	0.26
715	0.21
716	0.2
717	0.17
718	0.11
719	0.11
720	0.12
721	0.09
722	0.1
723	0.1
724	0.11
725	0.11
726	0.1
727	0.16
728	0.2
729	0.23
730	0.28
731	0.29
732	0.3
733	0.36
734	0.39
735	0.39

G0VH06

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer