Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q8RKR1

Protein Details
Accession A0A1Q8RKR1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
398-438DDGDNKKRKKHEGETPDEKAERKRRKAEKKAAKAAKKAAKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
403-438KKRKKHEGETPDEKAERKRRKAEKKAAKAAKKAAKG
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12, nucl 10.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002478  PUA  
IPR015947  PUA-like_sf  
IPR036974  PUA_sf  
IPR004802  tRNA_PsdUridine_synth_B_fam  
IPR032819  TruB_C  
IPR004521  Uncharacterised_CHP00451  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01472  PUA  
PF16198  TruB_C_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50890  PUA  
CDD cd21148  PUA_Cbf5  
Amino Acid Sequences MAMEIVKHKEVEEEFTIKPQAGVPQLDTSSWPLLLKNYDKRNVEKTGHSGTLDPKRQPDFNIYKRVVADHQCSIDRATRLVKSQQSAGKEYVAVIRLHDKLPGGKVQFARALETLTGALFQRPPLISAVKRQLRIRTIHESKLIEFDNDRHLGVFWVSCEAGTYIRTLCVHLGLLLGVGGHMQELRRVRSGAMDETKGMVTLHDVLDAQWTMDNTRDESYLRKVISPLETLLTGYKRVVVKDSAVNAVCYGAKLMLPGLLRYESGIEVHDEVVLMTTKGEAIALGIAQMSTVEMSTCDHGVVAKVKRCIMERDLYPRRWGLGPLASEKKKMKADGKLDKYGRPNEATPAKWVSEYKDFGAAQGAAAAAPAATPATPQKSADVTMTTPGTAVTPANAEDDGDNKKRKKHEGETPDEKAERKRRKAEKKAAKAAKKAAKGGAADDDEDSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.33
3 0.34
4 0.28
5 0.28
6 0.24
7 0.24
8 0.24
9 0.26
10 0.25
11 0.29
12 0.29
13 0.29
14 0.29
15 0.28
16 0.25
17 0.23
18 0.21
19 0.17
20 0.2
21 0.26
22 0.32
23 0.37
24 0.44
25 0.51
26 0.55
27 0.59
28 0.62
29 0.63
30 0.6
31 0.56
32 0.54
33 0.53
34 0.51
35 0.46
36 0.42
37 0.43
38 0.48
39 0.5
40 0.46
41 0.46
42 0.48
43 0.5
44 0.49
45 0.52
46 0.52
47 0.53
48 0.6
49 0.55
50 0.54
51 0.52
52 0.53
53 0.49
54 0.45
55 0.42
56 0.36
57 0.38
58 0.36
59 0.36
60 0.35
61 0.35
62 0.3
63 0.27
64 0.27
65 0.27
66 0.3
67 0.36
68 0.38
69 0.35
70 0.4
71 0.42
72 0.41
73 0.43
74 0.4
75 0.34
76 0.29
77 0.28
78 0.25
79 0.24
80 0.2
81 0.18
82 0.21
83 0.22
84 0.22
85 0.22
86 0.2
87 0.2
88 0.23
89 0.27
90 0.24
91 0.28
92 0.29
93 0.3
94 0.33
95 0.3
96 0.3
97 0.25
98 0.24
99 0.19
100 0.18
101 0.15
102 0.11
103 0.11
104 0.09
105 0.1
106 0.09
107 0.09
108 0.13
109 0.13
110 0.14
111 0.15
112 0.2
113 0.19
114 0.26
115 0.35
116 0.37
117 0.41
118 0.43
119 0.47
120 0.48
121 0.51
122 0.5
123 0.5
124 0.5
125 0.49
126 0.51
127 0.47
128 0.42
129 0.42
130 0.37
131 0.28
132 0.24
133 0.22
134 0.23
135 0.22
136 0.21
137 0.17
138 0.16
139 0.16
140 0.15
141 0.14
142 0.08
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.07
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.02
168 0.03
169 0.03
170 0.07
171 0.1
172 0.12
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.17
177 0.2
178 0.21
179 0.22
180 0.2
181 0.19
182 0.19
183 0.19
184 0.16
185 0.14
186 0.09
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.06
197 0.07
198 0.06
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.13
206 0.16
207 0.18
208 0.18
209 0.17
210 0.17
211 0.18
212 0.2
213 0.19
214 0.15
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.13
219 0.11
220 0.1
221 0.08
222 0.12
223 0.12
224 0.13
225 0.14
226 0.13
227 0.15
228 0.17
229 0.19
230 0.18
231 0.17
232 0.17
233 0.15
234 0.15
235 0.13
236 0.1
237 0.09
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.04
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.08
288 0.14
289 0.19
290 0.22
291 0.24
292 0.26
293 0.29
294 0.31
295 0.33
296 0.31
297 0.32
298 0.32
299 0.4
300 0.46
301 0.45
302 0.46
303 0.42
304 0.4
305 0.35
306 0.33
307 0.26
308 0.24
309 0.24
310 0.28
311 0.36
312 0.35
313 0.39
314 0.4
315 0.43
316 0.42
317 0.45
318 0.45
319 0.45
320 0.54
321 0.59
322 0.64
323 0.67
324 0.65
325 0.64
326 0.65
327 0.61
328 0.56
329 0.49
330 0.44
331 0.42
332 0.46
333 0.42
334 0.39
335 0.38
336 0.34
337 0.33
338 0.32
339 0.3
340 0.31
341 0.32
342 0.29
343 0.32
344 0.31
345 0.29
346 0.31
347 0.26
348 0.18
349 0.17
350 0.15
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.04
355 0.03
356 0.04
357 0.03
358 0.03
359 0.05
360 0.09
361 0.14
362 0.16
363 0.17
364 0.2
365 0.22
366 0.23
367 0.24
368 0.23
369 0.19
370 0.21
371 0.21
372 0.18
373 0.16
374 0.15
375 0.14
376 0.12
377 0.11
378 0.08
379 0.09
380 0.1
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.14
386 0.21
387 0.26
388 0.34
389 0.36
390 0.43
391 0.5
392 0.59
393 0.66
394 0.68
395 0.71
396 0.73
397 0.8
398 0.82
399 0.8
400 0.78
401 0.7
402 0.65
403 0.64
404 0.64
405 0.65
406 0.65
407 0.7
408 0.74
409 0.82
410 0.9
411 0.91
412 0.92
413 0.92
414 0.94
415 0.94
416 0.91
417 0.88
418 0.87
419 0.85
420 0.8
421 0.74
422 0.67
423 0.62
424 0.55
425 0.5
426 0.47
427 0.4
428 0.35