Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q8RVB1

Protein Details
Accession A0A1Q8RVB1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-23SDANARKRKREVDGASKSKKKLBasic
317-339APGKQRGTKRIPQRDKLKERMAPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-22RKRKREVDGASKSKKK
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 8.5, cyto_nucl 7.5, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MSDANARKRKREVDGASKSKKKLAAAGAAPSTVSVTSVIQPQVCPPVLASTPGVRLPKNVPFSPYVKPDAAPGKRRSKVPAVSQDLVLHSSSHATMDYTAREDGVSESQQALKHYVGVYDPKTGTLKVVEAKKMVVRGVARAKHAPEEAMTAPADNQSYFALKKDLGQTFGTKKAKKAIESVALNAIDPNKSQNSAPKKLDTAAKAILQEIGGVTATMASREELQAAVDDAKPVPKPNLEAEAIQDVYDPDEFIGREILAAIPVKDWIEPTKKGEDVQCYSRHVASRIKKVVDSGNVSKTRLLRYFYLLFLFYTMAAPGKQRGTKRIPQRDKLKERMAPAPQVVIEHIRRKFSDGGEMRKFHIDLLITHCCAVLCIVDNFEVETSQLREDLRLDQKEINNYFYEIGAKVKQVAGKEKGKSQYVAKLSLPLSFPKLRSIAPKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.81
3 0.82
4 0.82
5 0.77
6 0.72
7 0.67
8 0.58
9 0.55
10 0.52
11 0.51
12 0.46
13 0.5
14 0.46
15 0.42
16 0.39
17 0.31
18 0.26
19 0.17
20 0.14
21 0.09
22 0.09
23 0.11
24 0.16
25 0.18
26 0.18
27 0.19
28 0.21
29 0.27
30 0.26
31 0.24
32 0.2
33 0.23
34 0.22
35 0.24
36 0.24
37 0.2
38 0.23
39 0.27
40 0.29
41 0.24
42 0.27
43 0.3
44 0.36
45 0.4
46 0.39
47 0.38
48 0.4
49 0.43
50 0.46
51 0.45
52 0.42
53 0.37
54 0.35
55 0.37
56 0.43
57 0.47
58 0.49
59 0.53
60 0.58
61 0.61
62 0.64
63 0.65
64 0.64
65 0.63
66 0.64
67 0.66
68 0.64
69 0.61
70 0.59
71 0.55
72 0.47
73 0.41
74 0.32
75 0.22
76 0.14
77 0.14
78 0.12
79 0.11
80 0.1
81 0.08
82 0.1
83 0.12
84 0.13
85 0.14
86 0.14
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.15
92 0.14
93 0.13
94 0.14
95 0.17
96 0.19
97 0.2
98 0.2
99 0.16
100 0.18
101 0.17
102 0.16
103 0.16
104 0.19
105 0.19
106 0.22
107 0.22
108 0.22
109 0.23
110 0.22
111 0.21
112 0.18
113 0.19
114 0.19
115 0.24
116 0.24
117 0.23
118 0.25
119 0.25
120 0.26
121 0.24
122 0.22
123 0.17
124 0.21
125 0.29
126 0.3
127 0.31
128 0.33
129 0.34
130 0.34
131 0.33
132 0.28
133 0.2
134 0.21
135 0.19
136 0.17
137 0.16
138 0.13
139 0.12
140 0.13
141 0.13
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.14
151 0.2
152 0.21
153 0.22
154 0.23
155 0.26
156 0.27
157 0.36
158 0.4
159 0.34
160 0.34
161 0.4
162 0.42
163 0.39
164 0.41
165 0.36
166 0.37
167 0.37
168 0.36
169 0.32
170 0.29
171 0.27
172 0.23
173 0.2
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.1
178 0.11
179 0.12
180 0.18
181 0.25
182 0.31
183 0.34
184 0.33
185 0.33
186 0.35
187 0.39
188 0.33
189 0.29
190 0.24
191 0.24
192 0.22
193 0.21
194 0.19
195 0.14
196 0.12
197 0.08
198 0.06
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.11
222 0.1
223 0.12
224 0.14
225 0.18
226 0.17
227 0.17
228 0.17
229 0.18
230 0.18
231 0.15
232 0.14
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.07
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.11
255 0.16
256 0.17
257 0.21
258 0.24
259 0.24
260 0.26
261 0.29
262 0.31
263 0.3
264 0.33
265 0.33
266 0.33
267 0.34
268 0.34
269 0.32
270 0.29
271 0.34
272 0.35
273 0.42
274 0.44
275 0.44
276 0.42
277 0.42
278 0.43
279 0.4
280 0.4
281 0.34
282 0.37
283 0.37
284 0.38
285 0.38
286 0.36
287 0.36
288 0.33
289 0.32
290 0.26
291 0.29
292 0.31
293 0.29
294 0.28
295 0.24
296 0.2
297 0.18
298 0.16
299 0.11
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.11
306 0.16
307 0.2
308 0.23
309 0.3
310 0.37
311 0.44
312 0.54
313 0.62
314 0.67
315 0.71
316 0.79
317 0.82
318 0.83
319 0.84
320 0.82
321 0.75
322 0.7
323 0.69
324 0.63
325 0.57
326 0.49
327 0.43
328 0.34
329 0.31
330 0.28
331 0.26
332 0.27
333 0.3
334 0.31
335 0.33
336 0.33
337 0.37
338 0.39
339 0.34
340 0.4
341 0.38
342 0.44
343 0.48
344 0.49
345 0.47
346 0.47
347 0.46
348 0.35
349 0.33
350 0.25
351 0.2
352 0.25
353 0.29
354 0.25
355 0.25
356 0.26
357 0.22
358 0.21
359 0.19
360 0.13
361 0.1
362 0.1
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.13
367 0.13
368 0.11
369 0.09
370 0.11
371 0.11
372 0.11
373 0.13
374 0.13
375 0.14
376 0.16
377 0.24
378 0.3
379 0.31
380 0.34
381 0.38
382 0.42
383 0.5
384 0.5
385 0.46
386 0.38
387 0.37
388 0.34
389 0.28
390 0.26
391 0.18
392 0.2
393 0.19
394 0.18
395 0.19
396 0.21
397 0.23
398 0.25
399 0.33
400 0.37
401 0.42
402 0.45
403 0.51
404 0.55
405 0.56
406 0.55
407 0.52
408 0.53
409 0.5
410 0.5
411 0.44
412 0.44
413 0.41
414 0.42
415 0.39
416 0.33
417 0.35
418 0.36
419 0.36
420 0.36
421 0.38
422 0.36
423 0.45