Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q8RLN5

Protein Details
Accession A0A1Q8RLN5    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-54SQNQEDKMAKKEKKTKVKAVAPSQQAHydrophilic
413-440LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGMIDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
419-432KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSTPSGPPSWLFSNNFTKTDNSANSTTASQNQEDKMAKKEKKTKVKAVAPSQQAPPDQLMDLVDSFLSENAFTSAHEAFQKQRAKSGWKPSTKKQVASPNLVTVFQTWQTSTDGSDGQTIVTKAVIKADSESTTSSSDDSSSDEEDVDMADAAEDSDSSSSSSSSDSSSESDSESESEDEKPKAAPKQNLKRKAPESDSSDSDASSSSSDDSSSSDSSSSEDEAPRAKKQKVKSESSNSDSSSDSSDSSSESSSSDSESSSSDSDSDSDSESDSDSDSDSDSDASKAAKVPLPDSDSDSDSDSSSDSDSDEDTKKTVKPKSTKADADSSSNSSATLDKTSPEYKPSASTAADPPLPPDPMTYRNNNRGGKNANGKKVPNKPFSRIPDEVYVDPRFASNEYVPNDYSQRAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGMIDVSSKKGIKFDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.49
3 0.45
4 0.43
5 0.4
6 0.45
7 0.42
8 0.37
9 0.35
10 0.34
11 0.34
12 0.34
13 0.33
14 0.32
15 0.32
16 0.29
17 0.32
18 0.32
19 0.37
20 0.39
21 0.39
22 0.41
23 0.48
24 0.5
25 0.55
26 0.64
27 0.67
28 0.74
29 0.81
30 0.82
31 0.82
32 0.86
33 0.85
34 0.85
35 0.83
36 0.79
37 0.74
38 0.68
39 0.63
40 0.55
41 0.48
42 0.4
43 0.33
44 0.27
45 0.23
46 0.19
47 0.16
48 0.15
49 0.13
50 0.11
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.08
55 0.06
56 0.07
57 0.07
58 0.08
59 0.07
60 0.11
61 0.1
62 0.12
63 0.14
64 0.16
65 0.18
66 0.26
67 0.34
68 0.3
69 0.36
70 0.39
71 0.45
72 0.51
73 0.59
74 0.6
75 0.63
76 0.69
77 0.71
78 0.78
79 0.76
80 0.71
81 0.67
82 0.68
83 0.65
84 0.66
85 0.6
86 0.55
87 0.5
88 0.47
89 0.4
90 0.31
91 0.27
92 0.21
93 0.2
94 0.14
95 0.15
96 0.16
97 0.16
98 0.15
99 0.14
100 0.13
101 0.13
102 0.15
103 0.13
104 0.11
105 0.14
106 0.13
107 0.11
108 0.11
109 0.12
110 0.1
111 0.14
112 0.14
113 0.12
114 0.14
115 0.16
116 0.16
117 0.17
118 0.18
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.15
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.12
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.08
135 0.06
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.03
142 0.03
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.12
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.15
169 0.17
170 0.24
171 0.29
172 0.34
173 0.41
174 0.52
175 0.61
176 0.7
177 0.7
178 0.71
179 0.69
180 0.69
181 0.63
182 0.58
183 0.55
184 0.49
185 0.47
186 0.42
187 0.38
188 0.31
189 0.26
190 0.2
191 0.14
192 0.1
193 0.09
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.14
211 0.16
212 0.2
213 0.25
214 0.27
215 0.3
216 0.36
217 0.45
218 0.48
219 0.52
220 0.56
221 0.6
222 0.62
223 0.61
224 0.58
225 0.49
226 0.44
227 0.37
228 0.3
229 0.23
230 0.18
231 0.14
232 0.12
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.08
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.1
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.11
275 0.12
276 0.13
277 0.14
278 0.17
279 0.2
280 0.2
281 0.22
282 0.22
283 0.21
284 0.21
285 0.22
286 0.19
287 0.16
288 0.15
289 0.12
290 0.11
291 0.1
292 0.09
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.11
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.16
301 0.19
302 0.25
303 0.3
304 0.35
305 0.41
306 0.5
307 0.58
308 0.64
309 0.66
310 0.62
311 0.65
312 0.58
313 0.55
314 0.49
315 0.43
316 0.36
317 0.31
318 0.27
319 0.2
320 0.2
321 0.16
322 0.16
323 0.13
324 0.13
325 0.17
326 0.21
327 0.21
328 0.23
329 0.24
330 0.22
331 0.24
332 0.26
333 0.25
334 0.22
335 0.25
336 0.25
337 0.27
338 0.28
339 0.24
340 0.25
341 0.25
342 0.25
343 0.22
344 0.21
345 0.22
346 0.26
347 0.31
348 0.38
349 0.42
350 0.5
351 0.59
352 0.62
353 0.59
354 0.6
355 0.6
356 0.59
357 0.62
358 0.61
359 0.6
360 0.6
361 0.63
362 0.64
363 0.7
364 0.71
365 0.7
366 0.68
367 0.66
368 0.7
369 0.73
370 0.72
371 0.65
372 0.6
373 0.57
374 0.56
375 0.52
376 0.49
377 0.43
378 0.34
379 0.32
380 0.28
381 0.22
382 0.19
383 0.21
384 0.18
385 0.24
386 0.26
387 0.3
388 0.3
389 0.31
390 0.32
391 0.3
392 0.28
393 0.24
394 0.27
395 0.25
396 0.26
397 0.25
398 0.26
399 0.26
400 0.31
401 0.32
402 0.26
403 0.26
404 0.3
405 0.3
406 0.35
407 0.37
408 0.4
409 0.49
410 0.59
411 0.68
412 0.75
413 0.82
414 0.83
415 0.9
416 0.91
417 0.9
418 0.9
419 0.88
420 0.86
421 0.84
422 0.78
423 0.67
424 0.57
425 0.55
426 0.46
427 0.42
428 0.36
429 0.3
430 0.28