Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q8RTB7

Protein Details
Accession A0A1Q8RTB7    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-102LPEPAPKTSRGPKKKKQSNLHTPAARKHydrophilic
472-499KGKGAKLEGRKDRKTQWRRVQDNLEDNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-92KTSRGPKKKKQ
304-306HKR
474-484KGAKLEGRKDR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSLAQLSRLLPLPEEELKQILDYASTLSKAEAAEHFNNFLGDSPQAVEFISSFNSRRQDTKAPAPSSASATSASGLPEPAPKTSRGPKKKKQSNLHTPAARKIEAFAPPPGASYSKRDQEDDYYGGKKASSAARSGSSAPASSNQPPKSATPPPSQQRTAGGYLISDVKAKPKSNPVSRSATPKPSAKPTTTKISIAGGTPMAGASTALSDLDAAIRSLELTTNPTLGDDPKARRCNCVATRHPLQTAAPNCLSCGKVICVKEGLGPCTYCGAPLLSADDVQGMIKELKAERGRERMAADREAHKRAEVSKKPAPFSQNRISEAEAKAREHRDKLLNFQAQNARRTTVRDEAADFDVSGAMAGNGGNIWSTPEERARELKRQQKILREIEWNARPEYEKRRQVVSIDLVGGRVVKKMAAVDRPTTPDDEEVVVHEDVDENGVGQHQQQHGGGGAFSHNPLLGALIKPVYDAKGKGAKLEGRKDRKTQWRRVQDNLEDNEAVILDGGAHGHSTTADEPACG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.24
4 0.24
5 0.23
6 0.22
7 0.17
8 0.13
9 0.11
10 0.13
11 0.13
12 0.13
13 0.13
14 0.12
15 0.14
16 0.14
17 0.16
18 0.17
19 0.22
20 0.25
21 0.26
22 0.28
23 0.26
24 0.26
25 0.23
26 0.21
27 0.17
28 0.13
29 0.12
30 0.12
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.11
35 0.09
36 0.1
37 0.12
38 0.14
39 0.15
40 0.2
41 0.25
42 0.27
43 0.3
44 0.36
45 0.41
46 0.45
47 0.54
48 0.58
49 0.55
50 0.55
51 0.56
52 0.51
53 0.47
54 0.42
55 0.32
56 0.24
57 0.22
58 0.2
59 0.18
60 0.16
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.16
65 0.17
66 0.2
67 0.21
68 0.22
69 0.29
70 0.38
71 0.48
72 0.53
73 0.62
74 0.68
75 0.77
76 0.85
77 0.88
78 0.9
79 0.9
80 0.9
81 0.88
82 0.88
83 0.83
84 0.77
85 0.74
86 0.68
87 0.58
88 0.47
89 0.4
90 0.36
91 0.34
92 0.33
93 0.28
94 0.27
95 0.26
96 0.27
97 0.26
98 0.24
99 0.22
100 0.25
101 0.3
102 0.33
103 0.35
104 0.36
105 0.36
106 0.39
107 0.42
108 0.39
109 0.36
110 0.31
111 0.3
112 0.28
113 0.26
114 0.2
115 0.19
116 0.22
117 0.2
118 0.2
119 0.21
120 0.23
121 0.25
122 0.26
123 0.24
124 0.2
125 0.18
126 0.17
127 0.18
128 0.2
129 0.25
130 0.31
131 0.3
132 0.31
133 0.32
134 0.34
135 0.37
136 0.41
137 0.4
138 0.39
139 0.47
140 0.52
141 0.58
142 0.57
143 0.52
144 0.49
145 0.47
146 0.43
147 0.35
148 0.27
149 0.2
150 0.19
151 0.2
152 0.16
153 0.13
154 0.1
155 0.16
156 0.21
157 0.22
158 0.24
159 0.32
160 0.41
161 0.48
162 0.53
163 0.52
164 0.54
165 0.55
166 0.61
167 0.56
168 0.54
169 0.5
170 0.5
171 0.48
172 0.49
173 0.51
174 0.47
175 0.47
176 0.44
177 0.49
178 0.46
179 0.44
180 0.36
181 0.34
182 0.31
183 0.25
184 0.22
185 0.13
186 0.11
187 0.1
188 0.08
189 0.06
190 0.05
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.13
216 0.15
217 0.19
218 0.27
219 0.35
220 0.35
221 0.37
222 0.38
223 0.44
224 0.45
225 0.5
226 0.46
227 0.46
228 0.5
229 0.5
230 0.49
231 0.41
232 0.35
233 0.32
234 0.29
235 0.26
236 0.22
237 0.2
238 0.2
239 0.2
240 0.2
241 0.14
242 0.13
243 0.1
244 0.14
245 0.15
246 0.15
247 0.14
248 0.14
249 0.18
250 0.18
251 0.18
252 0.15
253 0.14
254 0.13
255 0.14
256 0.14
257 0.1
258 0.09
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.07
274 0.07
275 0.14
276 0.17
277 0.2
278 0.23
279 0.28
280 0.29
281 0.3
282 0.31
283 0.31
284 0.31
285 0.32
286 0.31
287 0.32
288 0.35
289 0.36
290 0.35
291 0.28
292 0.27
293 0.29
294 0.37
295 0.35
296 0.38
297 0.41
298 0.45
299 0.46
300 0.48
301 0.49
302 0.43
303 0.46
304 0.47
305 0.47
306 0.46
307 0.45
308 0.44
309 0.43
310 0.39
311 0.38
312 0.32
313 0.28
314 0.31
315 0.35
316 0.37
317 0.33
318 0.37
319 0.38
320 0.37
321 0.42
322 0.46
323 0.45
324 0.42
325 0.46
326 0.48
327 0.45
328 0.47
329 0.42
330 0.35
331 0.3
332 0.33
333 0.32
334 0.31
335 0.29
336 0.26
337 0.26
338 0.28
339 0.29
340 0.26
341 0.22
342 0.15
343 0.13
344 0.11
345 0.09
346 0.06
347 0.04
348 0.04
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.05
356 0.06
357 0.07
358 0.09
359 0.14
360 0.16
361 0.19
362 0.27
363 0.3
364 0.38
365 0.46
366 0.52
367 0.54
368 0.62
369 0.64
370 0.66
371 0.7
372 0.67
373 0.64
374 0.61
375 0.57
376 0.56
377 0.57
378 0.5
379 0.42
380 0.38
381 0.35
382 0.36
383 0.43
384 0.44
385 0.46
386 0.46
387 0.49
388 0.49
389 0.48
390 0.49
391 0.43
392 0.36
393 0.31
394 0.28
395 0.24
396 0.22
397 0.22
398 0.16
399 0.13
400 0.1
401 0.08
402 0.09
403 0.13
404 0.17
405 0.23
406 0.26
407 0.28
408 0.32
409 0.36
410 0.37
411 0.35
412 0.32
413 0.26
414 0.24
415 0.22
416 0.19
417 0.16
418 0.19
419 0.16
420 0.15
421 0.13
422 0.12
423 0.11
424 0.12
425 0.1
426 0.06
427 0.06
428 0.07
429 0.07
430 0.08
431 0.14
432 0.14
433 0.17
434 0.17
435 0.18
436 0.19
437 0.2
438 0.18
439 0.13
440 0.13
441 0.12
442 0.12
443 0.12
444 0.1
445 0.09
446 0.09
447 0.1
448 0.11
449 0.1
450 0.12
451 0.12
452 0.12
453 0.13
454 0.14
455 0.15
456 0.17
457 0.17
458 0.22
459 0.29
460 0.29
461 0.31
462 0.36
463 0.4
464 0.45
465 0.54
466 0.58
467 0.6
468 0.67
469 0.7
470 0.74
471 0.79
472 0.81
473 0.82
474 0.82
475 0.83
476 0.83
477 0.85
478 0.85
479 0.82
480 0.82
481 0.74
482 0.69
483 0.58
484 0.52
485 0.43
486 0.33
487 0.24
488 0.15
489 0.1
490 0.05
491 0.05
492 0.06
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.06
497 0.06
498 0.09
499 0.1
500 0.14