FuNGI

A0A1Q8RM62

Protein Details

Accession

A0A1Q8RM62

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
99-121	IGSVPKVKRKRGVKVLEKKFDEP	Basic
131-160	GSLLRKKDSNTKKPAEQKETKAKGKRKATA	Hydrophilic
342-367	AGKPKGKTGKRTAKGKKPKKMPPLDP	Basic
651-675	QKPAVSASPKRPRGRPRKNSDVDLP	Hydrophilic
682-707	SAQPPPPSPKRGRGRPKKTGEPTKTA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
104-117	KVKRKRGVKVLEKK
132-159	SLLRKKDSNTKKPAEQKETKAKGKRKAT
295-306	AAARSKASKKKP
343-362	GKPKGKTGKRTAKGKKPKKM
658-669	SPKRPRGRPRKN
684-716	QPPPPSPKRGRGRPKKTGEPTKTAAATTSRKVK

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017956 AT_hook_DNA-bd_motif IPR000637 HMGI/Y_DNA-bd_CS IPR027784 Slx4_ascomycetes IPR018574 Structure-sp_endonuc_su_Slx4
Gene Ontology	GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0003677 F:DNA binding GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006260 P:DNA replication GO:0006996 P:organelle organization GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF09494 Slx4
PROSITE	View protein in PROSITE PS00354 HMGI_Y
CDD	cd22999 SAP_SLX4

Amino Acid Sequences

MASPSRSPRHDPYSVSSSPGLPSLDQIKAQTFKQPLSRSGGTPMPMPDHATYPSTSASSFVRIEHSAIDLTTPCKQQLSAAPIETPVPFEEEEVTVISIGSVPKVKRKRGVKVLEKKFDEPQPNSTKTAGGSLLRKKDSNTKKPAEQKETKAKGKRKATAKDAEVVSRHFAKPIDEEAIILPPPKKDVDEPLQLEAALRRRMDWTPPPADTVMASASKSSQVVDLLSSAARSPNRVTSRQSFQNLFKNYGRPEEEQSIQSIEPPDVAQQVLKKRKLIEAVSINESFTSVPIPKAAAARSKASKKKPRTMTELATAAYVVRDAPKEDASSAPPLDTVEPDAEAGKPKGKTGKRTAKGKKPKKMPPLDPVLLSPTTALRQAAKQDYVFGTSSQLAREHSPTFLRDLQTALQASNSFTKDEDPFVTPINSDAIEPEPRLKLWDVGARDEDGRLLDLEVINLADTPQTTATAARDGSDPYGYSGIEKPTALPPNPIPSDASFPDIDDLLLKGTTGEAPREHTKTSPLFSTIQSNQKVPDAIEAVLVSSGSLPDHEDQDHHLMPVRLPSTGKVLRTATTAPEHVPEPKKPNFDLYTDAQLSREIASYGFKPVKRRQGMLALLNDCWASKQRTALASLPTNHPMSTTSQAQATTKSQKPAVSASPKRPRGRPRKNSDVDLPSSEPPPSAQPPPPSPKRGRGRPKKTGEPTKTAAATTSRKVKPKASIAVPVVQETSSTVASPCRKKHKISEVVEIPDSASEGSLSPLPSTASSPEQTFSSPPPLDATLSLGEDTDMSLATPPTGQQSAALFVYITEAVTSAPPTTDPKKPSFHEMMLMYDPIVLEDLAAWLNTGQLSRVGYDGEVSATEVKQWCESKSVCCLWRESLRGKERKRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.52
3	0.45
4	0.39
5	0.34
6	0.33
7	0.27
8	0.19
9	0.22
10	0.23
11	0.24
12	0.25
13	0.26
14	0.29
15	0.31
16	0.31
17	0.35
18	0.34
19	0.36
20	0.43
21	0.45
22	0.43
23	0.49
24	0.51
25	0.45
26	0.46
27	0.46
28	0.39
29	0.37
30	0.36
31	0.32
32	0.3
33	0.32
34	0.29
35	0.27
36	0.28
37	0.27
38	0.25
39	0.23
40	0.23
41	0.2
42	0.18
43	0.17
44	0.17
45	0.19
46	0.19
47	0.18
48	0.21
49	0.21
50	0.22
51	0.21
52	0.21
53	0.18
54	0.17
55	0.17
56	0.14
57	0.16
58	0.21
59	0.22
60	0.21
61	0.21
62	0.21
63	0.24
64	0.3
65	0.34
66	0.33
67	0.33
68	0.32
69	0.32
70	0.34
71	0.29
72	0.23
73	0.17
74	0.15
75	0.14
76	0.14
77	0.15
78	0.14
79	0.15
80	0.14
81	0.14
82	0.11
83	0.1
84	0.1
85	0.09
86	0.09
87	0.1
88	0.14
89	0.15
90	0.25
91	0.33
92	0.4
93	0.47
94	0.56
95	0.64
96	0.69
97	0.78
98	0.8
99	0.83
100	0.87
101	0.87
102	0.83
103	0.76
104	0.73
105	0.7
106	0.68
107	0.61
108	0.6
109	0.59
110	0.58
111	0.57
112	0.52
113	0.45
114	0.37
115	0.37
116	0.3
117	0.26
118	0.29
119	0.34
120	0.41
121	0.43
122	0.43
123	0.43
124	0.5
125	0.57
126	0.59
127	0.62
128	0.6
129	0.66
130	0.75
131	0.82
132	0.82
133	0.79
134	0.78
135	0.79
136	0.82
137	0.82
138	0.81
139	0.8
140	0.79
141	0.8
142	0.79
143	0.78
144	0.77
145	0.77
146	0.76
147	0.71
148	0.68
149	0.61
150	0.57
151	0.49
152	0.43
153	0.38
154	0.34
155	0.32
156	0.27
157	0.25
158	0.23
159	0.24
160	0.26
161	0.25
162	0.2
163	0.21
164	0.2
165	0.21
166	0.19
167	0.19
168	0.17
169	0.14
170	0.16
171	0.16
172	0.17
173	0.17
174	0.25
175	0.29
176	0.36
177	0.38
178	0.38
179	0.37
180	0.35
181	0.33
182	0.29
183	0.29
184	0.24
185	0.22
186	0.21
187	0.24
188	0.26
189	0.32
190	0.36
191	0.37
192	0.38
193	0.39
194	0.4
195	0.37
196	0.36
197	0.29
198	0.23
199	0.18
200	0.14
201	0.13
202	0.11
203	0.11
204	0.12
205	0.12
206	0.11
207	0.09
208	0.09
209	0.1
210	0.1
211	0.09
212	0.09
213	0.09
214	0.09
215	0.08
216	0.11
217	0.11
218	0.13
219	0.15
220	0.23
221	0.28
222	0.31
223	0.36
224	0.39
225	0.46
226	0.51
227	0.54
228	0.49
229	0.5
230	0.55
231	0.52
232	0.52
233	0.47
234	0.45
235	0.42
236	0.44
237	0.43
238	0.37
239	0.39
240	0.38
241	0.38
242	0.33
243	0.33
244	0.29
245	0.24
246	0.24
247	0.2
248	0.15
249	0.13
250	0.12
251	0.12
252	0.11
253	0.11
254	0.1
255	0.14
256	0.23
257	0.31
258	0.34
259	0.35
260	0.36
261	0.4
262	0.45
263	0.42
264	0.4
265	0.38
266	0.39
267	0.41
268	0.39
269	0.35
270	0.29
271	0.27
272	0.19
273	0.13
274	0.12
275	0.08
276	0.08
277	0.09
278	0.1
279	0.11
280	0.13
281	0.15
282	0.18
283	0.2
284	0.24
285	0.3
286	0.38
287	0.45
288	0.53
289	0.61
290	0.64
291	0.71
292	0.76
293	0.75
294	0.75
295	0.74
296	0.68
297	0.63
298	0.56
299	0.47
300	0.37
301	0.31
302	0.22
303	0.16
304	0.11
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.1
310	0.11
311	0.12
312	0.13
313	0.14
314	0.14
315	0.17
316	0.16
317	0.14
318	0.13
319	0.13
320	0.12
321	0.11
322	0.11
323	0.08
324	0.08
325	0.08
326	0.09
327	0.09
328	0.11
329	0.11
330	0.14
331	0.14
332	0.16
333	0.24
334	0.27
335	0.34
336	0.42
337	0.52
338	0.55
339	0.65
340	0.72
341	0.74
342	0.82
343	0.84
344	0.83
345	0.81
346	0.83
347	0.83
348	0.84
349	0.79
350	0.75
351	0.74
352	0.67
353	0.58
354	0.49
355	0.42
356	0.33
357	0.27
358	0.2
359	0.12
360	0.11
361	0.11
362	0.11
363	0.08
364	0.1
365	0.14
366	0.17
367	0.18
368	0.17
369	0.18
370	0.18
371	0.2
372	0.19
373	0.15
374	0.14
375	0.13
376	0.14
377	0.12
378	0.13
379	0.12
380	0.13
381	0.15
382	0.14
383	0.14
384	0.15
385	0.15
386	0.18
387	0.2
388	0.2
389	0.17
390	0.18
391	0.17
392	0.18
393	0.18
394	0.14
395	0.11
396	0.11
397	0.12
398	0.14
399	0.14
400	0.12
401	0.11
402	0.14
403	0.14
404	0.15
405	0.15
406	0.13
407	0.14
408	0.14
409	0.14
410	0.12
411	0.12
412	0.11
413	0.1
414	0.08
415	0.08
416	0.09
417	0.1
418	0.1
419	0.11
420	0.11
421	0.11
422	0.12
423	0.12
424	0.11
425	0.12
426	0.16
427	0.15
428	0.16
429	0.17
430	0.16
431	0.16
432	0.14
433	0.13
434	0.09
435	0.08
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.03
447	0.03
448	0.04
449	0.04
450	0.05
451	0.05
452	0.06
453	0.06
454	0.08
455	0.08
456	0.08
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.09
462	0.08
463	0.09
464	0.08
465	0.09
466	0.1
467	0.1
468	0.11
469	0.1
470	0.11
471	0.15
472	0.19
473	0.18
474	0.19
475	0.19
476	0.25
477	0.26
478	0.25
479	0.21
480	0.18
481	0.22
482	0.2
483	0.22
484	0.15
485	0.14
486	0.14
487	0.13
488	0.12
489	0.08
490	0.07
491	0.05
492	0.05
493	0.05
494	0.04
495	0.04
496	0.07
497	0.07
498	0.09
499	0.08
500	0.13
501	0.17
502	0.19
503	0.2
504	0.18
505	0.23
506	0.24
507	0.25
508	0.22
509	0.2
510	0.2
511	0.2
512	0.26
513	0.25
514	0.3
515	0.3
516	0.3
517	0.28
518	0.28
519	0.28
520	0.21
521	0.19
522	0.14
523	0.12
524	0.12
525	0.11
526	0.1
527	0.09
528	0.08
529	0.06
530	0.04
531	0.04
532	0.03
533	0.04
534	0.05
535	0.06
536	0.08
537	0.08
538	0.09
539	0.11
540	0.16
541	0.16
542	0.15
543	0.17
544	0.16
545	0.16
546	0.21
547	0.18
548	0.15
549	0.15
550	0.16
551	0.2
552	0.23
553	0.23
554	0.22
555	0.23
556	0.22
557	0.24
558	0.25
559	0.2
560	0.19
561	0.2
562	0.16
563	0.17
564	0.17
565	0.22
566	0.25
567	0.27
568	0.32
569	0.36
570	0.39
571	0.38
572	0.44
573	0.39
574	0.37
575	0.37
576	0.33
577	0.34
578	0.32
579	0.31
580	0.25
581	0.23
582	0.22
583	0.18
584	0.15
585	0.09
586	0.08
587	0.09
588	0.1
589	0.15
590	0.2
591	0.21
592	0.28
593	0.34
594	0.44
595	0.46
596	0.47
597	0.45
598	0.49
599	0.51
600	0.49
601	0.48
602	0.39
603	0.36
604	0.34
605	0.3
606	0.22
607	0.18
608	0.17
609	0.15
610	0.15
611	0.18
612	0.21
613	0.23
614	0.27
615	0.29
616	0.3
617	0.31
618	0.32
619	0.33
620	0.32
621	0.31
622	0.28
623	0.25
624	0.21
625	0.2
626	0.22
627	0.22
628	0.19
629	0.2
630	0.22
631	0.22
632	0.24
633	0.25
634	0.29
635	0.3
636	0.32
637	0.33
638	0.34
639	0.35
640	0.36
641	0.39
642	0.41
643	0.44
644	0.51
645	0.59
646	0.66
647	0.69
648	0.72
649	0.75
650	0.76
651	0.81
652	0.81
653	0.8
654	0.83
655	0.83
656	0.81
657	0.78
658	0.73
659	0.65
660	0.59
661	0.53
662	0.43
663	0.39
664	0.34
665	0.26
666	0.2
667	0.22
668	0.22
669	0.24
670	0.27
671	0.32
672	0.4
673	0.49
674	0.55
675	0.59
676	0.6
677	0.65
678	0.7
679	0.75
680	0.78
681	0.8
682	0.83
683	0.85
684	0.88
685	0.88
686	0.88
687	0.89
688	0.84
689	0.8
690	0.73
691	0.69
692	0.61
693	0.51
694	0.43
695	0.38
696	0.36
697	0.34
698	0.4
699	0.4
700	0.45
701	0.49
702	0.52
703	0.54
704	0.58
705	0.61
706	0.55
707	0.57
708	0.53
709	0.56
710	0.51
711	0.44
712	0.36
713	0.28
714	0.24
715	0.17
716	0.17
717	0.11
718	0.11
719	0.1
720	0.16
721	0.24
722	0.31
723	0.38
724	0.46
725	0.51
726	0.56
727	0.65
728	0.7
729	0.73
730	0.7
731	0.73
732	0.69
733	0.68
734	0.63
735	0.53
736	0.42
737	0.32
738	0.27
739	0.17
740	0.11
741	0.07
742	0.06
743	0.08
744	0.1
745	0.1
746	0.1
747	0.11
748	0.12
749	0.12
750	0.14
751	0.15
752	0.17
753	0.19
754	0.2
755	0.2
756	0.21
757	0.21
758	0.22
759	0.22
760	0.26
761	0.25
762	0.24
763	0.26
764	0.26
765	0.26
766	0.24
767	0.24
768	0.17
769	0.18
770	0.18
771	0.14
772	0.13
773	0.12
774	0.11
775	0.08
776	0.06
777	0.05
778	0.07
779	0.07
780	0.07
781	0.08
782	0.08
783	0.12
784	0.13
785	0.13
786	0.14
787	0.15
788	0.18
789	0.18
790	0.18
791	0.13
792	0.12
793	0.14
794	0.12
795	0.11
796	0.07
797	0.07
798	0.08
799	0.09
800	0.1
801	0.08
802	0.08
803	0.1
804	0.16
805	0.21
806	0.28
807	0.32
808	0.37
809	0.44
810	0.47
811	0.54
812	0.55
813	0.52
814	0.51
815	0.47
816	0.46
817	0.4
818	0.38
819	0.29
820	0.23
821	0.21
822	0.15
823	0.14
824	0.09
825	0.07
826	0.06
827	0.07
828	0.07
829	0.07
830	0.07
831	0.06
832	0.07
833	0.08
834	0.08
835	0.08
836	0.1
837	0.11
838	0.12
839	0.13
840	0.13
841	0.12
842	0.13
843	0.13
844	0.11
845	0.1
846	0.11
847	0.13
848	0.12
849	0.17
850	0.18
851	0.2
852	0.25
853	0.27
854	0.27
855	0.31
856	0.33
857	0.34
858	0.4
859	0.45
860	0.44
861	0.44
862	0.46
863	0.46
864	0.52
865	0.54
866	0.53
867	0.56
868	0.62
869	0.69

A0A1Q8RM62

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer