FuNGI

A0A1Q8RA62

Protein Details

Accession

A0A1Q8RA62

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-39	GQNPNGQPRPPPIKRRPRGDPLVARKRPG	Basic
202-221	KDPNAVQKPKPKKEEKDVQF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
18-48	PRPPPIKRRPRGDPLVARKRPGPPRPASARP
210-214	PKPKK
421-441	KKAEEERRKEGKRTTKALIKR
519-528	KKGKSLKRPG
542-546	RKKLK

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPGLPNGQNPNGQPRPPPIKRRPRGDPLVARKRPGPPRPASARPAPNSLQTASGARPSPGATSRPGIPQPQTEEEIRVRRAANGGWLDPPPPNVKEFKIVTTKKALKDGVRHHVMKLFSSKADLEQRGIDPTNQAEFTRPVTLQRRDPRQPPPGREVKQEQPEPMPVDEKEAERLAQLKAEREAVRAVELAKSAPSLKDPNAVQKPKPKKEEKDVQFHRTPRTEKEKKQQELRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAPLSETTVCFVATRDGKFTVVPLEKWYKFTAKPHFNTMRLEEAEALMSKKTDVGRWYMRDKQKKSEQEEWEATRHALYGPARIKTESNTFRAASREEKLDHDQIDMEGDEFQDDDENPGLDVDNDEEFKEASDRIRRDQLGANLFGDADERRVEKEENEEKKAEEERRKEGKRTTKALIKREKETIYQSDSSGYDPFESSSSDEDSDEEKQAEENKDKEKEKEDETAQKADSKDKTASGVSSKGNTTPSGRQKHTDALKKGKSLKRPGSPNLSESSGNESSRKKLKKHAVASVQQSRSSTPVGQKSHLGKGPMSDGEATGGEMSDGQLRKKKIKLVGTGARGTPVGSRAGSPIPAVSGSKPGSPMPEGSPAPRAGSPPGPIEAWEIVNALPQLPEGISIGNLMRRFQGRIGDGPGQMDRKEWIKLVKENCAYGADKILRRKAQPSV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.53
3	0.53
4	0.49
5	0.5
6	0.56
7	0.61
8	0.7
9	0.7
10	0.75
11	0.82
12	0.87
13	0.87
14	0.86
15	0.86
16	0.86
17	0.85
18	0.85
19	0.87
20	0.82
21	0.76
22	0.72
23	0.72
24	0.72
25	0.7
26	0.69
27	0.64
28	0.7
29	0.75
30	0.77
31	0.74
32	0.73
33	0.74
34	0.68
35	0.68
36	0.61
37	0.58
38	0.54
39	0.48
40	0.41
41	0.33
42	0.32
43	0.27
44	0.3
45	0.26
46	0.22
47	0.23
48	0.21
49	0.24
50	0.25
51	0.26
52	0.24
53	0.26
54	0.29
55	0.34
56	0.37
57	0.37
58	0.37
59	0.4
60	0.44
61	0.45
62	0.45
63	0.4
64	0.42
65	0.43
66	0.47
67	0.43
68	0.4
69	0.36
70	0.35
71	0.36
72	0.31
73	0.32
74	0.29
75	0.29
76	0.28
77	0.28
78	0.27
79	0.26
80	0.28
81	0.26
82	0.23
83	0.25
84	0.26
85	0.27
86	0.33
87	0.34
88	0.37
89	0.42
90	0.43
91	0.44
92	0.5
93	0.55
94	0.51
95	0.56
96	0.54
97	0.49
98	0.56
99	0.6
100	0.59
101	0.6
102	0.58
103	0.53
104	0.53
105	0.49
106	0.43
107	0.4
108	0.33
109	0.26
110	0.27
111	0.26
112	0.27
113	0.35
114	0.33
115	0.29
116	0.3
117	0.3
118	0.32
119	0.32
120	0.27
121	0.21
122	0.22
123	0.24
124	0.21
125	0.21
126	0.19
127	0.2
128	0.22
129	0.24
130	0.22
131	0.25
132	0.33
133	0.38
134	0.44
135	0.51
136	0.58
137	0.61
138	0.67
139	0.69
140	0.71
141	0.74
142	0.71
143	0.71
144	0.72
145	0.68
146	0.69
147	0.67
148	0.65
149	0.66
150	0.63
151	0.57
152	0.5
153	0.52
154	0.47
155	0.42
156	0.36
157	0.27
158	0.29
159	0.28
160	0.26
161	0.24
162	0.22
163	0.21
164	0.19
165	0.21
166	0.16
167	0.18
168	0.18
169	0.18
170	0.18
171	0.25
172	0.24
173	0.23
174	0.25
175	0.21
176	0.21
177	0.19
178	0.18
179	0.13
180	0.13
181	0.12
182	0.1
183	0.11
184	0.11
185	0.1
186	0.13
187	0.15
188	0.16
189	0.21
190	0.22
191	0.31
192	0.39
193	0.43
194	0.44
195	0.5
196	0.6
197	0.63
198	0.72
199	0.71
200	0.68
201	0.74
202	0.81
203	0.77
204	0.78
205	0.76
206	0.74
207	0.72
208	0.68
209	0.65
210	0.61
211	0.58
212	0.54
213	0.58
214	0.6
215	0.61
216	0.68
217	0.72
218	0.71
219	0.78
220	0.76
221	0.73
222	0.71
223	0.67
224	0.6
225	0.51
226	0.45
227	0.38
228	0.34
229	0.26
230	0.2
231	0.16
232	0.12
233	0.1
234	0.12
235	0.12
236	0.13
237	0.13
238	0.12
239	0.12
240	0.12
241	0.12
242	0.11
243	0.09
244	0.06
245	0.08
246	0.08
247	0.07
248	0.08
249	0.08
250	0.09
251	0.1
252	0.1
253	0.09
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.09
258	0.12
259	0.14
260	0.15
261	0.16
262	0.17
263	0.17
264	0.17
265	0.17
266	0.19
267	0.17
268	0.17
269	0.19
270	0.26
271	0.26
272	0.28
273	0.3
274	0.27
275	0.28
276	0.35
277	0.4
278	0.42
279	0.43
280	0.5
281	0.53
282	0.51
283	0.52
284	0.47
285	0.43
286	0.34
287	0.33
288	0.24
289	0.19
290	0.17
291	0.15
292	0.13
293	0.08
294	0.07
295	0.06
296	0.09
297	0.09
298	0.11
299	0.11
300	0.16
301	0.21
302	0.25
303	0.3
304	0.36
305	0.44
306	0.51
307	0.53
308	0.56
309	0.6
310	0.64
311	0.66
312	0.67
313	0.63
314	0.6
315	0.62
316	0.56
317	0.48
318	0.41
319	0.34
320	0.25
321	0.21
322	0.14
323	0.13
324	0.11
325	0.16
326	0.18
327	0.2
328	0.2
329	0.21
330	0.21
331	0.2
332	0.28
333	0.25
334	0.25
335	0.26
336	0.26
337	0.26
338	0.27
339	0.27
340	0.22
341	0.19
342	0.2
343	0.18
344	0.21
345	0.24
346	0.25
347	0.23
348	0.2
349	0.19
350	0.16
351	0.16
352	0.12
353	0.09
354	0.06
355	0.06
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.07
378	0.09
379	0.16
380	0.17
381	0.2
382	0.26
383	0.26
384	0.27
385	0.31
386	0.33
387	0.3
388	0.29
389	0.27
390	0.21
391	0.21
392	0.18
393	0.15
394	0.09
395	0.07
396	0.07
397	0.08
398	0.08
399	0.11
400	0.12
401	0.11
402	0.2
403	0.29
404	0.32
405	0.35
406	0.35
407	0.33
408	0.36
409	0.41
410	0.4
411	0.38
412	0.38
413	0.43
414	0.52
415	0.55
416	0.56
417	0.58
418	0.61
419	0.61
420	0.62
421	0.59
422	0.56
423	0.6
424	0.65
425	0.67
426	0.61
427	0.56
428	0.57
429	0.54
430	0.49
431	0.48
432	0.43
433	0.38
434	0.35
435	0.32
436	0.28
437	0.26
438	0.25
439	0.2
440	0.17
441	0.12
442	0.11
443	0.11
444	0.1
445	0.1
446	0.1
447	0.11
448	0.12
449	0.12
450	0.12
451	0.12
452	0.14
453	0.15
454	0.15
455	0.13
456	0.12
457	0.12
458	0.18
459	0.21
460	0.22
461	0.24
462	0.29
463	0.36
464	0.38
465	0.4
466	0.4
467	0.4
468	0.4
469	0.42
470	0.41
471	0.43
472	0.44
473	0.44
474	0.39
475	0.39
476	0.37
477	0.37
478	0.35
479	0.3
480	0.28
481	0.26
482	0.27
483	0.24
484	0.25
485	0.21
486	0.23
487	0.21
488	0.22
489	0.21
490	0.21
491	0.22
492	0.22
493	0.23
494	0.27
495	0.35
496	0.41
497	0.42
498	0.43
499	0.44
500	0.51
501	0.55
502	0.56
503	0.54
504	0.56
505	0.59
506	0.62
507	0.68
508	0.66
509	0.67
510	0.68
511	0.69
512	0.68
513	0.7
514	0.71
515	0.71
516	0.68
517	0.61
518	0.54
519	0.48
520	0.4
521	0.34
522	0.35
523	0.29
524	0.28
525	0.29
526	0.28
527	0.31
528	0.4
529	0.45
530	0.4
531	0.46
532	0.56
533	0.62
534	0.67
535	0.7
536	0.7
537	0.7
538	0.76
539	0.76
540	0.68
541	0.6
542	0.54
543	0.46
544	0.39
545	0.35
546	0.3
547	0.27
548	0.33
549	0.35
550	0.36
551	0.41
552	0.43
553	0.48
554	0.47
555	0.42
556	0.34
557	0.33
558	0.35
559	0.29
560	0.27
561	0.2
562	0.17
563	0.16
564	0.16
565	0.14
566	0.1
567	0.09
568	0.07
569	0.06
570	0.07
571	0.11
572	0.13
573	0.16
574	0.22
575	0.26
576	0.32
577	0.37
578	0.43
579	0.45
580	0.52
581	0.56
582	0.6
583	0.65
584	0.64
585	0.63
586	0.57
587	0.5
588	0.42
589	0.35
590	0.27
591	0.21
592	0.17
593	0.14
594	0.15
595	0.16
596	0.18
597	0.18
598	0.17
599	0.15
600	0.14
601	0.15
602	0.15
603	0.14
604	0.19
605	0.2
606	0.21
607	0.23
608	0.22
609	0.25
610	0.25
611	0.27
612	0.23
613	0.29
614	0.29
615	0.29
616	0.33
617	0.31
618	0.32
619	0.31
620	0.29
621	0.26
622	0.29
623	0.3
624	0.28
625	0.29
626	0.26
627	0.25
628	0.27
629	0.25
630	0.21
631	0.19
632	0.17
633	0.14
634	0.17
635	0.17
636	0.13
637	0.11
638	0.1
639	0.1
640	0.1
641	0.11
642	0.08
643	0.08
644	0.08
645	0.09
646	0.11
647	0.14
648	0.15
649	0.15
650	0.19
651	0.21
652	0.24
653	0.25
654	0.31
655	0.3
656	0.33
657	0.38
658	0.39
659	0.38
660	0.38
661	0.4
662	0.36
663	0.33
664	0.3
665	0.27
666	0.25
667	0.27
668	0.27
669	0.3
670	0.34
671	0.42
672	0.46
673	0.52
674	0.53
675	0.51
676	0.5
677	0.47
678	0.41
679	0.35
680	0.38
681	0.36
682	0.38
683	0.44
684	0.52
685	0.53
686	0.55

A0A1Q8RA62

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer