FuNGI

A0A1Q8RWD4

Protein Details

Accession

A0A1Q8RWD4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
206-226	AANAGRKRKKRWDVSSTPAGD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
211-216	RKRKKR

Subcellular Location(s)

plas 18, cyto_nucl 4, nucl 3.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDADFEAVRKLQAERNAAAAAKKGSRTFDPSNQRADSGTKQKLTESFDTELYDGNGVDKFAGYHTSIPAGDDDDDEMEGADNTRRLVGQYTASRDMIDEFARGDGVEEDDVLAGRGEKSNRITDRETDYQKRRFDRALTPTRADPFAANGADGTSYRDIMEKRELEREEERVMRAIAAKAEGGAEENGNVAQATLKDGDMENADAANAGRKRKKRWDVSSTPAGDEEAGQPSEPVKSKRSRWDQAPSLPGTEAADGPKKRSRWDQAPSATPMGNQGLATPMHPSQAGGAILPTTFGTDISGRNMPLSDEELDALLPGEEQGYKILEPPPGYAPVRAPAHKLMATPAQQTGFMMQDPDAVRLSGKPMPAEIPGIGDLQFFKAEDMAYFGKLTDGSDENSLSVEELKERKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARQFGAGPLFDQILPLLMEKTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGKEIISNLSKAAGLATMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAVLPHLKGLVDCIGPNLNDEQTKVRTVTSLAIAALAEASNPYGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGFIIPLMDEEYANYYTSQIMEILLREFSSPDEEMKKVVLKVVSQCASTDGVTAGYLKEHVLDEFFKSFWVRRMALDKRNYRQVVETTVDIGQKVGVSEILERIVVNLKDESEAYRKMTVETVEKIVASLGAADIGERLEERLIDGILHSFQEQSVEDIIMLNGFGSVVNALGTRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLISRIAMVMKQCGEDALMGKLGIVLYEYLGEEYPEVLGSILGALRSIVTVVGITQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVNTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHIALGVVGLGCEDAMVHLLNLLYPNLFETSPHVIDRIIEAIEAIRIAVGPGIVLNYVWAGLFHPARKVRTPYWRLYNDAYVQGADAMVPYYPNLDEEKVDRSELAIML

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.32
3	0.34
4	0.36
5	0.35
6	0.34
7	0.33
8	0.3
9	0.29
10	0.33
11	0.32
12	0.34
13	0.37
14	0.44
15	0.47
16	0.51
17	0.57
18	0.58
19	0.62
20	0.6
21	0.56
22	0.5
23	0.48
24	0.48
25	0.47
26	0.5
27	0.46
28	0.46
29	0.49
30	0.52
31	0.53
32	0.5
33	0.45
34	0.4
35	0.38
36	0.39
37	0.36
38	0.32
39	0.26
40	0.21
41	0.16
42	0.14
43	0.13
44	0.11
45	0.11
46	0.1
47	0.09
48	0.09
49	0.13
50	0.13
51	0.14
52	0.16
53	0.18
54	0.18
55	0.19
56	0.18
57	0.18
58	0.17
59	0.15
60	0.15
61	0.13
62	0.13
63	0.12
64	0.11
65	0.09
66	0.09
67	0.09
68	0.11
69	0.1
70	0.11
71	0.12
72	0.12
73	0.13
74	0.16
75	0.18
76	0.23
77	0.28
78	0.34
79	0.37
80	0.37
81	0.36
82	0.33
83	0.33
84	0.28
85	0.23
86	0.17
87	0.13
88	0.14
89	0.14
90	0.13
91	0.12
92	0.1
93	0.11
94	0.1
95	0.09
96	0.09
97	0.1
98	0.1
99	0.09
100	0.08
101	0.07
102	0.08
103	0.12
104	0.14
105	0.18
106	0.23
107	0.31
108	0.35
109	0.4
110	0.42
111	0.43
112	0.49
113	0.53
114	0.57
115	0.58
116	0.63
117	0.65
118	0.7
119	0.7
120	0.67
121	0.64
122	0.61
123	0.61
124	0.62
125	0.65
126	0.64
127	0.62
128	0.61
129	0.59
130	0.55
131	0.46
132	0.36
133	0.3
134	0.28
135	0.25
136	0.2
137	0.17
138	0.16
139	0.16
140	0.15
141	0.16
142	0.12
143	0.12
144	0.13
145	0.17
146	0.17
147	0.21
148	0.29
149	0.29
150	0.3
151	0.38
152	0.39
153	0.4
154	0.43
155	0.43
156	0.4
157	0.39
158	0.38
159	0.32
160	0.31
161	0.27
162	0.26
163	0.24
164	0.2
165	0.18
166	0.16
167	0.14
168	0.14
169	0.12
170	0.11
171	0.1
172	0.09
173	0.08
174	0.08
175	0.08
176	0.08
177	0.08
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.09
182	0.1
183	0.1
184	0.11
185	0.11
186	0.13
187	0.13
188	0.14
189	0.11
190	0.1
191	0.1
192	0.09
193	0.09
194	0.15
195	0.17
196	0.23
197	0.31
198	0.37
199	0.46
200	0.56
201	0.66
202	0.7
203	0.76
204	0.79
205	0.8
206	0.82
207	0.82
208	0.74
209	0.64
210	0.54
211	0.45
212	0.34
213	0.28
214	0.22
215	0.16
216	0.14
217	0.13
218	0.13
219	0.13
220	0.18
221	0.21
222	0.22
223	0.25
224	0.32
225	0.4
226	0.5
227	0.59
228	0.62
229	0.65
230	0.71
231	0.72
232	0.71
233	0.71
234	0.62
235	0.54
236	0.47
237	0.4
238	0.31
239	0.25
240	0.19
241	0.16
242	0.22
243	0.21
244	0.26
245	0.31
246	0.31
247	0.34
248	0.42
249	0.48
250	0.49
251	0.56
252	0.6
253	0.6
254	0.64
255	0.64
256	0.57
257	0.49
258	0.4
259	0.36
260	0.28
261	0.23
262	0.17
263	0.13
264	0.13
265	0.13
266	0.13
267	0.13
268	0.12
269	0.12
270	0.12
271	0.12
272	0.1
273	0.14
274	0.13
275	0.1
276	0.1
277	0.09
278	0.09
279	0.1
280	0.09
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.07
285	0.09
286	0.1
287	0.13
288	0.15
289	0.14
290	0.15
291	0.15
292	0.14
293	0.14
294	0.16
295	0.13
296	0.12
297	0.12
298	0.12
299	0.11
300	0.11
301	0.09
302	0.06
303	0.05
304	0.04
305	0.05
306	0.04
307	0.05
308	0.06
309	0.07
310	0.07
311	0.1
312	0.13
313	0.15
314	0.15
315	0.17
316	0.19
317	0.23
318	0.24
319	0.23
320	0.21
321	0.26
322	0.29
323	0.28
324	0.29
325	0.26
326	0.3
327	0.29
328	0.28
329	0.24
330	0.26
331	0.27
332	0.26
333	0.25
334	0.22
335	0.2
336	0.2
337	0.19
338	0.14
339	0.11
340	0.11
341	0.08
342	0.13
343	0.14
344	0.15
345	0.14
346	0.13
347	0.13
348	0.13
349	0.17
350	0.15
351	0.15
352	0.13
353	0.14
354	0.15
355	0.16
356	0.17
357	0.13
358	0.12
359	0.12
360	0.12
361	0.11
362	0.1
363	0.1
364	0.09
365	0.1
366	0.08
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.1
372	0.1
373	0.1
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.11
379	0.09
380	0.1
381	0.1
382	0.12
383	0.12
384	0.11
385	0.11
386	0.11
387	0.08
388	0.08
389	0.07
390	0.1
391	0.11
392	0.12
393	0.16
394	0.17
395	0.19
396	0.21
397	0.26
398	0.27
399	0.35
400	0.41
401	0.43
402	0.49
403	0.49
404	0.47
405	0.49
406	0.48
407	0.45
408	0.45
409	0.42
410	0.42
411	0.45
412	0.44
413	0.42
414	0.48
415	0.5
416	0.45
417	0.43
418	0.41
419	0.45
420	0.52
421	0.51
422	0.42
423	0.33
424	0.31
425	0.3
426	0.29
427	0.22
428	0.14
429	0.11
430	0.1
431	0.11
432	0.11
433	0.1
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.06
439	0.05
440	0.06
441	0.06
442	0.09
443	0.1
444	0.12
445	0.12
446	0.13
447	0.16
448	0.17
449	0.18
450	0.16
451	0.15
452	0.14
453	0.18
454	0.2
455	0.17
456	0.18
457	0.18
458	0.18
459	0.18
460	0.18
461	0.13
462	0.13
463	0.14
464	0.14
465	0.15
466	0.17
467	0.16
468	0.17
469	0.18
470	0.18
471	0.16
472	0.15
473	0.13
474	0.13
475	0.14
476	0.13
477	0.12
478	0.09
479	0.09
480	0.09
481	0.09
482	0.06
483	0.04
484	0.03
485	0.04
486	0.05
487	0.05
488	0.06
489	0.07
490	0.07
491	0.08
492	0.1
493	0.1
494	0.12
495	0.12
496	0.14
497	0.13
498	0.14
499	0.13
500	0.11
501	0.1
502	0.08
503	0.08
504	0.05
505	0.04
506	0.04
507	0.04
508	0.05
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.06
516	0.07
517	0.09
518	0.1
519	0.11
520	0.13
521	0.14
522	0.15
523	0.15
524	0.14
525	0.11
526	0.11
527	0.11
528	0.11
529	0.1
530	0.1
531	0.09
532	0.08
533	0.09
534	0.08
535	0.07
536	0.06
537	0.05
538	0.04
539	0.04
540	0.03
541	0.03
542	0.03
543	0.03
544	0.02
545	0.03
546	0.03
547	0.04
548	0.06
549	0.08
550	0.11
551	0.16
552	0.2
553	0.23
554	0.28
555	0.37
556	0.45
557	0.53
558	0.55
559	0.58
560	0.61
561	0.65
562	0.62
563	0.57
564	0.5
565	0.45
566	0.44
567	0.37
568	0.33
569	0.26
570	0.24
571	0.19
572	0.17
573	0.13
574	0.08
575	0.06
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.05
580	0.05
581	0.04
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.06
586	0.07
587	0.07
588	0.07
589	0.08
590	0.09
591	0.08
592	0.09
593	0.09
594	0.08
595	0.08
596	0.1
597	0.12
598	0.12
599	0.13
600	0.13
601	0.12
602	0.11
603	0.12
604	0.13
605	0.11
606	0.1
607	0.08
608	0.08
609	0.08
610	0.07
611	0.06
612	0.04
613	0.03
614	0.03
615	0.03
616	0.03
617	0.03
618	0.03
619	0.03
620	0.04
621	0.05
622	0.05
623	0.06
624	0.06
625	0.06
626	0.07
627	0.07
628	0.07
629	0.06
630	0.05
631	0.05
632	0.06
633	0.08
634	0.13
635	0.22
636	0.24
637	0.25
638	0.31
639	0.34
640	0.36
641	0.36
642	0.37
643	0.32
644	0.3
645	0.3
646	0.24
647	0.2
648	0.18
649	0.15
650	0.08
651	0.05
652	0.03
653	0.03
654	0.03
655	0.03
656	0.04
657	0.04
658	0.04
659	0.04
660	0.07
661	0.08
662	0.08
663	0.08
664	0.08
665	0.08
666	0.08
667	0.08
668	0.06
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.06
678	0.09
679	0.09
680	0.1
681	0.12
682	0.13
683	0.13
684	0.14
685	0.16
686	0.13
687	0.15
688	0.14
689	0.13
690	0.16
691	0.21
692	0.21
693	0.19
694	0.19
695	0.18
696	0.18
697	0.17
698	0.14
699	0.09
700	0.08
701	0.08
702	0.08
703	0.06
704	0.05
705	0.06
706	0.05
707	0.06
708	0.06
709	0.06
710	0.07
711	0.08
712	0.1
713	0.1
714	0.1
715	0.1
716	0.11
717	0.12
718	0.16
719	0.2
720	0.18
721	0.2
722	0.28
723	0.34
724	0.4
725	0.48
726	0.5
727	0.5
728	0.58
729	0.57
730	0.5
731	0.46
732	0.4
733	0.36
734	0.31
735	0.27
736	0.2
737	0.21
738	0.2
739	0.16
740	0.15
741	0.1
742	0.09
743	0.08
744	0.07
745	0.05
746	0.05
747	0.06
748	0.07
749	0.07
750	0.07
751	0.07
752	0.07
753	0.12
754	0.11
755	0.12
756	0.12
757	0.12
758	0.12
759	0.13
760	0.15
761	0.14
762	0.16
763	0.16
764	0.18
765	0.18
766	0.18
767	0.2
768	0.19
769	0.19
770	0.19
771	0.19
772	0.17
773	0.17
774	0.16
775	0.14
776	0.12
777	0.08
778	0.06
779	0.04
780	0.04
781	0.03
782	0.03
783	0.04
784	0.04
785	0.04
786	0.04
787	0.04
788	0.04
789	0.04
790	0.05
791	0.06
792	0.06
793	0.06
794	0.06
795	0.06
796	0.07
797	0.07
798	0.07
799	0.06
800	0.06
801	0.08
802	0.08
803	0.09
804	0.09
805	0.08
806	0.08
807	0.08
808	0.08
809	0.07
810	0.06
811	0.04
812	0.03
813	0.03
814	0.03
815	0.03
816	0.03
817	0.03
818	0.04
819	0.04
820	0.04
821	0.08
822	0.09
823	0.12
824	0.12
825	0.13
826	0.14
827	0.2
828	0.3
829	0.29
830	0.31
831	0.3
832	0.33
833	0.33
834	0.32
835	0.29
836	0.22
837	0.22
838	0.21
839	0.22
840	0.25
841	0.26
842	0.27
843	0.29
844	0.32
845	0.37
846	0.4
847	0.39
848	0.33
849	0.33
850	0.32
851	0.29
852	0.26
853	0.19
854	0.15
855	0.12
856	0.12
857	0.1
858	0.1
859	0.09
860	0.08
861	0.1
862	0.1
863	0.1
864	0.1
865	0.11
866	0.11
867	0.1
868	0.11
869	0.09
870	0.09
871	0.08
872	0.08
873	0.09
874	0.08
875	0.07
876	0.06
877	0.05
878	0.04
879	0.05
880	0.06
881	0.06
882	0.06
883	0.06
884	0.06
885	0.06
886	0.06
887	0.05
888	0.05
889	0.04
890	0.04
891	0.04
892	0.04
893	0.05
894	0.04
895	0.04
896	0.04
897	0.04
898	0.04
899	0.04
900	0.04
901	0.03
902	0.03
903	0.04
904	0.05
905	0.05
906	0.06
907	0.09
908	0.12
909	0.13
910	0.13
911	0.15
912	0.16
913	0.18
914	0.2
915	0.2
916	0.23
917	0.25
918	0.26
919	0.28
920	0.29
921	0.33
922	0.37
923	0.46
924	0.45
925	0.51
926	0.53
927	0.59
928	0.62
929	0.64
930	0.61
931	0.61
932	0.57
933	0.53
934	0.5
935	0.42
936	0.35
937	0.28
938	0.23
939	0.14
940	0.11
941	0.08
942	0.08
943	0.08
944	0.09
945	0.1
946	0.11
947	0.14
948	0.17
949	0.2
950	0.22
951	0.23
952	0.23
953	0.26
954	0.25
955	0.24
956	0.24
957	0.22
958	0.21
959	0.19
960	0.18
961	0.19
962	0.19
963	0.19
964	0.15
965	0.18
966	0.22
967	0.22
968	0.24
969	0.22
970	0.27
971	0.33
972	0.43
973	0.49
974	0.5
975	0.59
976	0.65
977	0.72
978	0.67
979	0.6
980	0.51
981	0.41
982	0.36
983	0.28
984	0.2
985	0.11
986	0.13
987	0.13
988	0.12
989	0.11
990	0.11
991	0.11
992	0.1
993	0.1
994	0.07
995	0.07
996	0.08
997	0.1
998	0.12
999	0.12
1000	0.13
1001	0.14
1002	0.16
1003	0.19
1004	0.26
1005	0.29
1006	0.35
1007	0.37
1008	0.42
1009	0.42
1010	0.43
1011	0.4
1012	0.32
1013	0.28
1014	0.2
1015	0.17
1016	0.11
1017	0.09
1018	0.06
1019	0.06
1020	0.05
1021	0.04
1022	0.04
1023	0.04
1024	0.05
1025	0.05
1026	0.06
1027	0.09
1028	0.1
1029	0.1
1030	0.11
1031	0.16
1032	0.16
1033	0.18
1034	0.18
1035	0.17
1036	0.18
1037	0.18
1038	0.19
1039	0.2
1040	0.23
1041	0.25
1042	0.26
1043	0.25
1044	0.28
1045	0.27
1046	0.26
1047	0.2
1048	0.17
1049	0.14
1050	0.14
1051	0.15
1052	0.11
1053	0.11
1054	0.11
1055	0.11
1056	0.13
1057	0.12
1058	0.13
1059	0.11
1060	0.11
1061	0.11
1062	0.1
1063	0.1
1064	0.09
1065	0.08
1066	0.07
1067	0.08
1068	0.08
1069	0.08
1070	0.08
1071	0.08
1072	0.08
1073	0.07
1074	0.06
1075	0.07
1076	0.1
1077	0.1
1078	0.1
1079	0.11
1080	0.14
1081	0.19
1082	0.21
1083	0.23
1084	0.2
1085	0.2
1086	0.22
1087	0.27
1088	0.3
1089	0.27
1090	0.27
1091	0.26
1092	0.26
1093	0.25
1094	0.23
1095	0.18
1096	0.11
1097	0.1
1098	0.08
1099	0.06
1100	0.05
1101	0.05
1102	0.05
1103	0.04
1104	0.04
1105	0.04
1106	0.03
1107	0.04
1108	0.05
1109	0.05
1110	0.06
1111	0.06
1112	0.07
1113	0.09
1114	0.09
1115	0.08
1116	0.08
1117	0.1
1118	0.11
1119	0.11
1120	0.1
1121	0.14
1122	0.21
1123	0.23
1124	0.24
1125	0.23
1126	0.21
1127	0.22
1128	0.23
1129	0.21
1130	0.14
1131	0.11
1132	0.11
1133	0.11
1134	0.11
1135	0.1
1136	0.08
1137	0.06
1138	0.05
1139	0.06
1140	0.06
1141	0.05
1142	0.05
1143	0.05
1144	0.06
1145	0.06
1146	0.06
1147	0.06
1148	0.06
1149	0.06
1150	0.06
1151	0.06
1152	0.06
1153	0.12
1154	0.16
1155	0.17
1156	0.25
1157	0.31
1158	0.36
1159	0.43
1160	0.49
1161	0.52
1162	0.59
1163	0.65
1164	0.66
1165	0.7
1166	0.7
1167	0.68
1168	0.66
1169	0.65
1170	0.58
1171	0.55
1172	0.47
1173	0.36
1174	0.32
1175	0.27
1176	0.22
1177	0.14
1178	0.11
1179	0.08
1180	0.07
1181	0.07
1182	0.07
1183	0.08
1184	0.09
1185	0.11
1186	0.14
1187	0.15
1188	0.17
1189	0.19
1190	0.25
1191	0.25
1192	0.25
1193	0.23
1194	0.21

A0A1Q8RWD4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer