FuNGI

G0V6Z5

Protein Details

Accession

G0V6Z5

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
35-65	GSNRSPFIKRDRLKRNFLKSRMNSRRVVKKD	Hydrophilic
580-605	NEGKEKLSRKSSPRKKSPSVTAPRLR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
43-50	KRDRLKRN
317-328	RAKRGNSRRKTR
582-604	GKEKLSRKSSPRKKSPSVTAPRL

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	ncs:NCAS_0A06850 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MDQSSKEDSPMVNGRAKPTGQRSQARADTAGGGGGSNRSPFIKRDRLKRNFLKSRMNSRRVVKKDDPELLEERERALLSSQTTSNSIDIKPNVKVKKEVSSNEEQFNEYPLRAVSKESLENMRTHLLKFQSKKRINPNESFHPPIRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQREIQEYKKKQLQPQQSQLQKASQTPNSVNTANQTPSVSATPAVVGSSTTNATPGLQTSAASATTDTTNQPPIVNGIVDGPTTTAPTAVASNGTEASTTAVPMITQLEEAGMAEDPTKVGMVKYDGKESELQEEATVDPFADVSPDGGGRAKRGNSRRKTRQLKVLDENAKKLRFEEFYPWVMEDYDGYNTWVGSYEAGNSDSYVLLSVEDDGSFTMIPADKVYKFTARNKYATLTIEEAEKRMDKKSGEVPRWLMKHLDNIGTTTTRYDRTKRRLKAVADQRNADEDEAHDDNSEVELDYDEEFADDEEAPIIDGNEQENKESEQRIKKEMLQANAMGLRDDEQLPDEEDADDLFNEKKIDEEGERIKKALQKTELAALYSSDDDEINPYLSESETENKEENEKIKKEDNENEGKEKLSRKSSPRKKSPSVTAPRLRVKSIKDCIIILKGSKKLLKNFPKGQWNPNVNKRKREESMGPETQIKEEPQANNASSISKSPLIKQEEPPSKKIKTEPTENGTIPLITEQDIIDAIGDGKVNVKEFGKGIRKKYPGPENKKLMFAIVKKLCRKVDNEHMELKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.43
3	0.45
4	0.46
5	0.46
6	0.51
7	0.54
8	0.6
9	0.6
10	0.64
11	0.68
12	0.63
13	0.56
14	0.49
15	0.42
16	0.34
17	0.3
18	0.21
19	0.16
20	0.13
21	0.13
22	0.13
23	0.11
24	0.12
25	0.14
26	0.16
27	0.21
28	0.29
29	0.38
30	0.44
31	0.53
32	0.63
33	0.7
34	0.78
35	0.84
36	0.85
37	0.85
38	0.86
39	0.86
40	0.84
41	0.87
42	0.87
43	0.83
44	0.8
45	0.78
46	0.81
47	0.76
48	0.77
49	0.74
50	0.72
51	0.73
52	0.74
53	0.68
54	0.63
55	0.61
56	0.57
57	0.53
58	0.45
59	0.38
60	0.32
61	0.3
62	0.25
63	0.23
64	0.21
65	0.18
66	0.22
67	0.21
68	0.2
69	0.22
70	0.23
71	0.23
72	0.23
73	0.22
74	0.24
75	0.27
76	0.29
77	0.33
78	0.4
79	0.43
80	0.44
81	0.49
82	0.46
83	0.52
84	0.56
85	0.55
86	0.54
87	0.58
88	0.59
89	0.58
90	0.56
91	0.48
92	0.41
93	0.4
94	0.35
95	0.25
96	0.22
97	0.17
98	0.19
99	0.17
100	0.2
101	0.19
102	0.21
103	0.24
104	0.27
105	0.32
106	0.3
107	0.31
108	0.31
109	0.34
110	0.3
111	0.28
112	0.3
113	0.3
114	0.36
115	0.42
116	0.49
117	0.54
118	0.59
119	0.67
120	0.72
121	0.77
122	0.76
123	0.78
124	0.76
125	0.75
126	0.75
127	0.73
128	0.64
129	0.6
130	0.54
131	0.55
132	0.58
133	0.54
134	0.55
135	0.59
136	0.65
137	0.67
138	0.75
139	0.76
140	0.74
141	0.71
142	0.7
143	0.64
144	0.57
145	0.55
146	0.46
147	0.37
148	0.28
149	0.31
150	0.28
151	0.32
152	0.37
153	0.33
154	0.33
155	0.34
156	0.4
157	0.4
158	0.45
159	0.49
160	0.49
161	0.55
162	0.61
163	0.65
164	0.67
165	0.71
166	0.73
167	0.71
168	0.74
169	0.75
170	0.72
171	0.72
172	0.66
173	0.62
174	0.53
175	0.49
176	0.46
177	0.4
178	0.39
179	0.36
180	0.38
181	0.37
182	0.35
183	0.3
184	0.27
185	0.28
186	0.24
187	0.24
188	0.2
189	0.17
190	0.18
191	0.19
192	0.16
193	0.12
194	0.11
195	0.1
196	0.1
197	0.09
198	0.07
199	0.06
200	0.06
201	0.08
202	0.08
203	0.07
204	0.08
205	0.08
206	0.08
207	0.08
208	0.08
209	0.09
210	0.09
211	0.09
212	0.09
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.09
217	0.08
218	0.09
219	0.1
220	0.1
221	0.11
222	0.13
223	0.14
224	0.14
225	0.13
226	0.13
227	0.13
228	0.12
229	0.1
230	0.09
231	0.09
232	0.09
233	0.09
234	0.08
235	0.07
236	0.08
237	0.07
238	0.06
239	0.05
240	0.06
241	0.07
242	0.06
243	0.07
244	0.07
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.07
249	0.07
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.07
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.04
266	0.04
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.04
273	0.04
274	0.05
275	0.09
276	0.15
277	0.16
278	0.2
279	0.2
280	0.21
281	0.24
282	0.24
283	0.24
284	0.19
285	0.18
286	0.14
287	0.15
288	0.13
289	0.11
290	0.1
291	0.07
292	0.06
293	0.06
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.04
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.08
302	0.08
303	0.09
304	0.13
305	0.15
306	0.22
307	0.31
308	0.41
309	0.47
310	0.58
311	0.66
312	0.73
313	0.8
314	0.78
315	0.79
316	0.76
317	0.74
318	0.7
319	0.69
320	0.67
321	0.6
322	0.6
323	0.55
324	0.49
325	0.42
326	0.37
327	0.31
328	0.23
329	0.24
330	0.25
331	0.23
332	0.24
333	0.24
334	0.24
335	0.21
336	0.19
337	0.17
338	0.12
339	0.09
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.08
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.06
349	0.05
350	0.06
351	0.07
352	0.08
353	0.08
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.06
358	0.06
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.05
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.05
372	0.05
373	0.06
374	0.08
375	0.08
376	0.1
377	0.12
378	0.16
379	0.19
380	0.27
381	0.36
382	0.38
383	0.39
384	0.38
385	0.38
386	0.36
387	0.34
388	0.28
389	0.2
390	0.17
391	0.18
392	0.17
393	0.16
394	0.15
395	0.15
396	0.14
397	0.14
398	0.17
399	0.14
400	0.17
401	0.25
402	0.32
403	0.33
404	0.35
405	0.37
406	0.4
407	0.41
408	0.38
409	0.32
410	0.25
411	0.28
412	0.27
413	0.26
414	0.21
415	0.2
416	0.21
417	0.19
418	0.18
419	0.14
420	0.14
421	0.15
422	0.17
423	0.23
424	0.31
425	0.4
426	0.5
427	0.53
428	0.59
429	0.62
430	0.62
431	0.66
432	0.67
433	0.68
434	0.62
435	0.59
436	0.52
437	0.47
438	0.45
439	0.35
440	0.24
441	0.14
442	0.16
443	0.15
444	0.15
445	0.12
446	0.11
447	0.11
448	0.11
449	0.11
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.06
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.04
469	0.05
470	0.06
471	0.11
472	0.11
473	0.11
474	0.13
475	0.14
476	0.17
477	0.19
478	0.25
479	0.28
480	0.31
481	0.35
482	0.36
483	0.38
484	0.45
485	0.46
486	0.42
487	0.37
488	0.34
489	0.32
490	0.32
491	0.28
492	0.19
493	0.14
494	0.13
495	0.12
496	0.13
497	0.11
498	0.1
499	0.11
500	0.12
501	0.12
502	0.11
503	0.09
504	0.09
505	0.09
506	0.08
507	0.07
508	0.07
509	0.07
510	0.08
511	0.08
512	0.08
513	0.08
514	0.09
515	0.12
516	0.12
517	0.17
518	0.24
519	0.31
520	0.32
521	0.32
522	0.33
523	0.35
524	0.38
525	0.39
526	0.35
527	0.31
528	0.32
529	0.38
530	0.36
531	0.32
532	0.29
533	0.22
534	0.19
535	0.17
536	0.15
537	0.09
538	0.08
539	0.07
540	0.09
541	0.1
542	0.09
543	0.09
544	0.09
545	0.09
546	0.09
547	0.1
548	0.1
549	0.14
550	0.15
551	0.18
552	0.19
553	0.2
554	0.22
555	0.25
556	0.28
557	0.32
558	0.32
559	0.34
560	0.4
561	0.44
562	0.48
563	0.53
564	0.55
565	0.56
566	0.57
567	0.57
568	0.51
569	0.47
570	0.44
571	0.42
572	0.41
573	0.39
574	0.43
575	0.48
576	0.58
577	0.67
578	0.74
579	0.79
580	0.83
581	0.83
582	0.83
583	0.84
584	0.83
585	0.83
586	0.82
587	0.8
588	0.78
589	0.79
590	0.74
591	0.67
592	0.62
593	0.58
594	0.58
595	0.56
596	0.54
597	0.47
598	0.46
599	0.45
600	0.43
601	0.39
602	0.33
603	0.32
604	0.3
605	0.33
606	0.38
607	0.4
608	0.44
609	0.53
610	0.6
611	0.63
612	0.68
613	0.71
614	0.76
615	0.76
616	0.76
617	0.75
618	0.74
619	0.73
620	0.75
621	0.79
622	0.74
623	0.79
624	0.76
625	0.75
626	0.7
627	0.69
628	0.67
629	0.64
630	0.68
631	0.64
632	0.6
633	0.56
634	0.53
635	0.48
636	0.43
637	0.36
638	0.31
639	0.31
640	0.3
641	0.3
642	0.34
643	0.32
644	0.31
645	0.3
646	0.27
647	0.22
648	0.23
649	0.23
650	0.23
651	0.23
652	0.26
653	0.33
654	0.39
655	0.44
656	0.48
657	0.55
658	0.6
659	0.64
660	0.66
661	0.65
662	0.6
663	0.6
664	0.6
665	0.6
666	0.57
667	0.62
668	0.64
669	0.63
670	0.67
671	0.63
672	0.58
673	0.49
674	0.41
675	0.32
676	0.24
677	0.19
678	0.13
679	0.13
680	0.11
681	0.1
682	0.11
683	0.1
684	0.08
685	0.08
686	0.08
687	0.08
688	0.08
689	0.07
690	0.11
691	0.13
692	0.14
693	0.16
694	0.17
695	0.18
696	0.19
697	0.29
698	0.35
699	0.4
700	0.46
701	0.53
702	0.58
703	0.62
704	0.7
705	0.72
706	0.73
707	0.76
708	0.79
709	0.79
710	0.77
711	0.75
712	0.66
713	0.6
714	0.56
715	0.5
716	0.51
717	0.49
718	0.54
719	0.56
720	0.63
721	0.64
722	0.62
723	0.63
724	0.62
725	0.64
726	0.65
727	0.64

G0V6Z5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer