Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0VDB6

Protein Details
Accession G0VDB6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
530-549SSPIKRRRVDYIKKNERSRSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003150  DNA-bd_RFX  
IPR039779  RFX-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
KEGG ncs:NCAS_0C04880  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02257  RFX_DNA_binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51526  RFX_DBD  
Amino Acid Sequences MPENKHETSAAAAAAATTAATANAHAHANASTSANQQLMNPSYQRSTSSIYHLLQAPSGQHMVNGPPLLAALPQANQMGPLPQQHTPLQSYQGTTNITNNNNTNNNNNSTMRLHEYHYGQAQQHPSHSGPTDGHPITRNDYERIPIQRQIDQMQYQHLRPILPAIASAAASATNHVPLPNFHHHHQQPQQQQQQQQHPRLLRTNSPVNILMNTPTPSASPSLSNLGLLPLLAQARLERTQSSIPSFAYQPTPSATSTTTAQVNGKANTSNEKAKRFNSLQNPPTAGKKTAKSQNVQEKNSPPPPPTSSRSSVSPPTRRNTQEILAKSIAEKYLNNPISEYASIVRNAEIAVLNMDAQTNSKASLQKAEQNRERERQVYALLWLMKNCESKHDSFVPRGRIFAQYASSCAQNNLKPLSQASLGKLIRTVFPDLTTRRLGMRGQSKYHYCGLRLINSDDFNPNDTDNDDNDEISPIKRENSEQLDVKLIDPENQEQQGAMTTTATTTNSDSAKETANDTLKRNNNGFESGNSSPIKRRRVDYIKKNERSRSSSADDSYNEIPFLDDLYHKMFMNDDLANTEHEALKLPPIPRDKLNLTTDKDIVSSLESLYYVHCKTIFENIKFMKFESLQKNLFLFSSGSISPQMYSLFISEELYDWIYQCDLITHIELIKFFSNLVINNKPMNDSILFKLDLFAKDYCDYVSKASIDLPLPVVEKKLKIAKKFSNLIKKLIKLFKFIQSFENSFPSFKEGMKKDWQNIINLHDILDMVSNERHQQVMKLIKDFMQVNIPMFLKDEYRQEGTPTTTDTDTDNKEKAVPNSMIGFMEALLQFISDEGKLNASGNVVVDCFVRFTNTVVGDISLKSADNLLPWLFVHNITVQLLHYSLDVSKFIKDTTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.06
4 0.04
5 0.04
6 0.04
7 0.05
8 0.06
9 0.07
10 0.1
11 0.11
12 0.11
13 0.12
14 0.12
15 0.14
16 0.15
17 0.16
18 0.16
19 0.17
20 0.2
21 0.2
22 0.2
23 0.2
24 0.26
25 0.26
26 0.29
27 0.28
28 0.28
29 0.3
30 0.31
31 0.32
32 0.28
33 0.31
34 0.29
35 0.34
36 0.38
37 0.35
38 0.39
39 0.4
40 0.37
41 0.33
42 0.32
43 0.27
44 0.24
45 0.25
46 0.2
47 0.16
48 0.17
49 0.18
50 0.21
51 0.2
52 0.16
53 0.14
54 0.15
55 0.14
56 0.13
57 0.12
58 0.09
59 0.09
60 0.12
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.15
66 0.16
67 0.2
68 0.22
69 0.23
70 0.28
71 0.29
72 0.33
73 0.34
74 0.34
75 0.34
76 0.33
77 0.33
78 0.3
79 0.32
80 0.31
81 0.28
82 0.32
83 0.33
84 0.34
85 0.36
86 0.37
87 0.39
88 0.42
89 0.43
90 0.43
91 0.42
92 0.44
93 0.44
94 0.42
95 0.39
96 0.35
97 0.37
98 0.37
99 0.33
100 0.32
101 0.32
102 0.34
103 0.35
104 0.37
105 0.38
106 0.33
107 0.37
108 0.41
109 0.37
110 0.37
111 0.36
112 0.33
113 0.33
114 0.32
115 0.29
116 0.24
117 0.26
118 0.32
119 0.29
120 0.31
121 0.3
122 0.31
123 0.34
124 0.39
125 0.38
126 0.32
127 0.33
128 0.34
129 0.36
130 0.41
131 0.4
132 0.39
133 0.39
134 0.41
135 0.42
136 0.43
137 0.43
138 0.4
139 0.37
140 0.4
141 0.4
142 0.37
143 0.37
144 0.35
145 0.29
146 0.26
147 0.28
148 0.21
149 0.17
150 0.17
151 0.14
152 0.14
153 0.13
154 0.13
155 0.09
156 0.08
157 0.07
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.11
165 0.19
166 0.27
167 0.31
168 0.32
169 0.41
170 0.43
171 0.52
172 0.59
173 0.6
174 0.6
175 0.66
176 0.73
177 0.68
178 0.73
179 0.72
180 0.75
181 0.75
182 0.72
183 0.69
184 0.64
185 0.63
186 0.64
187 0.6
188 0.55
189 0.52
190 0.54
191 0.48
192 0.47
193 0.44
194 0.38
195 0.35
196 0.29
197 0.25
198 0.19
199 0.19
200 0.16
201 0.15
202 0.14
203 0.14
204 0.15
205 0.14
206 0.13
207 0.13
208 0.17
209 0.16
210 0.16
211 0.15
212 0.14
213 0.13
214 0.11
215 0.09
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.11
222 0.14
223 0.14
224 0.13
225 0.16
226 0.2
227 0.22
228 0.24
229 0.22
230 0.21
231 0.22
232 0.23
233 0.21
234 0.22
235 0.19
236 0.18
237 0.18
238 0.19
239 0.17
240 0.18
241 0.17
242 0.15
243 0.16
244 0.18
245 0.17
246 0.16
247 0.17
248 0.2
249 0.23
250 0.22
251 0.22
252 0.21
253 0.21
254 0.25
255 0.27
256 0.31
257 0.32
258 0.38
259 0.4
260 0.4
261 0.47
262 0.45
263 0.5
264 0.51
265 0.55
266 0.53
267 0.53
268 0.56
269 0.49
270 0.5
271 0.46
272 0.4
273 0.36
274 0.35
275 0.39
276 0.44
277 0.48
278 0.46
279 0.51
280 0.58
281 0.62
282 0.62
283 0.59
284 0.56
285 0.58
286 0.6
287 0.54
288 0.45
289 0.41
290 0.43
291 0.43
292 0.43
293 0.42
294 0.4
295 0.4
296 0.41
297 0.4
298 0.44
299 0.47
300 0.51
301 0.5
302 0.5
303 0.55
304 0.55
305 0.55
306 0.5
307 0.47
308 0.45
309 0.42
310 0.43
311 0.36
312 0.33
313 0.29
314 0.27
315 0.23
316 0.17
317 0.16
318 0.12
319 0.22
320 0.24
321 0.23
322 0.22
323 0.21
324 0.23
325 0.22
326 0.21
327 0.12
328 0.12
329 0.13
330 0.13
331 0.12
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.08
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.1
348 0.12
349 0.13
350 0.18
351 0.19
352 0.24
353 0.31
354 0.38
355 0.41
356 0.46
357 0.51
358 0.51
359 0.52
360 0.47
361 0.41
362 0.35
363 0.31
364 0.23
365 0.19
366 0.18
367 0.17
368 0.16
369 0.15
370 0.15
371 0.16
372 0.19
373 0.18
374 0.2
375 0.21
376 0.23
377 0.27
378 0.32
379 0.31
380 0.34
381 0.39
382 0.41
383 0.38
384 0.38
385 0.35
386 0.3
387 0.29
388 0.25
389 0.23
390 0.15
391 0.17
392 0.17
393 0.16
394 0.14
395 0.15
396 0.16
397 0.15
398 0.17
399 0.18
400 0.17
401 0.17
402 0.17
403 0.18
404 0.17
405 0.16
406 0.15
407 0.21
408 0.2
409 0.19
410 0.21
411 0.19
412 0.18
413 0.19
414 0.2
415 0.12
416 0.13
417 0.18
418 0.17
419 0.2
420 0.2
421 0.18
422 0.17
423 0.18
424 0.18
425 0.19
426 0.26
427 0.26
428 0.28
429 0.31
430 0.32
431 0.33
432 0.37
433 0.33
434 0.25
435 0.27
436 0.26
437 0.27
438 0.27
439 0.26
440 0.24
441 0.24
442 0.24
443 0.2
444 0.19
445 0.16
446 0.15
447 0.13
448 0.11
449 0.11
450 0.11
451 0.1
452 0.13
453 0.12
454 0.11
455 0.11
456 0.12
457 0.12
458 0.1
459 0.12
460 0.08
461 0.09
462 0.1
463 0.11
464 0.15
465 0.19
466 0.23
467 0.23
468 0.23
469 0.25
470 0.25
471 0.24
472 0.22
473 0.17
474 0.16
475 0.16
476 0.17
477 0.17
478 0.16
479 0.16
480 0.13
481 0.13
482 0.11
483 0.1
484 0.09
485 0.06
486 0.05
487 0.06
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.1
493 0.1
494 0.11
495 0.12
496 0.12
497 0.14
498 0.13
499 0.14
500 0.15
501 0.2
502 0.22
503 0.23
504 0.3
505 0.32
506 0.35
507 0.35
508 0.33
509 0.3
510 0.3
511 0.29
512 0.22
513 0.24
514 0.21
515 0.25
516 0.23
517 0.23
518 0.26
519 0.31
520 0.37
521 0.33
522 0.34
523 0.39
524 0.49
525 0.58
526 0.62
527 0.67
528 0.72
529 0.78
530 0.82
531 0.79
532 0.74
533 0.71
534 0.65
535 0.59
536 0.53
537 0.49
538 0.44
539 0.41
540 0.35
541 0.33
542 0.31
543 0.25
544 0.2
545 0.16
546 0.14
547 0.11
548 0.11
549 0.08
550 0.06
551 0.08
552 0.11
553 0.12
554 0.12
555 0.12
556 0.12
557 0.12
558 0.15
559 0.13
560 0.1
561 0.11
562 0.11
563 0.12
564 0.12
565 0.12
566 0.1
567 0.09
568 0.11
569 0.09
570 0.12
571 0.16
572 0.16
573 0.21
574 0.25
575 0.27
576 0.28
577 0.33
578 0.33
579 0.36
580 0.4
581 0.41
582 0.4
583 0.41
584 0.4
585 0.34
586 0.31
587 0.25
588 0.2
589 0.14
590 0.11
591 0.08
592 0.08
593 0.07
594 0.07
595 0.08
596 0.12
597 0.11
598 0.11
599 0.12
600 0.12
601 0.13
602 0.23
603 0.3
604 0.27
605 0.34
606 0.35
607 0.39
608 0.38
609 0.38
610 0.33
611 0.27
612 0.34
613 0.33
614 0.37
615 0.34
616 0.36
617 0.36
618 0.31
619 0.29
620 0.22
621 0.17
622 0.11
623 0.13
624 0.11
625 0.12
626 0.12
627 0.13
628 0.11
629 0.12
630 0.11
631 0.09
632 0.09
633 0.09
634 0.09
635 0.09
636 0.09
637 0.09
638 0.09
639 0.09
640 0.1
641 0.1
642 0.09
643 0.09
644 0.08
645 0.08
646 0.07
647 0.07
648 0.07
649 0.08
650 0.09
651 0.09
652 0.1
653 0.11
654 0.12
655 0.13
656 0.13
657 0.12
658 0.11
659 0.12
660 0.13
661 0.14
662 0.2
663 0.21
664 0.22
665 0.24
666 0.25
667 0.25
668 0.23
669 0.24
670 0.19
671 0.19
672 0.19
673 0.21
674 0.21
675 0.19
676 0.21
677 0.21
678 0.21
679 0.21
680 0.19
681 0.19
682 0.19
683 0.19
684 0.19
685 0.17
686 0.17
687 0.16
688 0.19
689 0.16
690 0.16
691 0.16
692 0.19
693 0.17
694 0.17
695 0.17
696 0.15
697 0.16
698 0.16
699 0.18
700 0.17
701 0.18
702 0.22
703 0.29
704 0.33
705 0.37
706 0.46
707 0.5
708 0.56
709 0.63
710 0.67
711 0.69
712 0.67
713 0.69
714 0.66
715 0.62
716 0.63
717 0.63
718 0.56
719 0.51
720 0.52
721 0.53
722 0.51
723 0.48
724 0.45
725 0.43
726 0.44
727 0.41
728 0.43
729 0.35
730 0.31
731 0.31
732 0.3
733 0.26
734 0.25
735 0.31
736 0.28
737 0.33
738 0.43
739 0.47
740 0.47
741 0.54
742 0.54
743 0.5
744 0.5
745 0.48
746 0.44
747 0.39
748 0.34
749 0.26
750 0.23
751 0.19
752 0.18
753 0.14
754 0.11
755 0.12
756 0.12
757 0.14
758 0.15
759 0.16
760 0.15
761 0.17
762 0.22
763 0.3
764 0.33
765 0.33
766 0.34
767 0.34
768 0.39
769 0.37
770 0.31
771 0.29
772 0.27
773 0.25
774 0.28
775 0.26
776 0.22
777 0.23
778 0.22
779 0.18
780 0.2
781 0.24
782 0.25
783 0.28
784 0.28
785 0.29
786 0.32
787 0.32
788 0.31
789 0.28
790 0.27
791 0.23
792 0.23
793 0.24
794 0.26
795 0.29
796 0.32
797 0.3
798 0.28
799 0.32
800 0.36
801 0.36
802 0.38
803 0.33
804 0.32
805 0.33
806 0.33
807 0.29
808 0.24
809 0.22
810 0.14
811 0.17
812 0.14
813 0.12
814 0.1
815 0.1
816 0.09
817 0.09
818 0.1
819 0.06
820 0.08
821 0.09
822 0.11
823 0.11
824 0.12
825 0.13
826 0.13
827 0.13
828 0.12
829 0.13
830 0.11
831 0.11
832 0.11
833 0.1
834 0.11
835 0.1
836 0.12
837 0.11
838 0.13
839 0.19
840 0.2
841 0.21
842 0.2
843 0.21
844 0.2
845 0.19
846 0.19
847 0.13
848 0.12
849 0.12
850 0.13
851 0.13
852 0.12
853 0.15
854 0.14
855 0.14
856 0.14
857 0.17
858 0.16
859 0.16
860 0.17
861 0.16
862 0.18
863 0.17
864 0.18
865 0.15
866 0.15
867 0.15
868 0.14
869 0.12
870 0.11
871 0.12
872 0.14
873 0.15
874 0.15
875 0.17
876 0.18