Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q8RCT7

Protein Details
Accession A0A1Q8RCT7    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-73AAKMAESKHEWKRRRAVKKDSRVKMGHBasic
262-283DNLIRDKPSKKQRPPKNPALMSHydrophilic
408-446AQQNQGGNNKNKKRKWEDNKNFDKNSKKRRNSSSGDDAEHydrophilic
454-482KHNETEKTTKESPKRSPKAKPTKSTEEEWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-68KHEWKRRRAVKKDSR
268-276KPSKKQRPP
417-441KNKKRKWEDNKNFDKNSKKRRNSSS
446-474EKPAAKMTKHNETEKTTKESPKRSPKAKP
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 9.5, cyto_mito 8.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MAKDTVLEGVFAINKPYGMSSAQVIRDCQTQFNPSDMFKPLIERDLAAKMAESKHEWKRRRAVKKDSRVKMGHGGTLDPLATGVLILGVGSGTKSLGSFLDCTKTYETVVLFGASTDTYDRVGRILSRRPYDEITKEKVEKAMESFRGKFEQIPPLYSALKMEGKPLYEYAREGKAIPREIVGREVEVTELELVEWYEPGTHNFRWPTEEAETAEKNLAEQVWRVEKQQDTTRKLTPEEEKEEEKALSEHEEEKKKFEERQDNLIRDKPSKKQRPPKNPALMSGALGQLPAGKGSNLIAPPPSADEPFPWTDKGPPAARIRMTVTSGFYVRSFCHDLGVKVSSAAMMAELERSRQSDFEVRTENCLEYTDLVKGEGVWGPKVAEMLSSWQKKYPNGAPQAEQKRNNHAQQNQGGNNKNKKRKWEDNKNFDKNSKKRRNSSSGDDAEKPAAKMTKHNETEKTTKESPKRSPKAKPTKSTEEEWDGIKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.15
4 0.15
5 0.13
6 0.14
7 0.15
8 0.21
9 0.26
10 0.27
11 0.28
12 0.28
13 0.33
14 0.33
15 0.34
16 0.31
17 0.32
18 0.32
19 0.35
20 0.35
21 0.31
22 0.33
23 0.32
24 0.31
25 0.25
26 0.29
27 0.27
28 0.28
29 0.28
30 0.25
31 0.25
32 0.26
33 0.26
34 0.21
35 0.2
36 0.2
37 0.21
38 0.24
39 0.25
40 0.3
41 0.39
42 0.49
43 0.54
44 0.59
45 0.67
46 0.74
47 0.8
48 0.82
49 0.83
50 0.85
51 0.89
52 0.91
53 0.88
54 0.87
55 0.78
56 0.73
57 0.71
58 0.62
59 0.54
60 0.45
61 0.38
62 0.3
63 0.29
64 0.24
65 0.15
66 0.12
67 0.08
68 0.07
69 0.06
70 0.05
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.04
81 0.04
82 0.05
83 0.06
84 0.08
85 0.09
86 0.11
87 0.16
88 0.17
89 0.2
90 0.21
91 0.22
92 0.21
93 0.22
94 0.2
95 0.17
96 0.17
97 0.14
98 0.12
99 0.1
100 0.11
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.14
111 0.18
112 0.26
113 0.31
114 0.35
115 0.38
116 0.4
117 0.43
118 0.45
119 0.47
120 0.45
121 0.43
122 0.45
123 0.45
124 0.43
125 0.43
126 0.38
127 0.32
128 0.3
129 0.32
130 0.32
131 0.34
132 0.35
133 0.33
134 0.35
135 0.34
136 0.33
137 0.3
138 0.33
139 0.29
140 0.3
141 0.29
142 0.29
143 0.29
144 0.26
145 0.22
146 0.17
147 0.2
148 0.18
149 0.2
150 0.19
151 0.19
152 0.2
153 0.21
154 0.21
155 0.17
156 0.19
157 0.18
158 0.19
159 0.19
160 0.19
161 0.21
162 0.24
163 0.25
164 0.24
165 0.22
166 0.22
167 0.22
168 0.24
169 0.2
170 0.15
171 0.14
172 0.13
173 0.12
174 0.1
175 0.09
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.08
187 0.12
188 0.12
189 0.16
190 0.18
191 0.18
192 0.21
193 0.22
194 0.23
195 0.21
196 0.23
197 0.2
198 0.23
199 0.23
200 0.2
201 0.2
202 0.15
203 0.13
204 0.12
205 0.11
206 0.07
207 0.07
208 0.09
209 0.14
210 0.15
211 0.16
212 0.19
213 0.2
214 0.23
215 0.3
216 0.35
217 0.35
218 0.38
219 0.41
220 0.39
221 0.39
222 0.4
223 0.38
224 0.36
225 0.36
226 0.36
227 0.33
228 0.33
229 0.33
230 0.28
231 0.23
232 0.17
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.14
237 0.18
238 0.25
239 0.25
240 0.28
241 0.3
242 0.3
243 0.33
244 0.36
245 0.4
246 0.36
247 0.46
248 0.51
249 0.51
250 0.51
251 0.53
252 0.48
253 0.43
254 0.44
255 0.42
256 0.46
257 0.53
258 0.6
259 0.65
260 0.73
261 0.79
262 0.84
263 0.86
264 0.85
265 0.76
266 0.7
267 0.65
268 0.55
269 0.45
270 0.38
271 0.28
272 0.18
273 0.16
274 0.13
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.1
288 0.12
289 0.13
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.15
294 0.18
295 0.19
296 0.17
297 0.17
298 0.19
299 0.21
300 0.25
301 0.23
302 0.27
303 0.3
304 0.34
305 0.33
306 0.33
307 0.33
308 0.3
309 0.3
310 0.25
311 0.23
312 0.2
313 0.2
314 0.18
315 0.16
316 0.15
317 0.13
318 0.16
319 0.19
320 0.17
321 0.2
322 0.21
323 0.21
324 0.23
325 0.24
326 0.19
327 0.15
328 0.15
329 0.11
330 0.1
331 0.09
332 0.06
333 0.04
334 0.04
335 0.07
336 0.08
337 0.09
338 0.1
339 0.11
340 0.12
341 0.12
342 0.15
343 0.19
344 0.22
345 0.25
346 0.31
347 0.31
348 0.35
349 0.36
350 0.33
351 0.27
352 0.26
353 0.21
354 0.16
355 0.17
356 0.14
357 0.13
358 0.12
359 0.12
360 0.1
361 0.12
362 0.13
363 0.12
364 0.11
365 0.12
366 0.12
367 0.12
368 0.13
369 0.11
370 0.09
371 0.08
372 0.14
373 0.22
374 0.26
375 0.27
376 0.31
377 0.34
378 0.35
379 0.42
380 0.43
381 0.43
382 0.47
383 0.5
384 0.5
385 0.57
386 0.65
387 0.67
388 0.66
389 0.61
390 0.62
391 0.67
392 0.69
393 0.68
394 0.63
395 0.63
396 0.64
397 0.69
398 0.66
399 0.65
400 0.66
401 0.67
402 0.72
403 0.73
404 0.75
405 0.71
406 0.75
407 0.77
408 0.81
409 0.83
410 0.84
411 0.85
412 0.86
413 0.93
414 0.92
415 0.88
416 0.84
417 0.84
418 0.82
419 0.82
420 0.82
421 0.81
422 0.81
423 0.85
424 0.88
425 0.84
426 0.83
427 0.82
428 0.78
429 0.74
430 0.68
431 0.6
432 0.56
433 0.51
434 0.43
435 0.37
436 0.34
437 0.29
438 0.34
439 0.39
440 0.44
441 0.48
442 0.54
443 0.56
444 0.59
445 0.66
446 0.64
447 0.65
448 0.62
449 0.64
450 0.67
451 0.69
452 0.73
453 0.76
454 0.8
455 0.81
456 0.84
457 0.86
458 0.89
459 0.9
460 0.89
461 0.87
462 0.88
463 0.84
464 0.79
465 0.76
466 0.72
467 0.64