Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q8S4L1

Protein Details
Accession A0A1Q8S4L1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-261RMDVDRSRSRSRSRSRSRSRARSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-150RKLRRK
245-261RSRSRSRSRSRSRARSP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14, nucl 13, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKPDTVYADERRFLDERGSSASLAPNGENPATIMEKAVRERIVDAYFYKEQCFAVNEASIVDRVVEHVTFIGGTYGVTQKPTPFLCLAFKLLQLAPSDEVLETYLGFGGEKFKYLRALACFYIRMTRKAKDVYLMLEPFLEDRRKLRRKGRQGTSLTYMDEFVDDLLTKTRVCATSFRELPKRVDLVDLGELEERISPLGDIDELLDEEEEKEAAARGNAVEESEGEIPEGRDNDERMDVDRSRSRSRSRSRSRSRARSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.31
4 0.28
5 0.31
6 0.32
7 0.27
8 0.27
9 0.29
10 0.25
11 0.24
12 0.22
13 0.18
14 0.2
15 0.19
16 0.18
17 0.15
18 0.16
19 0.17
20 0.16
21 0.15
22 0.15
23 0.18
24 0.21
25 0.24
26 0.22
27 0.21
28 0.23
29 0.26
30 0.24
31 0.23
32 0.22
33 0.24
34 0.27
35 0.27
36 0.27
37 0.24
38 0.22
39 0.22
40 0.23
41 0.18
42 0.16
43 0.16
44 0.15
45 0.14
46 0.14
47 0.13
48 0.1
49 0.09
50 0.06
51 0.07
52 0.09
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.06
60 0.04
61 0.04
62 0.06
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.16
69 0.16
70 0.17
71 0.16
72 0.17
73 0.19
74 0.2
75 0.23
76 0.2
77 0.19
78 0.19
79 0.18
80 0.19
81 0.17
82 0.16
83 0.14
84 0.13
85 0.13
86 0.11
87 0.11
88 0.08
89 0.08
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.04
96 0.08
97 0.07
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.12
102 0.13
103 0.16
104 0.15
105 0.18
106 0.17
107 0.18
108 0.18
109 0.16
110 0.22
111 0.21
112 0.23
113 0.24
114 0.24
115 0.27
116 0.28
117 0.28
118 0.24
119 0.24
120 0.21
121 0.22
122 0.2
123 0.16
124 0.14
125 0.14
126 0.12
127 0.14
128 0.13
129 0.09
130 0.13
131 0.23
132 0.3
133 0.37
134 0.46
135 0.53
136 0.63
137 0.72
138 0.76
139 0.75
140 0.72
141 0.7
142 0.66
143 0.57
144 0.47
145 0.37
146 0.3
147 0.2
148 0.17
149 0.12
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.07
155 0.08
156 0.07
157 0.08
158 0.11
159 0.13
160 0.14
161 0.18
162 0.21
163 0.29
164 0.33
165 0.38
166 0.42
167 0.43
168 0.45
169 0.45
170 0.42
171 0.34
172 0.32
173 0.27
174 0.23
175 0.23
176 0.2
177 0.16
178 0.15
179 0.14
180 0.12
181 0.12
182 0.09
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.11
215 0.12
216 0.12
217 0.15
218 0.16
219 0.15
220 0.17
221 0.18
222 0.2
223 0.23
224 0.23
225 0.23
226 0.28
227 0.27
228 0.31
229 0.37
230 0.4
231 0.45
232 0.51
233 0.56
234 0.6
235 0.69
236 0.73
237 0.78
238 0.83
239 0.85
240 0.9
241 0.93