Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q8RL30

Protein Details
Accession A0A1Q8RL30    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
290-311TTTTMGGRRKKRKGALTNPSAYHydrophilic
373-398FLGNYTKPGKRTNKKNKAQTGLEQLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
297-302RRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MAKGKWINKKNAQHFTLVHRPQNDPLIHDENAPSMVLNPVPQRGGSSKEKHLSDLASELGSDAASIRDNEGEAAEYGVYYDDTEYDYMQHLRDLNSGGGEAVWVEASSTANKGKGKQTQSLEEALRQMDLSQKSEELLDESVLPSKNLQRMNYQSQQDIPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDDAYVDEDDDIFQQLAKDSREVDQYEFEEQYDDFEDEDDGWESDATAKPNKEYTSEAVPQLVPVEGEARPEHQNEDWLEDFKQFKKDQKGGKPQNKAAPSEMQSSIWTTTTMGGRRKKRKGALTNPSAYSMTSSSMVRTEQLTLLDARFDKIEEEYTAEMGDDMASVSEVSTASSVTGPTRSDFDSIMDDFLGNYTKPGKRTNKKNKAQTGLEQLDEIRKGLGPARFRSKNYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.67
3 0.68
4 0.65
5 0.6
6 0.54
7 0.55
8 0.53
9 0.58
10 0.51
11 0.42
12 0.43
13 0.42
14 0.39
15 0.38
16 0.34
17 0.27
18 0.27
19 0.24
20 0.17
21 0.12
22 0.13
23 0.12
24 0.15
25 0.16
26 0.18
27 0.19
28 0.19
29 0.22
30 0.22
31 0.28
32 0.33
33 0.37
34 0.43
35 0.49
36 0.5
37 0.48
38 0.49
39 0.44
40 0.36
41 0.33
42 0.25
43 0.18
44 0.17
45 0.14
46 0.12
47 0.1
48 0.08
49 0.06
50 0.06
51 0.07
52 0.08
53 0.09
54 0.09
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.1
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.14
77 0.15
78 0.16
79 0.17
80 0.18
81 0.16
82 0.15
83 0.15
84 0.13
85 0.1
86 0.09
87 0.07
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.06
95 0.09
96 0.1
97 0.14
98 0.16
99 0.19
100 0.26
101 0.33
102 0.37
103 0.42
104 0.45
105 0.46
106 0.48
107 0.49
108 0.43
109 0.37
110 0.34
111 0.27
112 0.23
113 0.18
114 0.15
115 0.16
116 0.17
117 0.18
118 0.17
119 0.17
120 0.17
121 0.17
122 0.17
123 0.12
124 0.11
125 0.09
126 0.08
127 0.09
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.15
133 0.2
134 0.23
135 0.24
136 0.27
137 0.33
138 0.41
139 0.46
140 0.43
141 0.39
142 0.39
143 0.39
144 0.33
145 0.28
146 0.2
147 0.15
148 0.13
149 0.13
150 0.11
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.06
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.11
189 0.15
190 0.16
191 0.16
192 0.15
193 0.16
194 0.17
195 0.17
196 0.15
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.09
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.07
213 0.09
214 0.1
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.17
219 0.18
220 0.18
221 0.18
222 0.19
223 0.23
224 0.25
225 0.24
226 0.22
227 0.21
228 0.2
229 0.18
230 0.15
231 0.08
232 0.06
233 0.08
234 0.07
235 0.09
236 0.09
237 0.11
238 0.13
239 0.14
240 0.16
241 0.14
242 0.19
243 0.17
244 0.22
245 0.2
246 0.19
247 0.19
248 0.2
249 0.23
250 0.21
251 0.27
252 0.24
253 0.3
254 0.37
255 0.44
256 0.49
257 0.57
258 0.66
259 0.7
260 0.76
261 0.78
262 0.74
263 0.76
264 0.7
265 0.63
266 0.55
267 0.51
268 0.45
269 0.42
270 0.37
271 0.3
272 0.27
273 0.27
274 0.25
275 0.18
276 0.15
277 0.11
278 0.13
279 0.16
280 0.21
281 0.27
282 0.34
283 0.43
284 0.53
285 0.61
286 0.66
287 0.7
288 0.75
289 0.78
290 0.81
291 0.82
292 0.8
293 0.78
294 0.7
295 0.65
296 0.55
297 0.44
298 0.36
299 0.26
300 0.19
301 0.15
302 0.14
303 0.12
304 0.14
305 0.14
306 0.13
307 0.13
308 0.13
309 0.13
310 0.14
311 0.15
312 0.14
313 0.14
314 0.17
315 0.16
316 0.15
317 0.14
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.15
322 0.12
323 0.15
324 0.15
325 0.15
326 0.14
327 0.13
328 0.12
329 0.09
330 0.08
331 0.05
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.11
347 0.12
348 0.13
349 0.16
350 0.17
351 0.18
352 0.18
353 0.18
354 0.21
355 0.2
356 0.2
357 0.17
358 0.16
359 0.14
360 0.15
361 0.15
362 0.1
363 0.11
364 0.17
365 0.21
366 0.25
367 0.34
368 0.44
369 0.52
370 0.64
371 0.73
372 0.77
373 0.84
374 0.91
375 0.91
376 0.89
377 0.85
378 0.81
379 0.8
380 0.73
381 0.64
382 0.55
383 0.46
384 0.43
385 0.38
386 0.3
387 0.21
388 0.18
389 0.18
390 0.23
391 0.27
392 0.28
393 0.35
394 0.45
395 0.5