FuNGI

A0A1Q8RXW3

Protein Details

Accession

A0A1Q8RXW3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
311-339	LARLGKGQPKPKKIPKWKLKKQNKGGEES	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
314-334	LGKGQPKPKKIPKWKLKKQNK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039905 CD2BP2/Lin1 IPR003169 GYF IPR035445 GYF-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005682 C:U5 snRNP
Pfam	View protein in Pfam PF02213 GYF
PROSITE	View protein in PROSITE PS50829 GYF

Amino Acid Sequences

MASRHSAARPKRAGETFARTHHHDADDDGHDSKKLKFDVRNPSALAPDAPEEDAILEADVIGGGGGATKRGAVNLDGYDSDSDNERNFKGRAEERHRGKKGDTNFLEQLDNYDAKSAGAAGGKVNEDDEDDDMFAADDDEEQEGKAAQEGIKASGKGSKEVRFLDDEQIEGQDLKSKSGGQIRLDEEESSDDEADRDLAIQEEGIDEEVGLGGLKRNAPKVEAFNMKEEQEEGRFDEDGNYIRKAADPNAVHDKWLEGLSKKDMKKAAAAHEKREAEARRLRMENDDLLTTDLLKALIVRLERGETPLEALARLGKGQPKPKKIPKWKLKKQNKGGEESMDVDQDKEITPEQARRKEAIEAITDAADKLLSRDHAEIYDEEREMLIREWQRETGEEWVEPAKDEEKEDVSAKMWEFRWTDGRDGADKQGPFDGPTMKAWQDAGYFGEGVEFRPVGEDGWTRVATFV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.6
3	0.56
4	0.57
5	0.58
6	0.54
7	0.56
8	0.56
9	0.51
10	0.43
11	0.39
12	0.38
13	0.37
14	0.34
15	0.31
16	0.26
17	0.26
18	0.27
19	0.27
20	0.28
21	0.29
22	0.34
23	0.39
24	0.47
25	0.56
26	0.6
27	0.63
28	0.58
29	0.56
30	0.51
31	0.45
32	0.37
33	0.28
34	0.24
35	0.2
36	0.19
37	0.16
38	0.14
39	0.13
40	0.13
41	0.1
42	0.08
43	0.06
44	0.05
45	0.05
46	0.05
47	0.04
48	0.03
49	0.03
50	0.02
51	0.04
52	0.05
53	0.05
54	0.05
55	0.07
56	0.07
57	0.08
58	0.1
59	0.09
60	0.13
61	0.13
62	0.15
63	0.14
64	0.16
65	0.16
66	0.16
67	0.15
68	0.14
69	0.15
70	0.15
71	0.18
72	0.18
73	0.21
74	0.21
75	0.22
76	0.27
77	0.32
78	0.41
79	0.47
80	0.55
81	0.61
82	0.71
83	0.73
84	0.68
85	0.65
86	0.62
87	0.59
88	0.6
89	0.54
90	0.5
91	0.49
92	0.48
93	0.45
94	0.38
95	0.34
96	0.27
97	0.25
98	0.17
99	0.16
100	0.14
101	0.13
102	0.13
103	0.1
104	0.08
105	0.09
106	0.09
107	0.08
108	0.1
109	0.11
110	0.11
111	0.11
112	0.09
113	0.09
114	0.1
115	0.1
116	0.09
117	0.09
118	0.09
119	0.08
120	0.08
121	0.07
122	0.06
123	0.05
124	0.04
125	0.05
126	0.06
127	0.06
128	0.06
129	0.06
130	0.06
131	0.06
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.09
136	0.1
137	0.13
138	0.15
139	0.15
140	0.15
141	0.18
142	0.18
143	0.2
144	0.24
145	0.25
146	0.27
147	0.29
148	0.31
149	0.3
150	0.32
151	0.33
152	0.29
153	0.25
154	0.21
155	0.2
156	0.18
157	0.14
158	0.12
159	0.13
160	0.13
161	0.13
162	0.14
163	0.14
164	0.17
165	0.23
166	0.26
167	0.21
168	0.27
169	0.28
170	0.29
171	0.3
172	0.27
173	0.21
174	0.19
175	0.18
176	0.13
177	0.12
178	0.09
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.06
183	0.05
184	0.04
185	0.05
186	0.05
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.05
201	0.07
202	0.08
203	0.1
204	0.11
205	0.13
206	0.15
207	0.17
208	0.21
209	0.26
210	0.26
211	0.28
212	0.29
213	0.28
214	0.26
215	0.24
216	0.19
217	0.14
218	0.13
219	0.11
220	0.11
221	0.11
222	0.1
223	0.11
224	0.11
225	0.13
226	0.14
227	0.13
228	0.12
229	0.12
230	0.13
231	0.13
232	0.14
233	0.18
234	0.16
235	0.2
236	0.28
237	0.28
238	0.27
239	0.26
240	0.24
241	0.18
242	0.2
243	0.17
244	0.1
245	0.12
246	0.17
247	0.24
248	0.25
249	0.28
250	0.29
251	0.28
252	0.31
253	0.33
254	0.37
255	0.4
256	0.41
257	0.4
258	0.45
259	0.45
260	0.41
261	0.44
262	0.37
263	0.33
264	0.37
265	0.37
266	0.35
267	0.36
268	0.36
269	0.33
270	0.34
271	0.3
272	0.25
273	0.22
274	0.17
275	0.17
276	0.16
277	0.12
278	0.1
279	0.08
280	0.06
281	0.06
282	0.05
283	0.05
284	0.07
285	0.07
286	0.08
287	0.08
288	0.1
289	0.1
290	0.12
291	0.13
292	0.1
293	0.12
294	0.13
295	0.12
296	0.1
297	0.1
298	0.1
299	0.09
300	0.1
301	0.11
302	0.15
303	0.2
304	0.3
305	0.38
306	0.45
307	0.55
308	0.64
309	0.72
310	0.78
311	0.84
312	0.85
313	0.88
314	0.89
315	0.91
316	0.92
317	0.92
318	0.91
319	0.9
320	0.84
321	0.8
322	0.72
323	0.64
324	0.55
325	0.47
326	0.38
327	0.3
328	0.25
329	0.19
330	0.16
331	0.14
332	0.12
333	0.11
334	0.1
335	0.11
336	0.14
337	0.22
338	0.3
339	0.36
340	0.39
341	0.39
342	0.4
343	0.41
344	0.41
345	0.37
346	0.31
347	0.26
348	0.24
349	0.23
350	0.22
351	0.17
352	0.14
353	0.11
354	0.08
355	0.07
356	0.09
357	0.1
358	0.12
359	0.14
360	0.15
361	0.16
362	0.18
363	0.19
364	0.2
365	0.22
366	0.2
367	0.18
368	0.17
369	0.17
370	0.16
371	0.16
372	0.19
373	0.19
374	0.22
375	0.24
376	0.27
377	0.28
378	0.27
379	0.29
380	0.28
381	0.26
382	0.23
383	0.22
384	0.23
385	0.22
386	0.21
387	0.21
388	0.19
389	0.17
390	0.19
391	0.21
392	0.2
393	0.23
394	0.24
395	0.23
396	0.21
397	0.23
398	0.22
399	0.25
400	0.23
401	0.27
402	0.27
403	0.3
404	0.36
405	0.35
406	0.38
407	0.36
408	0.39
409	0.36
410	0.37
411	0.39
412	0.37
413	0.34
414	0.32
415	0.33
416	0.31
417	0.28
418	0.29
419	0.27
420	0.23
421	0.26
422	0.3
423	0.26
424	0.26
425	0.26
426	0.25
427	0.22
428	0.21
429	0.2
430	0.17
431	0.16
432	0.14
433	0.18
434	0.15
435	0.15
436	0.18
437	0.16
438	0.13
439	0.16
440	0.16
441	0.13
442	0.17
443	0.18
444	0.18
445	0.24
446	0.25

A0A1Q8RXW3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer