Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q8RXY1

Protein Details
Accession A0A1Q8RXY1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-72TATPTAAAPPPKKRKKDSRGVDPSRYSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-61PPKKRKKD
Subcellular Location(s) cyto 13, nucl 7, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR041707  Pus3-like  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
CDD cd02569  PseudoU_synth_ScPus3  
Amino Acid Sequences MADGGKYASWDQARLISRIAHLERELAKRDAATTAVSASGPESGTATPTAAAPPPKKRKKDSRGVDPSRYSTRFIALKFAYLGKRYGGFEYASSATLPTIEGELWAALTKACLIFPDDPDVVNFDCCEYSKCGRTDRGVSAFGQVVGLRVRSSRPAPKPSVAEDADTPMEGTEKPEQQGGGEEKKKPEKVWDDVRDEIQYIKVLNRLLPDDIRVLAWCPSPPPGFSARFSCEERQYRYFFTQPAFTPTTAVGAGGLREGYLDIEAMNAAAQRFVGEHDFRNFCKVDGSKQITNFRRRMHEASVEEVEDAGSALPYLGAGAAEGGRLPKVYSFNIRGTAFLWHQIRHMVTILFLVGQRLEKPEIITELLDVEKTPRKPNYDLAHETPLVLWNCVFPGDEGSRSSTEADDALKWVYGESDVVESLWTHYREKKMDELLANRLLDLVSKQVQGTEGKAKGKRVFQGGHEGKLSGGYVPLAKRQLTPTPTEINDRWAQRKGFKNSEEMRESKNWRKAIKDAKQGAAAAAVDDGDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.3
3 0.26
4 0.27
5 0.35
6 0.35
7 0.31
8 0.29
9 0.34
10 0.38
11 0.41
12 0.44
13 0.37
14 0.37
15 0.33
16 0.34
17 0.29
18 0.24
19 0.2
20 0.15
21 0.15
22 0.14
23 0.13
24 0.12
25 0.11
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.11
30 0.1
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.1
35 0.11
36 0.13
37 0.15
38 0.22
39 0.27
40 0.37
41 0.48
42 0.58
43 0.66
44 0.74
45 0.81
46 0.84
47 0.88
48 0.87
49 0.87
50 0.89
51 0.89
52 0.87
53 0.81
54 0.77
55 0.75
56 0.67
57 0.59
58 0.49
59 0.47
60 0.42
61 0.38
62 0.4
63 0.31
64 0.32
65 0.3
66 0.34
67 0.32
68 0.29
69 0.3
70 0.24
71 0.27
72 0.26
73 0.26
74 0.23
75 0.2
76 0.18
77 0.22
78 0.21
79 0.18
80 0.16
81 0.15
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.11
101 0.13
102 0.15
103 0.2
104 0.19
105 0.19
106 0.2
107 0.22
108 0.19
109 0.17
110 0.15
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.14
115 0.16
116 0.2
117 0.26
118 0.28
119 0.32
120 0.35
121 0.39
122 0.42
123 0.43
124 0.43
125 0.38
126 0.36
127 0.34
128 0.31
129 0.26
130 0.21
131 0.15
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.14
139 0.2
140 0.28
141 0.34
142 0.41
143 0.46
144 0.49
145 0.51
146 0.51
147 0.53
148 0.44
149 0.39
150 0.31
151 0.3
152 0.25
153 0.22
154 0.18
155 0.11
156 0.11
157 0.09
158 0.12
159 0.14
160 0.16
161 0.16
162 0.17
163 0.17
164 0.16
165 0.22
166 0.23
167 0.27
168 0.29
169 0.32
170 0.36
171 0.43
172 0.45
173 0.41
174 0.44
175 0.42
176 0.44
177 0.52
178 0.53
179 0.51
180 0.51
181 0.52
182 0.44
183 0.38
184 0.32
185 0.23
186 0.16
187 0.12
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.13
192 0.14
193 0.14
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.1
205 0.09
206 0.13
207 0.13
208 0.13
209 0.15
210 0.19
211 0.2
212 0.22
213 0.25
214 0.25
215 0.28
216 0.31
217 0.31
218 0.33
219 0.36
220 0.39
221 0.4
222 0.39
223 0.38
224 0.38
225 0.37
226 0.32
227 0.28
228 0.26
229 0.23
230 0.26
231 0.25
232 0.22
233 0.2
234 0.19
235 0.19
236 0.15
237 0.14
238 0.08
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.03
244 0.03
245 0.04
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.15
265 0.17
266 0.17
267 0.21
268 0.2
269 0.17
270 0.21
271 0.2
272 0.2
273 0.26
274 0.32
275 0.31
276 0.35
277 0.44
278 0.46
279 0.53
280 0.53
281 0.48
282 0.48
283 0.5
284 0.5
285 0.45
286 0.45
287 0.39
288 0.38
289 0.36
290 0.3
291 0.25
292 0.21
293 0.17
294 0.1
295 0.09
296 0.05
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.02
302 0.02
303 0.02
304 0.02
305 0.02
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.07
315 0.09
316 0.11
317 0.17
318 0.2
319 0.22
320 0.27
321 0.27
322 0.26
323 0.24
324 0.26
325 0.21
326 0.23
327 0.23
328 0.18
329 0.19
330 0.21
331 0.21
332 0.18
333 0.19
334 0.13
335 0.11
336 0.11
337 0.1
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.06
342 0.07
343 0.08
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.13
348 0.14
349 0.15
350 0.15
351 0.14
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.1
356 0.09
357 0.11
358 0.16
359 0.18
360 0.24
361 0.27
362 0.32
363 0.35
364 0.43
365 0.47
366 0.49
367 0.52
368 0.5
369 0.51
370 0.46
371 0.44
372 0.36
373 0.35
374 0.27
375 0.22
376 0.17
377 0.12
378 0.13
379 0.13
380 0.13
381 0.07
382 0.12
383 0.13
384 0.15
385 0.15
386 0.19
387 0.19
388 0.19
389 0.2
390 0.15
391 0.14
392 0.13
393 0.14
394 0.11
395 0.11
396 0.11
397 0.1
398 0.1
399 0.09
400 0.09
401 0.08
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.07
406 0.07
407 0.08
408 0.07
409 0.1
410 0.15
411 0.16
412 0.18
413 0.24
414 0.3
415 0.33
416 0.37
417 0.4
418 0.4
419 0.44
420 0.46
421 0.45
422 0.44
423 0.46
424 0.43
425 0.36
426 0.31
427 0.25
428 0.21
429 0.17
430 0.16
431 0.14
432 0.15
433 0.15
434 0.16
435 0.18
436 0.19
437 0.22
438 0.25
439 0.27
440 0.34
441 0.37
442 0.43
443 0.47
444 0.51
445 0.52
446 0.51
447 0.5
448 0.46
449 0.54
450 0.5
451 0.49
452 0.44
453 0.39
454 0.31
455 0.29
456 0.27
457 0.15
458 0.13
459 0.1
460 0.13
461 0.14
462 0.2
463 0.22
464 0.23
465 0.25
466 0.3
467 0.37
468 0.37
469 0.4
470 0.4
471 0.43
472 0.44
473 0.49
474 0.44
475 0.43
476 0.46
477 0.47
478 0.47
479 0.47
480 0.5
481 0.51
482 0.6
483 0.62
484 0.65
485 0.62
486 0.66
487 0.67
488 0.71
489 0.69
490 0.63
491 0.6
492 0.59
493 0.65
494 0.65
495 0.66
496 0.63
497 0.61
498 0.63
499 0.66
500 0.68
501 0.7
502 0.71
503 0.7
504 0.67
505 0.67
506 0.63
507 0.54
508 0.46
509 0.36
510 0.26
511 0.19