FuNGI

A0A1Q8S5J5

Protein Details

Accession

A0A1Q8S5J5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-42	SDAAEPAPKRTKKPSNKSKSRDHQNAHIDP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
20-31	PKRTKKPSNKSK

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MASKREYAASDGSDAAEPAPKRTKKPSNKSKSRDHQNAHIDPTWGQKYVFSSFDGRTTVPHDPDLDFEDDTDAMAYLKSVRTQANGIPHLLVAPKVPIGPQLPKELQAGESDLEEGEEVEEDRNIYTSGEGDFRGYYHDGAYTARPADWREYNKQGDYEDGEWDGEQDGYYDGEDQDSEAAIHEAYYASILARFHSLRATLHTKPPPSVVAALPRTHGHHVGAFGPKSSTFSIWSQRLRTTDPLPAQVASMDKDGVLRVVRVLLGGKFLRRGEEVGERTSRWLWALLARLPERGELNHTEIGWIRDLGRRAVLMMQSLADMAALRDALEEGGMDLGVHDAVDDSSDDEDVLREMEVEERDGEVPDEKQSVEETSRQEDPEAREDEMKDLSPSGAQVEKGAAEDGEIADDQKSEPMELSEDGEIDESESVVSEEPTSVPVESLEEARARLLAQLDTTTAEQPAQGPVSEADDVEVSDQLRARMNMRATLNMILTVAGDFYGQRDLLEFRDPFTGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.17
3	0.19
4	0.17
5	0.22
6	0.31
7	0.34
8	0.39
9	0.49
10	0.6
11	0.65
12	0.76
13	0.81
14	0.82
15	0.89
16	0.91
17	0.91
18	0.91
19	0.91
20	0.9
21	0.84
22	0.83
23	0.82
24	0.8
25	0.75
26	0.67
27	0.58
28	0.49
29	0.52
30	0.45
31	0.36
32	0.31
33	0.27
34	0.28
35	0.3
36	0.3
37	0.24
38	0.26
39	0.25
40	0.28
41	0.28
42	0.24
43	0.23
44	0.27
45	0.3
46	0.28
47	0.29
48	0.28
49	0.27
50	0.29
51	0.31
52	0.28
53	0.21
54	0.19
55	0.19
56	0.17
57	0.16
58	0.14
59	0.1
60	0.07
61	0.07
62	0.07
63	0.07
64	0.09
65	0.11
66	0.14
67	0.15
68	0.17
69	0.2
70	0.23
71	0.3
72	0.31
73	0.3
74	0.27
75	0.26
76	0.25
77	0.23
78	0.2
79	0.11
80	0.11
81	0.11
82	0.1
83	0.11
84	0.14
85	0.17
86	0.22
87	0.24
88	0.31
89	0.31
90	0.33
91	0.34
92	0.31
93	0.28
94	0.23
95	0.23
96	0.15
97	0.14
98	0.12
99	0.11
100	0.1
101	0.09
102	0.07
103	0.06
104	0.05
105	0.06
106	0.06
107	0.06
108	0.07
109	0.07
110	0.07
111	0.07
112	0.07
113	0.07
114	0.07
115	0.08
116	0.1
117	0.1
118	0.1
119	0.1
120	0.1
121	0.13
122	0.13
123	0.12
124	0.11
125	0.12
126	0.11
127	0.13
128	0.14
129	0.13
130	0.13
131	0.13
132	0.14
133	0.15
134	0.2
135	0.25
136	0.29
137	0.33
138	0.4
139	0.43
140	0.44
141	0.43
142	0.38
143	0.34
144	0.32
145	0.27
146	0.21
147	0.18
148	0.16
149	0.14
150	0.14
151	0.12
152	0.08
153	0.07
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.06
158	0.07
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.04
173	0.05
174	0.04
175	0.04
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.1
180	0.1
181	0.1
182	0.11
183	0.12
184	0.11
185	0.17
186	0.22
187	0.21
188	0.29
189	0.33
190	0.33
191	0.33
192	0.34
193	0.29
194	0.25
195	0.25
196	0.19
197	0.22
198	0.23
199	0.23
200	0.23
201	0.23
202	0.23
203	0.23
204	0.23
205	0.16
206	0.15
207	0.15
208	0.17
209	0.2
210	0.17
211	0.16
212	0.15
213	0.14
214	0.16
215	0.15
216	0.13
217	0.12
218	0.14
219	0.2
220	0.25
221	0.28
222	0.27
223	0.29
224	0.3
225	0.3
226	0.31
227	0.27
228	0.28
229	0.27
230	0.27
231	0.25
232	0.23
233	0.2
234	0.18
235	0.16
236	0.11
237	0.11
238	0.08
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.06
245	0.05
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.07
250	0.05
251	0.09
252	0.09
253	0.1
254	0.12
255	0.12
256	0.13
257	0.13
258	0.14
259	0.13
260	0.2
261	0.21
262	0.21
263	0.23
264	0.21
265	0.22
266	0.22
267	0.2
268	0.13
269	0.12
270	0.1
271	0.11
272	0.13
273	0.14
274	0.18
275	0.18
276	0.19
277	0.19
278	0.19
279	0.17
280	0.15
281	0.17
282	0.14
283	0.18
284	0.18
285	0.18
286	0.17
287	0.18
288	0.18
289	0.16
290	0.14
291	0.11
292	0.13
293	0.14
294	0.14
295	0.13
296	0.12
297	0.12
298	0.14
299	0.13
300	0.11
301	0.1
302	0.09
303	0.08
304	0.08
305	0.07
306	0.05
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.03
311	0.03
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.04
329	0.04
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.06
338	0.05
339	0.04
340	0.05
341	0.08
342	0.08
343	0.09
344	0.09
345	0.1
346	0.11
347	0.11
348	0.11
349	0.1
350	0.1
351	0.11
352	0.12
353	0.11
354	0.11
355	0.11
356	0.13
357	0.14
358	0.18
359	0.19
360	0.21
361	0.24
362	0.24
363	0.24
364	0.26
365	0.28
366	0.31
367	0.31
368	0.28
369	0.29
370	0.29
371	0.3
372	0.27
373	0.24
374	0.17
375	0.15
376	0.14
377	0.12
378	0.11
379	0.11
380	0.12
381	0.11
382	0.11
383	0.11
384	0.11
385	0.11
386	0.12
387	0.09
388	0.07
389	0.08
390	0.07
391	0.08
392	0.07
393	0.07
394	0.07
395	0.08
396	0.08
397	0.09
398	0.1
399	0.09
400	0.09
401	0.09
402	0.11
403	0.12
404	0.14
405	0.12
406	0.12
407	0.11
408	0.12
409	0.11
410	0.09
411	0.08
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.07
420	0.07
421	0.09
422	0.1
423	0.09
424	0.09
425	0.09
426	0.11
427	0.11
428	0.12
429	0.13
430	0.13
431	0.13
432	0.13
433	0.14
434	0.12
435	0.13
436	0.14
437	0.12
438	0.12
439	0.13
440	0.13
441	0.15
442	0.16
443	0.15
444	0.13
445	0.13
446	0.12
447	0.12
448	0.15
449	0.14
450	0.13
451	0.13
452	0.14
453	0.17
454	0.17
455	0.16
456	0.14
457	0.13
458	0.13
459	0.12
460	0.13
461	0.1
462	0.11
463	0.13
464	0.14
465	0.18
466	0.2
467	0.21
468	0.26
469	0.28
470	0.32
471	0.33
472	0.35
473	0.33
474	0.34
475	0.33
476	0.27
477	0.24
478	0.18
479	0.16
480	0.12
481	0.1
482	0.07
483	0.06
484	0.06
485	0.07
486	0.11
487	0.1
488	0.1
489	0.12
490	0.14
491	0.16
492	0.24
493	0.23
494	0.21

A0A1Q8S5J5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer