Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0VCN4

Protein Details
Accession G0VCN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
979-1005QYGTGSKKTQTSKKKISNETNNNKFAKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
540-543RRKI
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR006167  XPF  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG ncs:NCAS_0C02540  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MSQLFVQEDSEDEELQLELSRQVEADEERIKDLQQKNTSSNDEIQRKQEEEEEAPLYPLIPNIPEDGQDFKPNLDDIRAVSIQLNLPLLFQQQVVESALITDDPLVIMGKGLGMASIVANLLQILATPTKLNDQLKRSLVLVLNARPRDNQRIQEELQELSWLSMENEGDDNGDATNEEYIIDEESPYNRPFSVISADSLSVENRRKLYLSGGIICVTSRILIVDLLSGILHPSRVTGMVVLNVEDLRNHSNVSFILEIYRSKNKWGFIKAFSESPESFTLEFSPLLSKMRDLRLRNVLLWPRFRVEVSACLNKLPNTVSNSVIEVKVSLTNSMSQIQFGLMECLKKCIAELNRKNPELFLEWWNIDNALDINFLKSIDSVMIPNWHRISYESKQLTKDIRYLKNLLKLLINADAVDFYEEIQLSLEANKPSISRKYSESPWLMANESQLVISYAKKRIINDGDYFLEEMPKWEQLISILDDIAHERLTKDSQGTTLIACSDSATCAQLTRVLACSDRKNGLRRIMLRKLQHYKALRDQRRKIIKEVRSKGPAVSNPNELNVSAAFAKEEIITKRRRTRGAAAVAAVERLRTAGTGDDIESKIDSYDIKEELTHIGDDDSLKSDSILNKFVDDDIGVPDIEADLPEDDDDDSAAEELYLKTAHTGVTKELWEARVKNFEYISRNEQIIVEKFSNLNDDSTFEEIMPSYIIMFEPDLSVIRRVEVYRAIHRELAPKVYFMYYGESVEEQSHLTAIKKEKDAFTKLIREHANLAQHFETTEDLSHFKNLAERKSKLNKLKRSGTRNAGGQAGLQEVTQDIIVVDTREFNAPLPGLLFRYGVRVLPCMLTVGDYIITPDICIERKSISDLIGSLQNNRLVSQCKKMLRYYKYPTLLIEFDEGQSFSLEPFSEKRHFKNKESSTTHPISNKLTQEEIQNKLSKLVMKFPTLKIIWSSSPLQTVNILLELKLGREQPDPSVAIQYGTGSKKTQTSKKKISNETNNNKFAKILDIPGISKIDYFNIRKRFRNFEKLQKLPLQEINNVLDDETLSTKLYSFFQAELMEREKDGATDSAEEVDPVDADGLEDEDLDLDELL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.13
4 0.1
5 0.1
6 0.1
7 0.11
8 0.1
9 0.1
10 0.13
11 0.14
12 0.19
13 0.22
14 0.23
15 0.26
16 0.27
17 0.28
18 0.33
19 0.39
20 0.42
21 0.45
22 0.49
23 0.5
24 0.56
25 0.6
26 0.56
27 0.57
28 0.57
29 0.57
30 0.56
31 0.58
32 0.57
33 0.54
34 0.51
35 0.49
36 0.44
37 0.39
38 0.4
39 0.36
40 0.31
41 0.3
42 0.28
43 0.23
44 0.18
45 0.16
46 0.12
47 0.11
48 0.12
49 0.14
50 0.15
51 0.16
52 0.17
53 0.22
54 0.23
55 0.27
56 0.27
57 0.24
58 0.26
59 0.25
60 0.25
61 0.22
62 0.21
63 0.17
64 0.23
65 0.23
66 0.21
67 0.21
68 0.22
69 0.22
70 0.22
71 0.23
72 0.16
73 0.16
74 0.16
75 0.17
76 0.15
77 0.13
78 0.12
79 0.11
80 0.13
81 0.14
82 0.13
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.07
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.15
117 0.21
118 0.27
119 0.31
120 0.35
121 0.42
122 0.44
123 0.45
124 0.42
125 0.41
126 0.37
127 0.35
128 0.35
129 0.34
130 0.4
131 0.4
132 0.41
133 0.4
134 0.43
135 0.48
136 0.5
137 0.51
138 0.48
139 0.53
140 0.53
141 0.55
142 0.52
143 0.43
144 0.36
145 0.29
146 0.24
147 0.18
148 0.17
149 0.1
150 0.09
151 0.11
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.12
173 0.16
174 0.16
175 0.16
176 0.15
177 0.15
178 0.15
179 0.16
180 0.2
181 0.17
182 0.18
183 0.19
184 0.2
185 0.2
186 0.2
187 0.19
188 0.19
189 0.23
190 0.26
191 0.25
192 0.26
193 0.26
194 0.26
195 0.29
196 0.29
197 0.29
198 0.28
199 0.28
200 0.27
201 0.26
202 0.25
203 0.21
204 0.14
205 0.1
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.09
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.13
239 0.13
240 0.16
241 0.14
242 0.12
243 0.13
244 0.14
245 0.15
246 0.19
247 0.26
248 0.23
249 0.28
250 0.31
251 0.34
252 0.39
253 0.44
254 0.44
255 0.41
256 0.45
257 0.42
258 0.41
259 0.38
260 0.38
261 0.31
262 0.3
263 0.27
264 0.24
265 0.22
266 0.21
267 0.2
268 0.16
269 0.16
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.17
277 0.25
278 0.32
279 0.33
280 0.39
281 0.45
282 0.47
283 0.46
284 0.49
285 0.48
286 0.46
287 0.48
288 0.43
289 0.37
290 0.36
291 0.35
292 0.3
293 0.25
294 0.27
295 0.28
296 0.32
297 0.3
298 0.3
299 0.32
300 0.3
301 0.29
302 0.24
303 0.23
304 0.21
305 0.23
306 0.23
307 0.22
308 0.24
309 0.24
310 0.22
311 0.17
312 0.13
313 0.12
314 0.13
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.12
319 0.14
320 0.16
321 0.15
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.1
327 0.12
328 0.1
329 0.13
330 0.13
331 0.15
332 0.15
333 0.14
334 0.14
335 0.18
336 0.25
337 0.33
338 0.41
339 0.49
340 0.57
341 0.58
342 0.58
343 0.51
344 0.47
345 0.4
346 0.34
347 0.27
348 0.23
349 0.22
350 0.23
351 0.22
352 0.2
353 0.15
354 0.13
355 0.1
356 0.07
357 0.08
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.13
370 0.14
371 0.18
372 0.19
373 0.18
374 0.18
375 0.2
376 0.26
377 0.23
378 0.32
379 0.32
380 0.34
381 0.35
382 0.39
383 0.41
384 0.35
385 0.39
386 0.38
387 0.38
388 0.39
389 0.43
390 0.43
391 0.46
392 0.45
393 0.4
394 0.33
395 0.28
396 0.26
397 0.24
398 0.2
399 0.12
400 0.11
401 0.1
402 0.09
403 0.09
404 0.07
405 0.05
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.06
412 0.08
413 0.11
414 0.09
415 0.1
416 0.11
417 0.11
418 0.14
419 0.19
420 0.2
421 0.19
422 0.23
423 0.27
424 0.3
425 0.36
426 0.35
427 0.31
428 0.31
429 0.3
430 0.27
431 0.23
432 0.2
433 0.14
434 0.12
435 0.1
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.1
440 0.13
441 0.15
442 0.19
443 0.21
444 0.22
445 0.27
446 0.31
447 0.32
448 0.31
449 0.31
450 0.27
451 0.26
452 0.26
453 0.19
454 0.16
455 0.12
456 0.12
457 0.1
458 0.09
459 0.09
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.1
464 0.1
465 0.09
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.09
470 0.09
471 0.07
472 0.06
473 0.06
474 0.07
475 0.08
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.1
480 0.11
481 0.11
482 0.1
483 0.09
484 0.09
485 0.08
486 0.07
487 0.07
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.07
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.1
499 0.1
500 0.12
501 0.15
502 0.17
503 0.18
504 0.21
505 0.24
506 0.27
507 0.31
508 0.35
509 0.38
510 0.41
511 0.46
512 0.5
513 0.52
514 0.5
515 0.54
516 0.55
517 0.51
518 0.52
519 0.48
520 0.45
521 0.48
522 0.56
523 0.56
524 0.58
525 0.61
526 0.64
527 0.7
528 0.67
529 0.65
530 0.64
531 0.64
532 0.65
533 0.66
534 0.63
535 0.57
536 0.55
537 0.5
538 0.45
539 0.41
540 0.36
541 0.33
542 0.31
543 0.28
544 0.28
545 0.27
546 0.22
547 0.19
548 0.13
549 0.12
550 0.07
551 0.07
552 0.06
553 0.05
554 0.06
555 0.06
556 0.08
557 0.09
558 0.14
559 0.19
560 0.25
561 0.33
562 0.37
563 0.4
564 0.42
565 0.46
566 0.49
567 0.5
568 0.46
569 0.39
570 0.35
571 0.32
572 0.28
573 0.21
574 0.13
575 0.07
576 0.06
577 0.05
578 0.04
579 0.04
580 0.04
581 0.05
582 0.06
583 0.07
584 0.09
585 0.09
586 0.1
587 0.09
588 0.09
589 0.08
590 0.08
591 0.07
592 0.06
593 0.08
594 0.09
595 0.09
596 0.09
597 0.1
598 0.11
599 0.11
600 0.1
601 0.08
602 0.07
603 0.08
604 0.08
605 0.08
606 0.09
607 0.08
608 0.08
609 0.08
610 0.1
611 0.13
612 0.15
613 0.18
614 0.15
615 0.16
616 0.16
617 0.16
618 0.14
619 0.1
620 0.09
621 0.07
622 0.07
623 0.07
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.05
629 0.04
630 0.04
631 0.04
632 0.04
633 0.05
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.04
638 0.04
639 0.04
640 0.04
641 0.03
642 0.04
643 0.04
644 0.05
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.06
649 0.07
650 0.08
651 0.09
652 0.09
653 0.12
654 0.12
655 0.13
656 0.14
657 0.15
658 0.17
659 0.18
660 0.19
661 0.24
662 0.24
663 0.26
664 0.25
665 0.27
666 0.28
667 0.3
668 0.33
669 0.28
670 0.27
671 0.25
672 0.25
673 0.25
674 0.23
675 0.23
676 0.18
677 0.17
678 0.17
679 0.17
680 0.19
681 0.16
682 0.15
683 0.11
684 0.12
685 0.13
686 0.14
687 0.14
688 0.11
689 0.11
690 0.1
691 0.1
692 0.09
693 0.06
694 0.05
695 0.05
696 0.05
697 0.05
698 0.05
699 0.05
700 0.05
701 0.06
702 0.07
703 0.07
704 0.09
705 0.09
706 0.09
707 0.11
708 0.11
709 0.13
710 0.17
711 0.2
712 0.25
713 0.29
714 0.3
715 0.31
716 0.32
717 0.36
718 0.32
719 0.35
720 0.28
721 0.25
722 0.24
723 0.22
724 0.21
725 0.16
726 0.19
727 0.13
728 0.13
729 0.14
730 0.13
731 0.13
732 0.13
733 0.13
734 0.09
735 0.08
736 0.08
737 0.08
738 0.09
739 0.13
740 0.17
741 0.21
742 0.25
743 0.27
744 0.31
745 0.36
746 0.39
747 0.39
748 0.39
749 0.42
750 0.39
751 0.44
752 0.41
753 0.37
754 0.37
755 0.36
756 0.38
757 0.31
758 0.34
759 0.27
760 0.25
761 0.24
762 0.2
763 0.18
764 0.12
765 0.12
766 0.1
767 0.11
768 0.12
769 0.13
770 0.13
771 0.12
772 0.16
773 0.19
774 0.26
775 0.32
776 0.33
777 0.4
778 0.49
779 0.58
780 0.63
781 0.69
782 0.7
783 0.71
784 0.79
785 0.79
786 0.78
787 0.77
788 0.75
789 0.7
790 0.64
791 0.57
792 0.49
793 0.4
794 0.33
795 0.26
796 0.2
797 0.15
798 0.11
799 0.09
800 0.07
801 0.08
802 0.07
803 0.06
804 0.04
805 0.04
806 0.05
807 0.06
808 0.06
809 0.07
810 0.08
811 0.1
812 0.1
813 0.1
814 0.12
815 0.11
816 0.11
817 0.11
818 0.11
819 0.11
820 0.12
821 0.12
822 0.1
823 0.14
824 0.14
825 0.15
826 0.16
827 0.16
828 0.16
829 0.16
830 0.16
831 0.13
832 0.12
833 0.11
834 0.1
835 0.1
836 0.09
837 0.08
838 0.08
839 0.08
840 0.08
841 0.07
842 0.08
843 0.09
844 0.1
845 0.11
846 0.12
847 0.12
848 0.13
849 0.18
850 0.18
851 0.17
852 0.17
853 0.16
854 0.17
855 0.21
856 0.21
857 0.19
858 0.21
859 0.23
860 0.22
861 0.23
862 0.24
863 0.24
864 0.27
865 0.32
866 0.36
867 0.38
868 0.42
869 0.49
870 0.55
871 0.57
872 0.63
873 0.64
874 0.66
875 0.65
876 0.62
877 0.56
878 0.52
879 0.45
880 0.37
881 0.32
882 0.23
883 0.19
884 0.2
885 0.18
886 0.14
887 0.13
888 0.12
889 0.09
890 0.1
891 0.09
892 0.1
893 0.12
894 0.18
895 0.25
896 0.29
897 0.36
898 0.45
899 0.51
900 0.55
901 0.63
902 0.65
903 0.68
904 0.71
905 0.71
906 0.69
907 0.66
908 0.65
909 0.57
910 0.53
911 0.48
912 0.48
913 0.45
914 0.39
915 0.39
916 0.36
917 0.41
918 0.44
919 0.43
920 0.42
921 0.43
922 0.41
923 0.4
924 0.41
925 0.37
926 0.33
927 0.37
928 0.35
929 0.37
930 0.41
931 0.41
932 0.47
933 0.42
934 0.41
935 0.35
936 0.35
937 0.31
938 0.3
939 0.32
940 0.25
941 0.29
942 0.28
943 0.26
944 0.23
945 0.22
946 0.19
947 0.19
948 0.17
949 0.12
950 0.15
951 0.15
952 0.15
953 0.18
954 0.18
955 0.18
956 0.21
957 0.22
958 0.22
959 0.27
960 0.27
961 0.24
962 0.27
963 0.24
964 0.22
965 0.21
966 0.2
967 0.21
968 0.22
969 0.23
970 0.2
971 0.22
972 0.29
973 0.37
974 0.44
975 0.49
976 0.57
977 0.66
978 0.74
979 0.82
980 0.85
981 0.88
982 0.89
983 0.9
984 0.9
985 0.89
986 0.87
987 0.79
988 0.69
989 0.59
990 0.48
991 0.44
992 0.35
993 0.29
994 0.27
995 0.28
996 0.28
997 0.3
998 0.31
999 0.25
1000 0.23
1001 0.2
1002 0.2
1003 0.25
1004 0.3
1005 0.35
1006 0.44
1007 0.5
1008 0.57
1009 0.62
1010 0.68
1011 0.69
1012 0.75
1013 0.74
1014 0.75
1015 0.8
1016 0.77
1017 0.79
1018 0.75
1019 0.7
1020 0.64
1021 0.64
1022 0.57
1023 0.5
1024 0.49
1025 0.44
1026 0.39
1027 0.36
1028 0.3
1029 0.23
1030 0.19
1031 0.18
1032 0.16
1033 0.14
1034 0.12
1035 0.12
1036 0.13
1037 0.15
1038 0.16
1039 0.17
1040 0.17
1041 0.17
1042 0.19
1043 0.21
1044 0.22
1045 0.25
1046 0.27
1047 0.25
1048 0.23
1049 0.24
1050 0.22
1051 0.2
1052 0.21
1053 0.18
1054 0.16
1055 0.17
1056 0.17
1057 0.18
1058 0.18
1059 0.18
1060 0.15
1061 0.14
1062 0.12
1063 0.1
1064 0.1
1065 0.07
1066 0.07
1067 0.07
1068 0.08
1069 0.07
1070 0.07
1071 0.07
1072 0.06
1073 0.07