Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0VHY7

Protein Details
Accession G0VHY7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
281-304TSIFLTKKKPLRKASTRGPRPDPSHydrophilic
320-341QLSSTSKKKKSLNDYIQMKKTDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
287-299KKKPLRKASTRGP
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9.5, mito 9, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG ncs:NCAS_0G01340  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MKSLQELSKITLMRNLSSIEDIGCTPFRLIEDVLDKMNKEQLIRLEEKNVFLVLEDDKIWLKFLKLDFPTSVHVSYVSRKEIIYNQYLDFIRKFDEILLNERRQLVSIYLKALVNKDPKKMKFRIPYRILYFKYQNDEMRKQQKTAEKLRLQMQQIKDERERNKTVSVDSVYLQKGRGVKTFVHNKSAFRKNYHSKMFNEAMRGAPSRIQRPTVQPSRPAITRRAFGGGSPVPAPAPVPLVANPAPVDTTTMQQDEPPIKPPVETKTRQVSPVKKRRVESTSIFLTKKKPLRKASTRGPRPDPSSLSSSSLSPPPPSMTQLSSTSKKKKSLNDYIQMKKTDTH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.26
3 0.21
4 0.22
5 0.22
6 0.17
7 0.16
8 0.15
9 0.17
10 0.16
11 0.15
12 0.14
13 0.14
14 0.15
15 0.16
16 0.16
17 0.17
18 0.2
19 0.21
20 0.24
21 0.24
22 0.24
23 0.23
24 0.27
25 0.24
26 0.21
27 0.23
28 0.26
29 0.31
30 0.35
31 0.36
32 0.38
33 0.38
34 0.39
35 0.36
36 0.31
37 0.23
38 0.19
39 0.19
40 0.13
41 0.12
42 0.11
43 0.12
44 0.13
45 0.13
46 0.14
47 0.13
48 0.13
49 0.16
50 0.17
51 0.24
52 0.24
53 0.28
54 0.28
55 0.29
56 0.33
57 0.31
58 0.3
59 0.21
60 0.21
61 0.19
62 0.24
63 0.26
64 0.24
65 0.22
66 0.22
67 0.24
68 0.29
69 0.32
70 0.31
71 0.29
72 0.27
73 0.31
74 0.32
75 0.32
76 0.26
77 0.22
78 0.2
79 0.18
80 0.17
81 0.14
82 0.19
83 0.18
84 0.24
85 0.31
86 0.29
87 0.31
88 0.32
89 0.3
90 0.25
91 0.24
92 0.2
93 0.19
94 0.19
95 0.19
96 0.2
97 0.21
98 0.21
99 0.22
100 0.25
101 0.29
102 0.3
103 0.35
104 0.41
105 0.46
106 0.52
107 0.55
108 0.59
109 0.59
110 0.64
111 0.68
112 0.65
113 0.67
114 0.65
115 0.69
116 0.62
117 0.57
118 0.55
119 0.47
120 0.46
121 0.43
122 0.43
123 0.42
124 0.44
125 0.47
126 0.51
127 0.5
128 0.46
129 0.47
130 0.48
131 0.49
132 0.52
133 0.54
134 0.47
135 0.49
136 0.54
137 0.54
138 0.51
139 0.5
140 0.43
141 0.42
142 0.42
143 0.43
144 0.41
145 0.43
146 0.44
147 0.45
148 0.46
149 0.4
150 0.4
151 0.36
152 0.33
153 0.29
154 0.27
155 0.21
156 0.18
157 0.2
158 0.17
159 0.17
160 0.16
161 0.15
162 0.16
163 0.17
164 0.18
165 0.17
166 0.18
167 0.24
168 0.34
169 0.34
170 0.39
171 0.38
172 0.39
173 0.45
174 0.52
175 0.48
176 0.42
177 0.49
178 0.49
179 0.55
180 0.6
181 0.56
182 0.5
183 0.53
184 0.54
185 0.47
186 0.42
187 0.35
188 0.29
189 0.26
190 0.26
191 0.2
192 0.19
193 0.21
194 0.24
195 0.24
196 0.26
197 0.26
198 0.31
199 0.4
200 0.44
201 0.43
202 0.43
203 0.45
204 0.46
205 0.47
206 0.44
207 0.42
208 0.37
209 0.36
210 0.32
211 0.32
212 0.27
213 0.23
214 0.27
215 0.22
216 0.2
217 0.19
218 0.18
219 0.14
220 0.14
221 0.15
222 0.08
223 0.09
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.14
228 0.15
229 0.16
230 0.15
231 0.13
232 0.13
233 0.12
234 0.15
235 0.11
236 0.13
237 0.14
238 0.15
239 0.14
240 0.14
241 0.19
242 0.2
243 0.2
244 0.23
245 0.23
246 0.22
247 0.23
248 0.26
249 0.29
250 0.34
251 0.36
252 0.38
253 0.45
254 0.47
255 0.53
256 0.57
257 0.6
258 0.62
259 0.7
260 0.73
261 0.7
262 0.7
263 0.72
264 0.69
265 0.66
266 0.6
267 0.57
268 0.55
269 0.54
270 0.53
271 0.47
272 0.47
273 0.49
274 0.52
275 0.53
276 0.54
277 0.58
278 0.68
279 0.75
280 0.79
281 0.81
282 0.85
283 0.86
284 0.85
285 0.83
286 0.8
287 0.76
288 0.74
289 0.67
290 0.6
291 0.56
292 0.49
293 0.46
294 0.39
295 0.35
296 0.31
297 0.31
298 0.29
299 0.26
300 0.26
301 0.26
302 0.27
303 0.3
304 0.3
305 0.28
306 0.3
307 0.35
308 0.4
309 0.43
310 0.5
311 0.56
312 0.59
313 0.64
314 0.67
315 0.71
316 0.74
317 0.77
318 0.78
319 0.79
320 0.82
321 0.83
322 0.83
323 0.77