Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9XA15

Protein Details
Accession A0A1L9XA15    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
216-242EAYIKGKEEKSKREKQRKEKNVLEVDMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-103RARG
201-235KKWAAAKELKPREEEEAYIKGKEEKSKREKQRKEK
248-272PRGAANGPRGRGARGGARGGRGGRG
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MADVRSKNLYELLGNDPELDPNREPEPPTRAVDRPAPRVGKRDAPKEAPSTQPRAENNNARRGNRATGNEAAFRDRNAGRTNNREKATEDPKEGQRHGFRARGERGERVRHDRQSRTGQTDTRKQVNQGWGNQSGDKTWDDEKAGEDIAHKDENEPQTPAAEEEPADKSKSFADYLAEKAAQEDLSAKPVRAANEGSKLDKKWAAAKELKPREEEEAYIKGKEEKSKREKQRKEKNVLEVDMRFVEAPRGAANGPRGRGARGGARGGRGGRGGNNTNAPRPSGAATSGASVTVDEKNFPSLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.22
4 0.25
5 0.27
6 0.28
7 0.24
8 0.25
9 0.27
10 0.29
11 0.31
12 0.32
13 0.36
14 0.35
15 0.38
16 0.4
17 0.4
18 0.41
19 0.48
20 0.49
21 0.49
22 0.53
23 0.56
24 0.54
25 0.57
26 0.58
27 0.58
28 0.59
29 0.6
30 0.59
31 0.58
32 0.6
33 0.6
34 0.58
35 0.58
36 0.56
37 0.55
38 0.51
39 0.52
40 0.49
41 0.51
42 0.55
43 0.56
44 0.57
45 0.6
46 0.63
47 0.57
48 0.59
49 0.56
50 0.53
51 0.5
52 0.47
53 0.42
54 0.42
55 0.43
56 0.41
57 0.39
58 0.37
59 0.31
60 0.28
61 0.28
62 0.24
63 0.26
64 0.26
65 0.32
66 0.33
67 0.43
68 0.51
69 0.53
70 0.54
71 0.51
72 0.49
73 0.5
74 0.53
75 0.48
76 0.44
77 0.42
78 0.47
79 0.51
80 0.5
81 0.49
82 0.44
83 0.45
84 0.45
85 0.44
86 0.39
87 0.42
88 0.45
89 0.46
90 0.45
91 0.46
92 0.47
93 0.51
94 0.53
95 0.53
96 0.55
97 0.56
98 0.6
99 0.57
100 0.58
101 0.6
102 0.6
103 0.58
104 0.55
105 0.52
106 0.51
107 0.55
108 0.54
109 0.5
110 0.46
111 0.42
112 0.44
113 0.47
114 0.46
115 0.43
116 0.42
117 0.39
118 0.39
119 0.38
120 0.32
121 0.24
122 0.21
123 0.17
124 0.15
125 0.13
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.14
130 0.13
131 0.12
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.11
136 0.12
137 0.11
138 0.1
139 0.15
140 0.17
141 0.17
142 0.17
143 0.15
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.11
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.11
152 0.12
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.13
157 0.15
158 0.13
159 0.11
160 0.12
161 0.13
162 0.14
163 0.16
164 0.15
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.1
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.13
173 0.14
174 0.13
175 0.15
176 0.17
177 0.18
178 0.19
179 0.21
180 0.18
181 0.26
182 0.28
183 0.28
184 0.3
185 0.29
186 0.3
187 0.29
188 0.28
189 0.27
190 0.28
191 0.32
192 0.36
193 0.42
194 0.49
195 0.55
196 0.56
197 0.51
198 0.5
199 0.49
200 0.42
201 0.38
202 0.32
203 0.3
204 0.3
205 0.28
206 0.27
207 0.26
208 0.28
209 0.34
210 0.36
211 0.4
212 0.48
213 0.58
214 0.68
215 0.75
216 0.82
217 0.85
218 0.9
219 0.9
220 0.9
221 0.87
222 0.86
223 0.82
224 0.74
225 0.69
226 0.58
227 0.51
228 0.42
229 0.35
230 0.26
231 0.18
232 0.18
233 0.13
234 0.13
235 0.11
236 0.12
237 0.12
238 0.15
239 0.22
240 0.25
241 0.26
242 0.3
243 0.3
244 0.3
245 0.32
246 0.32
247 0.31
248 0.3
249 0.36
250 0.33
251 0.34
252 0.37
253 0.35
254 0.35
255 0.3
256 0.27
257 0.25
258 0.29
259 0.31
260 0.31
261 0.39
262 0.4
263 0.43
264 0.43
265 0.41
266 0.35
267 0.33
268 0.32
269 0.25
270 0.24
271 0.21
272 0.2
273 0.2
274 0.19
275 0.17
276 0.15
277 0.13
278 0.14
279 0.16
280 0.16
281 0.16
282 0.17
283 0.19
284 0.19