FuNGI

A0A1L9WLU7

Protein Details

Accession

A0A1L9WLU7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
88-111	NEPAKPTLKYKPRAVNRRSKEERE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
74-174	ARPSPTPAPGPPGSNEPAKPTLKYKPRAVNRRSKEEREAIEKLEAQRNRERLKEAAAIQRGRGGGQHGGGRGGRGGMRGGMMGPGGGPLGPGMGGARRGRG
282-298	KKKEAEAEKAEKKKKKK

Subcellular Location(s)

mito 22.5, cyto_mito 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAPPRRGGAAAAAAAAGTRRTTAAASASAAEPNNAPTTESTTTTAAAAGPKPPVQRLQTLKKRTPPSGSIARPSPTPAPGPPGSNEPAKPTLKYKPRAVNRRSKEEREAIEKLEAQRNRERLKEAAAIQRGRGGGQHGGGRGGRGGMRGGMMGPGGGPLGPGMGGARRGRGGALGGGFDSRSRSRSVMDLGATQVGEGGDGYVSSDESDGEVRVSIDRINLGSDDDDEVDNKDRKVKLEGRGGIGVGGLRPLRLERHEHEERVVSVNMESSTTGAAEAKKKEAEAEKAEKKKKKKAEDDDALFVAQDDDGGEDVEENVDEEDQIVKEEPTDEEDQVMTDVPRADEGATNVDDGLLPVQKVKVRRKLSPSKSVSESAVPSPEPEVVIDPKSLLRTKEDIEEYERHEQDLEIVKTLFQKEPRPEAPEALAGAAEGAAEGEDKEKEKDKEGDEEEPKEEEEDKLAGQLFLMQFPPLTPNLVLPGTETTDSHPTTTTETPATEQPVKREDEMEIVDGDENATAAQGSAKVVTAADPGLLAGRVGKLNVHASGRVTMDWGGISFELDRATAVDFSQEALIVSTPPNAGDEEFPDDEKKVWAMGQLSGKFTVTPDWQKML

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.27
3	0.2
4	0.17
5	0.14
6	0.1
7	0.07
8	0.07
9	0.07
10	0.09
11	0.1
12	0.12
13	0.14
14	0.15
15	0.16
16	0.17
17	0.17
18	0.19
19	0.19
20	0.18
21	0.16
22	0.17
23	0.19
24	0.17
25	0.17
26	0.15
27	0.22
28	0.23
29	0.25
30	0.25
31	0.23
32	0.23
33	0.22
34	0.22
35	0.16
36	0.17
37	0.16
38	0.16
39	0.19
40	0.22
41	0.25
42	0.27
43	0.33
44	0.33
45	0.41
46	0.47
47	0.54
48	0.6
49	0.68
50	0.72
51	0.74
52	0.78
53	0.75
54	0.73
55	0.66
56	0.64
57	0.65
58	0.62
59	0.59
60	0.57
61	0.53
62	0.46
63	0.47
64	0.42
65	0.35
66	0.34
67	0.29
68	0.32
69	0.32
70	0.34
71	0.32
72	0.33
73	0.34
74	0.35
75	0.35
76	0.33
77	0.38
78	0.37
79	0.38
80	0.38
81	0.44
82	0.49
83	0.55
84	0.58
85	0.61
86	0.69
87	0.77
88	0.8
89	0.81
90	0.8
91	0.84
92	0.83
93	0.79
94	0.77
95	0.74
96	0.7
97	0.67
98	0.62
99	0.54
100	0.49
101	0.47
102	0.44
103	0.44
104	0.42
105	0.39
106	0.44
107	0.49
108	0.49
109	0.49
110	0.48
111	0.41
112	0.44
113	0.45
114	0.43
115	0.43
116	0.46
117	0.44
118	0.4
119	0.42
120	0.37
121	0.31
122	0.27
123	0.22
124	0.17
125	0.18
126	0.21
127	0.18
128	0.2
129	0.2
130	0.19
131	0.16
132	0.16
133	0.14
134	0.12
135	0.12
136	0.1
137	0.1
138	0.09
139	0.09
140	0.08
141	0.07
142	0.06
143	0.05
144	0.05
145	0.05
146	0.04
147	0.04
148	0.03
149	0.03
150	0.03
151	0.03
152	0.04
153	0.05
154	0.1
155	0.1
156	0.12
157	0.12
158	0.13
159	0.13
160	0.13
161	0.13
162	0.1
163	0.1
164	0.09
165	0.09
166	0.09
167	0.09
168	0.09
169	0.12
170	0.11
171	0.12
172	0.14
173	0.15
174	0.16
175	0.18
176	0.21
177	0.2
178	0.2
179	0.2
180	0.18
181	0.19
182	0.17
183	0.14
184	0.12
185	0.08
186	0.07
187	0.06
188	0.05
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.05
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.08
208	0.08
209	0.08
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.09
216	0.08
217	0.08
218	0.1
219	0.14
220	0.16
221	0.15
222	0.2
223	0.21
224	0.22
225	0.29
226	0.34
227	0.36
228	0.42
229	0.45
230	0.42
231	0.41
232	0.39
233	0.32
234	0.26
235	0.19
236	0.1
237	0.09
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.07
242	0.09
243	0.11
244	0.16
245	0.17
246	0.25
247	0.29
248	0.3
249	0.3
250	0.3
251	0.29
252	0.27
253	0.25
254	0.16
255	0.13
256	0.14
257	0.12
258	0.11
259	0.1
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.08
266	0.12
267	0.13
268	0.14
269	0.15
270	0.15
271	0.17
272	0.19
273	0.22
274	0.24
275	0.31
276	0.36
277	0.44
278	0.52
279	0.55
280	0.59
281	0.63
282	0.65
283	0.67
284	0.7
285	0.71
286	0.73
287	0.76
288	0.72
289	0.66
290	0.58
291	0.48
292	0.38
293	0.28
294	0.18
295	0.09
296	0.06
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.04
312	0.04
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.06
318	0.06
319	0.1
320	0.11
321	0.11
322	0.11
323	0.11
324	0.11
325	0.11
326	0.11
327	0.07
328	0.06
329	0.07
330	0.06
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.08
336	0.1
337	0.09
338	0.1
339	0.09
340	0.09
341	0.08
342	0.07
343	0.08
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.08
348	0.1
349	0.18
350	0.26
351	0.34
352	0.38
353	0.44
354	0.53
355	0.61
356	0.66
357	0.7
358	0.66
359	0.61
360	0.6
361	0.56
362	0.48
363	0.4
364	0.35
365	0.26
366	0.23
367	0.19
368	0.16
369	0.15
370	0.14
371	0.11
372	0.1
373	0.11
374	0.11
375	0.12
376	0.12
377	0.11
378	0.12
379	0.15
380	0.17
381	0.16
382	0.17
383	0.19
384	0.2
385	0.25
386	0.26
387	0.24
388	0.27
389	0.29
390	0.3
391	0.35
392	0.34
393	0.28
394	0.27
395	0.25
396	0.25
397	0.3
398	0.26
399	0.2
400	0.2
401	0.2
402	0.23
403	0.25
404	0.24
405	0.19
406	0.26
407	0.29
408	0.37
409	0.39
410	0.41
411	0.4
412	0.39
413	0.37
414	0.32
415	0.28
416	0.2
417	0.17
418	0.11
419	0.1
420	0.07
421	0.05
422	0.03
423	0.03
424	0.02
425	0.03
426	0.03
427	0.04
428	0.06
429	0.07
430	0.1
431	0.16
432	0.18
433	0.23
434	0.28
435	0.29
436	0.36
437	0.38
438	0.44
439	0.42
440	0.44
441	0.4
442	0.36
443	0.34
444	0.28
445	0.25
446	0.17
447	0.15
448	0.13
449	0.11
450	0.12
451	0.13
452	0.11
453	0.1
454	0.13
455	0.12
456	0.12
457	0.13
458	0.1
459	0.1
460	0.1
461	0.13
462	0.1
463	0.12
464	0.11
465	0.11
466	0.14
467	0.15
468	0.14
469	0.13
470	0.15
471	0.15
472	0.15
473	0.15
474	0.15
475	0.21
476	0.21
477	0.21
478	0.2
479	0.18
480	0.23
481	0.24
482	0.23
483	0.19
484	0.19
485	0.21
486	0.23
487	0.27
488	0.3
489	0.3
490	0.32
491	0.36
492	0.38
493	0.37
494	0.35
495	0.31
496	0.28
497	0.28
498	0.25
499	0.2
500	0.18
501	0.17
502	0.15
503	0.14
504	0.09
505	0.07
506	0.05
507	0.05
508	0.04
509	0.04
510	0.05
511	0.05
512	0.06
513	0.07
514	0.07
515	0.07
516	0.08
517	0.08
518	0.09
519	0.08
520	0.08
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.07
525	0.06
526	0.06
527	0.08
528	0.09
529	0.1
530	0.1
531	0.13
532	0.16
533	0.19
534	0.2
535	0.2
536	0.21
537	0.24
538	0.25
539	0.21
540	0.2
541	0.17
542	0.16
543	0.14
544	0.13
545	0.11
546	0.1
547	0.11
548	0.09
549	0.1
550	0.1
551	0.09
552	0.09
553	0.08
554	0.1
555	0.1
556	0.09
557	0.1
558	0.1
559	0.11
560	0.11
561	0.11
562	0.09
563	0.09
564	0.1
565	0.09
566	0.1
567	0.11
568	0.11
569	0.11
570	0.12
571	0.12
572	0.13
573	0.14
574	0.16
575	0.21
576	0.22
577	0.23
578	0.24
579	0.24
580	0.24
581	0.24
582	0.22
583	0.16
584	0.16
585	0.18
586	0.18
587	0.23
588	0.3
589	0.31
590	0.33
591	0.33
592	0.33
593	0.29
594	0.28
595	0.28
596	0.27
597	0.32

A0A1L9WLU7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer