Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0V9J2

Protein Details
Accession G0V9J2    Localization Confidence High Confidence Score 22.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-71ESGLKQNGSSRNSRRRRRPNSKKKNEETRTNPESMELPVGNPKPNPRKKRGNARAKSSEPAHydrophilic
79-117ETTTNSSNKLRPKQKSKPKAKSKSKSKFKQKERDPIKLIHydrophilic
292-342LAGSVKKEKAPKKKKSSEKIEGTAVETEKKAKKKKKRSRRKKDASSVPTTVHydrophilic
371-401LKQELDRKERLKKKSEKKKKQLPQLPSVNDSHydrophilic
410-429ALEPSKQKQPKPIRILKQDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-36RNSRRRRRPNSKKKNE
51-66NPKPNPRKKRGNARAK
87-112KLRPKQKSKPKAKSKSKSKFKQKERD
296-333VKKEKAPKKKKSSEKIEGTAVETEKKAKKKKKRSRRKK
377-392RKERLKKKSEKKKKQL
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG ncs:NCAS_0B05240  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSETTPTVIMESGLKQNGSSRNSRRRRRPNSKKKNEETRTNPESMELPVGNPKPNPRKKRGNARAKSSEPALDNTLSGETTTNSSNKLRPKQKSKPKAKSKSKSKFKQKERDPIKLIIRQLPPNLTEEGFLSTIKEKLGPKFFILFSIESWYFVPGHYSSRPFKRPVNSRAYFHFPQEKLAQLNSFVQKLIGINFVDNKYNVIVLQPSMLRRSVYVKKYLSDDKKDTDDKLCGTLNEDPLFNMFCERLEQSADDKNIYDDFSFLKSKNKELSKKKRSDAATQMRMEDALVRLAGSVKKEKAPKKKKSSEKIEGTAVETEKKAKKKKKRSRRKKDASSVPTTVNGTGNLTFATPKDVGISKNNNVVILDAGLKQELDRKERLKKKSEKKKKQLPQLPSVNDSKRTKPPADALEPSKQKQPKPIRILKQDT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.27
4 0.34
5 0.36
6 0.43
7 0.47
8 0.55
9 0.66
10 0.76
11 0.81
12 0.84
13 0.91
14 0.93
15 0.94
16 0.95
17 0.96
18 0.97
19 0.97
20 0.96
21 0.96
22 0.93
23 0.92
24 0.9
25 0.88
26 0.83
27 0.74
28 0.64
29 0.54
30 0.47
31 0.38
32 0.34
33 0.25
34 0.2
35 0.26
36 0.28
37 0.3
38 0.31
39 0.39
40 0.45
41 0.55
42 0.63
43 0.64
44 0.73
45 0.79
46 0.88
47 0.89
48 0.89
49 0.87
50 0.88
51 0.88
52 0.81
53 0.75
54 0.66
55 0.6
56 0.51
57 0.46
58 0.39
59 0.31
60 0.27
61 0.24
62 0.22
63 0.16
64 0.14
65 0.12
66 0.09
67 0.1
68 0.13
69 0.13
70 0.16
71 0.19
72 0.23
73 0.32
74 0.41
75 0.49
76 0.56
77 0.65
78 0.73
79 0.81
80 0.87
81 0.89
82 0.9
83 0.92
84 0.93
85 0.94
86 0.94
87 0.94
88 0.94
89 0.94
90 0.93
91 0.94
92 0.93
93 0.92
94 0.92
95 0.9
96 0.9
97 0.87
98 0.86
99 0.79
100 0.76
101 0.73
102 0.67
103 0.61
104 0.59
105 0.56
106 0.5
107 0.48
108 0.44
109 0.37
110 0.35
111 0.33
112 0.25
113 0.21
114 0.17
115 0.17
116 0.15
117 0.14
118 0.13
119 0.12
120 0.13
121 0.12
122 0.16
123 0.16
124 0.21
125 0.27
126 0.27
127 0.28
128 0.31
129 0.3
130 0.29
131 0.29
132 0.23
133 0.18
134 0.22
135 0.2
136 0.17
137 0.18
138 0.16
139 0.14
140 0.13
141 0.15
142 0.1
143 0.14
144 0.15
145 0.2
146 0.24
147 0.32
148 0.36
149 0.37
150 0.42
151 0.47
152 0.54
153 0.57
154 0.62
155 0.58
156 0.55
157 0.56
158 0.59
159 0.51
160 0.45
161 0.46
162 0.35
163 0.36
164 0.35
165 0.33
166 0.27
167 0.26
168 0.23
169 0.17
170 0.21
171 0.19
172 0.18
173 0.15
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.09
180 0.09
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.13
185 0.13
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.17
200 0.22
201 0.24
202 0.3
203 0.29
204 0.3
205 0.34
206 0.41
207 0.41
208 0.4
209 0.4
210 0.36
211 0.4
212 0.4
213 0.38
214 0.33
215 0.29
216 0.23
217 0.23
218 0.22
219 0.17
220 0.18
221 0.19
222 0.2
223 0.18
224 0.18
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.12
229 0.1
230 0.07
231 0.06
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.12
238 0.17
239 0.18
240 0.16
241 0.16
242 0.16
243 0.16
244 0.16
245 0.13
246 0.09
247 0.09
248 0.12
249 0.14
250 0.13
251 0.21
252 0.21
253 0.25
254 0.32
255 0.39
256 0.45
257 0.54
258 0.65
259 0.67
260 0.74
261 0.73
262 0.73
263 0.69
264 0.68
265 0.68
266 0.67
267 0.64
268 0.57
269 0.55
270 0.48
271 0.43
272 0.35
273 0.27
274 0.17
275 0.1
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.1
280 0.11
281 0.12
282 0.17
283 0.18
284 0.23
285 0.31
286 0.4
287 0.49
288 0.58
289 0.66
290 0.72
291 0.8
292 0.85
293 0.88
294 0.9
295 0.89
296 0.86
297 0.79
298 0.72
299 0.63
300 0.55
301 0.49
302 0.4
303 0.32
304 0.24
305 0.27
306 0.29
307 0.36
308 0.43
309 0.49
310 0.59
311 0.69
312 0.79
313 0.84
314 0.89
315 0.93
316 0.95
317 0.96
318 0.97
319 0.96
320 0.96
321 0.95
322 0.92
323 0.88
324 0.79
325 0.7
326 0.61
327 0.52
328 0.43
329 0.33
330 0.26
331 0.21
332 0.18
333 0.16
334 0.13
335 0.12
336 0.11
337 0.1
338 0.15
339 0.12
340 0.12
341 0.15
342 0.17
343 0.19
344 0.27
345 0.33
346 0.31
347 0.38
348 0.38
349 0.35
350 0.33
351 0.31
352 0.24
353 0.18
354 0.17
355 0.12
356 0.12
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.17
361 0.2
362 0.24
363 0.3
364 0.36
365 0.46
366 0.55
367 0.63
368 0.67
369 0.73
370 0.79
371 0.83
372 0.88
373 0.89
374 0.92
375 0.94
376 0.94
377 0.94
378 0.92
379 0.89
380 0.88
381 0.87
382 0.81
383 0.75
384 0.74
385 0.68
386 0.67
387 0.64
388 0.6
389 0.6
390 0.62
391 0.6
392 0.57
393 0.6
394 0.6
395 0.62
396 0.63
397 0.59
398 0.62
399 0.66
400 0.62
401 0.63
402 0.61
403 0.57
404 0.61
405 0.66
406 0.66
407 0.7
408 0.78
409 0.79