FuNGI

G0VCC0

Protein Details

Accession

G0VCC0

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
486-505	LWKDDKKKKFFVSKEGNSQV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
510-516	KRKLKKK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 4, cysk 2, cyto_pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR040662 Tfb2_C IPR004598 TFIIH_p52/Tfb2
Gene Ontology	GO:0000439 C:transcription factor TFIIH core complex GO:0001671 F:ATPase activator activity GO:0006289 P:nucleotide-excision repair
KEGG	ncs:NCAS_0C01390 -
Pfam	View protein in Pfam PF03849 Tfb2 PF18307 Tfb2_C

Amino Acid Sequences

MSTSVLKNSVTQYLEEIPQQVQTRLYESPATCLAIYRLLPQLAKFFVMSMVFNDKEVSLRDLDRWVKSNGKMQFQDAIKSMKSLHLIIPSKSNGGPLMINLNPTFRESFKNALTGGQVDNSFGIVADDDDDNGVVSLQLLDEYSANKWETILHFMVGTPMSSIPSASVLNLLKHTRLMEEVDHTSEFKITNEGFQFLLQELNSQIWTLLLQYLKMSETLKMDSVDVLNFIFMLGALEVGKGYSIDGLSETQKIMLKDMRDYGLVFQKYTNSNLFYPTNLALMLTSDTKSIVRTASGALESVLQNKREDSSKQANGEINKDLITNGDELDQVGYNPQDIPDGSLIIETNFKLYSYSNSPLQIATLSLFVHLKSRFANMVTGQITRESIRRALINGITADQIIAYLETHAHPQMRRLAEERLEKKLELDPNSKDPLQVLPPTVVDQIKLWQLELDRVITYEGSLYSDFETIAEYTTLSKYAQDIGVLLWKDDKKKKFFVSKEGNSQVLDYAKRKLKKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.28
3	0.27
4	0.22
5	0.26
6	0.28
7	0.26
8	0.25
9	0.24
10	0.27
11	0.26
12	0.28
13	0.29
14	0.27
15	0.29
16	0.29
17	0.29
18	0.25
19	0.25
20	0.23
21	0.22
22	0.22
23	0.21
24	0.23
25	0.24
26	0.25
27	0.25
28	0.28
29	0.24
30	0.25
31	0.22
32	0.17
33	0.18
34	0.18
35	0.17
36	0.16
37	0.21
38	0.2
39	0.2
40	0.21
41	0.18
42	0.19
43	0.21
44	0.21
45	0.17
46	0.18
47	0.2
48	0.26
49	0.31
50	0.33
51	0.34
52	0.35
53	0.39
54	0.41
55	0.47
56	0.45
57	0.48
58	0.46
59	0.45
60	0.49
61	0.43
62	0.44
63	0.39
64	0.38
65	0.29
66	0.29
67	0.27
68	0.24
69	0.25
70	0.23
71	0.23
72	0.28
73	0.31
74	0.3
75	0.35
76	0.33
77	0.33
78	0.32
79	0.3
80	0.22
81	0.2
82	0.19
83	0.14
84	0.18
85	0.16
86	0.18
87	0.17
88	0.18
89	0.17
90	0.19
91	0.21
92	0.16
93	0.21
94	0.22
95	0.27
96	0.26
97	0.29
98	0.26
99	0.26
100	0.25
101	0.22
102	0.2
103	0.17
104	0.16
105	0.13
106	0.13
107	0.12
108	0.1
109	0.08
110	0.07
111	0.05
112	0.05
113	0.06
114	0.06
115	0.06
116	0.06
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.05
121	0.04
122	0.04
123	0.04
124	0.04
125	0.04
126	0.04
127	0.04
128	0.05
129	0.06
130	0.07
131	0.1
132	0.11
133	0.1
134	0.11
135	0.13
136	0.14
137	0.18
138	0.18
139	0.15
140	0.15
141	0.15
142	0.16
143	0.14
144	0.12
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.08
149	0.08
150	0.06
151	0.08
152	0.08
153	0.07
154	0.11
155	0.11
156	0.13
157	0.16
158	0.17
159	0.15
160	0.17
161	0.17
162	0.14
163	0.14
164	0.15
165	0.13
166	0.15
167	0.17
168	0.17
169	0.17
170	0.17
171	0.16
172	0.15
173	0.14
174	0.11
175	0.13
176	0.11
177	0.14
178	0.15
179	0.16
180	0.15
181	0.14
182	0.15
183	0.11
184	0.13
185	0.08
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.08
190	0.07
191	0.07
192	0.05
193	0.06
194	0.05
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.08
200	0.08
201	0.09
202	0.1
203	0.09
204	0.11
205	0.11
206	0.13
207	0.12
208	0.12
209	0.11
210	0.11
211	0.1
212	0.08
213	0.07
214	0.06
215	0.05
216	0.05
217	0.04
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.04
233	0.06
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.08
238	0.11
239	0.11
240	0.12
241	0.13
242	0.13
243	0.14
244	0.16
245	0.15
246	0.13
247	0.13
248	0.14
249	0.18
250	0.17
251	0.16
252	0.15
253	0.18
254	0.18
255	0.21
256	0.2
257	0.16
258	0.16
259	0.19
260	0.2
261	0.16
262	0.17
263	0.15
264	0.14
265	0.11
266	0.1
267	0.07
268	0.07
269	0.08
270	0.07
271	0.07
272	0.06
273	0.07
274	0.07
275	0.08
276	0.08
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.08
281	0.09
282	0.09
283	0.08
284	0.07
285	0.09
286	0.09
287	0.14
288	0.16
289	0.16
290	0.16
291	0.17
292	0.18
293	0.19
294	0.2
295	0.22
296	0.28
297	0.31
298	0.33
299	0.36
300	0.38
301	0.36
302	0.38
303	0.32
304	0.24
305	0.19
306	0.18
307	0.14
308	0.12
309	0.11
310	0.09
311	0.07
312	0.08
313	0.07
314	0.07
315	0.08
316	0.08
317	0.06
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.09
326	0.08
327	0.09
328	0.08
329	0.09
330	0.09
331	0.08
332	0.1
333	0.07
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.08
338	0.09
339	0.13
340	0.16
341	0.19
342	0.21
343	0.22
344	0.22
345	0.21
346	0.21
347	0.17
348	0.13
349	0.1
350	0.09
351	0.08
352	0.08
353	0.09
354	0.08
355	0.13
356	0.13
357	0.14
358	0.14
359	0.16
360	0.17
361	0.18
362	0.2
363	0.16
364	0.22
365	0.22
366	0.21
367	0.19
368	0.19
369	0.19
370	0.17
371	0.19
372	0.16
373	0.16
374	0.18
375	0.18
376	0.19
377	0.22
378	0.22
379	0.22
380	0.2
381	0.19
382	0.17
383	0.16
384	0.14
385	0.1
386	0.08
387	0.06
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.06
392	0.07
393	0.09
394	0.11
395	0.15
396	0.15
397	0.19
398	0.27
399	0.28
400	0.31
401	0.32
402	0.35
403	0.38
404	0.48
405	0.47
406	0.47
407	0.47
408	0.44
409	0.43
410	0.44
411	0.44
412	0.4
413	0.42
414	0.4
415	0.43
416	0.48
417	0.46
418	0.4
419	0.34
420	0.32
421	0.31
422	0.3
423	0.26
424	0.23
425	0.23
426	0.25
427	0.28
428	0.23
429	0.19
430	0.17
431	0.19
432	0.22
433	0.21
434	0.19
435	0.18
436	0.18
437	0.22
438	0.23
439	0.21
440	0.17
441	0.17
442	0.18
443	0.15
444	0.14
445	0.12
446	0.1
447	0.11
448	0.11
449	0.12
450	0.12
451	0.12
452	0.12
453	0.11
454	0.12
455	0.1
456	0.11
457	0.1
458	0.09
459	0.11
460	0.12
461	0.13
462	0.11
463	0.12
464	0.12
465	0.15
466	0.16
467	0.14
468	0.14
469	0.14
470	0.2
471	0.2
472	0.19
473	0.22
474	0.25
475	0.34
476	0.42
477	0.49
478	0.5
479	0.58
480	0.67
481	0.71
482	0.73
483	0.75
484	0.77
485	0.77
486	0.81
487	0.77
488	0.71
489	0.6
490	0.55
491	0.48
492	0.42
493	0.4
494	0.32
495	0.35
496	0.41

G0VCC0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer