FuNGI

A0A1L9V350

Protein Details

Accession

A0A1L9V350

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
60-84	TTGFPAHRRRAKPSTFKQRRDPAAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
67-72	RRRAKP

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MAFRGERFVLDLGSDDESPSADSYDGAQGASTLNIPGMIGEIRERSPAAAPAPPTPKPTTTGFPAHRRRAKPSTFKQRRDPAAPSASASTSASAPTPKDEKMAIAQENARQLASMSDAQIEHERQELMESMDTSLLERFLRRARIDADDTPTSSKPTREQPATTEPEQDNRKEEEAAAAAPAPPSPPATTNPTAPTSTTTLKSPSPNNDSSQDDVPPTQIPSDLHAAAELPPSGSVHFPTPPSQTSPMPNLDPSSPSFLSDLQTHYFPNITHDPSALSWLQTPSADPEDPDSTSAYHPASNAEAIHPANLRFSLLGTVLSPSTSLSLPTTLGLHHHGKDPHAAGYTIPELTILSHSTFPAQRCIAWQVLGRILFRLGKGQFGERGSPLVEGLWSVVEKEGVVAGMLAEADGGTPGTGSSRRGGGQEKEGVAEKATDNATATAGGGSGSGRRQHASATAWAIEGVWLWQMGGGGDRGVLKEGAIRSQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.14
3	0.13
4	0.13
5	0.14
6	0.13
7	0.12
8	0.09
9	0.09
10	0.11
11	0.15
12	0.15
13	0.14
14	0.13
15	0.12
16	0.13
17	0.13
18	0.11
19	0.07
20	0.07
21	0.07
22	0.07
23	0.06
24	0.07
25	0.07
26	0.07
27	0.1
28	0.12
29	0.13
30	0.15
31	0.16
32	0.15
33	0.17
34	0.2
35	0.2
36	0.22
37	0.23
38	0.29
39	0.35
40	0.36
41	0.39
42	0.4
43	0.39
44	0.39
45	0.41
46	0.38
47	0.38
48	0.45
49	0.47
50	0.53
51	0.61
52	0.68
53	0.72
54	0.71
55	0.74
56	0.75
57	0.77
58	0.78
59	0.79
60	0.8
61	0.82
62	0.85
63	0.86
64	0.86
65	0.84
66	0.79
67	0.73
68	0.7
69	0.66
70	0.6
71	0.51
72	0.44
73	0.37
74	0.32
75	0.28
76	0.21
77	0.14
78	0.14
79	0.13
80	0.13
81	0.13
82	0.17
83	0.2
84	0.19
85	0.21
86	0.21
87	0.21
88	0.24
89	0.3
90	0.27
91	0.27
92	0.29
93	0.3
94	0.33
95	0.31
96	0.26
97	0.19
98	0.18
99	0.15
100	0.16
101	0.14
102	0.11
103	0.13
104	0.13
105	0.15
106	0.19
107	0.19
108	0.16
109	0.16
110	0.16
111	0.13
112	0.15
113	0.14
114	0.12
115	0.13
116	0.12
117	0.11
118	0.12
119	0.12
120	0.12
121	0.11
122	0.1
123	0.09
124	0.09
125	0.12
126	0.15
127	0.22
128	0.22
129	0.24
130	0.26
131	0.31
132	0.35
133	0.35
134	0.36
135	0.32
136	0.33
137	0.33
138	0.3
139	0.29
140	0.26
141	0.24
142	0.23
143	0.29
144	0.35
145	0.36
146	0.37
147	0.39
148	0.46
149	0.49
150	0.46
151	0.45
152	0.38
153	0.41
154	0.43
155	0.39
156	0.34
157	0.31
158	0.32
159	0.26
160	0.25
161	0.2
162	0.17
163	0.16
164	0.12
165	0.1
166	0.09
167	0.08
168	0.08
169	0.07
170	0.06
171	0.08
172	0.08
173	0.1
174	0.12
175	0.19
176	0.21
177	0.23
178	0.25
179	0.26
180	0.26
181	0.24
182	0.24
183	0.21
184	0.22
185	0.21
186	0.19
187	0.19
188	0.21
189	0.25
190	0.26
191	0.28
192	0.32
193	0.33
194	0.35
195	0.35
196	0.35
197	0.34
198	0.32
199	0.26
200	0.21
201	0.19
202	0.17
203	0.15
204	0.13
205	0.1
206	0.11
207	0.1
208	0.11
209	0.14
210	0.13
211	0.12
212	0.12
213	0.12
214	0.11
215	0.11
216	0.09
217	0.05
218	0.05
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.07
223	0.07
224	0.09
225	0.1
226	0.12
227	0.15
228	0.15
229	0.18
230	0.2
231	0.2
232	0.21
233	0.23
234	0.23
235	0.22
236	0.21
237	0.2
238	0.17
239	0.17
240	0.16
241	0.19
242	0.16
243	0.16
244	0.16
245	0.15
246	0.17
247	0.16
248	0.17
249	0.12
250	0.13
251	0.12
252	0.12
253	0.13
254	0.11
255	0.15
256	0.16
257	0.16
258	0.16
259	0.16
260	0.17
261	0.16
262	0.19
263	0.14
264	0.11
265	0.11
266	0.11
267	0.12
268	0.11
269	0.11
270	0.11
271	0.14
272	0.13
273	0.12
274	0.15
275	0.16
276	0.16
277	0.17
278	0.14
279	0.12
280	0.13
281	0.15
282	0.12
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.11
287	0.11
288	0.11
289	0.09
290	0.12
291	0.11
292	0.13
293	0.13
294	0.12
295	0.12
296	0.12
297	0.11
298	0.08
299	0.09
300	0.08
301	0.07
302	0.08
303	0.07
304	0.08
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.06
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.08
314	0.08
315	0.09
316	0.09
317	0.08
318	0.09
319	0.13
320	0.16
321	0.16
322	0.21
323	0.22
324	0.23
325	0.27
326	0.27
327	0.25
328	0.22
329	0.22
330	0.16
331	0.18
332	0.19
333	0.14
334	0.12
335	0.1
336	0.09
337	0.09
338	0.11
339	0.09
340	0.09
341	0.1
342	0.1
343	0.14
344	0.17
345	0.18
346	0.22
347	0.21
348	0.2
349	0.22
350	0.26
351	0.24
352	0.22
353	0.24
354	0.21
355	0.24
356	0.26
357	0.23
358	0.2
359	0.21
360	0.2
361	0.18
362	0.22
363	0.18
364	0.2
365	0.22
366	0.23
367	0.26
368	0.26
369	0.29
370	0.23
371	0.24
372	0.21
373	0.2
374	0.17
375	0.13
376	0.11
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.07
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.06
388	0.06
389	0.05
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.03
402	0.06
403	0.08
404	0.1
405	0.12
406	0.14
407	0.16
408	0.19
409	0.26
410	0.27
411	0.32
412	0.36
413	0.35
414	0.35
415	0.36
416	0.33
417	0.28
418	0.27
419	0.2
420	0.18
421	0.18
422	0.17
423	0.16
424	0.16
425	0.16
426	0.13
427	0.13
428	0.09
429	0.08
430	0.07
431	0.06
432	0.06
433	0.08
434	0.12
435	0.16
436	0.18
437	0.19
438	0.2
439	0.21
440	0.26
441	0.27
442	0.28
443	0.28
444	0.27
445	0.26
446	0.25
447	0.24
448	0.19
449	0.15
450	0.11
451	0.08
452	0.07
453	0.06
454	0.07
455	0.07
456	0.07
457	0.09
458	0.09
459	0.08
460	0.09
461	0.1
462	0.1
463	0.12
464	0.12
465	0.11
466	0.16

A0A1L9V350

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer