Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7TRT3

Protein Details
Accession A7TRT3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1015-1038VDYFSIRKKVKKFSVLKKLSKEDLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR006167  XPF  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG vpo:Kpol_1007p11  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MSQLFVQDDSDDEGLQDELSRQIKELKELQEKILVEEPKVGSGVDVVDETSQSEKKKTEKVEEEEDKVLYPLIPNDKYEYDDKKPDINDIRSVNINLSLPLSFQQQVVENALVSNDPLVILGKGLGMMSIVSNLLHILATPTKLDGKLKRSLVLVLNATQSDNQRIGEELQELFWLSDDDDDNNLSKNGNISSDQNGNENPRSFNVVTADSLSVEKRSKLYLSGGIISVTSRILIVDLLSGIIHPNRITGIVVLNVENLRHYSNESFIIEIFRSKNKWGFLKGFSESPESFVMEFSPLMRKMKDLKFKNVLLWPRFRVEISSCLNDILKQKSQKVIEIKVSLTNSMSQIQFGLIECLKKCIAELIRKNSELALDWWNIENALDLNFQRSIDSVMVPNWHRISFESKQLVKDIRFLRHLMKLLVTSDSVTFYEELQLSLEANKPSISRKYTESPWLMATESQLVISHSRKRIYDNERYQLEEQPKWEQVLSILEDISYQRNISKKNGPTLIACSDPATCRQITSVLAYSNRKDGIKNLMNQKLNLYRYRKEENKRLLKEANDKETQDTKEIVVSTAFVKEEVVSKRRRTRGAATVAAVERLRNAGAGEDIENIIDDYDVSWDEMSRVIDEEVLGSDEYIKYSNEAEDEAFESDTETAETCFSAARTSKEVWEKVKNDYHYINCNDQIIVDCFANLNDETALQEVMPSHIIMYEPDLTFVRNLEIYRAINHEQAPVIYFMYYGDSIEEQRHLTAIKKEKDAFTKLIRENAMLAQHFETEGDLSHYKNLADRKLQLSRLRNTSTRIAGGQNLLHEVTQDVVIVDSREFNASLPGLLYRYGVCVIPCMLTVGDYIITPDICIERKSVADLIGSFLNNRLESQCKKMAKYYKFPTLLIEFDEDQSFSLEPFAEKRSYRRNESSTVHQISSTLSQFEIQMKLSKLALKFPNLKIIWSSSPLQTVNIILELKLGRSQPDPSVSMALGVSKNSRSQPTSVKTNNETNDELYKTLLDIPGLSKVDYFSIRKKVKKFSVLKKLSKEDLTNLVDDEGLAQKIFNFLNIQEDEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.11
4 0.09
5 0.14
6 0.17
7 0.18
8 0.18
9 0.25
10 0.26
11 0.32
12 0.38
13 0.41
14 0.48
15 0.5
16 0.51
17 0.51
18 0.5
19 0.48
20 0.48
21 0.4
22 0.31
23 0.35
24 0.33
25 0.28
26 0.28
27 0.24
28 0.16
29 0.16
30 0.16
31 0.1
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.1
37 0.14
38 0.17
39 0.18
40 0.22
41 0.26
42 0.32
43 0.4
44 0.46
45 0.52
46 0.57
47 0.62
48 0.68
49 0.7
50 0.69
51 0.63
52 0.57
53 0.47
54 0.38
55 0.32
56 0.22
57 0.17
58 0.18
59 0.23
60 0.25
61 0.26
62 0.3
63 0.31
64 0.34
65 0.39
66 0.4
67 0.39
68 0.45
69 0.46
70 0.47
71 0.47
72 0.52
73 0.54
74 0.51
75 0.52
76 0.46
77 0.47
78 0.44
79 0.44
80 0.37
81 0.31
82 0.28
83 0.21
84 0.2
85 0.17
86 0.14
87 0.15
88 0.17
89 0.15
90 0.15
91 0.16
92 0.18
93 0.2
94 0.22
95 0.21
96 0.18
97 0.17
98 0.17
99 0.15
100 0.11
101 0.1
102 0.06
103 0.05
104 0.06
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.08
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.13
129 0.16
130 0.18
131 0.25
132 0.29
133 0.32
134 0.39
135 0.41
136 0.42
137 0.4
138 0.42
139 0.39
140 0.38
141 0.35
142 0.29
143 0.3
144 0.28
145 0.27
146 0.25
147 0.24
148 0.22
149 0.21
150 0.19
151 0.18
152 0.19
153 0.2
154 0.19
155 0.19
156 0.15
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.12
161 0.11
162 0.09
163 0.07
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.14
171 0.15
172 0.12
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.14
177 0.15
178 0.16
179 0.2
180 0.25
181 0.25
182 0.25
183 0.27
184 0.29
185 0.33
186 0.33
187 0.3
188 0.26
189 0.32
190 0.3
191 0.3
192 0.28
193 0.24
194 0.23
195 0.23
196 0.22
197 0.16
198 0.17
199 0.15
200 0.16
201 0.16
202 0.17
203 0.16
204 0.18
205 0.18
206 0.19
207 0.22
208 0.23
209 0.24
210 0.25
211 0.24
212 0.21
213 0.2
214 0.18
215 0.15
216 0.1
217 0.07
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.08
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.13
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.13
249 0.12
250 0.14
251 0.17
252 0.17
253 0.17
254 0.16
255 0.18
256 0.15
257 0.17
258 0.17
259 0.18
260 0.2
261 0.22
262 0.26
263 0.28
264 0.32
265 0.35
266 0.37
267 0.37
268 0.41
269 0.4
270 0.37
271 0.35
272 0.36
273 0.3
274 0.28
275 0.25
276 0.21
277 0.19
278 0.17
279 0.16
280 0.12
281 0.12
282 0.1
283 0.14
284 0.15
285 0.17
286 0.17
287 0.19
288 0.27
289 0.35
290 0.44
291 0.43
292 0.5
293 0.55
294 0.56
295 0.58
296 0.56
297 0.56
298 0.51
299 0.52
300 0.46
301 0.41
302 0.41
303 0.36
304 0.33
305 0.27
306 0.29
307 0.28
308 0.28
309 0.26
310 0.26
311 0.26
312 0.26
313 0.27
314 0.25
315 0.27
316 0.28
317 0.31
318 0.36
319 0.38
320 0.41
321 0.42
322 0.41
323 0.41
324 0.39
325 0.37
326 0.35
327 0.35
328 0.29
329 0.24
330 0.21
331 0.17
332 0.18
333 0.17
334 0.12
335 0.12
336 0.11
337 0.11
338 0.1
339 0.12
340 0.1
341 0.12
342 0.12
343 0.15
344 0.15
345 0.14
346 0.14
347 0.16
348 0.21
349 0.27
350 0.34
351 0.4
352 0.45
353 0.45
354 0.46
355 0.4
356 0.36
357 0.28
358 0.23
359 0.19
360 0.15
361 0.15
362 0.15
363 0.15
364 0.14
365 0.12
366 0.1
367 0.06
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.1
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.11
377 0.1
378 0.11
379 0.1
380 0.1
381 0.14
382 0.15
383 0.18
384 0.18
385 0.17
386 0.17
387 0.17
388 0.24
389 0.22
390 0.28
391 0.32
392 0.32
393 0.33
394 0.36
395 0.38
396 0.31
397 0.37
398 0.34
399 0.31
400 0.31
401 0.32
402 0.32
403 0.33
404 0.34
405 0.27
406 0.24
407 0.21
408 0.19
409 0.19
410 0.15
411 0.12
412 0.1
413 0.11
414 0.1
415 0.09
416 0.09
417 0.08
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.09
422 0.09
423 0.08
424 0.09
425 0.12
426 0.1
427 0.1
428 0.11
429 0.11
430 0.14
431 0.19
432 0.19
433 0.18
434 0.22
435 0.27
436 0.29
437 0.35
438 0.34
439 0.3
440 0.29
441 0.28
442 0.24
443 0.2
444 0.18
445 0.12
446 0.11
447 0.09
448 0.08
449 0.08
450 0.1
451 0.13
452 0.19
453 0.2
454 0.22
455 0.23
456 0.26
457 0.35
458 0.39
459 0.47
460 0.47
461 0.51
462 0.5
463 0.53
464 0.51
465 0.47
466 0.44
467 0.36
468 0.31
469 0.28
470 0.28
471 0.25
472 0.23
473 0.18
474 0.14
475 0.15
476 0.14
477 0.11
478 0.1
479 0.09
480 0.09
481 0.1
482 0.1
483 0.08
484 0.07
485 0.09
486 0.12
487 0.14
488 0.18
489 0.25
490 0.27
491 0.32
492 0.35
493 0.34
494 0.32
495 0.33
496 0.31
497 0.24
498 0.21
499 0.16
500 0.15
501 0.14
502 0.15
503 0.14
504 0.12
505 0.11
506 0.11
507 0.12
508 0.11
509 0.13
510 0.13
511 0.12
512 0.15
513 0.17
514 0.17
515 0.18
516 0.19
517 0.17
518 0.16
519 0.16
520 0.22
521 0.25
522 0.29
523 0.34
524 0.4
525 0.4
526 0.4
527 0.41
528 0.38
529 0.36
530 0.38
531 0.35
532 0.32
533 0.36
534 0.43
535 0.47
536 0.48
537 0.54
538 0.58
539 0.63
540 0.62
541 0.61
542 0.58
543 0.54
544 0.58
545 0.54
546 0.5
547 0.42
548 0.4
549 0.39
550 0.41
551 0.37
552 0.29
553 0.25
554 0.19
555 0.19
556 0.18
557 0.16
558 0.1
559 0.1
560 0.09
561 0.09
562 0.09
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.12
567 0.15
568 0.19
569 0.23
570 0.29
571 0.37
572 0.42
573 0.45
574 0.44
575 0.47
576 0.5
577 0.52
578 0.49
579 0.41
580 0.4
581 0.36
582 0.34
583 0.27
584 0.19
585 0.13
586 0.11
587 0.1
588 0.07
589 0.07
590 0.05
591 0.05
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.06
596 0.06
597 0.06
598 0.06
599 0.05
600 0.04
601 0.03
602 0.03
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.05
609 0.07
610 0.07
611 0.06
612 0.07
613 0.07
614 0.07
615 0.07
616 0.07
617 0.06
618 0.06
619 0.06
620 0.05
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.07
625 0.06
626 0.06
627 0.07
628 0.08
629 0.08
630 0.08
631 0.08
632 0.08
633 0.09
634 0.09
635 0.08
636 0.08
637 0.08
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.06
642 0.05
643 0.06
644 0.06
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.08
649 0.09
650 0.11
651 0.14
652 0.16
653 0.21
654 0.26
655 0.3
656 0.32
657 0.38
658 0.38
659 0.41
660 0.46
661 0.42
662 0.4
663 0.41
664 0.39
665 0.38
666 0.4
667 0.36
668 0.31
669 0.31
670 0.27
671 0.23
672 0.22
673 0.17
674 0.15
675 0.12
676 0.11
677 0.1
678 0.1
679 0.12
680 0.09
681 0.08
682 0.06
683 0.07
684 0.07
685 0.07
686 0.08
687 0.05
688 0.06
689 0.05
690 0.06
691 0.07
692 0.06
693 0.06
694 0.06
695 0.07
696 0.06
697 0.09
698 0.12
699 0.11
700 0.13
701 0.13
702 0.13
703 0.13
704 0.13
705 0.12
706 0.1
707 0.1
708 0.1
709 0.13
710 0.14
711 0.15
712 0.19
713 0.19
714 0.21
715 0.21
716 0.21
717 0.18
718 0.17
719 0.17
720 0.14
721 0.12
722 0.09
723 0.08
724 0.07
725 0.09
726 0.09
727 0.08
728 0.08
729 0.08
730 0.09
731 0.1
732 0.12
733 0.1
734 0.1
735 0.11
736 0.11
737 0.13
738 0.2
739 0.28
740 0.31
741 0.36
742 0.39
743 0.42
744 0.47
745 0.48
746 0.45
747 0.41
748 0.46
749 0.42
750 0.45
751 0.42
752 0.37
753 0.34
754 0.32
755 0.31
756 0.22
757 0.22
758 0.17
759 0.17
760 0.16
761 0.14
762 0.12
763 0.08
764 0.08
765 0.1
766 0.1
767 0.11
768 0.13
769 0.14
770 0.14
771 0.17
772 0.21
773 0.21
774 0.25
775 0.28
776 0.32
777 0.38
778 0.44
779 0.47
780 0.51
781 0.53
782 0.56
783 0.57
784 0.53
785 0.51
786 0.5
787 0.46
788 0.4
789 0.35
790 0.3
791 0.27
792 0.27
793 0.24
794 0.19
795 0.18
796 0.17
797 0.14
798 0.13
799 0.11
800 0.09
801 0.08
802 0.08
803 0.06
804 0.06
805 0.07
806 0.07
807 0.07
808 0.07
809 0.08
810 0.09
811 0.09
812 0.09
813 0.11
814 0.11
815 0.11
816 0.1
817 0.1
818 0.1
819 0.1
820 0.1
821 0.08
822 0.1
823 0.1
824 0.11
825 0.1
826 0.11
827 0.11
828 0.11
829 0.11
830 0.11
831 0.1
832 0.09
833 0.09
834 0.09
835 0.08
836 0.07
837 0.08
838 0.08
839 0.08
840 0.07
841 0.08
842 0.1
843 0.11
844 0.12
845 0.12
846 0.13
847 0.13
848 0.16
849 0.17
850 0.15
851 0.16
852 0.15
853 0.16
854 0.17
855 0.17
856 0.14
857 0.16
858 0.18
859 0.16
860 0.17
861 0.17
862 0.22
863 0.25
864 0.31
865 0.37
866 0.38
867 0.4
868 0.47
869 0.54
870 0.55
871 0.62
872 0.62
873 0.64
874 0.63
875 0.61
876 0.58
877 0.51
878 0.45
879 0.37
880 0.34
881 0.25
882 0.24
883 0.24
884 0.19
885 0.16
886 0.16
887 0.14
888 0.1
889 0.1
890 0.09
891 0.09
892 0.12
893 0.15
894 0.19
895 0.2
896 0.27
897 0.36
898 0.43
899 0.5
900 0.56
901 0.57
902 0.6
903 0.63
904 0.65
905 0.65
906 0.62
907 0.54
908 0.46
909 0.41
910 0.37
911 0.37
912 0.29
913 0.2
914 0.16
915 0.16
916 0.18
917 0.21
918 0.2
919 0.17
920 0.21
921 0.22
922 0.24
923 0.25
924 0.28
925 0.25
926 0.32
927 0.35
928 0.37
929 0.43
930 0.43
931 0.51
932 0.47
933 0.47
934 0.41
935 0.42
936 0.37
937 0.34
938 0.35
939 0.27
940 0.31
941 0.3
942 0.29
943 0.24
944 0.22
945 0.19
946 0.2
947 0.18
948 0.13
949 0.16
950 0.15
951 0.16
952 0.19
953 0.18
954 0.18
955 0.2
956 0.23
957 0.24
958 0.29
959 0.29
960 0.27
961 0.29
962 0.27
963 0.26
964 0.22
965 0.21
966 0.17
967 0.18
968 0.19
969 0.18
970 0.22
971 0.25
972 0.31
973 0.3
974 0.34
975 0.42
976 0.45
977 0.53
978 0.54
979 0.58
980 0.58
981 0.63
982 0.63
983 0.58
984 0.54
985 0.47
986 0.47
987 0.42
988 0.37
989 0.29
990 0.25
991 0.21
992 0.22
993 0.2
994 0.14
995 0.14
996 0.15
997 0.21
998 0.22
999 0.21
1000 0.18
1001 0.18
1002 0.22
1003 0.26
1004 0.29
1005 0.29
1006 0.38
1007 0.46
1008 0.53
1009 0.6
1010 0.66
1011 0.7
1012 0.76
1013 0.79
1014 0.79
1015 0.83
1016 0.86
1017 0.87
1018 0.86
1019 0.83
1020 0.8
1021 0.75
1022 0.68
1023 0.62
1024 0.6
1025 0.55
1026 0.47
1027 0.4
1028 0.34
1029 0.28
1030 0.24
1031 0.22
1032 0.15
1033 0.13
1034 0.12
1035 0.11
1036 0.11
1037 0.15
1038 0.15
1039 0.15
1040 0.14
1041 0.14
1042 0.21