Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0VL24

Protein Details
Accession G0VL24    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
213-236AGEMRLRKLKKNDRSEKKQIECPIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
204-229NKRKMKIRAAGEMRLRKLKKNDRSEK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR022030  SF3A1_dom  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG ncs:NCAS_0J02340  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12230  PRP21_like_P  
Amino Acid Sequences MAPSDTRTVNKEPYKFIFSNYEKTVAPSDLEVIKNTALLYVSKEYSTIKHLQKDLDRLFKGDDGVLFQFLETEHPLHTLFTQFIKQYRDVKKALPLTKNVIKNPGKDSQIELLQMCFDRAEYYEYSSEQKSEVEKLKHLEKVQFASFEWNKFEIIKVVNEGASVIYKEPLDFKKLHQRNIRDSFQSIFKESAKEETEVETPRVNKRKMKIRAAGEMRLRKLKKNDRSEKKQIECPITHRLIDEDKFDRHLQILLTDPNYKQERDKYQEKHHLSNLSFDDIYANLKRVVKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.53
3 0.51
4 0.52
5 0.48
6 0.52
7 0.48
8 0.46
9 0.38
10 0.4
11 0.4
12 0.31
13 0.28
14 0.21
15 0.21
16 0.22
17 0.23
18 0.21
19 0.2
20 0.19
21 0.19
22 0.18
23 0.15
24 0.12
25 0.11
26 0.14
27 0.16
28 0.17
29 0.16
30 0.17
31 0.17
32 0.18
33 0.23
34 0.28
35 0.3
36 0.35
37 0.38
38 0.43
39 0.47
40 0.55
41 0.55
42 0.56
43 0.51
44 0.46
45 0.46
46 0.41
47 0.36
48 0.28
49 0.22
50 0.17
51 0.17
52 0.16
53 0.14
54 0.12
55 0.11
56 0.1
57 0.12
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.11
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.15
69 0.15
70 0.19
71 0.22
72 0.26
73 0.33
74 0.39
75 0.43
76 0.42
77 0.43
78 0.46
79 0.51
80 0.53
81 0.48
82 0.44
83 0.45
84 0.51
85 0.54
86 0.47
87 0.49
88 0.45
89 0.44
90 0.46
91 0.45
92 0.4
93 0.35
94 0.37
95 0.3
96 0.29
97 0.27
98 0.22
99 0.16
100 0.16
101 0.15
102 0.12
103 0.09
104 0.07
105 0.06
106 0.07
107 0.1
108 0.09
109 0.11
110 0.12
111 0.13
112 0.16
113 0.15
114 0.15
115 0.12
116 0.13
117 0.12
118 0.15
119 0.2
120 0.2
121 0.21
122 0.24
123 0.27
124 0.29
125 0.3
126 0.29
127 0.25
128 0.26
129 0.25
130 0.24
131 0.2
132 0.24
133 0.24
134 0.21
135 0.21
136 0.18
137 0.18
138 0.17
139 0.17
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.1
156 0.11
157 0.15
158 0.15
159 0.18
160 0.28
161 0.33
162 0.41
163 0.44
164 0.48
165 0.55
166 0.61
167 0.62
168 0.53
169 0.5
170 0.44
171 0.42
172 0.39
173 0.31
174 0.26
175 0.23
176 0.23
177 0.22
178 0.25
179 0.21
180 0.2
181 0.19
182 0.19
183 0.22
184 0.22
185 0.23
186 0.21
187 0.22
188 0.29
189 0.37
190 0.39
191 0.4
192 0.46
193 0.55
194 0.61
195 0.67
196 0.67
197 0.63
198 0.69
199 0.68
200 0.68
201 0.66
202 0.63
203 0.58
204 0.59
205 0.56
206 0.53
207 0.58
208 0.62
209 0.63
210 0.68
211 0.75
212 0.77
213 0.85
214 0.89
215 0.89
216 0.84
217 0.81
218 0.77
219 0.74
220 0.66
221 0.61
222 0.59
223 0.52
224 0.47
225 0.4
226 0.37
227 0.35
228 0.34
229 0.35
230 0.3
231 0.29
232 0.32
233 0.33
234 0.31
235 0.25
236 0.26
237 0.21
238 0.19
239 0.21
240 0.21
241 0.23
242 0.26
243 0.25
244 0.31
245 0.34
246 0.33
247 0.35
248 0.39
249 0.46
250 0.5
251 0.6
252 0.6
253 0.67
254 0.76
255 0.77
256 0.75
257 0.72
258 0.72
259 0.63
260 0.63
261 0.55
262 0.5
263 0.43
264 0.36
265 0.31
266 0.24
267 0.28
268 0.22
269 0.22
270 0.21