FuNGI

A0A1L9RIQ5

Protein Details

Accession

A0A1L9RIQ5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-26	VSTPASHPPKMKRPPPPFAQAG	Hydrophilic
397-416	SPQHREPPPSPKRRKRTVAE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
406-412	SPKRRKR

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 10.333, mito 7.5, cyto_mito 5.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MATAVSTPASHPPKMKRPPPPFAQAGVNGVKPHQTSSSPPTTSKRLPGSGQSAAAGSTNFSVSNGVNGVVNSTNITNKGPLNRSKKDAQKLGDQSMRLQRPSGRTTATENEGRIGKNCPEPYVKTTSHILKKFSRSPPSLIVHLHPTHFRFEQQDGSFPYNSEMKVIIEHIRAGTVPHDMIEELLRANVRFYEGCLIVRVVDHKSASAQARKSTAPSTNENNTPFSIHNYNEHVTPSAFVPYPKQNQLTSEKPVTKTESDTGSHSDVKTNGNPSGSQGGKEAESAAATQQKNAVTKPRVFTTVLHPTPRSLQAELTLLATTPDPKAPKPLPPNSTSPGTSGNQPDRAPAPKRQKMLVEPQDLPHCESKLTRALAPPLFLDPVDSLEAAQDLLKFLESPQHREPPPSPKRRKRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLEPTTSGAAGASKSAVVDDAGGTASFEPRFSRFKTLENIRMQHEEKAKREHEIKLKQEMAKRQQQEQERERRRALEQRQAEEHAKEETRRQQLAAQQAQAQLAAAQQQNRHVMAQANGVSQAPQTSPVVRNQTPHNTSSPLVGNTMVTQAGVPMSISSSAQGAGSPPRPPSALQHAHPNVMSHPMAPSRSQQGPSRHGTPQMGQGTTPAMSHATPIMRNVTPTQRINHGSPTNSITQTPAMNQPIMPPQMGGGMGGLTPQQQQLLLQQRQQQIIAQQNLGNSQFTPQQVAQLQANVHAQQNIQSHQQQMLQAQQQNHQNQQQKAPNQQVYQAQLMRAQLAQMQMAQHQQQQQQTQGQSQGQQNQVHQGSPQMTPQQQQQQILMAAAQANGGHIPQNFQGVNMAQRYNHLYQQRLLRLRHEMATRFMAQYGSPTQYPPQIAQQYGIGLERSAKAWVQEIMRREREAAQQQRASQVAQVQAQVMQQQQNMMGRGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.69
3	0.71
4	0.75
5	0.81
6	0.81
7	0.8
8	0.74
9	0.68
10	0.65
11	0.57
12	0.54
13	0.48
14	0.43
15	0.36
16	0.33
17	0.34
18	0.28
19	0.28
20	0.25
21	0.24
22	0.28
23	0.35
24	0.43
25	0.41
26	0.45
27	0.48
28	0.53
29	0.55
30	0.57
31	0.56
32	0.52
33	0.52
34	0.55
35	0.56
36	0.52
37	0.48
38	0.41
39	0.34
40	0.29
41	0.27
42	0.19
43	0.13
44	0.11
45	0.1
46	0.09
47	0.09
48	0.11
49	0.1
50	0.13
51	0.13
52	0.12
53	0.12
54	0.12
55	0.14
56	0.13
57	0.13
58	0.12
59	0.13
60	0.15
61	0.16
62	0.17
63	0.18
64	0.21
65	0.29
66	0.34
67	0.42
68	0.49
69	0.53
70	0.58
71	0.63
72	0.69
73	0.7
74	0.71
75	0.66
76	0.67
77	0.67
78	0.7
79	0.66
80	0.57
81	0.54
82	0.56
83	0.57
84	0.48
85	0.45
86	0.42
87	0.44
88	0.48
89	0.46
90	0.39
91	0.36
92	0.41
93	0.44
94	0.44
95	0.41
96	0.37
97	0.36
98	0.37
99	0.35
100	0.31
101	0.3
102	0.29
103	0.33
104	0.34
105	0.34
106	0.37
107	0.4
108	0.44
109	0.47
110	0.43
111	0.38
112	0.43
113	0.48
114	0.52
115	0.51
116	0.52
117	0.51
118	0.58
119	0.64
120	0.67
121	0.67
122	0.61
123	0.62
124	0.65
125	0.62
126	0.58
127	0.51
128	0.45
129	0.43
130	0.42
131	0.39
132	0.36
133	0.33
134	0.35
135	0.33
136	0.33
137	0.29
138	0.3
139	0.36
140	0.33
141	0.37
142	0.36
143	0.39
144	0.37
145	0.33
146	0.33
147	0.28
148	0.26
149	0.22
150	0.19
151	0.15
152	0.15
153	0.17
154	0.19
155	0.16
156	0.18
157	0.16
158	0.16
159	0.15
160	0.15
161	0.14
162	0.12
163	0.11
164	0.1
165	0.1
166	0.1
167	0.11
168	0.11
169	0.1
170	0.08
171	0.09
172	0.1
173	0.1
174	0.1
175	0.1
176	0.12
177	0.11
178	0.13
179	0.16
180	0.16
181	0.17
182	0.17
183	0.17
184	0.15
185	0.16
186	0.17
187	0.14
188	0.16
189	0.16
190	0.15
191	0.16
192	0.21
193	0.25
194	0.29
195	0.3
196	0.3
197	0.33
198	0.34
199	0.35
200	0.34
201	0.35
202	0.33
203	0.36
204	0.39
205	0.41
206	0.46
207	0.45
208	0.43
209	0.37
210	0.35
211	0.3
212	0.29
213	0.27
214	0.23
215	0.25
216	0.28
217	0.28
218	0.27
219	0.27
220	0.23
221	0.2
222	0.19
223	0.16
224	0.15
225	0.14
226	0.14
227	0.17
228	0.24
229	0.29
230	0.33
231	0.36
232	0.33
233	0.38
234	0.44
235	0.44
236	0.42
237	0.44
238	0.44
239	0.43
240	0.45
241	0.45
242	0.4
243	0.39
244	0.36
245	0.32
246	0.29
247	0.29
248	0.29
249	0.28
250	0.29
251	0.25
252	0.25
253	0.23
254	0.25
255	0.26
256	0.26
257	0.25
258	0.23
259	0.23
260	0.22
261	0.28
262	0.24
263	0.21
264	0.19
265	0.19
266	0.18
267	0.18
268	0.16
269	0.1
270	0.09
271	0.09
272	0.1
273	0.16
274	0.15
275	0.16
276	0.18
277	0.2
278	0.22
279	0.23
280	0.3
281	0.28
282	0.32
283	0.35
284	0.34
285	0.34
286	0.34
287	0.34
288	0.33
289	0.38
290	0.37
291	0.38
292	0.36
293	0.34
294	0.36
295	0.4
296	0.34
297	0.25
298	0.22
299	0.21
300	0.22
301	0.21
302	0.18
303	0.13
304	0.1
305	0.1
306	0.1
307	0.09
308	0.08
309	0.11
310	0.12
311	0.12
312	0.2
313	0.22
314	0.3
315	0.37
316	0.44
317	0.45
318	0.47
319	0.52
320	0.48
321	0.5
322	0.42
323	0.35
324	0.32
325	0.28
326	0.28
327	0.29
328	0.29
329	0.3
330	0.29
331	0.29
332	0.27
333	0.33
334	0.33
335	0.36
336	0.43
337	0.44
338	0.47
339	0.48
340	0.49
341	0.47
342	0.54
343	0.54
344	0.48
345	0.44
346	0.44
347	0.46
348	0.43
349	0.41
350	0.33
351	0.25
352	0.2
353	0.19
354	0.2
355	0.21
356	0.22
357	0.21
358	0.21
359	0.25
360	0.25
361	0.26
362	0.23
363	0.18
364	0.17
365	0.14
366	0.14
367	0.09
368	0.1
369	0.1
370	0.09
371	0.08
372	0.07
373	0.07
374	0.06
375	0.07
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.12
383	0.12
384	0.19
385	0.23
386	0.29
387	0.3
388	0.33
389	0.37
390	0.41
391	0.5
392	0.55
393	0.61
394	0.64
395	0.73
396	0.79
397	0.84
398	0.78
399	0.78
400	0.76
401	0.73
402	0.66
403	0.58
404	0.5
405	0.41
406	0.36
407	0.25
408	0.15
409	0.08
410	0.05
411	0.04
412	0.03
413	0.03
414	0.03
415	0.03
416	0.03
417	0.03
418	0.03
419	0.04
420	0.05
421	0.07
422	0.07
423	0.08
424	0.09
425	0.09
426	0.09
427	0.09
428	0.08
429	0.06
430	0.06
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.05
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.03
441	0.04
442	0.03
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.06
452	0.09
453	0.12
454	0.14
455	0.2
456	0.2
457	0.23
458	0.3
459	0.34
460	0.4
461	0.41
462	0.42
463	0.38
464	0.42
465	0.4
466	0.37
467	0.39
468	0.36
469	0.35
470	0.4
471	0.38
472	0.37
473	0.4
474	0.41
475	0.42
476	0.45
477	0.46
478	0.45
479	0.49
480	0.49
481	0.5
482	0.52
483	0.49
484	0.49
485	0.48
486	0.46
487	0.47
488	0.51
489	0.55
490	0.56
491	0.6
492	0.6
493	0.63
494	0.59
495	0.56
496	0.53
497	0.53
498	0.51
499	0.49
500	0.46
501	0.45
502	0.46
503	0.47
504	0.45
505	0.36
506	0.31
507	0.25
508	0.22
509	0.2
510	0.22
511	0.26
512	0.3
513	0.3
514	0.3
515	0.3
516	0.33
517	0.41
518	0.39
519	0.32
520	0.29
521	0.29
522	0.29
523	0.25
524	0.21
525	0.12
526	0.09
527	0.12
528	0.11
529	0.12
530	0.13
531	0.16
532	0.18
533	0.19
534	0.19
535	0.16
536	0.17
537	0.16
538	0.19
539	0.17
540	0.15
541	0.15
542	0.15
543	0.13
544	0.12
545	0.11
546	0.07
547	0.08
548	0.08
549	0.11
550	0.13
551	0.18
552	0.25
553	0.25
554	0.27
555	0.3
556	0.38
557	0.38
558	0.38
559	0.36
560	0.31
561	0.3
562	0.31
563	0.28
564	0.2
565	0.18
566	0.16
567	0.14
568	0.12
569	0.13
570	0.1
571	0.07
572	0.06
573	0.06
574	0.05
575	0.05
576	0.04
577	0.03
578	0.04
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.06
586	0.06
587	0.1
588	0.12
589	0.14
590	0.15
591	0.16
592	0.17
593	0.17
594	0.21
595	0.27
596	0.3
597	0.3
598	0.39
599	0.39
600	0.4
601	0.4
602	0.36
603	0.26
604	0.25
605	0.24
606	0.14
607	0.15
608	0.16
609	0.17
610	0.17
611	0.19
612	0.2
613	0.24
614	0.27
615	0.31
616	0.36
617	0.41
618	0.44
619	0.46
620	0.42
621	0.42
622	0.41
623	0.36
624	0.38
625	0.35
626	0.31
627	0.26
628	0.25
629	0.23
630	0.21
631	0.19
632	0.12
633	0.09
634	0.08
635	0.09
636	0.11
637	0.11
638	0.11
639	0.13
640	0.17
641	0.16
642	0.18
643	0.21
644	0.25
645	0.29
646	0.32
647	0.33
648	0.34
649	0.38
650	0.38
651	0.43
652	0.4
653	0.35
654	0.35
655	0.36
656	0.34
657	0.31
658	0.29
659	0.23
660	0.21
661	0.2
662	0.2
663	0.22
664	0.2
665	0.2
666	0.2
667	0.21
668	0.24
669	0.25
670	0.23
671	0.17
672	0.15
673	0.16
674	0.16
675	0.13
676	0.07
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.06
681	0.06
682	0.07
683	0.07
684	0.07
685	0.07
686	0.08
687	0.15
688	0.25
689	0.27
690	0.3
691	0.37
692	0.41
693	0.43
694	0.43
695	0.37
696	0.33
697	0.39
698	0.37
699	0.32
700	0.29
701	0.28
702	0.3
703	0.29
704	0.24
705	0.15
706	0.15
707	0.17
708	0.16
709	0.2
710	0.17
711	0.22
712	0.23
713	0.25
714	0.24
715	0.23
716	0.23
717	0.21
718	0.24
719	0.2
720	0.2
721	0.19
722	0.18
723	0.2
724	0.24
725	0.23
726	0.26
727	0.27
728	0.27
729	0.28
730	0.31
731	0.27
732	0.26
733	0.3
734	0.32
735	0.34
736	0.34
737	0.37
738	0.43
739	0.45
740	0.49
741	0.5
742	0.51
743	0.5
744	0.57
745	0.6
746	0.58
747	0.61
748	0.65
749	0.63
750	0.56
751	0.58
752	0.53
753	0.49
754	0.5
755	0.43
756	0.35
757	0.32
758	0.31
759	0.28
760	0.23
761	0.19
762	0.15
763	0.15
764	0.14
765	0.13
766	0.13
767	0.14
768	0.18
769	0.2
770	0.22
771	0.27
772	0.31
773	0.35
774	0.37
775	0.41
776	0.43
777	0.43
778	0.43
779	0.42
780	0.4
781	0.4
782	0.43
783	0.45
784	0.45
785	0.46
786	0.43
787	0.46
788	0.45
789	0.39
790	0.34
791	0.32
792	0.28
793	0.26
794	0.29
795	0.28
796	0.29
797	0.3
798	0.38
799	0.42
800	0.44
801	0.45
802	0.41
803	0.39
804	0.37
805	0.35
806	0.28
807	0.19
808	0.15
809	0.13
810	0.12
811	0.08
812	0.08
813	0.08
814	0.08
815	0.1
816	0.09
817	0.12
818	0.13
819	0.19
820	0.18
821	0.18
822	0.21
823	0.2
824	0.25
825	0.26
826	0.26
827	0.2
828	0.24
829	0.3
830	0.3
831	0.34
832	0.35
833	0.34
834	0.38
835	0.47
836	0.53
837	0.54
838	0.53
839	0.52
840	0.55
841	0.55
842	0.56
843	0.53
844	0.47
845	0.44
846	0.47
847	0.45
848	0.38
849	0.35
850	0.3
851	0.24
852	0.25
853	0.25
854	0.24
855	0.22
856	0.23
857	0.25
858	0.29
859	0.32
860	0.29
861	0.34
862	0.36
863	0.36
864	0.35
865	0.34
866	0.3
867	0.29
868	0.28
869	0.19
870	0.14
871	0.16
872	0.15
873	0.15
874	0.16
875	0.15
876	0.15
877	0.17
878	0.21
879	0.24
880	0.28
881	0.34
882	0.41
883	0.45
884	0.45
885	0.45
886	0.46
887	0.5
888	0.56
889	0.58
890	0.58
891	0.59
892	0.59
893	0.62
894	0.59
895	0.5
896	0.43
897	0.38
898	0.34
899	0.31
900	0.3
901	0.26
902	0.26
903	0.26
904	0.27
905	0.27
906	0.26
907	0.24
908	0.25
909	0.28
910	0.3

A0A1L9RIQ5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer