Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9RXJ8

Protein Details
Accession A0A1L9RXJ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-33QEARAVIIRPKNRHKLCRACFLEIHydrophilic
333-354TANAQPKKKKTGSKITTKPLKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
340-341KK
Subcellular Location(s) mito 21, mito_nucl 13.333, cyto_mito 11.833, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032442  CTU1_C  
IPR000541  Ncs6/Tuc1/Ctu1  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR011063  TilS/TtcA_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016779  F:nucleotidyltransferase activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0032447  P:protein urmylation  
GO:0034227  P:tRNA thio-modification  
GO:0002098  P:tRNA wobble uridine modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF01171  ATP_bind_3  
PF16503  zn-ribbon_14  
CDD cd01993  Alpha_ANH_like_II  
Amino Acid Sequences MAPTQCFNCQEARAVIIRPKNRHKLCRACFLEIFETEVHETITSTNLFYRGERIAIGASGGKDSTVLASVMKTLNDRYDYGLELCLLSIDEGIKGYRDDSLETVKRNSTQYEMPLEIVGYNELYGWTMDQVVAQVGKKGNCTYCGVFRRQALDRGAARLGIKHVVTGHNADDVAETVMMNLLRGDLPRLSRGTSIVTDSGASEVKRSKPLKYAYEKEIVLYAHHKKLDYFSTECIYSPEAFRGSARTLIKDLEKIRPSSILDIVKSGEDMAELVPKQVTGGKKCGSGAAEEESTGGCGSQNGRSSGGEMAAMEKKLTEDDTAQSRETEIKLPTANAQPKKKKTGSKITTKPLKTQTLGKCERCGYISSQKICKACSLLEGLNKNRPKTAIEVGIGMEDEEGSSTLMRQMEQIQLTSGTG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.36
3 0.39
4 0.45
5 0.5
6 0.58
7 0.65
8 0.72
9 0.78
10 0.82
11 0.84
12 0.83
13 0.85
14 0.8
15 0.76
16 0.69
17 0.65
18 0.59
19 0.48
20 0.45
21 0.34
22 0.31
23 0.25
24 0.23
25 0.18
26 0.13
27 0.13
28 0.11
29 0.14
30 0.12
31 0.11
32 0.13
33 0.14
34 0.15
35 0.15
36 0.19
37 0.17
38 0.18
39 0.17
40 0.16
41 0.15
42 0.14
43 0.15
44 0.13
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.08
56 0.1
57 0.12
58 0.12
59 0.13
60 0.13
61 0.17
62 0.19
63 0.2
64 0.21
65 0.22
66 0.23
67 0.22
68 0.22
69 0.18
70 0.15
71 0.14
72 0.1
73 0.09
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.1
84 0.1
85 0.11
86 0.13
87 0.21
88 0.24
89 0.26
90 0.29
91 0.28
92 0.31
93 0.31
94 0.31
95 0.26
96 0.26
97 0.27
98 0.29
99 0.28
100 0.25
101 0.23
102 0.22
103 0.18
104 0.15
105 0.12
106 0.07
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.08
120 0.08
121 0.11
122 0.14
123 0.15
124 0.17
125 0.19
126 0.2
127 0.21
128 0.24
129 0.23
130 0.28
131 0.32
132 0.34
133 0.35
134 0.35
135 0.38
136 0.36
137 0.4
138 0.34
139 0.35
140 0.32
141 0.32
142 0.3
143 0.26
144 0.24
145 0.2
146 0.19
147 0.15
148 0.14
149 0.12
150 0.14
151 0.14
152 0.15
153 0.15
154 0.14
155 0.13
156 0.13
157 0.12
158 0.1
159 0.09
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.07
172 0.07
173 0.09
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.14
179 0.14
180 0.13
181 0.14
182 0.12
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.08
189 0.09
190 0.11
191 0.13
192 0.21
193 0.22
194 0.23
195 0.29
196 0.34
197 0.4
198 0.44
199 0.47
200 0.43
201 0.47
202 0.45
203 0.38
204 0.35
205 0.27
206 0.21
207 0.22
208 0.22
209 0.2
210 0.21
211 0.21
212 0.19
213 0.22
214 0.24
215 0.23
216 0.21
217 0.19
218 0.2
219 0.2
220 0.2
221 0.18
222 0.17
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.13
230 0.12
231 0.18
232 0.18
233 0.17
234 0.18
235 0.19
236 0.2
237 0.23
238 0.24
239 0.26
240 0.28
241 0.28
242 0.28
243 0.29
244 0.29
245 0.26
246 0.29
247 0.23
248 0.21
249 0.2
250 0.2
251 0.17
252 0.16
253 0.13
254 0.08
255 0.05
256 0.06
257 0.05
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.12
265 0.16
266 0.16
267 0.22
268 0.23
269 0.25
270 0.25
271 0.27
272 0.24
273 0.21
274 0.2
275 0.17
276 0.16
277 0.14
278 0.15
279 0.12
280 0.12
281 0.1
282 0.08
283 0.05
284 0.06
285 0.08
286 0.12
287 0.15
288 0.16
289 0.18
290 0.18
291 0.2
292 0.19
293 0.18
294 0.14
295 0.1
296 0.12
297 0.14
298 0.14
299 0.12
300 0.11
301 0.11
302 0.12
303 0.13
304 0.11
305 0.1
306 0.14
307 0.2
308 0.22
309 0.23
310 0.22
311 0.22
312 0.23
313 0.23
314 0.24
315 0.19
316 0.2
317 0.21
318 0.22
319 0.25
320 0.31
321 0.38
322 0.41
323 0.51
324 0.57
325 0.63
326 0.72
327 0.74
328 0.74
329 0.75
330 0.79
331 0.77
332 0.78
333 0.8
334 0.81
335 0.83
336 0.78
337 0.76
338 0.73
339 0.71
340 0.63
341 0.63
342 0.61
343 0.62
344 0.68
345 0.63
346 0.61
347 0.56
348 0.56
349 0.48
350 0.43
351 0.39
352 0.4
353 0.45
354 0.45
355 0.49
356 0.52
357 0.53
358 0.51
359 0.48
360 0.41
361 0.33
362 0.31
363 0.3
364 0.29
365 0.34
366 0.4
367 0.41
368 0.48
369 0.52
370 0.5
371 0.48
372 0.46
373 0.41
374 0.4
375 0.42
376 0.4
377 0.36
378 0.36
379 0.33
380 0.32
381 0.29
382 0.23
383 0.16
384 0.09
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.11
392 0.12
393 0.12
394 0.14
395 0.17
396 0.23
397 0.24
398 0.25
399 0.23