Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9S116

Protein Details
Accession A0A1L9S116    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
119-138GNGGKKKPKFFKAHKLNKSSBasic
342-361DVKGGKKSSKCKNVPSGASCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-133GGNGGKKKPKFFKAHK
Subcellular Location(s) extr 17, cyto 6, mito 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000743  Glyco_hydro_28  
IPR006626  PbH1  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
Gene Ontology GO:0005576  C:extracellular region  
GO:0004650  F:polygalacturonase activity  
GO:0071555  P:cell wall organization  
GO:0045490  P:pectin catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00295  Glyco_hydro_28  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00502  POLYGALACTURONASE  
Amino Acid Sequences MYIQPLLALMGAALVAAAPASELDTRSSCTFTSASAAKSGKSSCSTIVLDNIAVPAGETLDLTGLKTGATVIFEGETTFGYKEWKGPLISMSGTSITVKQSSGAKINCDGSRWWDGKGGNGGKKKPKFFKAHKLNKSSITGLKVYNTPVQGFSIQSDHLTITDVTIDNSAGTSKGHNTDAFDIGSSTYITIDGATVYNQDDCLAVNSGEHITFTNGYCDGGHGLSIGSVGGRKDNTVNDVTISNSKIVNSQNGARIKTVYGATGSVTGVKFEDITLSGITKYGIVVQQDYKNGSPTGKPTNGVKVDDITFKKVTGTVKSSATDIYILCGSGSCENWTWSGVDVKGGKKSSKCKNVPSGASCSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.03
2 0.02
3 0.02
4 0.02
5 0.02
6 0.03
7 0.05
8 0.06
9 0.08
10 0.11
11 0.13
12 0.17
13 0.18
14 0.2
15 0.18
16 0.2
17 0.2
18 0.17
19 0.22
20 0.21
21 0.2
22 0.25
23 0.26
24 0.24
25 0.27
26 0.28
27 0.27
28 0.28
29 0.28
30 0.23
31 0.28
32 0.29
33 0.26
34 0.28
35 0.25
36 0.22
37 0.2
38 0.18
39 0.13
40 0.11
41 0.09
42 0.06
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.06
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.06
53 0.07
54 0.07
55 0.06
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.1
68 0.11
69 0.14
70 0.17
71 0.2
72 0.19
73 0.2
74 0.21
75 0.21
76 0.21
77 0.18
78 0.16
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.12
84 0.12
85 0.11
86 0.12
87 0.15
88 0.17
89 0.23
90 0.23
91 0.24
92 0.26
93 0.31
94 0.29
95 0.27
96 0.25
97 0.24
98 0.3
99 0.28
100 0.26
101 0.26
102 0.26
103 0.27
104 0.35
105 0.36
106 0.35
107 0.4
108 0.44
109 0.49
110 0.55
111 0.59
112 0.59
113 0.62
114 0.65
115 0.68
116 0.73
117 0.75
118 0.8
119 0.81
120 0.8
121 0.74
122 0.69
123 0.64
124 0.56
125 0.48
126 0.4
127 0.34
128 0.28
129 0.26
130 0.23
131 0.22
132 0.22
133 0.2
134 0.17
135 0.16
136 0.17
137 0.16
138 0.15
139 0.13
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.09
147 0.08
148 0.06
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.12
165 0.14
166 0.15
167 0.14
168 0.13
169 0.11
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.06
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.03
215 0.05
216 0.05
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.1
221 0.11
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.14
226 0.15
227 0.16
228 0.16
229 0.16
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.16
234 0.16
235 0.18
236 0.18
237 0.2
238 0.26
239 0.3
240 0.31
241 0.28
242 0.27
243 0.24
244 0.25
245 0.22
246 0.16
247 0.13
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.08
259 0.1
260 0.07
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.1
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.11
271 0.11
272 0.14
273 0.18
274 0.22
275 0.24
276 0.27
277 0.26
278 0.26
279 0.26
280 0.25
281 0.24
282 0.25
283 0.31
284 0.31
285 0.32
286 0.32
287 0.41
288 0.43
289 0.42
290 0.38
291 0.33
292 0.33
293 0.39
294 0.38
295 0.34
296 0.3
297 0.28
298 0.28
299 0.28
300 0.29
301 0.28
302 0.3
303 0.29
304 0.31
305 0.32
306 0.32
307 0.29
308 0.26
309 0.22
310 0.17
311 0.16
312 0.13
313 0.13
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.13
318 0.15
319 0.15
320 0.16
321 0.17
322 0.18
323 0.19
324 0.18
325 0.17
326 0.2
327 0.17
328 0.22
329 0.25
330 0.27
331 0.33
332 0.37
333 0.4
334 0.43
335 0.52
336 0.57
337 0.63
338 0.67
339 0.69
340 0.76
341 0.8
342 0.81
343 0.77