Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9RXT1

Protein Details
Accession A0A1L9RXT1    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-113KSEAGGDKKKRKRAPPDPNAPKRALBasic
241-262EPTPPRSSAKRRRSEGKPAAKEBasic
264-291ASPTVNKKESPKKKRTSARTQKDQVQEEHydrophilic
296-322KAPSSARKPAADKRTKKKRKSEAGTDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-110SEAGGDKKKRKRAPPDPNAPK
244-280PPRSSAKRRRSEGKPAAKEVASPTVNKKESPKKKRTS
299-316SSARKPAADKRTKKKRKS
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSRKDDSKPKEGHVSVNVDDFTRTRDNVIMSLAQLQSAVSDLSRAYITHANTVLGRSPAGLDIGGINGITQSLFDSGLLGLRASSPGAKSEAGGDKKKRKRAPPDPNAPKRALTPYFLYMQHNRTRIAEELGGNSRPKDVADEGTRRWADMPEPQKEVWKKLYADNLAVYKEKVKAYKAGLPVPDDDNARASSQLQQDVAGAEASADESEQDEDEEEHEQEQEPEEEEEEEVEESPEPVKEPTPPRSSAKRRRSEGKPAAKEVASPTVNKKESPKKKRTSARTQKDQVQEEDEQQKAPSSARKPAADKRTKKKRKSEAGTDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.47
3 0.47
4 0.42
5 0.32
6 0.32
7 0.26
8 0.25
9 0.24
10 0.23
11 0.21
12 0.23
13 0.24
14 0.24
15 0.27
16 0.22
17 0.18
18 0.23
19 0.21
20 0.18
21 0.16
22 0.14
23 0.12
24 0.11
25 0.11
26 0.05
27 0.06
28 0.06
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.11
33 0.16
34 0.17
35 0.21
36 0.22
37 0.21
38 0.21
39 0.23
40 0.22
41 0.18
42 0.17
43 0.13
44 0.13
45 0.12
46 0.12
47 0.1
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.06
53 0.05
54 0.04
55 0.05
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.06
63 0.06
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.07
73 0.09
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.16
78 0.23
79 0.27
80 0.33
81 0.4
82 0.48
83 0.56
84 0.65
85 0.67
86 0.69
87 0.75
88 0.79
89 0.82
90 0.83
91 0.86
92 0.88
93 0.89
94 0.85
95 0.76
96 0.66
97 0.57
98 0.54
99 0.44
100 0.36
101 0.3
102 0.27
103 0.29
104 0.29
105 0.3
106 0.28
107 0.31
108 0.34
109 0.33
110 0.32
111 0.29
112 0.3
113 0.27
114 0.26
115 0.23
116 0.18
117 0.19
118 0.2
119 0.21
120 0.19
121 0.18
122 0.16
123 0.14
124 0.13
125 0.13
126 0.11
127 0.14
128 0.19
129 0.22
130 0.22
131 0.29
132 0.29
133 0.26
134 0.25
135 0.21
136 0.18
137 0.21
138 0.26
139 0.23
140 0.26
141 0.26
142 0.32
143 0.32
144 0.34
145 0.31
146 0.3
147 0.28
148 0.28
149 0.34
150 0.29
151 0.29
152 0.27
153 0.25
154 0.21
155 0.2
156 0.18
157 0.14
158 0.16
159 0.17
160 0.16
161 0.16
162 0.19
163 0.22
164 0.27
165 0.28
166 0.28
167 0.28
168 0.27
169 0.28
170 0.25
171 0.24
172 0.2
173 0.17
174 0.15
175 0.15
176 0.14
177 0.12
178 0.11
179 0.15
180 0.16
181 0.18
182 0.16
183 0.15
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.09
188 0.06
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.15
228 0.21
229 0.29
230 0.34
231 0.38
232 0.43
233 0.52
234 0.62
235 0.66
236 0.71
237 0.73
238 0.74
239 0.79
240 0.8
241 0.81
242 0.8
243 0.8
244 0.76
245 0.71
246 0.7
247 0.61
248 0.55
249 0.47
250 0.45
251 0.36
252 0.32
253 0.33
254 0.38
255 0.4
256 0.4
257 0.45
258 0.48
259 0.57
260 0.66
261 0.7
262 0.7
263 0.79
264 0.87
265 0.88
266 0.89
267 0.89
268 0.89
269 0.89
270 0.87
271 0.86
272 0.84
273 0.8
274 0.72
275 0.67
276 0.59
277 0.55
278 0.54
279 0.47
280 0.39
281 0.34
282 0.33
283 0.28
284 0.28
285 0.29
286 0.27
287 0.36
288 0.41
289 0.47
290 0.52
291 0.6
292 0.68
293 0.7
294 0.75
295 0.78
296 0.82
297 0.87
298 0.9
299 0.91
300 0.91
301 0.92
302 0.91