Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0VDI1

Protein Details
Accession G0VDI1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
658-680IGGSQRAGSQKSKRKKKKVGGFGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
666-678SQKSKRKKKKVGG
Subcellular Location(s) nucl 15, mito_nucl 12.333, mito 8.5, cyto_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019350  RNA_pol_I-sp_TIF_RRN6-like  
KEGG ncs:NCAS_0C05530  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10214  Rrn6  
Amino Acid Sequences MSILRNNKPSSNCIRIDFRSTIKSIKIPTMAKEMGKSSDCLGIITENSLHILKIHSIFSNDYEMDYTLYNPLPFNKFSDFPFSDVAFNPWDVQEFAVIDIKGNWGVGRIPRIMKNQKVKELHLLNESRGSAFDIEELSNWRRIAWSCGYSRLLLFSRSKVIEVDFQNNWQLDMVEAKSWSNLRDYKPINDTFGFLLTSKEIIVLRTKNAANNVIREVSWKHDLDPNDLTIQISVQTVEMIEGTLYVTYISSKRHNKLFCHAFYSTDDDELLQTLGYSTLINVPRSINGIHTLVFPTSREKYPPDYNNNLNKPKSFPLSQAFLRTYDTSEIFKIIIGNNIASDNYTSGYDSMRIDCTSMVTELSSKFDSLLTNMIRTQISGNESKAPEKADEDIFQDYGYRLSSAMNDVLVIWADMENLKKNSKLCRSIEELTEIPKHFKDLSEFESFLEQFMDYYVEQNISFTNLKSICKMLFHEEIGSFDMLYNKLLQCWDMVSKNSESLTKETIASTIWSVLKFTKVSNYKILETDIHDSLGEPYRAIIDQWDNTSDLEDEDDEQLGTFRSTIPMSSQPQFLLNSQSQIPTIKSSQPRTSKGNNLRPNQGKISKSNLPPLTSTNFSQNLMSHSQVNGLSSTLPNTMTPAFTLMQPATAGMSSSFSIGGSQRAGSQKSKRKKKKVGGFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.55
3 0.58
4 0.55
5 0.51
6 0.48
7 0.47
8 0.46
9 0.43
10 0.44
11 0.41
12 0.43
13 0.45
14 0.42
15 0.43
16 0.47
17 0.47
18 0.44
19 0.44
20 0.4
21 0.38
22 0.37
23 0.35
24 0.28
25 0.29
26 0.27
27 0.24
28 0.22
29 0.19
30 0.18
31 0.18
32 0.17
33 0.12
34 0.14
35 0.14
36 0.13
37 0.12
38 0.13
39 0.15
40 0.17
41 0.19
42 0.19
43 0.21
44 0.22
45 0.24
46 0.27
47 0.23
48 0.21
49 0.2
50 0.19
51 0.18
52 0.17
53 0.16
54 0.14
55 0.16
56 0.16
57 0.15
58 0.2
59 0.23
60 0.24
61 0.27
62 0.28
63 0.28
64 0.29
65 0.38
66 0.34
67 0.33
68 0.35
69 0.33
70 0.31
71 0.3
72 0.3
73 0.22
74 0.21
75 0.2
76 0.16
77 0.17
78 0.15
79 0.14
80 0.13
81 0.12
82 0.13
83 0.16
84 0.15
85 0.14
86 0.14
87 0.15
88 0.14
89 0.13
90 0.12
91 0.08
92 0.12
93 0.15
94 0.19
95 0.21
96 0.25
97 0.31
98 0.41
99 0.48
100 0.54
101 0.61
102 0.64
103 0.69
104 0.69
105 0.67
106 0.67
107 0.62
108 0.57
109 0.55
110 0.49
111 0.42
112 0.42
113 0.39
114 0.3
115 0.26
116 0.24
117 0.17
118 0.15
119 0.15
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.16
124 0.17
125 0.2
126 0.2
127 0.19
128 0.2
129 0.2
130 0.25
131 0.26
132 0.3
133 0.28
134 0.33
135 0.35
136 0.33
137 0.32
138 0.31
139 0.26
140 0.26
141 0.26
142 0.23
143 0.27
144 0.27
145 0.28
146 0.24
147 0.24
148 0.26
149 0.27
150 0.31
151 0.25
152 0.26
153 0.3
154 0.29
155 0.27
156 0.2
157 0.17
158 0.12
159 0.14
160 0.14
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.13
165 0.14
166 0.15
167 0.17
168 0.22
169 0.23
170 0.32
171 0.34
172 0.37
173 0.43
174 0.44
175 0.42
176 0.38
177 0.36
178 0.28
179 0.26
180 0.22
181 0.15
182 0.15
183 0.11
184 0.11
185 0.09
186 0.1
187 0.09
188 0.1
189 0.15
190 0.16
191 0.17
192 0.22
193 0.23
194 0.23
195 0.26
196 0.31
197 0.28
198 0.29
199 0.3
200 0.25
201 0.24
202 0.24
203 0.23
204 0.21
205 0.24
206 0.22
207 0.21
208 0.25
209 0.26
210 0.29
211 0.29
212 0.26
213 0.22
214 0.22
215 0.2
216 0.15
217 0.14
218 0.1
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.03
233 0.03
234 0.05
235 0.07
236 0.09
237 0.17
238 0.24
239 0.28
240 0.35
241 0.39
242 0.41
243 0.49
244 0.54
245 0.47
246 0.47
247 0.43
248 0.38
249 0.36
250 0.39
251 0.3
252 0.23
253 0.21
254 0.15
255 0.15
256 0.13
257 0.12
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.1
266 0.12
267 0.13
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.16
272 0.16
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.11
277 0.11
278 0.12
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.12
283 0.14
284 0.15
285 0.16
286 0.18
287 0.24
288 0.32
289 0.38
290 0.41
291 0.43
292 0.49
293 0.56
294 0.61
295 0.62
296 0.55
297 0.49
298 0.45
299 0.43
300 0.4
301 0.32
302 0.29
303 0.26
304 0.29
305 0.29
306 0.3
307 0.28
308 0.24
309 0.25
310 0.22
311 0.19
312 0.17
313 0.17
314 0.14
315 0.13
316 0.13
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.09
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.07
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.07
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.14
357 0.12
358 0.12
359 0.13
360 0.14
361 0.13
362 0.13
363 0.13
364 0.11
365 0.13
366 0.14
367 0.15
368 0.18
369 0.19
370 0.2
371 0.2
372 0.19
373 0.17
374 0.16
375 0.18
376 0.14
377 0.15
378 0.16
379 0.16
380 0.15
381 0.14
382 0.13
383 0.11
384 0.1
385 0.09
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.07
390 0.08
391 0.08
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.06
397 0.05
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.05
402 0.06
403 0.1
404 0.12
405 0.13
406 0.15
407 0.18
408 0.25
409 0.32
410 0.39
411 0.37
412 0.4
413 0.45
414 0.45
415 0.44
416 0.4
417 0.33
418 0.29
419 0.32
420 0.28
421 0.24
422 0.21
423 0.22
424 0.19
425 0.2
426 0.2
427 0.19
428 0.23
429 0.25
430 0.26
431 0.24
432 0.27
433 0.25
434 0.21
435 0.18
436 0.13
437 0.09
438 0.09
439 0.1
440 0.07
441 0.08
442 0.08
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.1
448 0.11
449 0.1
450 0.16
451 0.17
452 0.18
453 0.19
454 0.21
455 0.18
456 0.19
457 0.21
458 0.2
459 0.21
460 0.21
461 0.22
462 0.21
463 0.21
464 0.21
465 0.19
466 0.14
467 0.11
468 0.13
469 0.11
470 0.11
471 0.12
472 0.11
473 0.12
474 0.12
475 0.12
476 0.1
477 0.12
478 0.15
479 0.15
480 0.16
481 0.19
482 0.2
483 0.21
484 0.22
485 0.23
486 0.21
487 0.22
488 0.23
489 0.21
490 0.21
491 0.19
492 0.19
493 0.16
494 0.15
495 0.12
496 0.13
497 0.14
498 0.13
499 0.14
500 0.14
501 0.17
502 0.17
503 0.17
504 0.22
505 0.26
506 0.29
507 0.36
508 0.38
509 0.37
510 0.37
511 0.39
512 0.32
513 0.3
514 0.31
515 0.24
516 0.21
517 0.19
518 0.18
519 0.19
520 0.23
521 0.19
522 0.15
523 0.14
524 0.16
525 0.16
526 0.15
527 0.16
528 0.14
529 0.17
530 0.19
531 0.2
532 0.19
533 0.19
534 0.2
535 0.17
536 0.13
537 0.12
538 0.11
539 0.11
540 0.11
541 0.11
542 0.1
543 0.09
544 0.1
545 0.09
546 0.09
547 0.07
548 0.07
549 0.09
550 0.09
551 0.1
552 0.13
553 0.2
554 0.25
555 0.27
556 0.28
557 0.27
558 0.29
559 0.3
560 0.28
561 0.27
562 0.24
563 0.24
564 0.24
565 0.24
566 0.22
567 0.23
568 0.23
569 0.21
570 0.23
571 0.28
572 0.35
573 0.41
574 0.49
575 0.54
576 0.58
577 0.61
578 0.65
579 0.68
580 0.71
581 0.74
582 0.74
583 0.71
584 0.76
585 0.76
586 0.74
587 0.73
588 0.69
589 0.63
590 0.58
591 0.61
592 0.59
593 0.56
594 0.6
595 0.55
596 0.5
597 0.48
598 0.48
599 0.46
600 0.41
601 0.39
602 0.36
603 0.35
604 0.33
605 0.33
606 0.3
607 0.29
608 0.3
609 0.3
610 0.24
611 0.22
612 0.25
613 0.24
614 0.23
615 0.19
616 0.16
617 0.16
618 0.15
619 0.17
620 0.14
621 0.15
622 0.13
623 0.16
624 0.17
625 0.16
626 0.16
627 0.17
628 0.16
629 0.15
630 0.2
631 0.17
632 0.17
633 0.16
634 0.16
635 0.14
636 0.13
637 0.13
638 0.09
639 0.11
640 0.1
641 0.11
642 0.11
643 0.09
644 0.11
645 0.12
646 0.14
647 0.13
648 0.14
649 0.19
650 0.24
651 0.28
652 0.34
653 0.44
654 0.51
655 0.61
656 0.71
657 0.77
658 0.82
659 0.9
660 0.93