Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0VAU6

Protein Details
Accession G0VAU6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
119-166VASGNSKKSNNNNNNRKSNNNRKPNNNNRNKQNNKKTQQQGQKPKDTEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026705  Hid-1/Ecm30  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ncs:NCAS_0B08890  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12722  Hid1  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MSAEQAATTTPAAEPVAQSVQTTDIAQDTQEVPVTVSKDATEAAPADAEQETKPQRILTPAPVPTSSPWKINSAEAPISTISQDQLNAIRSSKNRSPVPVMKPTPSSTKWVPIKASIVVASGNSKKSNNNNNNRKSNNNRKPNNNNRNKQNNKKTQQQGQKPKDTENSEKQGDEISKNVNEDAQATNDAESPEKKHHNSHSHHHNHHSHPHPAQVQGQEQEENGTKQTPRRKFNNNRNNTNGRVFRSKFHYNNHHSHPHNFQQPLVQLGAKTYPIQLVLMAINNVAAQIEYYFSDENLSKDSYLLSKMSQDGFAPLSLIGQFYRLVNMSFRADPVIILAALREIVRNESATVEIVRGTSNVSYLAFKDMKKSTEEAESEVEETKENPLNPFFIRSKNWSNWIAIPENAEKFQKAQNEAQAEQKVTIDVESVLSGDVLDNFMINIIPVPIPSRVAVPVATTEIAAEQPVAEQQESEVTTSST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.15
3 0.18
4 0.17
5 0.17
6 0.16
7 0.18
8 0.18
9 0.18
10 0.15
11 0.13
12 0.13
13 0.12
14 0.15
15 0.13
16 0.13
17 0.15
18 0.14
19 0.14
20 0.17
21 0.19
22 0.16
23 0.16
24 0.15
25 0.14
26 0.14
27 0.14
28 0.13
29 0.12
30 0.12
31 0.12
32 0.11
33 0.12
34 0.12
35 0.13
36 0.11
37 0.18
38 0.21
39 0.23
40 0.24
41 0.24
42 0.25
43 0.3
44 0.34
45 0.34
46 0.38
47 0.4
48 0.42
49 0.41
50 0.41
51 0.38
52 0.42
53 0.37
54 0.33
55 0.31
56 0.32
57 0.33
58 0.34
59 0.35
60 0.32
61 0.32
62 0.28
63 0.28
64 0.25
65 0.24
66 0.21
67 0.18
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.11
72 0.15
73 0.17
74 0.18
75 0.18
76 0.23
77 0.24
78 0.32
79 0.36
80 0.41
81 0.4
82 0.43
83 0.5
84 0.53
85 0.58
86 0.6
87 0.59
88 0.54
89 0.55
90 0.54
91 0.52
92 0.46
93 0.45
94 0.37
95 0.44
96 0.45
97 0.46
98 0.45
99 0.41
100 0.41
101 0.37
102 0.36
103 0.26
104 0.22
105 0.17
106 0.16
107 0.17
108 0.18
109 0.19
110 0.19
111 0.2
112 0.25
113 0.33
114 0.44
115 0.5
116 0.57
117 0.65
118 0.72
119 0.8
120 0.79
121 0.79
122 0.78
123 0.79
124 0.79
125 0.79
126 0.77
127 0.78
128 0.85
129 0.88
130 0.89
131 0.88
132 0.86
133 0.86
134 0.89
135 0.89
136 0.89
137 0.89
138 0.88
139 0.84
140 0.85
141 0.83
142 0.81
143 0.81
144 0.81
145 0.81
146 0.79
147 0.82
148 0.73
149 0.7
150 0.68
151 0.64
152 0.62
153 0.59
154 0.56
155 0.49
156 0.47
157 0.43
158 0.39
159 0.35
160 0.28
161 0.21
162 0.19
163 0.18
164 0.19
165 0.19
166 0.15
167 0.13
168 0.14
169 0.13
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.13
176 0.12
177 0.12
178 0.13
179 0.18
180 0.24
181 0.25
182 0.29
183 0.37
184 0.45
185 0.48
186 0.54
187 0.59
188 0.62
189 0.64
190 0.66
191 0.65
192 0.59
193 0.64
194 0.6
195 0.55
196 0.47
197 0.48
198 0.42
199 0.37
200 0.37
201 0.31
202 0.29
203 0.26
204 0.26
205 0.21
206 0.19
207 0.19
208 0.16
209 0.14
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.16
214 0.26
215 0.31
216 0.36
217 0.42
218 0.52
219 0.61
220 0.71
221 0.76
222 0.76
223 0.75
224 0.76
225 0.74
226 0.66
227 0.63
228 0.55
229 0.48
230 0.47
231 0.41
232 0.37
233 0.4
234 0.44
235 0.42
236 0.45
237 0.51
238 0.5
239 0.55
240 0.58
241 0.59
242 0.53
243 0.53
244 0.52
245 0.48
246 0.48
247 0.42
248 0.37
249 0.32
250 0.31
251 0.29
252 0.25
253 0.19
254 0.12
255 0.13
256 0.13
257 0.1
258 0.1
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.11
285 0.12
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.1
290 0.11
291 0.12
292 0.1
293 0.11
294 0.13
295 0.14
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.12
301 0.11
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.09
311 0.08
312 0.09
313 0.09
314 0.12
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.13
320 0.12
321 0.12
322 0.11
323 0.08
324 0.07
325 0.07
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.1
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.16
352 0.18
353 0.18
354 0.24
355 0.26
356 0.27
357 0.29
358 0.3
359 0.26
360 0.3
361 0.31
362 0.27
363 0.26
364 0.26
365 0.24
366 0.24
367 0.22
368 0.15
369 0.15
370 0.17
371 0.18
372 0.18
373 0.2
374 0.2
375 0.22
376 0.23
377 0.28
378 0.26
379 0.28
380 0.31
381 0.36
382 0.42
383 0.44
384 0.49
385 0.46
386 0.46
387 0.45
388 0.46
389 0.41
390 0.34
391 0.34
392 0.33
393 0.33
394 0.32
395 0.29
396 0.25
397 0.25
398 0.29
399 0.31
400 0.31
401 0.33
402 0.38
403 0.42
404 0.43
405 0.48
406 0.47
407 0.42
408 0.37
409 0.33
410 0.27
411 0.21
412 0.2
413 0.14
414 0.1
415 0.1
416 0.09
417 0.09
418 0.08
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.1
435 0.11
436 0.13
437 0.13
438 0.15
439 0.15
440 0.16
441 0.16
442 0.15
443 0.16
444 0.18
445 0.17
446 0.15
447 0.14
448 0.13
449 0.13
450 0.12
451 0.1
452 0.07
453 0.07
454 0.1
455 0.12
456 0.11
457 0.11
458 0.12
459 0.17
460 0.18
461 0.18