Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9RDT6

Protein Details
Accession A0A1L9RDT6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-100SGAASKMKKRGRKSKAEKEREREDABasic
321-342NPNPVRPRREFKPPPNPHRGQLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-96KMKKRGRKSKAEKERE
Subcellular Location(s) mito 16, cyto_nucl 6.5, nucl 5.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MSSPPPPGNPLKRPSMSSSASQPIGANPKRARMHPLRQTSFPTTIEAESRTFSDAGSVTGSFTGSLGGTSADGVFSGAASKMKKRGRKSKAEKEREREDAASMRGMETRVGSVDAEGSVRGGPSGGGGGGGAGGGADDGDDDDDFDDEVELLGREDGATDTEAEKKNLALLVDAFNPLQSERYDLFKRAKLRKETLRRIVNHVLSQSVPASVVTTINGFTKVFAGEMIEKARTVQAEWADAHDQAALAAFEAEERAADERAAAAATAATTSGGATPTSGATTPVNGAGDPAVKKEPLNGDRSSIPPHVHAAASRPSSPSHNPNPVRPRREFKPPPNPHRGQLLPSHLREAQRRYKRDYEGGGVGFSGLSMGNLGVRGAVTWNAGGAGGRRIFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.61
3 0.55
4 0.5
5 0.51
6 0.48
7 0.45
8 0.42
9 0.36
10 0.33
11 0.41
12 0.4
13 0.42
14 0.38
15 0.47
16 0.5
17 0.52
18 0.55
19 0.55
20 0.62
21 0.63
22 0.71
23 0.67
24 0.67
25 0.71
26 0.68
27 0.63
28 0.53
29 0.47
30 0.38
31 0.35
32 0.34
33 0.29
34 0.24
35 0.21
36 0.21
37 0.21
38 0.18
39 0.16
40 0.17
41 0.14
42 0.14
43 0.15
44 0.14
45 0.12
46 0.12
47 0.13
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.05
56 0.06
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.04
63 0.05
64 0.06
65 0.09
66 0.11
67 0.15
68 0.23
69 0.3
70 0.38
71 0.47
72 0.57
73 0.63
74 0.73
75 0.8
76 0.83
77 0.87
78 0.91
79 0.9
80 0.87
81 0.85
82 0.8
83 0.73
84 0.63
85 0.55
86 0.48
87 0.4
88 0.35
89 0.28
90 0.23
91 0.2
92 0.2
93 0.17
94 0.13
95 0.12
96 0.1
97 0.11
98 0.1
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.02
120 0.02
121 0.02
122 0.02
123 0.02
124 0.02
125 0.02
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.03
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.07
148 0.13
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.14
153 0.14
154 0.15
155 0.14
156 0.09
157 0.08
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.07
167 0.1
168 0.1
169 0.15
170 0.17
171 0.2
172 0.24
173 0.26
174 0.34
175 0.38
176 0.45
177 0.46
178 0.51
179 0.58
180 0.64
181 0.69
182 0.7
183 0.7
184 0.64
185 0.65
186 0.64
187 0.57
188 0.48
189 0.4
190 0.32
191 0.24
192 0.23
193 0.17
194 0.1
195 0.08
196 0.06
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.09
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.1
220 0.09
221 0.11
222 0.11
223 0.13
224 0.13
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.15
229 0.11
230 0.1
231 0.08
232 0.08
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.04
239 0.04
240 0.03
241 0.04
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.03
256 0.03
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.11
271 0.11
272 0.09
273 0.1
274 0.09
275 0.13
276 0.12
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.15
281 0.19
282 0.27
283 0.28
284 0.32
285 0.3
286 0.32
287 0.34
288 0.36
289 0.37
290 0.31
291 0.27
292 0.24
293 0.26
294 0.25
295 0.23
296 0.21
297 0.21
298 0.25
299 0.27
300 0.26
301 0.25
302 0.25
303 0.3
304 0.35
305 0.39
306 0.4
307 0.48
308 0.49
309 0.57
310 0.67
311 0.71
312 0.73
313 0.71
314 0.71
315 0.65
316 0.73
317 0.74
318 0.74
319 0.76
320 0.79
321 0.82
322 0.85
323 0.84
324 0.76
325 0.74
326 0.66
327 0.59
328 0.56
329 0.56
330 0.53
331 0.51
332 0.52
333 0.47
334 0.5
335 0.52
336 0.54
337 0.55
338 0.57
339 0.61
340 0.64
341 0.69
342 0.7
343 0.71
344 0.67
345 0.62
346 0.59
347 0.54
348 0.46
349 0.37
350 0.31
351 0.23
352 0.18
353 0.13
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.09
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.16