FuNGI

A0A1L9RLF3

Protein Details

Accession

A0A1L9RLF3

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-51	APPMRIRRPKVADPLVRPKRKPTARPAVPPSAG	Hydrophilic
135-154	GQFTRPVRLQRRDPRAKSQE	Hydrophilic
521-543	GTDTSRKKTKSKYPSSQPTPQPG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-49	MRIRRPKVADPLVRPKRKPTARPAVPPS
415-436	KEKEARRVLGKGVRKALKKREK
474-478	KSKKE

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MTTPTNNPNSRTPLGSSGAPPMRIRRPKVADPLVRPKRKPTARPAVPPSAGNGAAPKPLPARPIVPNVQPGSLLEKPKLASATDHLAVNGFSGPLLSDTYVDYPLVTTKRALRESLKHHIARFASKKNIDPRDEGQFTRPVRLQRRDPRAKSQEINAERGQGNQKEASESSQQMDDLEREELEARKTAREKERADNLAQIAPSIGSAPKRSNAPKQKTQQVFKTDMTPEEIARARIKYEEALPWHLEDFDSKNIWVGNYEAALSETHAVFVLENTGKMRMIPVEKWYKFNAKSQFKALTIEEAEKFMAKKIKDPRWFMEKQQEQAQQKELETFAKQRKVYAGKQGAPAGVEGLEADEMDFEEDRFADDEEHDDLFNDDEDAKAAEKRIKQDQLKANVFDLKEEKEYEEEELREMKEKEARRVLGKGVRKALKKREKNYDYSSGSDVNPYSDEESSDESESERLKEEERKAEEEKSKKEPAISSKGSNTPSGRPKHTDSLKKGTTTASRKRLGSPNGSDASGTDTSRKKTKSKYPSSQPTPQPGSRPMSPSASSAVPGSKKRARNVPVGGAGPSDVDGGAGSGGEISENGKTKKLKLNPPAISSQSGTPQGSRAASPTPLGNKSFSGSRASSPEGGSIKSQVRVSTPGPSGQSFPTPAEIHAAIPPSGILSGDLLRIFRPRMGESKDNHRRFIAIVKDVSVYGKEDRLLRPGTLKET

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.42
3	0.36
4	0.38
5	0.4
6	0.4
7	0.39
8	0.4
9	0.47
10	0.53
11	0.57
12	0.58
13	0.62
14	0.67
15	0.75
16	0.77
17	0.76
18	0.76
19	0.81
20	0.82
21	0.83
22	0.77
23	0.75
24	0.76
25	0.77
26	0.77
27	0.76
28	0.77
29	0.77
30	0.84
31	0.84
32	0.82
33	0.75
34	0.67
35	0.59
36	0.53
37	0.44
38	0.35
39	0.31
40	0.23
41	0.24
42	0.24
43	0.23
44	0.22
45	0.24
46	0.26
47	0.25
48	0.28
49	0.3
50	0.38
51	0.4
52	0.41
53	0.46
54	0.46
55	0.44
56	0.39
57	0.35
58	0.34
59	0.34
60	0.33
61	0.27
62	0.28
63	0.28
64	0.31
65	0.31
66	0.24
67	0.22
68	0.22
69	0.28
70	0.26
71	0.26
72	0.23
73	0.22
74	0.21
75	0.19
76	0.15
77	0.09
78	0.07
79	0.06
80	0.07
81	0.07
82	0.08
83	0.08
84	0.08
85	0.09
86	0.12
87	0.13
88	0.12
89	0.11
90	0.11
91	0.15
92	0.16
93	0.16
94	0.17
95	0.22
96	0.3
97	0.32
98	0.35
99	0.37
100	0.44
101	0.5
102	0.57
103	0.6
104	0.56
105	0.55
106	0.57
107	0.53
108	0.54
109	0.54
110	0.52
111	0.52
112	0.52
113	0.58
114	0.61
115	0.67
116	0.61
117	0.59
118	0.55
119	0.56
120	0.56
121	0.5
122	0.44
123	0.43
124	0.41
125	0.41
126	0.41
127	0.4
128	0.46
129	0.53
130	0.59
131	0.62
132	0.72
133	0.77
134	0.79
135	0.81
136	0.8
137	0.79
138	0.72
139	0.68
140	0.67
141	0.6
142	0.6
143	0.5
144	0.47
145	0.4
146	0.42
147	0.42
148	0.34
149	0.34
150	0.3
151	0.3
152	0.28
153	0.28
154	0.28
155	0.25
156	0.25
157	0.23
158	0.22
159	0.21
160	0.19
161	0.19
162	0.16
163	0.13
164	0.13
165	0.11
166	0.11
167	0.13
168	0.14
169	0.14
170	0.17
171	0.17
172	0.21
173	0.25
174	0.32
175	0.38
176	0.45
177	0.48
178	0.52
179	0.6
180	0.58
181	0.57
182	0.53
183	0.46
184	0.4
185	0.35
186	0.27
187	0.19
188	0.15
189	0.13
190	0.1
191	0.1
192	0.09
193	0.12
194	0.14
195	0.16
196	0.22
197	0.27
198	0.36
199	0.45
200	0.51
201	0.58
202	0.64
203	0.71
204	0.73
205	0.75
206	0.72
207	0.68
208	0.64
209	0.56
210	0.55
211	0.47
212	0.4
213	0.38
214	0.31
215	0.25
216	0.24
217	0.25
218	0.21
219	0.22
220	0.21
221	0.17
222	0.17
223	0.18
224	0.16
225	0.17
226	0.19
227	0.19
228	0.23
229	0.23
230	0.22
231	0.22
232	0.2
233	0.17
234	0.15
235	0.15
236	0.14
237	0.14
238	0.13
239	0.14
240	0.15
241	0.15
242	0.13
243	0.11
244	0.09
245	0.08
246	0.08
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.07
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.09
259	0.08
260	0.09
261	0.09
262	0.1
263	0.1
264	0.1
265	0.11
266	0.1
267	0.12
268	0.13
269	0.19
270	0.28
271	0.29
272	0.32
273	0.35
274	0.39
275	0.38
276	0.44
277	0.47
278	0.44
279	0.45
280	0.47
281	0.47
282	0.41
283	0.42
284	0.35
285	0.29
286	0.23
287	0.24
288	0.19
289	0.16
290	0.16
291	0.14
292	0.14
293	0.13
294	0.16
295	0.14
296	0.2
297	0.29
298	0.38
299	0.44
300	0.49
301	0.5
302	0.54
303	0.56
304	0.52
305	0.53
306	0.48
307	0.43
308	0.47
309	0.5
310	0.44
311	0.44
312	0.45
313	0.36
314	0.32
315	0.31
316	0.24
317	0.18
318	0.18
319	0.22
320	0.23
321	0.28
322	0.27
323	0.27
324	0.32
325	0.36
326	0.37
327	0.4
328	0.41
329	0.38
330	0.4
331	0.41
332	0.35
333	0.29
334	0.27
335	0.17
336	0.11
337	0.08
338	0.05
339	0.04
340	0.04
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.07
356	0.09
357	0.09
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.07
363	0.06
364	0.05
365	0.04
366	0.05
367	0.05
368	0.06
369	0.06
370	0.08
371	0.11
372	0.14
373	0.17
374	0.24
375	0.31
376	0.32
377	0.4
378	0.46
379	0.51
380	0.52
381	0.5
382	0.44
383	0.4
384	0.38
385	0.32
386	0.26
387	0.19
388	0.17
389	0.17
390	0.16
391	0.14
392	0.15
393	0.15
394	0.15
395	0.14
396	0.13
397	0.14
398	0.14
399	0.18
400	0.18
401	0.17
402	0.21
403	0.23
404	0.28
405	0.32
406	0.34
407	0.32
408	0.33
409	0.35
410	0.36
411	0.39
412	0.38
413	0.4
414	0.44
415	0.47
416	0.52
417	0.58
418	0.62
419	0.65
420	0.67
421	0.71
422	0.7
423	0.71
424	0.71
425	0.69
426	0.61
427	0.55
428	0.5
429	0.41
430	0.36
431	0.31
432	0.25
433	0.17
434	0.15
435	0.13
436	0.13
437	0.11
438	0.11
439	0.11
440	0.13
441	0.14
442	0.14
443	0.13
444	0.12
445	0.14
446	0.14
447	0.13
448	0.12
449	0.12
450	0.14
451	0.21
452	0.25
453	0.31
454	0.34
455	0.38
456	0.38
457	0.44
458	0.49
459	0.49
460	0.49
461	0.48
462	0.49
463	0.45
464	0.46
465	0.43
466	0.43
467	0.45
468	0.43
469	0.39
470	0.39
471	0.43
472	0.42
473	0.42
474	0.37
475	0.36
476	0.41
477	0.43
478	0.43
479	0.43
480	0.46
481	0.51
482	0.57
483	0.59
484	0.58
485	0.62
486	0.61
487	0.57
488	0.53
489	0.48
490	0.48
491	0.48
492	0.51
493	0.5
494	0.51
495	0.51
496	0.56
497	0.6
498	0.58
499	0.57
500	0.52
501	0.5
502	0.47
503	0.46
504	0.39
505	0.31
506	0.31
507	0.25
508	0.21
509	0.2
510	0.22
511	0.26
512	0.33
513	0.36
514	0.37
515	0.43
516	0.53
517	0.58
518	0.65
519	0.72
520	0.76
521	0.83
522	0.85
523	0.85
524	0.81
525	0.79
526	0.75
527	0.68
528	0.62
529	0.58
530	0.56
531	0.5
532	0.48
533	0.42
534	0.4
535	0.38
536	0.34
537	0.31
538	0.26
539	0.23
540	0.2
541	0.22
542	0.22
543	0.24
544	0.3
545	0.35
546	0.4
547	0.45
548	0.53
549	0.53
550	0.56
551	0.59
552	0.57
553	0.54
554	0.5
555	0.45
556	0.36
557	0.31
558	0.23
559	0.18
560	0.12
561	0.07
562	0.06
563	0.05
564	0.05
565	0.05
566	0.04
567	0.04
568	0.03
569	0.03
570	0.03
571	0.03
572	0.04
573	0.08
574	0.13
575	0.14
576	0.2
577	0.22
578	0.28
579	0.37
580	0.44
581	0.51
582	0.55
583	0.65
584	0.65
585	0.68
586	0.68
587	0.62
588	0.56
589	0.48
590	0.41
591	0.35
592	0.35
593	0.31
594	0.26
595	0.25
596	0.25
597	0.25
598	0.23
599	0.21
600	0.19
601	0.19
602	0.2
603	0.23
604	0.26
605	0.28
606	0.3
607	0.29
608	0.27
609	0.28
610	0.3
611	0.27
612	0.27
613	0.25
614	0.26
615	0.29
616	0.32
617	0.32
618	0.29
619	0.34
620	0.29
621	0.29
622	0.27
623	0.28
624	0.28
625	0.29
626	0.3
627	0.25
628	0.27
629	0.3
630	0.3
631	0.33
632	0.32
633	0.32
634	0.33
635	0.33
636	0.33
637	0.31
638	0.33
639	0.28
640	0.27
641	0.28
642	0.26
643	0.25
644	0.27
645	0.25
646	0.23
647	0.23
648	0.24
649	0.18
650	0.17
651	0.17
652	0.13
653	0.12
654	0.11
655	0.09
656	0.08
657	0.09
658	0.12
659	0.13
660	0.12
661	0.14
662	0.17
663	0.18
664	0.19
665	0.22
666	0.23
667	0.31
668	0.38
669	0.44
670	0.45
671	0.55
672	0.63
673	0.64
674	0.63
675	0.56
676	0.5
677	0.45
678	0.49
679	0.45
680	0.41
681	0.38
682	0.37
683	0.37
684	0.36
685	0.36
686	0.29
687	0.24
688	0.2
689	0.21
690	0.22
691	0.26
692	0.28
693	0.32
694	0.34
695	0.33
696	0.36

A0A1L9RLF3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer