FuNGI

A0A1L9RTC0

Protein Details

Accession

A0A1L9RTC0

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
83-106	NNDGPPKTVKKGKKPKAPLHSAGP	Hydrophilic
494-518	QAEGTARKEKKQTWRRVQDDNDDNE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
84-109	NDGPPKTVKKGKKPKAPLHSAGPARR

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 4.5, cyto_mito 4.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039128 TRIP4-like IPR009349 Znf_C2HC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06221 zf-C2HC5

Amino Acid Sequences

MSNANLVSWGAPRLAQLLPLDEESLTQIITYAAGLSKEASADHLKNLLGDSPAALEFIASFNSRRESQRPPQPDRSPARSGGNNDGPPKTVKKGKKPKAPLHSAGPARRPENFGNVTGGYRKADMEEDYIPKSRSRGNKQDAGASSLSTEPVASLQPPRGPSPYESSAPSSRNPSPAPKSTAKAPPSASGPVISDILPNVKSKAAKASSRPAGTGSAGSSKNSLTTNNISDLTAAIAALEVSTNPTLGGGNQKCNCYASLHPLFTPAPNCLNCGKIICSLEGLQPCSFCGTALLSNEEVQSMIRELRAERGQEKMRAHNEGVHREGGPGQGPGSGPQDRQLDAAKAHRDRLLNFQAQNARRTRVVDEAADFETPNVASTLWMSPAQRALALKKQQRVLREMEEKARPEWEKKKTIMSLDIKGGRVTRVYQSAGPAEASPSAEEEAEAEAEAEAEAEKSVPHDEGKRRGEAFGHNPLLAAGGLLRPVWKGPDGKQAEGTARKEKKQTWRRVQDDNDDNEQWILDGGLHGYTT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.17
3	0.16
4	0.18
5	0.2
6	0.21
7	0.21
8	0.18
9	0.18
10	0.17
11	0.16
12	0.12
13	0.09
14	0.09
15	0.08
16	0.08
17	0.08
18	0.06
19	0.07
20	0.08
21	0.09
22	0.09
23	0.1
24	0.1
25	0.1
26	0.13
27	0.18
28	0.19
29	0.21
30	0.22
31	0.22
32	0.22
33	0.23
34	0.21
35	0.16
36	0.15
37	0.13
38	0.13
39	0.13
40	0.12
41	0.11
42	0.08
43	0.07
44	0.08
45	0.1
46	0.09
47	0.1
48	0.12
49	0.17
50	0.21
51	0.25
52	0.3
53	0.36
54	0.45
55	0.54
56	0.61
57	0.66
58	0.73
59	0.74
60	0.79
61	0.79
62	0.76
63	0.72
64	0.66
65	0.64
66	0.59
67	0.57
68	0.56
69	0.56
70	0.53
71	0.52
72	0.49
73	0.44
74	0.42
75	0.42
76	0.4
77	0.4
78	0.44
79	0.51
80	0.62
81	0.7
82	0.76
83	0.83
84	0.86
85	0.87
86	0.88
87	0.81
88	0.77
89	0.76
90	0.73
91	0.68
92	0.65
93	0.6
94	0.54
95	0.52
96	0.5
97	0.43
98	0.45
99	0.41
100	0.36
101	0.34
102	0.33
103	0.31
104	0.28
105	0.28
106	0.2
107	0.18
108	0.17
109	0.14
110	0.16
111	0.15
112	0.17
113	0.19
114	0.21
115	0.23
116	0.26
117	0.26
118	0.25
119	0.26
120	0.29
121	0.34
122	0.41
123	0.48
124	0.52
125	0.58
126	0.58
127	0.63
128	0.58
129	0.53
130	0.44
131	0.33
132	0.28
133	0.21
134	0.2
135	0.13
136	0.11
137	0.06
138	0.07
139	0.08
140	0.08
141	0.1
142	0.12
143	0.15
144	0.18
145	0.2
146	0.21
147	0.23
148	0.24
149	0.29
150	0.3
151	0.29
152	0.29
153	0.31
154	0.34
155	0.34
156	0.33
157	0.32
158	0.3
159	0.33
160	0.33
161	0.36
162	0.38
163	0.41
164	0.46
165	0.44
166	0.44
167	0.45
168	0.52
169	0.46
170	0.44
171	0.4
172	0.36
173	0.35
174	0.35
175	0.29
176	0.21
177	0.2
178	0.17
179	0.16
180	0.14
181	0.11
182	0.09
183	0.11
184	0.11
185	0.11
186	0.11
187	0.13
188	0.13
189	0.14
190	0.21
191	0.23
192	0.26
193	0.29
194	0.36
195	0.4
196	0.4
197	0.4
198	0.33
199	0.3
200	0.27
201	0.24
202	0.17
203	0.16
204	0.16
205	0.16
206	0.15
207	0.14
208	0.15
209	0.15
210	0.14
211	0.13
212	0.15
213	0.16
214	0.18
215	0.18
216	0.16
217	0.16
218	0.15
219	0.12
220	0.09
221	0.07
222	0.04
223	0.04
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.02
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.05
234	0.05
235	0.14
236	0.14
237	0.21
238	0.23
239	0.24
240	0.24
241	0.25
242	0.25
243	0.2
244	0.19
245	0.21
246	0.23
247	0.23
248	0.23
249	0.24
250	0.24
251	0.22
252	0.22
253	0.16
254	0.15
255	0.15
256	0.17
257	0.16
258	0.16
259	0.15
260	0.16
261	0.15
262	0.15
263	0.15
264	0.13
265	0.13
266	0.14
267	0.16
268	0.17
269	0.18
270	0.15
271	0.14
272	0.14
273	0.14
274	0.13
275	0.09
276	0.08
277	0.07
278	0.09
279	0.1
280	0.11
281	0.1
282	0.11
283	0.11
284	0.1
285	0.09
286	0.07
287	0.07
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.07
293	0.12
294	0.15
295	0.16
296	0.17
297	0.22
298	0.26
299	0.3
300	0.32
301	0.35
302	0.35
303	0.36
304	0.36
305	0.35
306	0.36
307	0.35
308	0.35
309	0.29
310	0.27
311	0.24
312	0.24
313	0.2
314	0.16
315	0.12
316	0.1
317	0.1
318	0.1
319	0.11
320	0.14
321	0.15
322	0.14
323	0.19
324	0.21
325	0.2
326	0.21
327	0.21
328	0.19
329	0.19
330	0.25
331	0.27
332	0.26
333	0.28
334	0.31
335	0.3
336	0.3
337	0.37
338	0.38
339	0.36
340	0.35
341	0.38
342	0.42
343	0.43
344	0.47
345	0.42
346	0.37
347	0.34
348	0.36
349	0.33
350	0.3
351	0.3
352	0.25
353	0.24
354	0.24
355	0.24
356	0.22
357	0.19
358	0.14
359	0.13
360	0.11
361	0.1
362	0.07
363	0.06
364	0.06
365	0.08
366	0.09
367	0.1
368	0.12
369	0.12
370	0.13
371	0.15
372	0.15
373	0.15
374	0.16
375	0.18
376	0.25
377	0.33
378	0.37
379	0.41
380	0.47
381	0.48
382	0.5
383	0.5
384	0.47
385	0.47
386	0.48
387	0.46
388	0.47
389	0.5
390	0.48
391	0.45
392	0.46
393	0.41
394	0.42
395	0.47
396	0.49
397	0.5
398	0.51
399	0.57
400	0.54
401	0.55
402	0.56
403	0.53
404	0.48
405	0.48
406	0.5
407	0.43
408	0.41
409	0.38
410	0.3
411	0.27
412	0.25
413	0.22
414	0.22
415	0.24
416	0.24
417	0.26
418	0.26
419	0.26
420	0.24
421	0.2
422	0.17
423	0.16
424	0.15
425	0.12
426	0.12
427	0.12
428	0.11
429	0.1
430	0.1
431	0.1
432	0.09
433	0.09
434	0.07
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.06
445	0.08
446	0.09
447	0.12
448	0.2
449	0.27
450	0.37
451	0.42
452	0.46
453	0.46
454	0.46
455	0.46
456	0.46
457	0.46
458	0.46
459	0.44
460	0.38
461	0.37
462	0.35
463	0.33
464	0.25
465	0.18
466	0.09
467	0.07
468	0.07
469	0.08
470	0.09
471	0.08
472	0.09
473	0.12
474	0.16
475	0.19
476	0.23
477	0.33
478	0.37
479	0.39
480	0.42
481	0.43
482	0.46
483	0.5
484	0.51
485	0.51
486	0.53
487	0.56
488	0.59
489	0.64
490	0.67
491	0.7
492	0.76
493	0.77
494	0.81
495	0.82
496	0.84
497	0.84
498	0.83
499	0.82
500	0.77
501	0.73
502	0.63
503	0.58
504	0.48
505	0.41
506	0.3
507	0.21
508	0.15
509	0.08
510	0.07
511	0.07

A0A1L9RTC0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer