Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0VJ17

Protein Details
Accession G0VJ17    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
122-150RFLPKPKVVGPPKPKNKKKRGTGAPGGRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-18RGGR
125-215PKPKVVGPPKPKNKKKRGTGAPGGRGGARGGFGGRGGSRGGFGARGGSRGGFGGRGGSRGGSRGGFGGRGGSRGGFGGSRGGSRGGFGGRR
Subcellular Location(s) mito 14, cyto_nucl 7.5, nucl 7, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG ncs:NCAS_0H01850  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MSFRGGRGGSRGGFRGGRGGARGGFGGRSFQQGPPDTVLEMGAFLHPCEGDIVCRSINTKIPYFNAPIYLENKTQVGKVDEILGPLNEVYFTIKCSEGVQATSFKEGDKFYIGSDKLLPIERFLPKPKVVGPPKPKNKKKRGTGAPGGRGGARGGFGGRGGSRGGFGARGGSRGGFGGRGGSRGGSRGGFGGRGGSRGGFGGSRGGSRGGFGGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.31
3 0.27
4 0.27
5 0.25
6 0.26
7 0.22
8 0.22
9 0.22
10 0.17
11 0.17
12 0.15
13 0.17
14 0.15
15 0.19
16 0.21
17 0.22
18 0.28
19 0.29
20 0.32
21 0.31
22 0.31
23 0.26
24 0.24
25 0.23
26 0.15
27 0.13
28 0.1
29 0.09
30 0.08
31 0.07
32 0.08
33 0.07
34 0.08
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.1
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.14
43 0.15
44 0.2
45 0.22
46 0.23
47 0.23
48 0.25
49 0.28
50 0.3
51 0.28
52 0.26
53 0.23
54 0.24
55 0.24
56 0.25
57 0.23
58 0.21
59 0.21
60 0.18
61 0.17
62 0.17
63 0.16
64 0.14
65 0.13
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.12
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.09
82 0.1
83 0.11
84 0.1
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.13
89 0.14
90 0.13
91 0.12
92 0.13
93 0.12
94 0.12
95 0.11
96 0.1
97 0.09
98 0.14
99 0.14
100 0.13
101 0.14
102 0.13
103 0.13
104 0.16
105 0.16
106 0.12
107 0.16
108 0.18
109 0.2
110 0.24
111 0.27
112 0.24
113 0.26
114 0.29
115 0.34
116 0.37
117 0.44
118 0.5
119 0.56
120 0.66
121 0.76
122 0.81
123 0.82
124 0.87
125 0.87
126 0.86
127 0.86
128 0.85
129 0.83
130 0.84
131 0.82
132 0.77
133 0.69
134 0.61
135 0.5
136 0.41
137 0.32
138 0.23
139 0.15
140 0.1
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.12
155 0.12
156 0.13
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.09
163 0.09
164 0.13
165 0.13
166 0.14
167 0.14
168 0.15
169 0.15
170 0.16
171 0.18
172 0.13
173 0.13
174 0.14
175 0.15
176 0.14
177 0.13
178 0.17
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.15
186 0.09
187 0.1
188 0.14
189 0.14
190 0.15
191 0.16
192 0.18
193 0.16
194 0.16
195 0.18