Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0VDS8

Protein Details
Accession G0VDS8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
395-427PDVVLVKKLYQRKTRKNRNWKLKRMAREHKEIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
406-421RKTRKNRNWKLKRMAR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039768  Nmd3  
IPR007064  Nmd3_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0015031  P:protein transport  
KEGG ncs:NCAS_0D01360  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04981  NMD3  
Amino Acid Sequences MNFQPLEHQHQHQQQVSTVLCCNCGTPIDGSTGLVMCYDCIKMTVDITEGIPREANISFCRNCERFLQPPGQWIRADLESRELLAICLRRLKGLTKVRLVDASFIWTEPHSRRIRIKLTVQGEAMANTIIQQTFEVEYVVIAMQCPDCAKSYTTHTWRAAVQIRQKVPHKRTFLYLEQLILKHNAHVDTISISEAKDGLDFFYSQKNHAVKMIDFLNSVVPMKYKKSEELISQDTHTGSATYKFSYSVEIVPICRDDLVVLPKKLAKHLGNISQFVLCSKISNTVQFLDPNTLQTADLSAQVYWRSPFNALADVSQLTEFIVLDVESTGISKGKRVLADVTIARSADLGINDQVYYTRSHLGAILHAGDTVMGYFIANSNYNSDLFDGLNIDYVPDVVLVKKLYQRKTRKNRNWKLKRMAREHKEIDAAQDYSSRVQKQDMERAERDYELFLQELEEDDEMRQTINLYKNNAPAPAPQPHEIEEDEDPDAPQIDIDELLDELDEMTLDDGTDDPQQQEPTM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.52
3 0.49
4 0.43
5 0.41
6 0.33
7 0.3
8 0.28
9 0.26
10 0.21
11 0.2
12 0.2
13 0.16
14 0.17
15 0.18
16 0.19
17 0.18
18 0.18
19 0.17
20 0.15
21 0.13
22 0.12
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.09
27 0.1
28 0.12
29 0.12
30 0.13
31 0.14
32 0.13
33 0.14
34 0.15
35 0.19
36 0.17
37 0.18
38 0.17
39 0.16
40 0.17
41 0.17
42 0.19
43 0.18
44 0.24
45 0.25
46 0.27
47 0.35
48 0.34
49 0.35
50 0.37
51 0.4
52 0.39
53 0.43
54 0.49
55 0.42
56 0.5
57 0.53
58 0.51
59 0.45
60 0.4
61 0.38
62 0.35
63 0.36
64 0.27
65 0.27
66 0.23
67 0.24
68 0.23
69 0.19
70 0.15
71 0.17
72 0.19
73 0.16
74 0.22
75 0.21
76 0.23
77 0.24
78 0.27
79 0.32
80 0.4
81 0.45
82 0.46
83 0.48
84 0.48
85 0.5
86 0.48
87 0.4
88 0.31
89 0.28
90 0.21
91 0.19
92 0.18
93 0.15
94 0.19
95 0.19
96 0.28
97 0.27
98 0.32
99 0.39
100 0.46
101 0.52
102 0.53
103 0.57
104 0.56
105 0.56
106 0.55
107 0.49
108 0.42
109 0.36
110 0.3
111 0.24
112 0.16
113 0.11
114 0.08
115 0.1
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.06
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.09
135 0.11
136 0.12
137 0.13
138 0.2
139 0.29
140 0.33
141 0.39
142 0.39
143 0.39
144 0.39
145 0.43
146 0.42
147 0.39
148 0.42
149 0.42
150 0.44
151 0.48
152 0.55
153 0.58
154 0.59
155 0.62
156 0.6
157 0.54
158 0.56
159 0.56
160 0.52
161 0.48
162 0.42
163 0.36
164 0.32
165 0.31
166 0.27
167 0.24
168 0.2
169 0.15
170 0.16
171 0.15
172 0.12
173 0.12
174 0.11
175 0.09
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.15
190 0.15
191 0.16
192 0.22
193 0.22
194 0.22
195 0.24
196 0.26
197 0.19
198 0.22
199 0.22
200 0.17
201 0.16
202 0.16
203 0.14
204 0.12
205 0.12
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.12
210 0.15
211 0.16
212 0.17
213 0.2
214 0.22
215 0.24
216 0.28
217 0.3
218 0.27
219 0.26
220 0.25
221 0.22
222 0.19
223 0.16
224 0.11
225 0.08
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.12
233 0.12
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.1
241 0.08
242 0.07
243 0.06
244 0.08
245 0.14
246 0.18
247 0.17
248 0.18
249 0.2
250 0.21
251 0.22
252 0.25
253 0.2
254 0.21
255 0.25
256 0.32
257 0.32
258 0.33
259 0.32
260 0.26
261 0.25
262 0.2
263 0.17
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.13
268 0.13
269 0.15
270 0.16
271 0.16
272 0.17
273 0.17
274 0.17
275 0.16
276 0.15
277 0.15
278 0.14
279 0.13
280 0.12
281 0.11
282 0.11
283 0.08
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.14
297 0.14
298 0.13
299 0.14
300 0.13
301 0.13
302 0.11
303 0.1
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.06
317 0.07
318 0.08
319 0.11
320 0.14
321 0.15
322 0.16
323 0.18
324 0.17
325 0.21
326 0.21
327 0.2
328 0.18
329 0.17
330 0.16
331 0.14
332 0.13
333 0.1
334 0.1
335 0.09
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.1
343 0.1
344 0.12
345 0.11
346 0.12
347 0.14
348 0.14
349 0.14
350 0.13
351 0.12
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.05
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.05
363 0.07
364 0.08
365 0.09
366 0.11
367 0.12
368 0.12
369 0.13
370 0.13
371 0.12
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.09
376 0.1
377 0.09
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.05
385 0.08
386 0.09
387 0.11
388 0.17
389 0.25
390 0.32
391 0.42
392 0.52
393 0.61
394 0.72
395 0.81
396 0.86
397 0.9
398 0.93
399 0.94
400 0.95
401 0.94
402 0.94
403 0.91
404 0.9
405 0.89
406 0.89
407 0.85
408 0.84
409 0.77
410 0.69
411 0.66
412 0.56
413 0.5
414 0.44
415 0.38
416 0.28
417 0.28
418 0.25
419 0.24
420 0.28
421 0.26
422 0.22
423 0.25
424 0.31
425 0.35
426 0.43
427 0.46
428 0.49
429 0.49
430 0.52
431 0.51
432 0.46
433 0.4
434 0.34
435 0.28
436 0.22
437 0.2
438 0.15
439 0.13
440 0.13
441 0.13
442 0.12
443 0.11
444 0.1
445 0.1
446 0.11
447 0.11
448 0.11
449 0.1
450 0.09
451 0.15
452 0.22
453 0.26
454 0.3
455 0.34
456 0.4
457 0.42
458 0.43
459 0.38
460 0.37
461 0.38
462 0.4
463 0.41
464 0.39
465 0.39
466 0.39
467 0.41
468 0.36
469 0.35
470 0.29
471 0.27
472 0.25
473 0.23
474 0.2
475 0.18
476 0.18
477 0.13
478 0.12
479 0.09
480 0.09
481 0.08
482 0.08
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.06
488 0.06
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.06
496 0.06
497 0.08
498 0.12
499 0.13
500 0.15
501 0.19