FuNGI

A0A1L9U055

Protein Details

Accession

A0A1L9U055

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
79-100	EPSKPTLKYKPRAVGRRSKEER	Basic
227-250	EEAVLDQKKKKKQQRKGKIALGSA	Hydrophilic
341-362	GLLPAPKKKVRRKLDSREPSVP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
69-105	PAPSAGSGPGEPSKPTLKYKPRAVGRRSKEEREAIEK
124-139	GKASMAARGRAGFAGR
234-257	KKKKKQQRKGKIALGSARDKGLRP
346-355	PKKKVRRKLD

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAGPRRGASSAPARNSNSGESGSNPTPNTSASPAPTPAPGTTTRAPVQRLQSLKKRAPSGSIGPGPAPSAGSGPGEPSKPTLKYKPRAVGRRSKEEREAIEKLEAERHAERLAEAAAIQRGKASMAARGRAGFAGRGGRGGMMGMSGAAGPLGSGFAARRGRGGSRFGTGDSRGTSMSRRSKSMTAGAAGGNGSASVSSDESDGELRVSIDRINLESDADDDEEEAVLDQKKKKKQQRKGKIALGSARDKGLRPIRVERHEHEDRVVSVNMESSTAKSTELREQAKGKAKDDDALFVQDDEETPTETETQVKQEPTDENDQTMMDVPHAEEPVTTDDGLLPAPKKKVRRKLDSREPSVPAAKDPKSLLRTKEDIEEYDRHAEDLELVKDLFTKEPPTKPNEFTEGAKAEAETTIDEQEKEKTEEDKEAEPQDDKLTGQLFLMQFPPITPNLIEPNADGTNADGEATDIPNPAAAQAVAQNAEVNGAQSDIPGLKHEEEFEVLDGLEESTAARTQSKVVTAADWQLKAGQAGKLNVHASGRVTMDWGGISFELDRAAAVDFLQEALIVSTPPNVTEDVVDDEYKVWAMGQLSGKFTVTPDWEKIL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.58
3	0.54
4	0.54
5	0.53
6	0.5
7	0.43
8	0.37
9	0.32
10	0.29
11	0.32
12	0.31
13	0.33
14	0.3
15	0.29
16	0.28
17	0.28
18	0.28
19	0.25
20	0.26
21	0.24
22	0.28
23	0.28
24	0.28
25	0.29
26	0.29
27	0.25
28	0.26
29	0.25
30	0.28
31	0.29
32	0.33
33	0.36
34	0.38
35	0.4
36	0.42
37	0.46
38	0.47
39	0.51
40	0.53
41	0.58
42	0.63
43	0.66
44	0.67
45	0.67
46	0.62
47	0.6
48	0.58
49	0.54
50	0.54
51	0.51
52	0.45
53	0.4
54	0.38
55	0.34
56	0.28
57	0.23
58	0.14
59	0.11
60	0.11
61	0.13
62	0.12
63	0.15
64	0.17
65	0.18
66	0.18
67	0.21
68	0.25
69	0.28
70	0.34
71	0.41
72	0.48
73	0.55
74	0.63
75	0.69
76	0.73
77	0.78
78	0.8
79	0.8
80	0.78
81	0.81
82	0.79
83	0.76
84	0.73
85	0.7
86	0.67
87	0.64
88	0.59
89	0.51
90	0.48
91	0.43
92	0.37
93	0.36
94	0.31
95	0.29
96	0.27
97	0.26
98	0.23
99	0.22
100	0.2
101	0.16
102	0.16
103	0.11
104	0.1
105	0.11
106	0.14
107	0.13
108	0.13
109	0.12
110	0.12
111	0.12
112	0.15
113	0.14
114	0.16
115	0.2
116	0.23
117	0.24
118	0.24
119	0.25
120	0.22
121	0.23
122	0.17
123	0.15
124	0.18
125	0.16
126	0.16
127	0.16
128	0.14
129	0.13
130	0.13
131	0.1
132	0.05
133	0.05
134	0.04
135	0.04
136	0.04
137	0.03
138	0.03
139	0.03
140	0.02
141	0.03
142	0.03
143	0.02
144	0.03
145	0.04
146	0.1
147	0.13
148	0.14
149	0.15
150	0.17
151	0.21
152	0.24
153	0.28
154	0.24
155	0.24
156	0.25
157	0.25
158	0.26
159	0.24
160	0.23
161	0.2
162	0.19
163	0.17
164	0.17
165	0.18
166	0.23
167	0.31
168	0.31
169	0.32
170	0.35
171	0.37
172	0.39
173	0.41
174	0.35
175	0.27
176	0.26
177	0.24
178	0.21
179	0.18
180	0.14
181	0.09
182	0.07
183	0.05
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.06
191	0.06
192	0.07
193	0.07
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.07
198	0.07
199	0.07
200	0.08
201	0.08
202	0.09
203	0.1
204	0.1
205	0.1
206	0.09
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.08
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.05
216	0.06
217	0.08
218	0.12
219	0.17
220	0.24
221	0.32
222	0.41
223	0.52
224	0.6
225	0.69
226	0.77
227	0.83
228	0.87
229	0.88
230	0.86
231	0.81
232	0.74
233	0.69
234	0.63
235	0.55
236	0.45
237	0.37
238	0.31
239	0.26
240	0.28
241	0.3
242	0.29
243	0.29
244	0.36
245	0.42
246	0.47
247	0.52
248	0.48
249	0.5
250	0.49
251	0.46
252	0.39
253	0.34
254	0.28
255	0.27
256	0.24
257	0.16
258	0.12
259	0.13
260	0.12
261	0.11
262	0.1
263	0.08
264	0.09
265	0.09
266	0.1
267	0.09
268	0.12
269	0.16
270	0.23
271	0.24
272	0.25
273	0.28
274	0.33
275	0.42
276	0.42
277	0.37
278	0.35
279	0.33
280	0.34
281	0.32
282	0.28
283	0.19
284	0.19
285	0.17
286	0.13
287	0.12
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.07
292	0.06
293	0.06
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.09
298	0.08
299	0.11
300	0.14
301	0.14
302	0.14
303	0.16
304	0.17
305	0.19
306	0.24
307	0.21
308	0.19
309	0.19
310	0.19
311	0.16
312	0.17
313	0.13
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.06
321	0.08
322	0.1
323	0.11
324	0.1
325	0.09
326	0.08
327	0.09
328	0.09
329	0.09
330	0.08
331	0.1
332	0.14
333	0.18
334	0.27
335	0.35
336	0.46
337	0.53
338	0.63
339	0.7
340	0.77
341	0.84
342	0.85
343	0.83
344	0.78
345	0.71
346	0.63
347	0.57
348	0.47
349	0.39
350	0.36
351	0.31
352	0.28
353	0.27
354	0.3
355	0.31
356	0.35
357	0.34
358	0.33
359	0.35
360	0.34
361	0.38
362	0.33
363	0.3
364	0.3
365	0.3
366	0.27
367	0.29
368	0.27
369	0.22
370	0.21
371	0.19
372	0.16
373	0.17
374	0.15
375	0.11
376	0.11
377	0.11
378	0.12
379	0.13
380	0.12
381	0.1
382	0.14
383	0.18
384	0.23
385	0.27
386	0.33
387	0.37
388	0.38
389	0.41
390	0.41
391	0.39
392	0.35
393	0.37
394	0.32
395	0.28
396	0.25
397	0.22
398	0.17
399	0.15
400	0.14
401	0.09
402	0.09
403	0.1
404	0.11
405	0.11
406	0.12
407	0.14
408	0.17
409	0.18
410	0.19
411	0.19
412	0.21
413	0.25
414	0.27
415	0.27
416	0.28
417	0.28
418	0.28
419	0.26
420	0.25
421	0.22
422	0.2
423	0.17
424	0.16
425	0.14
426	0.13
427	0.12
428	0.15
429	0.14
430	0.14
431	0.15
432	0.13
433	0.12
434	0.12
435	0.14
436	0.1
437	0.12
438	0.11
439	0.13
440	0.17
441	0.18
442	0.18
443	0.16
444	0.2
445	0.19
446	0.18
447	0.16
448	0.12
449	0.12
450	0.11
451	0.11
452	0.06
453	0.06
454	0.08
455	0.09
456	0.09
457	0.08
458	0.08
459	0.09
460	0.09
461	0.08
462	0.08
463	0.06
464	0.06
465	0.08
466	0.1
467	0.1
468	0.1
469	0.11
470	0.1
471	0.11
472	0.1
473	0.09
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.06
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.09
482	0.13
483	0.14
484	0.15
485	0.16
486	0.16
487	0.17
488	0.17
489	0.16
490	0.14
491	0.12
492	0.11
493	0.1
494	0.09
495	0.07
496	0.06
497	0.05
498	0.06
499	0.08
500	0.08
501	0.09
502	0.09
503	0.12
504	0.15
505	0.17
506	0.18
507	0.18
508	0.19
509	0.2
510	0.26
511	0.28
512	0.26
513	0.24
514	0.23
515	0.23
516	0.23
517	0.24
518	0.2
519	0.2
520	0.23
521	0.24
522	0.27
523	0.27
524	0.27
525	0.25
526	0.23
527	0.21
528	0.21
529	0.21
530	0.16
531	0.17
532	0.16
533	0.16
534	0.14
535	0.13
536	0.11
537	0.1
538	0.11
539	0.09
540	0.09
541	0.09
542	0.09
543	0.08
544	0.07
545	0.08
546	0.07
547	0.07
548	0.07
549	0.07
550	0.07
551	0.07
552	0.06
553	0.06
554	0.06
555	0.07
556	0.06
557	0.07
558	0.1
559	0.1
560	0.11
561	0.12
562	0.12
563	0.13
564	0.13
565	0.16
566	0.18
567	0.2
568	0.2
569	0.19
570	0.19
571	0.19
572	0.18
573	0.15
574	0.1
575	0.1
576	0.11
577	0.16
578	0.22
579	0.24
580	0.27
581	0.28
582	0.29
583	0.26
584	0.26
585	0.26
586	0.25
587	0.28

A0A1L9U055

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer