Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L9TDE8

Protein Details
Accession A0A1L9TDE8    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
374-396SAEPERSRPSRGRKRNYDDNSFVHydrophilic
411-438FYSNSEGGGKKKRKKDHVSKIPAPPDRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
419-430GKKKRKKDHVSK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSDRTPSAPLRTGPPSPSSPAPFTSFKDSLQPPITPDQIPQTPTSPPLMSVSAPNNASDFASMQALPNQATSQPASLSSPPSSAPMSTQTSQQPTTGITNSFPTPASSVDPDHSDKSFGTGISETGAPAPASASAAPTQKSEYRRTDHDRNLETPQTGTGVRDFAQMGGSSQVLHGDAMELDTEPSAHTKSNWPSLESLQKEFSSAFHLCKSSHIATGPDPSVDLISLYGLGPVARSVARNDPVTGEKINRLRKSYEGKLKGLGLSGRNKAVKHDPSSSGGLRQMMMWPEEEWQNQKVFGKEIKVADMDSALHNLQMKAMKMEPGPVPNNDYWEDVLGHDKPTKNTNTGEAAKKPAAPQSSVRTAAQPNGTPISAEPERSRPSRGRKRNYDDNSFVGYGEGYADDDDESGFYSNSEGGGKKKRKKDHVSKIPAPPDRGGSYGVGMFGIGAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.43
3 0.42
4 0.47
5 0.46
6 0.43
7 0.43
8 0.45
9 0.43
10 0.43
11 0.47
12 0.42
13 0.37
14 0.42
15 0.41
16 0.43
17 0.43
18 0.41
19 0.36
20 0.4
21 0.43
22 0.35
23 0.35
24 0.35
25 0.35
26 0.36
27 0.34
28 0.31
29 0.29
30 0.31
31 0.33
32 0.26
33 0.23
34 0.24
35 0.23
36 0.22
37 0.25
38 0.26
39 0.27
40 0.27
41 0.26
42 0.23
43 0.22
44 0.21
45 0.17
46 0.15
47 0.11
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.15
52 0.16
53 0.16
54 0.16
55 0.15
56 0.14
57 0.16
58 0.16
59 0.14
60 0.13
61 0.14
62 0.17
63 0.18
64 0.21
65 0.2
66 0.2
67 0.19
68 0.21
69 0.21
70 0.17
71 0.17
72 0.19
73 0.24
74 0.23
75 0.27
76 0.3
77 0.34
78 0.35
79 0.33
80 0.28
81 0.25
82 0.28
83 0.26
84 0.22
85 0.18
86 0.2
87 0.21
88 0.21
89 0.19
90 0.16
91 0.15
92 0.15
93 0.17
94 0.16
95 0.17
96 0.17
97 0.21
98 0.23
99 0.24
100 0.23
101 0.22
102 0.19
103 0.21
104 0.2
105 0.16
106 0.16
107 0.14
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.1
112 0.09
113 0.1
114 0.08
115 0.07
116 0.08
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.1
122 0.13
123 0.14
124 0.14
125 0.17
126 0.21
127 0.26
128 0.31
129 0.35
130 0.37
131 0.44
132 0.51
133 0.57
134 0.59
135 0.63
136 0.6
137 0.57
138 0.58
139 0.52
140 0.45
141 0.36
142 0.29
143 0.23
144 0.19
145 0.16
146 0.12
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.1
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.04
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.08
176 0.14
177 0.17
178 0.25
179 0.26
180 0.26
181 0.27
182 0.3
183 0.36
184 0.32
185 0.31
186 0.25
187 0.24
188 0.24
189 0.22
190 0.19
191 0.17
192 0.16
193 0.15
194 0.15
195 0.16
196 0.16
197 0.17
198 0.22
199 0.18
200 0.18
201 0.18
202 0.17
203 0.17
204 0.2
205 0.19
206 0.14
207 0.12
208 0.11
209 0.1
210 0.08
211 0.07
212 0.04
213 0.03
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.07
225 0.12
226 0.15
227 0.15
228 0.16
229 0.17
230 0.18
231 0.2
232 0.19
233 0.16
234 0.18
235 0.25
236 0.32
237 0.32
238 0.34
239 0.33
240 0.38
241 0.44
242 0.47
243 0.49
244 0.47
245 0.45
246 0.45
247 0.44
248 0.39
249 0.33
250 0.27
251 0.22
252 0.22
253 0.23
254 0.25
255 0.27
256 0.26
257 0.28
258 0.34
259 0.35
260 0.34
261 0.37
262 0.35
263 0.37
264 0.41
265 0.38
266 0.32
267 0.28
268 0.24
269 0.2
270 0.18
271 0.17
272 0.14
273 0.14
274 0.13
275 0.11
276 0.12
277 0.15
278 0.16
279 0.16
280 0.17
281 0.17
282 0.18
283 0.2
284 0.19
285 0.2
286 0.21
287 0.21
288 0.23
289 0.23
290 0.24
291 0.22
292 0.21
293 0.18
294 0.16
295 0.14
296 0.1
297 0.12
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.13
303 0.15
304 0.15
305 0.15
306 0.16
307 0.18
308 0.17
309 0.21
310 0.2
311 0.24
312 0.26
313 0.25
314 0.29
315 0.26
316 0.3
317 0.27
318 0.26
319 0.21
320 0.2
321 0.19
322 0.15
323 0.19
324 0.16
325 0.17
326 0.2
327 0.22
328 0.23
329 0.29
330 0.32
331 0.31
332 0.32
333 0.33
334 0.36
335 0.39
336 0.43
337 0.39
338 0.41
339 0.39
340 0.4
341 0.38
342 0.36
343 0.33
344 0.3
345 0.32
346 0.34
347 0.39
348 0.4
349 0.39
350 0.38
351 0.37
352 0.39
353 0.38
354 0.32
355 0.29
356 0.29
357 0.28
358 0.24
359 0.22
360 0.25
361 0.22
362 0.24
363 0.23
364 0.27
365 0.33
366 0.35
367 0.41
368 0.41
369 0.51
370 0.59
371 0.67
372 0.71
373 0.76
374 0.83
375 0.88
376 0.87
377 0.86
378 0.79
379 0.73
380 0.67
381 0.57
382 0.48
383 0.37
384 0.29
385 0.2
386 0.16
387 0.12
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.06
395 0.07
396 0.08
397 0.07
398 0.07
399 0.08
400 0.08
401 0.09
402 0.12
403 0.12
404 0.18
405 0.29
406 0.39
407 0.47
408 0.56
409 0.65
410 0.73
411 0.83
412 0.88
413 0.89
414 0.9
415 0.91
416 0.91
417 0.91
418 0.9
419 0.85
420 0.78
421 0.7
422 0.64
423 0.56
424 0.49
425 0.42
426 0.33
427 0.29
428 0.25
429 0.23
430 0.16
431 0.13