Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0VD58

Protein Details
Accession G0VD58    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
457-478IEQWRVNKEKRKQQQFMTNNNSHydrophilic
538-582GGSNGGTPKPKKPRKTKKKAEGETAGAKKKRAPAKKQSGKSTPSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
534-578KRNGGGSNGGTPKPKKPRKTKKKAEGETAGAKKKRAPAKKQSGKS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
KEGG ncs:NCAS_0C04300  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MNTSPEMSSDGHPFGIPVNSPSMKGSPPSTAGGGPVNVGSNAVRTTTLTPQQQQQQQLLQKQRMLLQQQQQQQRHQQSMQNFEAQFYQLLMTINKKPKRLYNFVEDSDAILKKYEQYRPSFEFHIYENNYKICAPANTRLQQQQKNPEISSDGLVLNKNNETLKEFLEYVARGKIPEAIMEVLKDCNIQFYEGNLILQVYDHTNTVDVTTAKDVKVENNQSPPARSMSPSNARATSPAAPATFKRPRVYRTLLRPNDLTTYYDMMAYADHAKFSDTIYQQFESEILTLTKRNLKLDVPLNPYEHRDKLEDELFAMPQWDNGELKHHHREECTVEGSKGQVKHVEEHGELPQHSSNYEQLMLIMNDRTITTTNSTFAITLAKNATKLLNNANGNNSSSSNNTSSNSKGNQGGTVKNSSNGNSSSGTQVAIAAAAAAAAAAAGATVGNENNQFSRLKFIEQWRVNKEKRKQQQFMTNNNSNTNSAHMNVNNVRTGSATPFSSKISMGAPLSAQQQFLQQQQALEQQQQQQQGKGTKRNGGGSNGGTPKPKKPRKTKKKAEGETAGAKKKRAPAKKQSGKSTPSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.19
4 0.16
5 0.22
6 0.22
7 0.23
8 0.26
9 0.27
10 0.25
11 0.27
12 0.28
13 0.25
14 0.27
15 0.29
16 0.28
17 0.25
18 0.26
19 0.25
20 0.23
21 0.19
22 0.17
23 0.15
24 0.13
25 0.14
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.12
30 0.12
31 0.12
32 0.16
33 0.22
34 0.29
35 0.33
36 0.36
37 0.42
38 0.5
39 0.54
40 0.55
41 0.53
42 0.54
43 0.55
44 0.6
45 0.63
46 0.59
47 0.56
48 0.53
49 0.54
50 0.53
51 0.52
52 0.51
53 0.51
54 0.53
55 0.59
56 0.66
57 0.65
58 0.65
59 0.7
60 0.69
61 0.67
62 0.65
63 0.62
64 0.59
65 0.62
66 0.59
67 0.56
68 0.48
69 0.42
70 0.39
71 0.35
72 0.28
73 0.2
74 0.17
75 0.12
76 0.14
77 0.14
78 0.17
79 0.24
80 0.33
81 0.37
82 0.41
83 0.43
84 0.5
85 0.57
86 0.61
87 0.59
88 0.59
89 0.61
90 0.59
91 0.59
92 0.51
93 0.44
94 0.41
95 0.36
96 0.26
97 0.2
98 0.18
99 0.2
100 0.26
101 0.31
102 0.32
103 0.37
104 0.44
105 0.47
106 0.51
107 0.47
108 0.43
109 0.37
110 0.33
111 0.37
112 0.34
113 0.33
114 0.33
115 0.31
116 0.3
117 0.28
118 0.28
119 0.21
120 0.21
121 0.22
122 0.27
123 0.35
124 0.37
125 0.41
126 0.49
127 0.54
128 0.57
129 0.6
130 0.62
131 0.61
132 0.63
133 0.59
134 0.52
135 0.46
136 0.4
137 0.34
138 0.26
139 0.2
140 0.16
141 0.17
142 0.16
143 0.16
144 0.15
145 0.16
146 0.14
147 0.15
148 0.16
149 0.16
150 0.17
151 0.17
152 0.17
153 0.15
154 0.18
155 0.17
156 0.16
157 0.18
158 0.16
159 0.14
160 0.14
161 0.17
162 0.15
163 0.15
164 0.15
165 0.13
166 0.13
167 0.14
168 0.14
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.08
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.1
177 0.11
178 0.15
179 0.15
180 0.15
181 0.12
182 0.11
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.1
194 0.08
195 0.09
196 0.12
197 0.14
198 0.13
199 0.15
200 0.15
201 0.16
202 0.24
203 0.27
204 0.27
205 0.3
206 0.34
207 0.33
208 0.35
209 0.33
210 0.28
211 0.24
212 0.22
213 0.21
214 0.25
215 0.31
216 0.33
217 0.34
218 0.33
219 0.32
220 0.32
221 0.31
222 0.26
223 0.21
224 0.19
225 0.17
226 0.17
227 0.18
228 0.25
229 0.28
230 0.29
231 0.32
232 0.33
233 0.36
234 0.42
235 0.48
236 0.46
237 0.5
238 0.57
239 0.55
240 0.55
241 0.53
242 0.47
243 0.43
244 0.37
245 0.28
246 0.19
247 0.18
248 0.16
249 0.15
250 0.13
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.11
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.15
262 0.12
263 0.15
264 0.17
265 0.18
266 0.17
267 0.17
268 0.17
269 0.11
270 0.1
271 0.08
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.09
276 0.14
277 0.14
278 0.15
279 0.16
280 0.16
281 0.2
282 0.24
283 0.3
284 0.3
285 0.32
286 0.33
287 0.32
288 0.34
289 0.33
290 0.29
291 0.24
292 0.2
293 0.19
294 0.21
295 0.22
296 0.19
297 0.16
298 0.16
299 0.14
300 0.13
301 0.12
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.13
309 0.14
310 0.19
311 0.26
312 0.28
313 0.29
314 0.29
315 0.32
316 0.3
317 0.31
318 0.29
319 0.23
320 0.21
321 0.2
322 0.2
323 0.21
324 0.18
325 0.16
326 0.17
327 0.17
328 0.2
329 0.22
330 0.24
331 0.21
332 0.22
333 0.23
334 0.22
335 0.2
336 0.2
337 0.19
338 0.16
339 0.15
340 0.15
341 0.14
342 0.13
343 0.13
344 0.11
345 0.09
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.1
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.09
354 0.08
355 0.09
356 0.11
357 0.11
358 0.12
359 0.13
360 0.13
361 0.12
362 0.11
363 0.14
364 0.11
365 0.13
366 0.15
367 0.14
368 0.14
369 0.15
370 0.17
371 0.15
372 0.17
373 0.19
374 0.24
375 0.25
376 0.26
377 0.29
378 0.28
379 0.28
380 0.27
381 0.24
382 0.18
383 0.18
384 0.2
385 0.19
386 0.19
387 0.19
388 0.2
389 0.21
390 0.25
391 0.25
392 0.24
393 0.25
394 0.24
395 0.28
396 0.28
397 0.3
398 0.28
399 0.31
400 0.29
401 0.28
402 0.29
403 0.25
404 0.26
405 0.24
406 0.23
407 0.19
408 0.2
409 0.19
410 0.18
411 0.17
412 0.13
413 0.12
414 0.09
415 0.08
416 0.07
417 0.04
418 0.04
419 0.03
420 0.03
421 0.02
422 0.02
423 0.02
424 0.02
425 0.01
426 0.01
427 0.01
428 0.02
429 0.02
430 0.03
431 0.03
432 0.05
433 0.06
434 0.07
435 0.08
436 0.1
437 0.11
438 0.11
439 0.18
440 0.18
441 0.21
442 0.26
443 0.33
444 0.41
445 0.47
446 0.54
447 0.55
448 0.63
449 0.66
450 0.69
451 0.71
452 0.71
453 0.75
454 0.78
455 0.77
456 0.76
457 0.8
458 0.8
459 0.81
460 0.8
461 0.77
462 0.69
463 0.66
464 0.61
465 0.51
466 0.43
467 0.36
468 0.28
469 0.22
470 0.24
471 0.21
472 0.26
473 0.29
474 0.31
475 0.3
476 0.28
477 0.27
478 0.23
479 0.25
480 0.21
481 0.2
482 0.19
483 0.19
484 0.2
485 0.22
486 0.22
487 0.21
488 0.18
489 0.17
490 0.19
491 0.17
492 0.17
493 0.16
494 0.17
495 0.21
496 0.21
497 0.2
498 0.17
499 0.22
500 0.24
501 0.26
502 0.29
503 0.26
504 0.25
505 0.27
506 0.34
507 0.31
508 0.33
509 0.35
510 0.36
511 0.4
512 0.48
513 0.48
514 0.44
515 0.48
516 0.52
517 0.55
518 0.57
519 0.57
520 0.56
521 0.58
522 0.62
523 0.59
524 0.56
525 0.53
526 0.47
527 0.5
528 0.48
529 0.46
530 0.45
531 0.45
532 0.5
533 0.55
534 0.62
535 0.64
536 0.7
537 0.79
538 0.84
539 0.92
540 0.94
541 0.94
542 0.96
543 0.93
544 0.92
545 0.88
546 0.84
547 0.82
548 0.79
549 0.78
550 0.69
551 0.63
552 0.58
553 0.59
554 0.62
555 0.62
556 0.64
557 0.66
558 0.74
559 0.83
560 0.87
561 0.89
562 0.88