FuNGI

A0A1L9T9C7

Protein Details

Accession

A0A1L9T9C7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
463-482	WYNDQIREKRRKQRDFEEKG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
471-476	KRRKQR
485-490	IKGRRR

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MPSLSTVPQRRQRSDEDDETDASATASSSPAPTHSSNSKRPRIEQAGSESGVSEASNIDTAAETEDENDSAEDDSATATQANSQRQSQAPAKQSRSAVNGVQNQVSQEGYKPGAIVRIKVTDFVTYTSAEFFPGPKLNMVIGPNGTGKSTLVCAICLGLGWGPQHLGRAKDIGEFVKHGCREATIEIELAGGPNHQRNPVISRTIKREGNKSTFTLNGRPSGMREVLRLAHSFAIQVDNLCQFLPQDKVSEFAALTPIELLNSTQRAAAGAEMVELHENLKSLRAEQKSLQSNNEADRDLLSNLVDRQEMQRADVERVRQRAQIKKQIEVLEMVRPVVHYKELHRKFNAAKQERRDCQRELEELEAELEPVMRSVKEKEGYCKQIDDVIKHKQRKFEAAERAATDIGKKVEQYEQSMKDMEAEIEAEKKSSVNYRQEGIKITQTINRLNRQLNEEPIEFDANWYNDQIREKRRKQRDFEEKGDEIKGRRRPLQEKLAETTRLLNQAEQQLQGIDSQAGQQERKLQQASQDSYKAYKWLLNNQDKFEQEVFGPPIVTCSIKDSRYTNHVESLLQRTDYTAFTVQSRNDFRTLQRHLNRDMNLHDISIRTSSVRLRNLQAPLHDDELRNMGFQGWAKDFLNGPEPVLAMLCSENRLHQTPVSLRDISDQTYTALENSSITSWVAGKQAYQIVRRREYGPGASSTRVRQVRPAKVWTSQPVDTSAKGTLQARIQELKDDIKIVKEAIESDRASLTELGREYEKAQRERDELEREKAEKQTAYTNFRAIPERIRQQEAKKKSNDDYFATIRAKVMDIRNKQDQLSIEKAEAVIEYADAVETLRKLEEEVIKLTMWKVEGISDLEILKGRTSDHNERLKAKAEEVKQKSQEVAEMAQETKRVGNEARKVAAHLKENPELEEMGKQIYDSHTVTELEAEIDSEKARLELTHGGPSNVVQEFEERERQIERLRGKLTDFQNKLADFNHAINEIRGKWEPRLDAIIKSVSDAFSDSFARIGCAGQVSLDKAGEELGPDGQPSGNEFDQWSIQVHVKFREHESLSLLDSHRQSGGERAVSTIFYLMALQSLSASPFRVVDEINQGMDPRNERMVHERLVDIACAPSEDGSGGGQYFLITPKLLSGLVYKPGMRVLCIVSGEHMPGDHNLIDFGTAVKNMRAITARSKGKERAIDGTASRSTVAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.69
3	0.65
4	0.59
5	0.55
6	0.5
7	0.43
8	0.34
9	0.26
10	0.17
11	0.12
12	0.1
13	0.09
14	0.08
15	0.09
16	0.1
17	0.12
18	0.16
19	0.18
20	0.23
21	0.32
22	0.4
23	0.49
24	0.58
25	0.66
26	0.66
27	0.7
28	0.74
29	0.73
30	0.69
31	0.66
32	0.64
33	0.61
34	0.56
35	0.51
36	0.41
37	0.33
38	0.28
39	0.22
40	0.14
41	0.08
42	0.08
43	0.08
44	0.08
45	0.08
46	0.08
47	0.09
48	0.1
49	0.1
50	0.09
51	0.1
52	0.12
53	0.11
54	0.12
55	0.11
56	0.1
57	0.1
58	0.1
59	0.09
60	0.08
61	0.09
62	0.08
63	0.09
64	0.08
65	0.07
66	0.13
67	0.18
68	0.25
69	0.27
70	0.29
71	0.34
72	0.35
73	0.43
74	0.43
75	0.47
76	0.5
77	0.55
78	0.58
79	0.59
80	0.61
81	0.59
82	0.57
83	0.52
84	0.48
85	0.47
86	0.49
87	0.46
88	0.45
89	0.4
90	0.37
91	0.34
92	0.3
93	0.22
94	0.17
95	0.18
96	0.17
97	0.17
98	0.16
99	0.16
100	0.23
101	0.23
102	0.23
103	0.23
104	0.28
105	0.28
106	0.3
107	0.3
108	0.26
109	0.26
110	0.25
111	0.23
112	0.18
113	0.19
114	0.19
115	0.18
116	0.16
117	0.15
118	0.14
119	0.17
120	0.21
121	0.21
122	0.2
123	0.21
124	0.21
125	0.24
126	0.25
127	0.23
128	0.19
129	0.2
130	0.21
131	0.2
132	0.19
133	0.16
134	0.15
135	0.13
136	0.13
137	0.15
138	0.14
139	0.13
140	0.13
141	0.13
142	0.13
143	0.11
144	0.1
145	0.07
146	0.09
147	0.09
148	0.1
149	0.1
150	0.11
151	0.16
152	0.18
153	0.19
154	0.19
155	0.21
156	0.21
157	0.23
158	0.25
159	0.23
160	0.22
161	0.22
162	0.23
163	0.29
164	0.28
165	0.26
166	0.24
167	0.22
168	0.23
169	0.23
170	0.24
171	0.17
172	0.17
173	0.16
174	0.16
175	0.14
176	0.12
177	0.1
178	0.08
179	0.09
180	0.14
181	0.16
182	0.17
183	0.19
184	0.21
185	0.26
186	0.3
187	0.36
188	0.37
189	0.41
190	0.47
191	0.54
192	0.57
193	0.56
194	0.59
195	0.59
196	0.6
197	0.59
198	0.53
199	0.48
200	0.48
201	0.48
202	0.46
203	0.41
204	0.37
205	0.36
206	0.35
207	0.34
208	0.34
209	0.34
210	0.28
211	0.27
212	0.26
213	0.26
214	0.28
215	0.27
216	0.23
217	0.21
218	0.2
219	0.19
220	0.16
221	0.15
222	0.13
223	0.13
224	0.13
225	0.12
226	0.13
227	0.12
228	0.11
229	0.09
230	0.12
231	0.15
232	0.14
233	0.16
234	0.15
235	0.17
236	0.18
237	0.19
238	0.16
239	0.13
240	0.15
241	0.12
242	0.12
243	0.11
244	0.1
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.1
249	0.12
250	0.12
251	0.11
252	0.11
253	0.12
254	0.12
255	0.11
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.11
268	0.11
269	0.13
270	0.21
271	0.23
272	0.26
273	0.29
274	0.37
275	0.42
276	0.44
277	0.44
278	0.4
279	0.4
280	0.41
281	0.4
282	0.32
283	0.24
284	0.23
285	0.22
286	0.18
287	0.16
288	0.13
289	0.12
290	0.12
291	0.13
292	0.12
293	0.11
294	0.13
295	0.19
296	0.19
297	0.18
298	0.22
299	0.22
300	0.26
301	0.29
302	0.33
303	0.32
304	0.37
305	0.38
306	0.38
307	0.43
308	0.48
309	0.54
310	0.58
311	0.55
312	0.54
313	0.57
314	0.55
315	0.49
316	0.43
317	0.36
318	0.3
319	0.28
320	0.24
321	0.18
322	0.16
323	0.16
324	0.14
325	0.16
326	0.13
327	0.19
328	0.3
329	0.36
330	0.42
331	0.42
332	0.46
333	0.47
334	0.52
335	0.57
336	0.54
337	0.55
338	0.58
339	0.66
340	0.68
341	0.7
342	0.69
343	0.6
344	0.58
345	0.56
346	0.51
347	0.43
348	0.4
349	0.33
350	0.28
351	0.28
352	0.21
353	0.16
354	0.12
355	0.1
356	0.07
357	0.06
358	0.07
359	0.06
360	0.07
361	0.1
362	0.16
363	0.21
364	0.23
365	0.29
366	0.36
367	0.42
368	0.42
369	0.4
370	0.35
371	0.36
372	0.37
373	0.33
374	0.3
375	0.35
376	0.42
377	0.49
378	0.51
379	0.51
380	0.51
381	0.56
382	0.57
383	0.56
384	0.57
385	0.53
386	0.54
387	0.48
388	0.47
389	0.4
390	0.33
391	0.25
392	0.19
393	0.16
394	0.14
395	0.13
396	0.13
397	0.17
398	0.19
399	0.24
400	0.28
401	0.29
402	0.3
403	0.31
404	0.29
405	0.25
406	0.24
407	0.18
408	0.11
409	0.1
410	0.08
411	0.1
412	0.1
413	0.09
414	0.08
415	0.08
416	0.09
417	0.14
418	0.21
419	0.25
420	0.27
421	0.29
422	0.32
423	0.34
424	0.36
425	0.32
426	0.29
427	0.24
428	0.24
429	0.25
430	0.25
431	0.3
432	0.32
433	0.35
434	0.35
435	0.36
436	0.37
437	0.4
438	0.4
439	0.37
440	0.36
441	0.31
442	0.28
443	0.27
444	0.26
445	0.19
446	0.18
447	0.17
448	0.14
449	0.14
450	0.13
451	0.13
452	0.13
453	0.18
454	0.23
455	0.29
456	0.39
457	0.47
458	0.56
459	0.67
460	0.73
461	0.75
462	0.79
463	0.81
464	0.78
465	0.76
466	0.73
467	0.64
468	0.57
469	0.53
470	0.44
471	0.35
472	0.35
473	0.35
474	0.32
475	0.37
476	0.41
477	0.44
478	0.49
479	0.57
480	0.55
481	0.52
482	0.52
483	0.51
484	0.45
485	0.4
486	0.36
487	0.27
488	0.26
489	0.23
490	0.19
491	0.18
492	0.22
493	0.22
494	0.2
495	0.18
496	0.14
497	0.14
498	0.14
499	0.12
500	0.07
501	0.05
502	0.06
503	0.08
504	0.1
505	0.1
506	0.1
507	0.18
508	0.19
509	0.23
510	0.23
511	0.21
512	0.26
513	0.33
514	0.35
515	0.31
516	0.31
517	0.28
518	0.29
519	0.28
520	0.24
521	0.17
522	0.18
523	0.16
524	0.22
525	0.31
526	0.38
527	0.41
528	0.42
529	0.45
530	0.42
531	0.44
532	0.36
533	0.27
534	0.18
535	0.19
536	0.17
537	0.14
538	0.14
539	0.1
540	0.11
541	0.11
542	0.11
543	0.08
544	0.12
545	0.15
546	0.15
547	0.18
548	0.18
549	0.2
550	0.25
551	0.29
552	0.25
553	0.24
554	0.24
555	0.23
556	0.24
557	0.27
558	0.22
559	0.18
560	0.17
561	0.15
562	0.16
563	0.15
564	0.15
565	0.11
566	0.11
567	0.12
568	0.15
569	0.14
570	0.18
571	0.2
572	0.2
573	0.21
574	0.21
575	0.22
576	0.27
577	0.31
578	0.35
579	0.38
580	0.4
581	0.41
582	0.46
583	0.45
584	0.39
585	0.36
586	0.31
587	0.26
588	0.22
589	0.19
590	0.14
591	0.14
592	0.12
593	0.11
594	0.07
595	0.08
596	0.12
597	0.16
598	0.19
599	0.21
600	0.23
601	0.27
602	0.3
603	0.3
604	0.27
605	0.26
606	0.24
607	0.26
608	0.25
609	0.2
610	0.18
611	0.19
612	0.18
613	0.14
614	0.12
615	0.09
616	0.09
617	0.1
618	0.11
619	0.1
620	0.12
621	0.12
622	0.13
623	0.13
624	0.13
625	0.17
626	0.14
627	0.13
628	0.11
629	0.11
630	0.1
631	0.1
632	0.09
633	0.05
634	0.06
635	0.06
636	0.06
637	0.07
638	0.08
639	0.1
640	0.12
641	0.13
642	0.12
643	0.16
644	0.17
645	0.21
646	0.24
647	0.22
648	0.2
649	0.23
650	0.23
651	0.21
652	0.19
653	0.15
654	0.12
655	0.12
656	0.12
657	0.09
658	0.08
659	0.07
660	0.06
661	0.07
662	0.06
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.06
667	0.07
668	0.08
669	0.08
670	0.08
671	0.09
672	0.13
673	0.16
674	0.21
675	0.25
676	0.3
677	0.33
678	0.36
679	0.36
680	0.35
681	0.34
682	0.32
683	0.28
684	0.26
685	0.25
686	0.24
687	0.24
688	0.23
689	0.28
690	0.28
691	0.26
692	0.3
693	0.37
694	0.43
695	0.46
696	0.5
697	0.45
698	0.46
699	0.49
700	0.46
701	0.42
702	0.35
703	0.31
704	0.31
705	0.3
706	0.27
707	0.25
708	0.21
709	0.16
710	0.17
711	0.17
712	0.15
713	0.16
714	0.18
715	0.18
716	0.21
717	0.2
718	0.21
719	0.22
720	0.21
721	0.19
722	0.18
723	0.16
724	0.14
725	0.15
726	0.13
727	0.12
728	0.11
729	0.12
730	0.12
731	0.17
732	0.15
733	0.16
734	0.16
735	0.15
736	0.16
737	0.16
738	0.14
739	0.12
740	0.12
741	0.12
742	0.12
743	0.13
744	0.14
745	0.18
746	0.25
747	0.26
748	0.28
749	0.3
750	0.32
751	0.35
752	0.38
753	0.41
754	0.38
755	0.39
756	0.4
757	0.39
758	0.4
759	0.39
760	0.36
761	0.28
762	0.26
763	0.29
764	0.31
765	0.35
766	0.33
767	0.33
768	0.32
769	0.33
770	0.36
771	0.28
772	0.29
773	0.3
774	0.36
775	0.37
776	0.4
777	0.43
778	0.48
779	0.56
780	0.59
781	0.6
782	0.57
783	0.59
784	0.6
785	0.62
786	0.57
787	0.51
788	0.48
789	0.41
790	0.42
791	0.38
792	0.33
793	0.27
794	0.24
795	0.21
796	0.2
797	0.25
798	0.28
799	0.32
800	0.37
801	0.43
802	0.44
803	0.43
804	0.42
805	0.38
806	0.35
807	0.35
808	0.31
809	0.25
810	0.23
811	0.23
812	0.2
813	0.17
814	0.11
815	0.07
816	0.05
817	0.05
818	0.04
819	0.04
820	0.04
821	0.04
822	0.05
823	0.05
824	0.06
825	0.06
826	0.06
827	0.07
828	0.11
829	0.15
830	0.16
831	0.18
832	0.19
833	0.19
834	0.19
835	0.19
836	0.16
837	0.13
838	0.11
839	0.09
840	0.08
841	0.1
842	0.11
843	0.12
844	0.11
845	0.11
846	0.11
847	0.12
848	0.12
849	0.1
850	0.09
851	0.1
852	0.14
853	0.22
854	0.3
855	0.37
856	0.45
857	0.48
858	0.51
859	0.52
860	0.53
861	0.47
862	0.43
863	0.41
864	0.4
865	0.47
866	0.5
867	0.55
868	0.51
869	0.51
870	0.49
871	0.42
872	0.38
873	0.3
874	0.25
875	0.19
876	0.18
877	0.18
878	0.17
879	0.18
880	0.16
881	0.15
882	0.14
883	0.14
884	0.16
885	0.23
886	0.29
887	0.33
888	0.35
889	0.33
890	0.36
891	0.4
892	0.41
893	0.38
894	0.38
895	0.39
896	0.41
897	0.42
898	0.41
899	0.36
900	0.31
901	0.27
902	0.23
903	0.17
904	0.13
905	0.12
906	0.11
907	0.11
908	0.12
909	0.15
910	0.13
911	0.14
912	0.16
913	0.16
914	0.16
915	0.15
916	0.14
917	0.11
918	0.1
919	0.09
920	0.07
921	0.08
922	0.08
923	0.07
924	0.07
925	0.06
926	0.07
927	0.06
928	0.09
929	0.16
930	0.18
931	0.25
932	0.26
933	0.26
934	0.26
935	0.26
936	0.27
937	0.21
938	0.19
939	0.12
940	0.13
941	0.17
942	0.2
943	0.26
944	0.22
945	0.24
946	0.25
947	0.27
948	0.3
949	0.33
950	0.33
951	0.34
952	0.37
953	0.37
954	0.38
955	0.44
956	0.46
957	0.49
958	0.47
959	0.44
960	0.47
961	0.46
962	0.44
963	0.37
964	0.34
965	0.26
966	0.26
967	0.24
968	0.2
969	0.21
970	0.2
971	0.23
972	0.2
973	0.22
974	0.24
975	0.24
976	0.26
977	0.31
978	0.31
979	0.3
980	0.36
981	0.34
982	0.32
983	0.32
984	0.32
985	0.27
986	0.27
987	0.25
988	0.18
989	0.17
990	0.16
991	0.14
992	0.13
993	0.14
994	0.12
995	0.12
996	0.12
997	0.13
998	0.12
999	0.11
1000	0.1
1001	0.1
1002	0.1
1003	0.1
1004	0.11
1005	0.12
1006	0.13
1007	0.13
1008	0.12
1009	0.11
1010	0.12
1011	0.11
1012	0.1
1013	0.09
1014	0.09
1015	0.09
1016	0.09
1017	0.1
1018	0.1
1019	0.1
1020	0.12
1021	0.16
1022	0.14
1023	0.15
1024	0.16
1025	0.17
1026	0.18
1027	0.19
1028	0.18
1029	0.15
1030	0.19
1031	0.22
1032	0.25
1033	0.29
1034	0.32
1035	0.34
1036	0.36
1037	0.43
1038	0.4
1039	0.39
1040	0.38
1041	0.34
1042	0.31
1043	0.33
1044	0.3
1045	0.27
1046	0.26
1047	0.26
1048	0.24
1049	0.23
1050	0.22
1051	0.23
1052	0.28
1053	0.26
1054	0.25
1055	0.25
1056	0.25
1057	0.24
1058	0.24
1059	0.19
1060	0.13
1061	0.09
1062	0.09
1063	0.07
1064	0.07
1065	0.07
1066	0.06
1067	0.07
1068	0.07
1069	0.09
1070	0.09
1071	0.11
1072	0.1
1073	0.11
1074	0.13
1075	0.13
1076	0.13
1077	0.15
1078	0.22
1079	0.22
1080	0.23
1081	0.23
1082	0.22
1083	0.24
1084	0.27
1085	0.27
1086	0.22
1087	0.27
1088	0.27
1089	0.29
1090	0.35
1091	0.38
1092	0.37
1093	0.37
1094	0.34
1095	0.31
1096	0.31
1097	0.29
1098	0.22
1099	0.18
1100	0.15
1101	0.13
1102	0.13
1103	0.1
1104	0.09
1105	0.09
1106	0.09
1107	0.08
1108	0.09
1109	0.08
1110	0.08
1111	0.07
1112	0.07
1113	0.08
1114	0.1
1115	0.1
1116	0.1
1117	0.09
1118	0.11
1119	0.12
1120	0.12
1121	0.12
1122	0.14
1123	0.16
1124	0.21
1125	0.24
1126	0.24
1127	0.23
1128	0.28
1129	0.27
1130	0.25
1131	0.24
1132	0.21
1133	0.22
1134	0.23
1135	0.22
1136	0.2
1137	0.21
1138	0.21
1139	0.18
1140	0.16
1141	0.13
1142	0.13
1143	0.17
1144	0.15
1145	0.14
1146	0.13
1147	0.13
1148	0.13
1149	0.12
1150	0.12
1151	0.1
1152	0.11
1153	0.13
1154	0.13
1155	0.16
1156	0.15
1157	0.19
1158	0.21
1159	0.23
1160	0.29
1161	0.37
1162	0.45
1163	0.47
1164	0.54
1165	0.56
1166	0.61
1167	0.64
1168	0.6
1169	0.57
1170	0.52
1171	0.52
1172	0.47
1173	0.47
1174	0.41
1175	0.35

A0A1L9T9C7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer