FuNGI

A0A1L9T0M4

Protein Details

Accession

A0A1L9T0M4

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-49	QPLRIRRPRVADPLVRPKRKTATKGPPGNG	Hydrophilic
512-531	GTDTSRKKGKNKPSTSQSST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-50	RRPRVADPLVRPKRKTATKGPPGNGQ
404-425	EKREKEARRVLGKGVRKALQKR

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MTTPTNNPNPQMPTGSSGTQPLRIRRPRVADPLVRPKRKTATKGPPGNGQKLRSFPTRPAPSNAQPDRPNIPPAKSEFATNGFSGPLLSQSYIDYPVVITKRAIKEGLKHHVARFASKKVVDPRDESQFTRPVRLQRRDPRSRIHELHTDKGPGGQRLSSETSNQVDDLEREEMEARKAAREKERADNLAQIAPSIGSAPKRTNVPKQKTQQVSKTDMTPEEIARTRIKYEEALPWHLEDFDNKNVWVGNYEAALSETHAIFILESTGKMTMIPVEKWYRFNAKNQFKTLTIEEAEKFMAKKIKDPRWFMEKQQEQAQRKELEQFAKQRKVYAGKQGTPATEGLEADEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEDAKAAEKRIKQDQLKANVFDLKDEKEYEEEELKEKREKEARRVLGKGVRKALQKREKNFDYSSGSDANPYTDEESSDETDAEKSKEEERKVEEEKNKKDPATPSKGNTTPSGRLKHSDTSKKAAIGVSRKRLGSPNVSDASGTDTSRKKGKNKPSTSQSSTQPGSRPMTPVASSVPTNKKRVRSTFPGAGSASDVDGAVGSGGEVSESGKSKKLKLNPPSVVSQGETPQRSRAGSPTSVTGRNLSGSRASSPESLKGSHVTGHNRVSTPGPSTTQSFPSPAEIHAAIPPNGILSTDLLKIFRPRIGESRENHRKFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGPWREA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.38
3	0.32
4	0.34
5	0.33
6	0.36
7	0.4
8	0.43
9	0.49
10	0.56
11	0.61
12	0.63
13	0.68
14	0.69
15	0.73
16	0.74
17	0.72
18	0.73
19	0.78
20	0.8
21	0.8
22	0.74
23	0.72
24	0.74
25	0.74
26	0.73
27	0.72
28	0.73
29	0.76
30	0.83
31	0.79
32	0.79
33	0.77
34	0.79
35	0.75
36	0.68
37	0.63
38	0.59
39	0.61
40	0.58
41	0.54
42	0.51
43	0.55
44	0.6
45	0.58
46	0.6
47	0.63
48	0.63
49	0.7
50	0.69
51	0.67
52	0.61
53	0.62
54	0.6
55	0.55
56	0.55
57	0.49
58	0.47
59	0.44
60	0.45
61	0.48
62	0.43
63	0.42
64	0.37
65	0.37
66	0.36
67	0.31
68	0.27
69	0.19
70	0.19
71	0.17
72	0.14
73	0.12
74	0.11
75	0.11
76	0.11
77	0.12
78	0.14
79	0.16
80	0.16
81	0.13
82	0.12
83	0.18
84	0.19
85	0.18
86	0.18
87	0.23
88	0.27
89	0.3
90	0.33
91	0.3
92	0.36
93	0.44
94	0.51
95	0.51
96	0.5
97	0.49
98	0.52
99	0.51
100	0.51
101	0.47
102	0.44
103	0.43
104	0.41
105	0.46
106	0.49
107	0.56
108	0.52
109	0.51
110	0.5
111	0.53
112	0.55
113	0.5
114	0.46
115	0.46
116	0.43
117	0.45
118	0.45
119	0.45
120	0.52
121	0.58
122	0.63
123	0.65
124	0.75
125	0.79
126	0.79
127	0.79
128	0.77
129	0.78
130	0.72
131	0.68
132	0.66
133	0.62
134	0.62
135	0.56
136	0.51
137	0.41
138	0.42
139	0.41
140	0.34
141	0.31
142	0.26
143	0.23
144	0.26
145	0.31
146	0.26
147	0.25
148	0.25
149	0.25
150	0.25
151	0.24
152	0.2
153	0.17
154	0.16
155	0.17
156	0.15
157	0.13
158	0.13
159	0.15
160	0.15
161	0.16
162	0.18
163	0.15
164	0.19
165	0.23
166	0.28
167	0.34
168	0.4
169	0.43
170	0.49
171	0.55
172	0.53
173	0.51
174	0.49
175	0.43
176	0.38
177	0.34
178	0.24
179	0.18
180	0.15
181	0.13
182	0.1
183	0.1
184	0.09
185	0.12
186	0.14
187	0.16
188	0.22
189	0.27
190	0.36
191	0.45
192	0.52
193	0.58
194	0.64
195	0.71
196	0.74
197	0.76
198	0.74
199	0.69
200	0.68
201	0.6
202	0.56
203	0.49
204	0.41
205	0.38
206	0.32
207	0.26
208	0.24
209	0.24
210	0.23
211	0.23
212	0.24
213	0.22
214	0.21
215	0.22
216	0.19
217	0.2
218	0.25
219	0.26
220	0.28
221	0.27
222	0.27
223	0.26
224	0.24
225	0.22
226	0.18
227	0.18
228	0.19
229	0.19
230	0.18
231	0.18
232	0.18
233	0.18
234	0.16
235	0.13
236	0.09
237	0.08
238	0.09
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.06
249	0.06
250	0.07
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.07
258	0.08
259	0.1
260	0.11
261	0.14
262	0.2
263	0.21
264	0.23
265	0.26
266	0.31
267	0.31
268	0.38
269	0.44
270	0.49
271	0.53
272	0.54
273	0.54
274	0.47
275	0.48
276	0.42
277	0.35
278	0.26
279	0.23
280	0.2
281	0.18
282	0.17
283	0.15
284	0.14
285	0.13
286	0.17
287	0.15
288	0.21
289	0.29
290	0.38
291	0.45
292	0.49
293	0.51
294	0.54
295	0.56
296	0.53
297	0.54
298	0.48
299	0.44
300	0.48
301	0.52
302	0.47
303	0.48
304	0.51
305	0.42
306	0.39
307	0.41
308	0.35
309	0.31
310	0.32
311	0.38
312	0.4
313	0.45
314	0.45
315	0.42
316	0.42
317	0.45
318	0.43
319	0.44
320	0.42
321	0.37
322	0.42
323	0.41
324	0.38
325	0.33
326	0.31
327	0.22
328	0.17
329	0.14
330	0.09
331	0.09
332	0.08
333	0.07
334	0.07
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.07
347	0.08
348	0.09
349	0.08
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.06
355	0.05
356	0.04
357	0.05
358	0.05
359	0.06
360	0.06
361	0.07
362	0.11
363	0.13
364	0.17
365	0.23
366	0.3
367	0.32
368	0.4
369	0.46
370	0.5
371	0.52
372	0.49
373	0.44
374	0.4
375	0.38
376	0.31
377	0.26
378	0.19
379	0.17
380	0.17
381	0.16
382	0.14
383	0.14
384	0.15
385	0.16
386	0.15
387	0.16
388	0.18
389	0.19
390	0.23
391	0.23
392	0.26
393	0.31
394	0.33
395	0.39
396	0.46
397	0.51
398	0.51
399	0.52
400	0.51
401	0.51
402	0.53
403	0.49
404	0.44
405	0.42
406	0.43
407	0.47
408	0.53
409	0.56
410	0.58
411	0.59
412	0.64
413	0.62
414	0.61
415	0.56
416	0.51
417	0.46
418	0.4
419	0.37
420	0.3
421	0.27
422	0.23
423	0.22
424	0.18
425	0.14
426	0.13
427	0.12
428	0.1
429	0.11
430	0.11
431	0.13
432	0.14
433	0.13
434	0.13
435	0.11
436	0.12
437	0.13
438	0.13
439	0.11
440	0.11
441	0.18
442	0.24
443	0.25
444	0.28
445	0.31
446	0.37
447	0.4
448	0.47
449	0.48
450	0.52
451	0.56
452	0.6
453	0.59
454	0.53
455	0.54
456	0.54
457	0.55
458	0.55
459	0.53
460	0.48
461	0.52
462	0.54
463	0.51
464	0.47
465	0.43
466	0.41
467	0.43
468	0.45
469	0.4
470	0.4
471	0.42
472	0.45
473	0.49
474	0.51
475	0.48
476	0.49
477	0.5
478	0.48
479	0.46
480	0.4
481	0.37
482	0.37
483	0.41
484	0.42
485	0.44
486	0.43
487	0.43
488	0.46
489	0.44
490	0.43
491	0.39
492	0.39
493	0.36
494	0.36
495	0.34
496	0.3
497	0.31
498	0.25
499	0.21
500	0.2
501	0.21
502	0.24
503	0.31
504	0.37
505	0.39
506	0.46
507	0.57
508	0.62
509	0.68
510	0.74
511	0.76
512	0.8
513	0.78
514	0.75
515	0.68
516	0.65
517	0.59
518	0.53
519	0.47
520	0.43
521	0.4
522	0.36
523	0.34
524	0.29
525	0.31
526	0.28
527	0.26
528	0.23
529	0.22
530	0.22
531	0.27
532	0.35
533	0.37
534	0.44
535	0.48
536	0.53
537	0.59
538	0.65
539	0.66
540	0.64
541	0.67
542	0.67
543	0.63
544	0.59
545	0.52
546	0.45
547	0.38
548	0.3
549	0.22
550	0.14
551	0.12
552	0.08
553	0.07
554	0.06
555	0.05
556	0.04
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.03
561	0.03
562	0.04
563	0.07
564	0.1
565	0.11
566	0.17
567	0.2
568	0.26
569	0.33
570	0.42
571	0.49
572	0.56
573	0.65
574	0.65
575	0.67
576	0.64
577	0.6
578	0.52
579	0.44
580	0.38
581	0.32
582	0.34
583	0.33
584	0.3
585	0.32
586	0.33
587	0.33
588	0.32
589	0.33
590	0.31
591	0.32
592	0.32
593	0.34
594	0.36
595	0.38
596	0.37
597	0.34
598	0.29
599	0.29
600	0.28
601	0.24
602	0.23
603	0.22
604	0.23
605	0.23
606	0.25
607	0.26
608	0.27
609	0.31
610	0.29
611	0.29
612	0.28
613	0.29
614	0.27
615	0.27
616	0.3
617	0.31
618	0.35
619	0.38
620	0.41
621	0.39
622	0.4
623	0.38
624	0.36
625	0.33
626	0.31
627	0.29
628	0.27
629	0.3
630	0.32
631	0.33
632	0.32
633	0.3
634	0.28
635	0.31
636	0.3
637	0.27
638	0.28
639	0.24
640	0.23
641	0.26
642	0.29
643	0.23
644	0.22
645	0.21
646	0.17
647	0.17
648	0.16
649	0.12
650	0.1
651	0.12
652	0.15
653	0.16
654	0.16
655	0.18
656	0.23
657	0.25
658	0.26
659	0.26
660	0.29
661	0.36
662	0.43
663	0.49
664	0.48
665	0.57
666	0.65
667	0.65
668	0.63
669	0.55
670	0.49
671	0.43
672	0.47
673	0.45
674	0.37
675	0.36
676	0.35
677	0.36
678	0.34
679	0.33
680	0.25
681	0.19
682	0.18
683	0.19
684	0.21
685	0.22
686	0.23
687	0.29
688	0.31
689	0.32
690	0.4

A0A1L9T0M4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer